Doublet Group distance statistics: 51885

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 4, 3, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.013 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.015, 0.037, 0.058, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.037 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.016, 0.038, 0.060, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.038 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.034, 0.149, 0.263, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.149 std_dev=0.115
C2'	A	0, 0.069, 0.197, 0.325, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.197 std_dev=0.128
N3	B	0, 0.236, 0.380, 0.524, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.380 std_dev=0.144
C2	B	0, 0.197, 0.348, 0.499, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.348 std_dev=0.151
O2'	A	0, 0.100, 0.257, 0.414, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.257 std_dev=0.157
C4'	A	0, 0.069, 0.238, 0.407, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.238 std_dev=0.169
O2	B	0, 0.168, 0.353, 0.539, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.353 std_dev=0.185
C3'	A	0, 0.104, 0.296, 0.489, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.296 std_dev=0.193
C3'	B	0, 0.228, 0.428, 0.627, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.428 std_dev=0.199
N1	B	0, 0.214, 0.415, 0.616, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.415 std_dev=0.201
C4'	B	0, 0.219, 0.422, 0.625, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.422 std_dev=0.203
C2'	B	0, 0.219, 0.423, 0.627, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.423 std_dev=0.204
C1'	B	0, 0.206, 0.411, 0.617, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.411 std_dev=0.206
O4'	B	0, 0.220, 0.430, 0.640, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.430 std_dev=0.210
O3'	B	0, 0.268, 0.485, 0.701, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.485 std_dev=0.217
O4	B	0, 0.273, 0.506, 0.739, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.506 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.219, 0.457, 0.696, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.457 std_dev=0.238
C5'	B	0, 0.232, 0.472, 0.711, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.472 std_dev=0.240
O2'	B	0, 0.208, 0.464, 0.721, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.464 std_dev=0.256
O5'	A	0, 0.140, 0.403, 0.667, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.403 std_dev=0.263
O3'	A	0, 0.186, 0.458, 0.731, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.458 std_dev=0.273
C5'	A	0, 0.111, 0.394, 0.677, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.394 std_dev=0.283
OP2	A	0, 0.159, 0.460, 0.761, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.460 std_dev=0.301
P	A	0, 0.161, 0.465, 0.768, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.465 std_dev=0.304
C6	B	0, 0.244, 0.549, 0.855, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.549 std_dev=0.306
C5	B	0, 0.260, 0.573, 0.886, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.573 std_dev=0.313
O5'	B	0, 0.199, 0.546, 0.894, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.546 std_dev=0.348
OP1	A	0, 0.180, 0.539, 0.898, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.539 std_dev=0.359
P	B	0, 0.272, 0.692, 1.113, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.692 std_dev=0.421
OP1	B	0, 0.312, 0.748, 1.183, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.748 std_dev=0.435
OP2	B	0, 0.303, 0.776, 1.248, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.776 std_dev=0.473

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.07	0.09	0.05	0.04
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.03	0.09	0.08	0.08	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.04	0.03	0.10	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.07	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.11	0.06	0.08	0.10	0.08	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.12	0.12	0.14	0.12
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.04	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.03	0.01
C5	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.03	0.12	0.12	0.13	0.12
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.06	0.10	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04	0.10	0.09	0.08	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.09	0.08	0.06	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.11	0.10	0.11	0.09
N4	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.03	0.12	0.14	0.16	0.13
O2	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.10	0.04	0.08	0.08	0.07	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05	0.05	0.01	0.06	0.03	0.12	0.00	0.05	0.05	0.03	0.07	0.05	0.03
