Doublet Group distance statistics: 51884

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 1, 10, 5, 9, 5, 11, 3, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.017, 0.020, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.020 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.018, 0.023, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.023 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.018, 0.024, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.028, 0.035, 0.043, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.031, 0.038, 0.046, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.038 std_dev=0.008
N4	A	0, 0.025, 0.047, 0.069, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.047 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.132, 0.158, 0.184, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.158 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.041, 0.112, 0.184, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.112 std_dev=0.072
C2'	A	0, 0.083, 0.182, 0.280, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.182 std_dev=0.098
C4'	A	0, 0.289, 0.394, 0.500, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.394 std_dev=0.106
C3'	A	0, 0.315, 0.434, 0.554, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.434 std_dev=0.119
O2'	A	0, 0.293, 0.467, 0.642, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.467 std_dev=0.175
O3'	A	0, 0.580, 0.763, 0.945, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.763 std_dev=0.182
C5'	A	0, 0.437, 0.624, 0.810, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.624 std_dev=0.186
N1	B	0, 0.246, 0.462, 0.677, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.462 std_dev=0.215
C1'	B	0, 0.135, 0.361, 0.586, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.361 std_dev=0.225
O2'	B	0, 0.420, 0.666, 0.912, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.666 std_dev=0.246
C2	B	0, 0.372, 0.621, 0.870, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.621 std_dev=0.249
O2	B	0, 0.355, 0.604, 0.854, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.604 std_dev=0.249
O4'	B	0, 0.195, 0.445, 0.694, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.445 std_dev=0.250
O5'	A	0, 0.525, 0.790, 1.055, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.790 std_dev=0.265
C2'	B	0, 0.297, 0.570, 0.844, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.570 std_dev=0.273
C6	B	0, 0.292, 0.569, 0.846, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.569 std_dev=0.277
OP2	B	0, 0.336, 0.655, 0.973, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.655 std_dev=0.319
C4'	B	0, 0.325, 0.650, 0.975, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.650 std_dev=0.325
P	A	0, 0.796, 1.123, 1.451, 1.778 max_d=1.778 avg_d=1.123 std_dev=0.328
OP1	A	0, 1.068, 1.406, 1.745, 1.990 max_d=1.990 avg_d=1.406 std_dev=0.339
C5	B	0, 0.436, 0.776, 1.115, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.776 std_dev=0.340
N3	B	0, 0.534, 0.878, 1.222, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.878 std_dev=0.344
C3'	B	0, 0.404, 0.753, 1.101, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.753 std_dev=0.348
P	B	0, 0.428, 0.784, 1.139, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.784 std_dev=0.355
C5'	B	0, 0.315, 0.684, 1.053, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.684 std_dev=0.369
OP2	A	0, 1.065, 1.442, 1.818, 2.185 max_d=2.185 avg_d=1.442 std_dev=0.377
O5'	B	0, 0.260, 0.640, 1.021, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.640 std_dev=0.380
C4	B	0, 0.583, 0.972, 1.361, 2.033 max_d=2.033 avg_d=0.972 std_dev=0.389
O3'	B	0, 0.626, 1.029, 1.432, 1.856 max_d=1.856 avg_d=1.029 std_dev=0.403
OP1	B	0, 0.701, 1.138, 1.575, 2.248 max_d=2.248 avg_d=1.138 std_dev=0.437
O4	B	0, 0.723, 1.211, 1.699, 2.506 max_d=2.506 avg_d=1.211 std_dev=0.488

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.06	0.05
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02	0.08	0.08	0.10	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.09	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.05	0.03
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.09	0.03	0.05	0.05	0.08	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.13	0.13	0.14	0.13
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.15	0.14	0.14	0.13
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.05	0.07	0.11	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.13	0.11	0.09	0.09
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.07	0.07	0.07	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.02	0.10	0.11	0.13	0.10
N4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.14	0.15	0.17	0.15
