Doublet Group distance statistics: 51883

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 18, 11, 13, 8, 10, 14, 8, 9, 6, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.005, 0.008, 0.012, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.020 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.020, 0.052, 0.084, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.052 std_dev=0.032
N4	A	0, 0.020, 0.063, 0.106, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.063 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.065, 0.153, 0.241, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.153 std_dev=0.088
C2'	A	0, 0.099, 0.222, 0.345, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.222 std_dev=0.123
C4'	A	0, 0.103, 0.228, 0.353, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.228 std_dev=0.125
C3'	A	0, 0.164, 0.344, 0.523, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.344 std_dev=0.180
O2'	A	0, 0.135, 0.329, 0.522, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.329 std_dev=0.193
C2	B	0, 0.255, 0.450, 0.645, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.450 std_dev=0.195
O2	B	0, 0.246, 0.458, 0.670, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.458 std_dev=0.212
C5'	A	0, 0.212, 0.437, 0.662, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.437 std_dev=0.225
N3	B	0, 0.302, 0.530, 0.758, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.530 std_dev=0.228
N1	B	0, 0.262, 0.525, 0.787, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.525 std_dev=0.262
O5'	A	0, 0.270, 0.558, 0.846, 2.449 max_d=2.449 avg_d=0.558 std_dev=0.288
C1'	B	0, 0.297, 0.586, 0.875, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.586 std_dev=0.289
O3'	A	0, 0.245, 0.542, 0.838, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.542 std_dev=0.297
C4	B	0, 0.324, 0.627, 0.930, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.627 std_dev=0.303
O4'	B	0, 0.401, 0.771, 1.141, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.771 std_dev=0.370
O4	B	0, 0.376, 0.746, 1.116, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.746 std_dev=0.370
C6	B	0, 0.302, 0.675, 1.049, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.675 std_dev=0.373
C2'	B	0, 0.281, 0.658, 1.036, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.658 std_dev=0.377
C5	B	0, 0.318, 0.705, 1.092, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.705 std_dev=0.387
P	A	0, 0.224, 0.618, 1.011, 3.266 max_d=3.266 avg_d=0.618 std_dev=0.394
O2'	B	0, 0.362, 0.756, 1.151, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.756 std_dev=0.394
OP1	A	0, 0.299, 0.699, 1.100, 3.184 max_d=3.184 avg_d=0.699 std_dev=0.401
C4'	B	0, 0.455, 0.953, 1.450, 2.078 max_d=2.078 avg_d=0.953 std_dev=0.498
C3'	B	0, 0.387, 0.888, 1.389, 2.162 max_d=2.162 avg_d=0.888 std_dev=0.501
OP2	A	0, 0.116, 0.657, 1.197, 5.023 max_d=5.023 avg_d=0.657 std_dev=0.541
O5'	B	0, 0.530, 1.126, 1.722, 2.249 max_d=2.249 avg_d=1.126 std_dev=0.596
C5'	B	0, 0.554, 1.156, 1.758, 2.556 max_d=2.556 avg_d=1.156 std_dev=0.602
O3'	B	0, 0.486, 1.092, 1.698, 2.893 max_d=2.893 avg_d=1.092 std_dev=0.606
OP2	B	0, 0.434, 1.085, 1.736, 2.428 max_d=2.428 avg_d=1.085 std_dev=0.651
P	B	0, 0.482, 1.184, 1.887, 2.527 max_d=2.527 avg_d=1.184 std_dev=0.703
OP1	B	0, 0.501, 1.248, 1.994, 2.736 max_d=2.736 avg_d=1.248 std_dev=0.746

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.10	0.11	0.09
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.06	0.02	0.15	0.15	0.22	0.16
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.05	0.06	0.11	0.00	0.02	0.00	0.08	0.12	0.08	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.02	0.12	0.05	0.06	0.11	0.09	0.02	0.01	0.01	0.08	0.14	0.07	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.23	0.24	0.35	0.25
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.03	0.25	0.26	0.36	0.26
C5'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.04	0.05	0.09	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.10	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.22	0.21	0.28	0.21
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.16	0.15	0.20	0.15
N3	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.19	0.20	0.29	0.21
N4	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.15	0.03	0.24	0.27	0.39	0.28
O2	0.02	0.00	0.11	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.12	0.03	0.12	0.12	0.17	0.13
