Doublet Group distance statistics: 51840

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 1, 5, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.027 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.019, 0.041, 0.063, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.041 std_dev=0.022
C2'	A	0, 0.057, 0.125, 0.192, 0.281 max_d=0.281 avg_d=0.125 std_dev=0.067
O4'	A	0, 0.042, 0.119, 0.196, 0.287 max_d=0.287 avg_d=0.119 std_dev=0.077
C3'	A	0, 0.107, 0.200, 0.293, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.200 std_dev=0.093
C4'	A	0, 0.075, 0.180, 0.285, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.180 std_dev=0.105
O2'	A	0, 0.100, 0.205, 0.310, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.205 std_dev=0.105
O3'	A	0, 0.136, 0.263, 0.390, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.263 std_dev=0.127
OP1	B	0, 0.136, 0.308, 0.480, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.308 std_dev=0.172
C5'	A	0, 0.147, 0.322, 0.496, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.322 std_dev=0.175
P	B	0, 0.204, 0.388, 0.572, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.388 std_dev=0.184
C5'	B	0, 0.164, 0.362, 0.560, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.362 std_dev=0.198
OP2	B	0, 0.285, 0.488, 0.690, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.488 std_dev=0.203
C4'	B	0, 0.196, 0.410, 0.623, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.410 std_dev=0.213
O5'	A	0, 0.197, 0.419, 0.641, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.419 std_dev=0.222
O5'	B	0, 0.185, 0.431, 0.676, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.431 std_dev=0.246
O4'	B	0, 0.214, 0.460, 0.706, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.460 std_dev=0.246
O3'	B	0, 0.217, 0.464, 0.711, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.464 std_dev=0.247
C3'	B	0, 0.213, 0.477, 0.741, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.477 std_dev=0.264
C8	B	0, 0.289, 0.558, 0.826, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.558 std_dev=0.269
P	A	0, 0.220, 0.509, 0.799, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.509 std_dev=0.289
N7	B	0, 0.324, 0.614, 0.903, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.614 std_dev=0.290
N9	B	0, 0.238, 0.539, 0.840, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.539 std_dev=0.301
C1'	B	0, 0.207, 0.508, 0.809, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.508 std_dev=0.301
C5	B	0, 0.297, 0.634, 0.972, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.634 std_dev=0.338
C4	B	0, 0.253, 0.599, 0.946, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.599 std_dev=0.346
C2'	B	0, 0.187, 0.555, 0.924, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.555 std_dev=0.368
C6	B	0, 0.321, 0.704, 1.086, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.704 std_dev=0.383
O6	B	0, 0.364, 0.749, 1.134, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.749 std_dev=0.385
N3	B	0, 0.249, 0.646, 1.042, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.646 std_dev=0.396
O2'	B	0, 0.202, 0.626, 1.050, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.626 std_dev=0.424
OP2	A	0, 0.425, 0.852, 1.278, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.852 std_dev=0.427
N1	B	0, 0.309, 0.742, 1.174, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.742 std_dev=0.432
