Doublet Group distance statistics: 51877

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 11, 19, 15, 6, 6, 4, 13, 10, 4, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.003, 0.006, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.014, 0.040, 0.065, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.040 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.016, 0.052, 0.088, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.052 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.038, 0.157, 0.276, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.157 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.051, 0.210, 0.369, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.210 std_dev=0.159
C4'	A	0, 0.061, 0.245, 0.428, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.245 std_dev=0.183
C2	B	0, 0.183, 0.394, 0.604, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.394 std_dev=0.211
O2'	A	0, 0.071, 0.284, 0.497, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.284 std_dev=0.213
N3	B	0, 0.168, 0.386, 0.605, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.386 std_dev=0.218
C3'	A	0, 0.087, 0.306, 0.525, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.306 std_dev=0.219
O4'	B	0, 0.191, 0.425, 0.659, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.425 std_dev=0.234
N1	B	0, 0.206, 0.454, 0.701, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.454 std_dev=0.247
C4'	B	0, 0.188, 0.465, 0.742, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.465 std_dev=0.277
C4	B	0, 0.170, 0.464, 0.758, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.464 std_dev=0.294
C1'	B	0, 0.160, 0.456, 0.751, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.456 std_dev=0.296
O2'	B	0, 0.146, 0.449, 0.752, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.449 std_dev=0.303
C5'	B	0, 0.204, 0.507, 0.811, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.507 std_dev=0.304
O5'	B	0, 0.224, 0.531, 0.838, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.531 std_dev=0.307
O3'	A	0, 0.137, 0.452, 0.766, 2.170 max_d=2.170 avg_d=0.452 std_dev=0.315
C6	B	0, 0.212, 0.545, 0.879, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.545 std_dev=0.333
P	B	0, 0.175, 0.518, 0.861, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.518 std_dev=0.343
N9	B	0, 0.167, 0.511, 0.856, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.511 std_dev=0.345
C5'	A	0, 0.118, 0.475, 0.831, 2.174 max_d=2.174 avg_d=0.475 std_dev=0.357
C2'	B	0, 0.135, 0.496, 0.856, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.496 std_dev=0.360
OP2	B	0, 0.173, 0.538, 0.902, 2.131 max_d=2.131 avg_d=0.538 std_dev=0.365
C5	B	0, 0.193, 0.559, 0.926, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.559 std_dev=0.366
C3'	B	0, 0.167, 0.548, 0.929, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.548 std_dev=0.381
OP1	B	0, 0.217, 0.612, 1.006, 2.208 max_d=2.208 avg_d=0.612 std_dev=0.395
N6	B	0, 0.247, 0.649, 1.051, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.649 std_dev=0.402
O5'	A	0, 0.148, 0.567, 0.986, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.567 std_dev=0.419
C8	B	0, 0.194, 0.647, 1.101, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.647 std_dev=0.453
O3'	B	0, 0.189, 0.647, 1.104, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.647 std_dev=0.458
