Doublet Group distance statistics: 51882

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 14, 8, 13, 4, 7, 4, 1, 2, 0, 1, 13, 23, 12, 2, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.013, 0.020, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.012, 0.019, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.031, 0.052, 0.072, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.052 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.026, 0.052, 0.078, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.052 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.066, 0.157, 0.247, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.157 std_dev=0.091
O4'	A	0, 0.058, 0.151, 0.245, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.151 std_dev=0.094
O2'	A	0, 0.089, 0.205, 0.321, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.205 std_dev=0.116
C4'	A	0, 0.092, 0.231, 0.370, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.231 std_dev=0.139
C3'	A	0, 0.099, 0.247, 0.395, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.247 std_dev=0.148
C2	B	0, 0.152, 0.322, 0.492, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.322 std_dev=0.170
O2	B	0, 0.165, 0.341, 0.517, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.341 std_dev=0.176
O3'	A	0, 0.140, 0.355, 0.570, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.355 std_dev=0.215
OP2	A	0, 0.169, 0.397, 0.625, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.397 std_dev=0.228
C5'	A	0, 0.144, 0.374, 0.604, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.374 std_dev=0.230
O5'	A	0, 0.166, 0.401, 0.637, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.401 std_dev=0.235
C5	B	0, 0.225, 0.479, 0.734, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.479 std_dev=0.255
P	A	0, 0.195, 0.479, 0.763, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.479 std_dev=0.284
C6	B	0, 0.302, 0.655, 1.009, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.655 std_dev=0.353
N3	B	0, 0.238, 0.603, 0.967, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.603 std_dev=0.365
N1	B	0, 0.268, 0.648, 1.029, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.648 std_dev=0.380
C4	B	0, 0.303, 0.717, 1.131, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.717 std_dev=0.414
OP1	A	0, 0.321, 0.818, 1.316, 2.257 max_d=2.257 avg_d=0.818 std_dev=0.498
O4	B	0, 0.397, 1.119, 1.842, 2.715 max_d=2.715 avg_d=1.119 std_dev=0.722
C1'	B	0, 0.274, 1.144, 2.014, 2.583 max_d=2.583 avg_d=1.144 std_dev=0.870
OP2	B	0, 0.515, 1.673, 2.831, 3.488 max_d=3.488 avg_d=1.673 std_dev=1.158
C2'	B	0, 0.266, 1.495, 2.724, 3.243 max_d=3.243 avg_d=1.495 std_dev=1.229
O4'	B	0, 0.319, 1.570, 2.821, 3.479 max_d=3.479 avg_d=1.570 std_dev=1.251
O5'	B	0, 0.407, 1.776, 3.146, 3.749 max_d=3.749 avg_d=1.776 std_dev=1.370
O2'	B	0, 0.239, 1.761, 3.283, 3.840 max_d=3.840 avg_d=1.761 std_dev=1.522
C3'	B	0, 0.291, 1.831, 3.370, 3.983 max_d=3.983 avg_d=1.831 std_dev=1.539
P	B	0, 0.461, 2.046, 3.631, 4.334 max_d=4.334 avg_d=2.046 std_dev=1.585
C4'	B	0, 0.321, 1.978, 3.635, 4.341 max_d=4.341 avg_d=1.978 std_dev=1.657
C5'	B	0, 0.370, 2.188, 4.005, 4.736 max_d=4.736 avg_d=2.188 std_dev=1.818
OP1	B	0, 0.483, 2.542, 4.602, 5.419 max_d=5.419 avg_d=2.542 std_dev=2.059
O3'	B	0, 0.264, 2.427, 4.590, 5.284 max_d=5.284 avg_d=2.427 std_dev=2.163

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.14	0.05
C2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.06	0.11	0.18	0.08
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.09	0.07	0.13	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.07	0.03	0.09	0.07	0.12	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.08	0.16	0.20	0.11
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.09	0.13	0.20	0.10
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.12	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.09	0.09	0.18	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.07	0.17	0.07
N3	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.07	0.15	0.20	0.10
N4	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.02	0.08	0.20	0.21	0.12
O2	0.03	0.01	0.13	0.12	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.15	0.03	0.07	0.11	0.18	0.08
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.06	0.05	0.03	0.05	0.03	0.03	0.09	0.07	0.13	0.00	0.04	0.04	0.04	0.07	0.07	0.04