O2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.10	0.02	0.07	0.08	0.10	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.06	0.04	0.09	0.00	0.03	0.03	0.03	0.07	0.04	0.03
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.09	0.03	0.06	0.06	0.10	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.08	0.07
O4'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.11	0.09
O5'	0.03	0.08	0.03	0.03	0.13	0.01	0.15	0.01	0.13	0.07	0.10	0.14	0.07	0.03	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.08	0.07	0.08	0.13	0.04	0.14	0.03	0.11	0.07	0.11	0.15	0.08	0.07	0.12	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.10	0.05	0.05	0.14	0.03	0.14	0.01	0.09	0.07	0.13	0.17	0.10	0.04	0.08	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.03	0.04	0.13	0.02	0.13	0.01	0.09	0.06	0.10	0.15	0.08	0.03	0.07	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.11	0.11	0.17	0.12	0.16	0.13	0.14	0.14	0.16	0.14	0.11	0.10	0.18	0.14	0.14	0.16	0.13	0.13
C2	0.14	0.15	0.12	0.12	0.17	0.14	0.16	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15	0.12	0.11	0.18	0.15	0.15	0.17	0.14	0.14
C2'	0.13	0.15	0.11	0.11	0.16	0.14	0.15	0.15	0.14	0.14	0.16	0.15	0.11	0.11	0.18	0.15	0.15	0.17	0.14	0.14
C3'	0.13	0.15	0.11	0.11	0.17	0.14	0.15	0.15	0.13	0.13	0.16	0.15	0.11	0.10	0.18	0.15	0.15	0.17	0.14	0.15
C4	0.13	0.14	0.11	0.11	0.16	0.12	0.15	0.12	0.15	0.14	0.16	0.14	0.10	0.09	0.17	0.13	0.14	0.16	0.13	0.13
C4'	0.12	0.13	0.09	0.09	0.17	0.12	0.15	0.13	0.13	0.13	0.16	0.12	0.10	0.09	0.19	0.14	0.13	0.15	0.13	0.13
C5	0.13	0.14	0.11	0.11	0.16	0.12	0.15	0.13	0.14	0.14	0.15	0.12	0.11	0.10	0.17	0.13	0.14	0.15	0.14	0.13
C5'	0.12	0.13	0.10	0.10	0.17	0.12	0.15	0.13	0.14	0.13	0.16	0.12	0.11	0.09	0.19	0.14	0.14	0.15	0.14	0.14
C6	0.13	0.14	0.11	0.11	0.16	0.12	0.16	0.12	0.15	0.14	0.16	0.13	0.11	0.10	0.18	0.13	0.13	0.15	0.14	0.13
N1	0.13	0.14	0.11	0.11	0.16	0.12	0.15	0.13	0.14	0.14	0.16	0.13	0.10	0.10	0.18	0.14	0.14	0.16	0.13	0.13
N3	0.15	0.16	0.13	0.12	0.17	0.14	0.16	0.14	0.16	0.15	0.17	0.16	0.12	0.12	0.18	0.15	0.15	0.17	0.15	0.14
N4	0.13	0.16	0.11	0.11	0.17	0.12	0.16	0.12	0.15	0.15	0.17	0.15	0.10	0.10	0.18	0.13	0.14	0.16	0.14	0.13
O2	0.16	0.16	0.13	0.14	0.17	0.16	0.17	0.16	0.16	0.16	0.17	0.16	0.13	0.13	0.18	0.17	0.16	0.19	0.15	0.16
O2'	0.14	0.15	0.12	0.12	0.17	0.14	0.15	0.15	0.14	0.14	0.16	0.15	0.12	0.12	0.18	0.15	0.15	0.17	0.14	0.15
O3'	0.14	0.15	0.11	0.12	0.17	0.15	0.15	0.16	0.14	0.14	0.17	0.16	0.12	0.11	0.19	0.16	0.17	0.18	0.16	0.17
O4'	0.13	0.15	0.10	0.10	0.18	0.12	0.17	0.12	0.15	0.14	0.17	0.13	0.10	0.09	0.20	0.13	0.13	0.15	0.14	0.13
O5'	0.13	0.14	0.11	0.11	0.17	0.13	0.16	0.14	0.14	0.13	0.16	0.13	0.11	0.11	0.20	0.14	0.14	0.15	0.15	0.15
OP1	0.14	0.14	0.11	0.12	0.18	0.14	0.17	0.15	0.15	0.14	0.16	0.13	0.11	0.11	0.20	0.15	0.16	0.17	0.17	0.17
OP2	0.15	0.15	0.13	0.14	0.18	0.15	0.17	0.16	0.15	0.15	0.17	0.13	0.13	0.13	0.20	0.16	0.16	0.17	0.18	0.18
P	0.12	0.13	0.11	0.11	0.17	0.13	0.16	0.14	0.14	0.13	0.16	0.11	0.11	0.10	0.19	0.14	0.14	0.15	0.15	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.06	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.06	0.06	0.10	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.08	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.07	0.04	0.03
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.04	0.06	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.08	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.08	0.11	0.15	0.11
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.08	0.11	0.14	0.12
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.07	0.08	0.11	0.09
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.06	0.09	0.07
N3	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.07	0.09	0.13	0.09
O2	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.05	0.06	0.10	0.07
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.05	0.03	0.03	0.08	0.03	0.03
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.06	0.02	0.05	0.08	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.12	0.09	0.07
O4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.02	0.09	0.13	0.17	0.13
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.07	0.05
O5'	0.03	0.06	0.02	0.03	0.08	0.01	0.08	0.01	0.07	0.05	0.07	0.05	0.03	0.05	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.06	0.07	0.08	0.11	0.05	0.11	0.04	0.08	0.06	0.09	0.06	0.08	0.12	0.13	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.10	0.04	0.05	0.15	0.02	0.14	0.01	0.11	0.09	0.13	0.10	0.03	0.09	0.17	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.08	0.03	0.04	0.11	0.01	0.12	0.01	0.09	0.07	0.09	0.07	0.03	0.07	0.13	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00