N7	B	0, 0.205, 0.680, 1.154, 1.914 max_d=1.914 avg_d=0.680 std_dev=0.475
P	A	0, 0.174, 0.820, 1.466, 2.334 max_d=2.334 avg_d=0.820 std_dev=0.646
OP2	A	0, 0.183, 0.849, 1.515, 2.328 max_d=2.328 avg_d=0.849 std_dev=0.666
OP1	A	0, 0.185, 1.062, 1.940, 3.188 max_d=3.188 avg_d=1.062 std_dev=0.877

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.07	0.15	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.03	0.15	0.16	0.24	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.04	0.05	0.13	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.20	0.10
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.02	0.11	0.03	0.04	0.06	0.11	0.01	0.00	0.02	0.04	0.11	0.21	0.11
C4	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.19	0.27	0.32	0.25
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03
C5	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.14	0.04	0.19	0.27	0.31	0.26
C5'	0.03	0.09	0.01	0.02	0.16	0.00	0.17	0.00	0.14	0.09	0.12	0.17	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.09	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.11	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.04	0.17	0.20	0.25	0.20
N1	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.14	0.14	0.21	0.14
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.02	0.17	0.22	0.29	0.21
N4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.20	0.32	0.36	0.28
O2	0.02	0.00	0.13	0.11	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.14	0.04	0.13	0.12	0.22	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.03	0.06	0.03	0.06	0.02	0.06	0.06	0.13	0.00	0.03	0.03	0.04	0.08	0.20	0.08
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.14	0.02	0.13	0.03	0.05	0.10	0.14	0.03	0.00	0.01	0.09	0.13	0.27	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.08	0.09	0.08	0.06
O5'	0.09	0.15	0.05	0.04	0.19	0.01	0.19	0.00	0.17	0.14	0.17	0.20	0.13	0.04	0.09	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.16	0.10	0.11	0.27	0.06	0.27	0.09	0.20	0.14	0.22	0.32	0.12	0.08	0.13	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.24	0.20	0.21	0.32	0.11	0.31	0.05	0.25	0.21	0.29	0.36	0.22	0.20	0.27	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.15	0.10	0.11	0.25	0.03	0.26	0.01	0.20	0.14	0.21	0.28	0.11	0.08	0.15	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.19	0.30	0.31	0.20	0.26	0.18	0.25	0.17	0.20	0.18	0.20	0.17	0.19	0.21	0.29	0.33	0.23	0.24	0.30	0.20	0.22
C2	0.23	0.15	0.29	0.30	0.17	0.25	0.16	0.25	0.14	0.19	0.14	0.17	0.14	0.17	0.20	0.28	0.31	0.23	0.24	0.30	0.19	0.22
C2'	0.24	0.12	0.30	0.30	0.17	0.25	0.16	0.24	0.13	0.21	0.12	0.15	0.13	0.18	0.21	0.29	0.32	0.23	0.23	0.28	0.17	0.20
C3'	0.26	0.13	0.33	0.32	0.20	0.27	0.18	0.26	0.15	0.24	0.13	0.18	0.15	0.21	0.24	0.31	0.34	0.25	0.25	0.29	0.18	0.21
C4	0.24	0.14	0.34	0.34	0.18	0.26	0.17	0.25	0.14	0.20	0.14	0.18	0.14	0.18	0.21	0.31	0.36	0.22	0.25	0.30	0.20	0.22
C4'	0.29	0.24	0.35	0.36	0.25	0.30	0.24	0.29	0.23	0.26	0.22	0.25	0.22	0.24	0.27	0.32	0.38	0.27	0.28	0.33	0.23	0.26
C5	0.25	0.18	0.35	0.35	0.21	0.26	0.19	0.25	0.17	0.22	0.17	0.22	0.16	0.20	0.23	0.31	0.38	0.22	0.25	0.30	0.21	0.23
C5'	0.39	0.37	0.45	0.47	0.37	0.40	0.36	0.40	0.35	0.37	0.35	0.38	0.34	0.36	0.38	0.41	0.49	0.37	0.40	0.43	0.34	0.37
C6	0.25	0.19	0.33	0.34	0.21	0.26	0.19	0.25	0.18	0.22	0.18	0.22	0.17	0.20	0.23	0.30	0.37	0.22	0.25	0.30	0.20	0.22
N1	0.24	0.18	0.31	0.31	0.19	0.26	0.18	0.25	0.16	0.20	0.16	0.20	0.16	0.18	0.21	0.29	0.34	0.23	0.24	0.30	0.20	0.22