C2	B	0, 0.287, 0.725, 1.163, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.725 std_dev=0.438
OP1	A	0, 0.412, 0.899, 1.385, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.899 std_dev=0.487
N2	B	0, 0.332, 0.824, 1.316, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.824 std_dev=0.492

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.09	0.23	0.13	0.09
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.03	0.14	0.31	0.13	0.13
C2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.03	0.02	0.11	0.19	0.23	0.09
C3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.18	0.23	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.19	0.45	0.22	0.17
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.21	0.17	0.05
C5	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.05	0.01	0.04	0.20	0.49	0.25	0.18
C5'	0.02	0.07	0.04	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.05	0.04	0.03	0.14	0.01	0.01	0.13	0.19	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.17	0.42	0.22	0.15
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.14	0.31	0.14	0.11
N3	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.03	0.17	0.37	0.16	0.15
O2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.12	0.02	0.05	0.12	0.27	0.12	0.13
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.04	0.07	0.02	0.04	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01	0.10	0.20	0.24	0.09
O3'	0.05	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.08	0.12	0.02	0.00	0.07	0.03	0.03	0.25	0.23	0.06
O4	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.00	0.03	0.21	0.49	0.25	0.19
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.03	0.00	0.08	0.22	0.11	0.10
O5'	0.09	0.14	0.11	0.04	0.19	0.01	0.20	0.01	0.17	0.14	0.17	0.12	0.10	0.03	0.21	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.31	0.19	0.18	0.45	0.21	0.49	0.13	0.42	0.31	0.37	0.27	0.20	0.25	0.49	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.13	0.23	0.23	0.22	0.17	0.25	0.19	0.22	0.14	0.16	0.12	0.24	0.23	0.25	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.13	0.09	0.04	0.17	0.05	0.18	0.01	0.15	0.11	0.15	0.13	0.09	0.06	0.19	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.09	0.12	0.15	0.09	0.12	0.10	0.13	0.11	0.10	0.10	0.09	0.09	0.11	0.09	0.16	0.18	0.10	0.13	0.14	0.13	0.11	0.12
C2	0.12	0.11	0.14	0.17	0.11	0.15	0.12	0.17	0.13	0.11	0.12	0.10	0.11	0.12	0.11	0.16	0.19	0.12	0.18	0.15	0.11	0.13	0.15
C2'	0.11	0.10	0.13	0.17	0.10	0.14	0.11	0.15	0.12	0.11	0.11	0.10	0.10	0.12	0.10	0.17	0.20	0.11	0.14	0.14	0.14	0.11	0.12
C3'	0.11	0.10	0.11	0.14	0.11	0.11	0.13	0.12	0.13	0.14	0.11	0.11	0.10	0.15	0.12	0.13	0.17	0.12	0.12	0.15	0.12	0.12	0.12
C4	0.14	0.12	0.18	0.20	0.12	0.17	0.13	0.19	0.14	0.13	0.13	0.12	0.12	0.14	0.13	0.16	0.21	0.15	0.21	0.16	0.11	0.16	0.18
C4'	0.11	0.11	0.11	0.13	0.12	0.11	0.14	0.12	0.14	0.15	0.12	0.11	0.10	0.16	0.12	0.11	0.15	0.12	0.13	0.16	0.12	0.12	0.12
C5	0.15	0.11	0.18	0.20	0.12	0.17	0.12	0.18	0.12	0.12	0.12	0.11	0.12	0.12	0.13	0.16	0.21	0.15	0.20	0.13	0.11	0.16	0.18
C5'	0.14	0.13	0.14	0.15	0.14	0.15	0.16	0.15	0.16	0.18	0.15	0.13	0.13	0.19	0.15	0.13	0.16	0.15	0.16	0.18	0.15	0.15	0.15
C6	0.13	0.09	0.16	0.19	0.09	0.16	0.09	0.17	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10	0.09	0.10	0.15	0.20	0.13	0.17	0.12	0.11	0.13	0.16
N1	0.11	0.09	0.14	0.17	0.09	0.14	0.10	0.16	0.11	0.09	0.10	0.09	0.09	0.10	0.09	0.15	0.19	0.11	0.16	0.13	0.12	0.12	0.14