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.06	0.05	0.13	0.00	0.04	0.03	0.04	0.08	0.06	0.04
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.12	0.02	0.16	0.03	0.14	0.05	0.08	0.15	0.12	0.04	0.00	0.02	0.08	0.15	0.14	0.09
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.09	0.09	0.10	0.09
O5'	0.10	0.15	0.08	0.08	0.23	0.01	0.25	0.01	0.22	0.16	0.19	0.24	0.12	0.04	0.08	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.10	0.15	0.12	0.14	0.24	0.07	0.26	0.10	0.21	0.15	0.20	0.27	0.12	0.08	0.15	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.22	0.08	0.07	0.35	0.05	0.36	0.07	0.28	0.20	0.29	0.39	0.17	0.06	0.14	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.07	0.07	0.25	0.02	0.26	0.01	0.21	0.15	0.21	0.28	0.13	0.04	0.09	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.10	0.35	0.38	0.12	0.34	0.11	0.32	0.15	0.15	0.12	0.09	0.41	0.45	0.17	0.25	0.28	0.30	0.25	0.26
C2	0.26	0.11	0.37	0.41	0.11	0.37	0.15	0.36	0.20	0.18	0.10	0.09	0.42	0.48	0.12	0.28	0.33	0.35	0.30	0.32
C2'	0.20	0.08	0.33	0.36	0.13	0.32	0.08	0.30	0.10	0.11	0.13	0.09	0.41	0.44	0.20	0.22	0.24	0.26	0.21	0.23
C3'	0.14	0.11	0.25	0.26	0.22	0.22	0.14	0.20	0.08	0.07	0.20	0.09	0.34	0.34	0.29	0.15	0.15	0.16	0.14	0.13
C4	0.23	0.11	0.34	0.35	0.11	0.30	0.14	0.29	0.18	0.17	0.10	0.09	0.37	0.38	0.11	0.23	0.27	0.28	0.27	0.26
C4'	0.16	0.08	0.27	0.28	0.18	0.24	0.11	0.22	0.06	0.07	0.16	0.07	0.35	0.36	0.26	0.17	0.17	0.18	0.15	0.15
C5	0.20	0.10	0.29	0.29	0.12	0.25	0.11	0.23	0.13	0.13	0.12	0.10	0.33	0.33	0.15	0.19	0.20	0.21	0.21	0.20
C5'	0.14	0.09	0.22	0.22	0.22	0.20	0.15	0.17	0.08	0.07	0.19	0.07	0.31	0.29	0.31	0.15	0.13	0.13	0.15	0.12
C6	0.21	0.10	0.31	0.31	0.13	0.27	0.11	0.25	0.13	0.13	0.12	0.10	0.36	0.37	0.17	0.21	0.22	0.22	0.21	0.21
N1	0.23	0.10	0.34	0.37	0.11	0.33	0.12	0.31	0.16	0.16	0.11	0.09	0.40	0.43	0.15	0.24	0.27	0.29	0.25	0.26
N3	0.26	0.11	0.37	0.41	0.12	0.36	0.17	0.36	0.22	0.19	0.10	0.10	0.41	0.46	0.11	0.27	0.33	0.35	0.32	0.33
N4	0.22	0.12	0.33	0.33	0.13	0.28	0.17	0.27	0.20	0.18	0.11	0.10	0.33	0.35	0.12	0.21	0.27	0.27	0.28	0.27
O2	0.27	0.11	0.39	0.44	0.11	0.41	0.17	0.41	0.22	0.20	0.10	0.10	0.43	0.52	0.12	0.31	0.37	0.40	0.34	0.37
O2'	0.24	0.09	0.38	0.42	0.12	0.37	0.10	0.36	0.14	0.14	0.12	0.09	0.45	0.52	0.18	0.26	0.30	0.33	0.26	0.28
O3'	0.10	0.15	0.22	0.23	0.28	0.19	0.21	0.16	0.13	0.10	0.25	0.12	0.32	0.32	0.35	0.12	0.12	0.13	0.13	0.11
O4'	0.22	0.10	0.32	0.34	0.14	0.30	0.11	0.28	0.14	0.14	0.13	0.10	0.38	0.41	0.20	0.23	0.24	0.25	0.21	0.22
O5'	0.30	0.25	0.33	0.32	0.30	0.32	0.27	0.31	0.25	0.26	0.28	0.26	0.40	0.35	0.35	0.31	0.31	0.32	0.34	0.32
OP1	0.33	0.31	0.31	0.29	0.41	0.33	0.38	0.34	0.34	0.32	0.36	0.31	0.38	0.30	0.46	0.35	0.37	0.38	0.43	0.40
OP2	0.47	0.47	0.45	0.45	0.52	0.46	0.51	0.48	0.48	0.47	0.50	0.46	0.48	0.44	0.56	0.48	0.52	0.53	0.57	0.54
P	0.33	0.31	0.33	0.32	0.37	0.34	0.35	0.34	0.32	0.31	0.34	0.32	0.40	0.33	0.43	0.35	0.36	0.37	0.41	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.09	0.10	0.14	0.11
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.06	0.08	0.05
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.13	0.17	0.21	0.17
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.13	0.17	0.20	0.17
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.08	0.05	0.07	0.04	0.05	0.02	0.10	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.11	0.13	0.14	0.13
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.08	0.09	0.12	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.11	0.14	0.18	0.14
O2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.07	0.08	0.13	0.09
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.02	0.04	0.06	0.00	0.04	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.07	0.03	0.06	0.08	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.09	0.07
O4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.14	0.19	0.23	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.01	0.04	0.00	0.05	0.06	0.08	0.05
O5'	0.04	0.09	0.05	0.06	0.13	0.01	0.13	0.01	0.11	0.08	0.11	0.07	0.04	0.07	0.14	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.10	0.06	0.08	0.17	0.05	0.17	0.06	0.13	0.09	0.14	0.08	0.07	0.09	0.19	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.14	0.08	0.08	0.21	0.02	0.20	0.01	0.14	0.12	0.18	0.13	0.05	0.09	0.23	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.11	0.05	0.06	0.17	0.01	0.17	0.01	0.13	0.09	0.14	0.09	0.04	0.07	0.19	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00