N3	0.23	0.14	0.30	0.30	0.17	0.26	0.15	0.25	0.14	0.19	0.13	0.16	0.13	0.17	0.20	0.29	0.32	0.23	0.24	0.30	0.19	0.22
N4	0.24	0.13	0.36	0.36	0.18	0.26	0.16	0.25	0.14	0.20	0.13	0.16	0.13	0.18	0.21	0.33	0.38	0.21	0.25	0.30	0.20	0.22
O2	0.22	0.14	0.27	0.27	0.16	0.25	0.15	0.25	0.13	0.18	0.14	0.16	0.13	0.16	0.19	0.26	0.29	0.23	0.23	0.30	0.19	0.22
O2'	0.23	0.13	0.29	0.28	0.17	0.24	0.15	0.23	0.13	0.20	0.12	0.15	0.13	0.17	0.20	0.28	0.30	0.22	0.22	0.28	0.17	0.19
O3'	0.24	0.11	0.31	0.30	0.17	0.24	0.16	0.23	0.13	0.22	0.12	0.14	0.14	0.19	0.21	0.30	0.32	0.22	0.22	0.25	0.15	0.18
O4'	0.25	0.23	0.31	0.32	0.22	0.27	0.21	0.26	0.21	0.21	0.22	0.24	0.20	0.20	0.23	0.29	0.36	0.23	0.25	0.31	0.21	0.23
O5'	0.45	0.40	0.48	0.49	0.42	0.44	0.40	0.44	0.38	0.43	0.37	0.42	0.36	0.41	0.43	0.44	0.50	0.43	0.44	0.46	0.38	0.41
OP1	0.59	0.58	0.60	0.62	0.60	0.58	0.59	0.59	0.58	0.61	0.57	0.59	0.57	0.60	0.60	0.53	0.61	0.58	0.60	0.61	0.55	0.58
OP2	0.60	0.58	0.62	0.64	0.59	0.60	0.58	0.61	0.55	0.60	0.55	0.59	0.52	0.58	0.60	0.57	0.64	0.59	0.61	0.62	0.55	0.58
P	0.52	0.52	0.55	0.56	0.52	0.52	0.51	0.52	0.50	0.52	0.50	0.53	0.48	0.51	0.52	0.49	0.56	0.51	0.53	0.54	0.47	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.10	0.06
C2	0.02	0.00	0.16	0.19	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.24	0.06	0.07	0.09	0.11	0.07
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.06	0.14	0.16	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.07	0.04
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.12	0.00	0.10	0.02	0.14	0.06	0.17	0.17	0.13	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.09	0.12	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.03	0.06	0.07	0.11	0.07
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.08	0.09	0.13	0.09
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.05	0.05	0.04	0.07	0.06	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.14	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.18	0.03	0.09	0.10	0.13	0.09
C8	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.04	0.07	0.08	0.14	0.08
N1	0.01	0.00	0.14	0.17	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.23	0.05	0.08	0.10	0.12	0.09
N3	0.02	0.00	0.16	0.17	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.20	0.06	0.06	0.08	0.10	0.07
N6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.18	0.03	0.10	0.11	0.14	0.11
N7	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.08	0.10	0.15	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.06	0.11	0.07
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.05	0.10	0.11	0.05	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.08	0.05	0.03
O3'	0.01	0.24	0.01	0.01	0.14	0.02	0.13	0.02	0.18	0.07	0.23	0.20	0.18	0.07	0.05	0.03	0.00	0.01	0.05	0.13	0.11	0.07
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.10	0.07
O5'	0.04	0.07	0.04	0.04	0.06	0.01	0.08	0.01	0.09	0.07	0.08	0.06	0.10	0.08	0.05	0.03	0.05	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.09	0.06	0.08	0.07	0.06	0.09	0.06	0.10	0.08	0.10	0.08	0.11	0.10	0.06	0.08	0.13	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.11	0.07	0.06	0.11	0.03	0.13	0.02	0.13	0.14	0.12	0.10	0.14	0.15	0.11	0.05	0.11	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.07	0.04	0.04	0.07	0.02	0.09	0.01	0.09	0.08	0.09	0.07	0.11	0.10	0.07	0.03	0.07	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00