N3	0.13	0.11	0.16	0.19	0.12	0.16	0.13	0.18	0.14	0.12	0.13	0.11	0.11	0.13	0.12	0.16	0.20	0.13	0.20	0.16	0.11	0.15	0.17
O2	0.13	0.12	0.15	0.17	0.12	0.15	0.13	0.17	0.14	0.13	0.13	0.13	0.12	0.14	0.12	0.19	0.19	0.13	0.17	0.16	0.12	0.12	0.15
O2'	0.20	0.18	0.23	0.24	0.18	0.23	0.18	0.24	0.19	0.18	0.18	0.18	0.19	0.18	0.18	0.27	0.27	0.20	0.23	0.20	0.20	0.17	0.19
O3'	0.13	0.13	0.14	0.16	0.13	0.14	0.13	0.14	0.13	0.13	0.12	0.14	0.13	0.14	0.13	0.18	0.18	0.14	0.13	0.14	0.11	0.12	0.12
O4	0.16	0.14	0.19	0.21	0.14	0.18	0.16	0.20	0.16	0.15	0.16	0.14	0.14	0.16	0.15	0.17	0.21	0.16	0.22	0.18	0.11	0.18	0.19
O4'	0.09	0.09	0.10	0.13	0.10	0.10	0.12	0.10	0.13	0.12	0.11	0.09	0.09	0.14	0.10	0.12	0.15	0.10	0.10	0.15	0.12	0.11	0.10
O5'	0.18	0.17	0.18	0.19	0.19	0.18	0.20	0.20	0.20	0.22	0.18	0.17	0.17	0.23	0.19	0.16	0.18	0.19	0.22	0.22	0.17	0.17	0.18
OP1	0.22	0.33	0.21	0.22	0.33	0.19	0.40	0.23	0.44	0.37	0.39	0.31	0.29	0.44	0.30	0.15	0.18	0.22	0.30	0.50	0.35	0.50	0.38
OP2	0.38	0.37	0.38	0.38	0.38	0.38	0.39	0.38	0.39	0.41	0.37	0.35	0.37	0.41	0.38	0.41	0.38	0.39	0.42	0.40	0.35	0.37	0.37
P	0.20	0.21	0.21	0.22	0.21	0.21	0.23	0.21	0.24	0.23	0.23	0.22	0.20	0.25	0.21	0.20	0.22	0.20	0.19	0.27	0.14	0.20	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.06	0.01	0.09	0.01	0.10	0.13	0.11
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.06	0.04	0.05	0.05	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.10	0.07	0.03
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.05	0.06	0.11	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.09	0.01	0.10	0.13	0.11
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02	0.12	0.01	0.13	0.17	0.14
C5'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.04	0.03	0.08	0.04	0.08	0.04	0.01	0.01	0.09	0.08	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.09	0.02	0.12	0.01	0.14	0.18	0.15
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.12	0.03	0.13	0.16	0.14
N1	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.13	0.07	0.02	0.11	0.01	0.12	0.16	0.13
N2	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.15	0.07	0.02	0.08	0.03	0.09	0.12	0.10
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.06	0.02	0.07	0.01	0.08	0.11	0.09
N7	0.01	0.02	0.06	0.08	0.01	0.04	0.00	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.13	0.03	0.16	0.20	0.16
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.11	0.10
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.09	0.07	0.08	0.08	0.11	0.03	0.13	0.15	0.12	0.05	0.04	0.00	0.06	0.06	0.05	0.10	0.08	0.03	0.05
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.09	0.10	0.07	0.07	0.06	0.11	0.06	0.06	0.00	0.02	0.11	0.10	0.12	0.06	0.07
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.08	0.07
O5'	0.04	0.09	0.02	0.05	0.09	0.01	0.12	0.01	0.12	0.12	0.11	0.08	0.07	0.13	0.08	0.05	0.11	0.04	0.00	0.14	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.10	0.10	0.03	0.14	0.00	0.17	0.21	0.18
OP1	0.06	0.10	0.10	0.11	0.10	0.08	0.13	0.08	0.14	0.13	0.12	0.09	0.08	0.16	0.09	0.08	0.12	0.06	0.02	0.17	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.13	0.07	0.06	0.13	0.03	0.17	0.01	0.18	0.16	0.16	0.12	0.11	0.20	0.11	0.03	0.06	0.08	0.02	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.03	0.04	0.11	0.03	0.14	0.02	0.15	0.14	0.13	0.10	0.09	0.16	0.10	0.05	0.07	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00