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.08	0.03	0.10	0.09	0.15	0.04	0.00	0.01	0.07	0.10	0.11	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.00	0.05	0.07	0.17	0.06
O5'	0.04	0.06	0.04	0.04	0.08	0.01	0.09	0.01	0.09	0.06	0.07	0.08	0.07	0.04	0.07	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.05	0.11	0.06	0.07	0.16	0.09	0.13	0.12	0.09	0.07	0.15	0.20	0.11	0.07	0.10	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.18	0.07	0.06	0.20	0.06	0.20	0.03	0.18	0.17	0.20	0.21	0.18	0.07	0.11	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.04	0.04	0.11	0.02	0.10	0.01	0.08	0.07	0.10	0.12	0.08	0.04	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.10	0.48	0.48	0.18	0.41	0.11	0.37	0.15	0.17	0.16	0.11	0.57	0.56	0.27	0.29	0.27	0.33	0.12	0.19
C2	0.30	0.10	0.32	0.34	0.13	0.40	0.10	0.39	0.16	0.17	0.13	0.10	0.38	0.32	0.20	0.35	0.28	0.36	0.15	0.25
C2'	0.18	0.10	0.30	0.29	0.14	0.21	0.11	0.18	0.11	0.12	0.13	0.11	0.33	0.32	0.20	0.15	0.14	0.16	0.13	0.11
C3'	0.14	0.11	0.33	0.30	0.17	0.15	0.13	0.12	0.11	0.11	0.15	0.13	0.35	0.36	0.22	0.12	0.10	0.10	0.17	0.13
C4	0.30	0.10	0.27	0.29	0.12	0.36	0.11	0.36	0.16	0.18	0.13	0.10	0.31	0.25	0.16	0.35	0.26	0.31	0.15	0.23
C4'	0.27	0.12	0.54	0.54	0.19	0.34	0.14	0.25	0.14	0.16	0.16	0.14	0.61	0.67	0.29	0.18	0.19	0.22	0.10	0.10
C5	0.31	0.10	0.41	0.41	0.15	0.37	0.10	0.33	0.15	0.18	0.15	0.11	0.48	0.44	0.22	0.30	0.24	0.28	0.13	0.18
C5'	0.27	0.13	0.62	0.61	0.21	0.33	0.15	0.23	0.15	0.17	0.17	0.16	0.69	0.78	0.31	0.15	0.18	0.19	0.11	0.07
C6	0.32	0.11	0.48	0.47	0.17	0.39	0.11	0.34	0.15	0.18	0.16	0.12	0.56	0.53	0.26	0.29	0.25	0.29	0.12	0.17
N1	0.31	0.10	0.43	0.43	0.16	0.40	0.11	0.37	0.15	0.18	0.15	0.11	0.51	0.48	0.24	0.31	0.27	0.32	0.13	0.20
N3	0.29	0.11	0.23	0.26	0.12	0.37	0.11	0.39	0.17	0.17	0.13	0.10	0.27	0.20	0.16	0.37	0.28	0.35	0.17	0.26
N4	0.28	0.12	0.16	0.19	0.12	0.33	0.14	0.35	0.18	0.18	0.12	0.12	0.16	0.13	0.13	0.38	0.26	0.31	0.17	0.25
O2	0.30	0.10	0.29	0.31	0.13	0.40	0.10	0.41	0.16	0.17	0.13	0.10	0.35	0.28	0.19	0.36	0.30	0.39	0.16	0.27
O2'	0.21	0.10	0.33	0.32	0.15	0.25	0.11	0.22	0.11	0.13	0.13	0.11	0.37	0.36	0.22	0.18	0.17	0.21	0.13	0.13
O3'	0.10	0.12	0.26	0.22	0.20	0.11	0.16	0.15	0.12	0.11	0.17	0.13	0.26	0.27	0.25	0.18	0.13	0.14	0.23	0.21
O4'	0.36	0.12	0.62	0.63	0.22	0.48	0.14	0.41	0.16	0.20	0.20	0.13	0.73	0.77	0.35	0.31	0.30	0.36	0.12	0.20
O5'	0.24	0.14	0.58	0.55	0.20	0.27	0.15	0.17	0.14	0.16	0.16	0.17	0.62	0.71	0.28	0.12	0.14	0.13	0.13	0.08
OP1	0.15	0.20	0.44	0.41	0.35	0.15	0.32	0.25	0.25	0.20	0.29	0.17	0.47	0.62	0.43	0.34	0.24	0.27	0.42	0.41
OP2	0.15	0.16	0.41	0.39	0.26	0.15	0.22	0.14	0.18	0.15	0.22	0.16	0.42	0.53	0.33	0.19	0.13	0.14	0.28	0.24
P	0.23	0.15	0.62	0.60	0.23	0.27	0.19	0.15	0.16	0.17	0.19	0.19	0.66	0.80	0.33	0.12	0.13	0.11	0.17	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.04	0.12	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.08	0.09	0.18	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.06	0.09	0.00	0.02	0.09	0.01	0.05	0.06	0.08	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.12	0.07	0.10	0.07	0.01	0.00	0.14	0.02	0.03	0.08	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.00	0.04	0.12	0.17	0.24	0.19
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.19	0.01	0.04	0.13	0.18	0.24	0.20
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.11	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.03	0.11	0.13	0.19	0.16
N1	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.02	0.08	0.09	0.16	0.12
N3	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.01	0.04	0.10	0.13	0.21	0.16
O2	0.02	0.01	0.09	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.09	0.01	0.05	0.07	0.07	0.17	0.11
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.06	0.11	0.00	0.07	0.06	0.03	0.03	0.09	0.05	0.03
O3'	0.02	0.08	0.02	0.00	0.17	0.03	0.19	0.02	0.15	0.07	0.12	0.09	0.07	0.00	0.21	0.03	0.06	0.16	0.15	0.11
O4	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.21	0.00	0.05	0.13	0.20	0.26	0.21
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.00	0.05	0.05	0.10	0.06
O5'	0.06	0.08	0.05	0.03	0.12	0.01	0.13	0.01	0.11	0.08	0.10	0.07	0.03	0.06	0.13	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.09	0.06	0.08	0.17	0.06	0.18	0.05	0.13	0.09	0.13	0.07	0.09	0.16	0.20	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.18	0.08	0.05	0.24	0.03	0.24	0.02	0.19	0.16	0.21	0.17	0.05	0.15	0.26	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.05	0.04	0.19	0.01	0.20	0.01	0.16	0.12	0.16	0.11	0.03	0.11	0.21	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00