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.12	0.02	0.15	0.02	0.13	0.05	0.08	0.13	0.10	0.05	0.00	0.02	0.11	0.07	0.10	0.08
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.00	0.10	0.11	0.05	0.06
O5'	0.07	0.09	0.03	0.05	0.12	0.01	0.12	0.01	0.10	0.09	0.11	0.12	0.08	0.03	0.11	0.10	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.08	0.08	0.07	0.12	0.08	0.12	0.09	0.09	0.08	0.10	0.14	0.08	0.07	0.07	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.08	0.07	0.07	0.14	0.03	0.13	0.01	0.08	0.06	0.11	0.16	0.07	0.05	0.10	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.03	0.04	0.12	0.01	0.12	0.01	0.08	0.06	0.09	0.13	0.06	0.03	0.08	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.11	0.15	0.15	0.17	0.15	0.13	0.15	0.11	0.11	0.15	0.12	0.16	0.17	0.23	0.16	0.16	0.15	0.22	0.16
C2	0.13	0.08	0.16	0.15	0.12	0.16	0.08	0.16	0.08	0.09	0.13	0.09	0.17	0.17	0.18	0.17	0.15	0.14	0.20	0.16
C2'	0.13	0.10	0.15	0.14	0.18	0.14	0.13	0.14	0.09	0.09	0.16	0.09	0.16	0.17	0.26	0.15	0.15	0.15	0.22	0.16
C3'	0.11	0.13	0.12	0.12	0.23	0.12	0.18	0.11	0.12	0.11	0.20	0.12	0.13	0.14	0.30	0.13	0.11	0.12	0.19	0.12
C4	0.14	0.07	0.18	0.16	0.10	0.16	0.07	0.15	0.09	0.09	0.11	0.08	0.19	0.17	0.14	0.17	0.17	0.16	0.23	0.18
C4'	0.11	0.13	0.10	0.10	0.22	0.11	0.19	0.10	0.14	0.11	0.20	0.15	0.11	0.13	0.29	0.12	0.11	0.13	0.19	0.12
C5	0.15	0.09	0.18	0.18	0.13	0.16	0.10	0.16	0.11	0.11	0.13	0.10	0.18	0.19	0.18	0.17	0.19	0.18	0.26	0.20
C5'	0.10	0.16	0.08	0.08	0.25	0.09	0.22	0.08	0.17	0.13	0.22	0.18	0.11	0.12	0.32	0.11	0.09	0.13	0.18	0.10
C6	0.15	0.10	0.17	0.17	0.16	0.16	0.13	0.15	0.12	0.11	0.15	0.11	0.17	0.19	0.21	0.16	0.18	0.17	0.25	0.19
N1	0.14	0.10	0.16	0.16	0.15	0.15	0.11	0.15	0.10	0.10	0.14	0.11	0.16	0.17	0.20	0.16	0.16	0.15	0.22	0.17
N3	0.13	0.08	0.17	0.16	0.10	0.16	0.07	0.16	0.08	0.09	0.11	0.09	0.19	0.17	0.15	0.17	0.16	0.15	0.21	0.17
N4	0.15	0.08	0.19	0.17	0.08	0.16	0.07	0.16	0.10	0.10	0.10	0.11	0.22	0.17	0.11	0.18	0.19	0.17	0.25	0.20
O2	0.13	0.08	0.16	0.16	0.12	0.16	0.08	0.16	0.08	0.08	0.13	0.09	0.18	0.18	0.17	0.17	0.15	0.14	0.18	0.15
O2'	0.14	0.10	0.16	0.16	0.18	0.16	0.13	0.16	0.10	0.10	0.16	0.10	0.17	0.18	0.26	0.17	0.17	0.16	0.23	0.18
O3'	0.12	0.16	0.12	0.12	0.28	0.13	0.23	0.12	0.16	0.13	0.24	0.14	0.14	0.14	0.37	0.13	0.10	0.11	0.17	0.11
O4'	0.14	0.13	0.13	0.13	0.19	0.13	0.16	0.13	0.14	0.13	0.17	0.16	0.13	0.15	0.25	0.15	0.14	0.15	0.21	0.15
O5'	0.12	0.16	0.15	0.15	0.25	0.13	0.22	0.11	0.16	0.13	0.22	0.19	0.18	0.19	0.32	0.12	0.09	0.11	0.18	0.11
OP1	0.14	0.21	0.13	0.14	0.32	0.14	0.31	0.13	0.25	0.19	0.26	0.22	0.16	0.16	0.38	0.16	0.14	0.18	0.22	0.15
OP2	0.16	0.21	0.17	0.16	0.30	0.16	0.29	0.15	0.24	0.19	0.25	0.22	0.19	0.19	0.34	0.17	0.13	0.16	0.18	0.13
P	0.12	0.18	0.12	0.12	0.27	0.12	0.25	0.10	0.20	0.16	0.23	0.22	0.16	0.16	0.32	0.13	0.10	0.15	0.19	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.07	0.09	0.12	0.08
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.01	0.03	0.18	0.20	0.30	0.22
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.10	0.02	0.04	0.12	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.15	0.12	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.14	0.00	0.18	0.02	0.16	0.07	0.09	0.08	0.02	0.01	0.15	0.01	0.04	0.17	0.10	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.14	0.00	0.10	0.01	0.19	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.16	0.00	0.05	0.33	0.39	0.49	0.40
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.12	0.04	0.05	0.06	0.06	0.02	0.12	0.00	0.01	0.09	0.03	0.02
C5	0.03	0.01	0.09	0.18	0.01	0.13	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.21	0.02	0.06	0.34	0.40	0.47	0.40
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.19	0.00	0.22	0.00	0.18	0.08	0.13	0.03	0.05	0.02	0.22	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02
C6	0.03	0.01	0.10	0.16	0.02	0.12	0.01	0.18	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.19	0.03	0.05	0.27	0.30	0.32	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.17	0.18	0.24	0.19
N3	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.26	0.30	0.41	0.32
O2	0.05	0.01	0.12	0.08	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.18	0.11	0.02	0.05	0.13	0.13	0.25	0.17
O2'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.05	0.06	0.07	0.05	0.08	0.02	0.08	0.18	0.00	0.04	0.05	0.05	0.03	0.12	0.09	0.04
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.16	0.02	0.21	0.02	0.19	0.07	0.09	0.11	0.04	0.00	0.18	0.02	0.06	0.23	0.13	0.13
O4	0.03	0.01	0.06	0.15	0.00	0.12	0.02	0.22	0.03	0.02	0.01	0.02	0.05	0.18	0.00	0.06	0.36	0.45	0.57	0.46
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.03	0.05	0.05	0.02	0.06	0.00	0.04	0.05	0.08	0.07
O5'	0.07	0.18	0.05	0.04	0.33	0.01	0.34	0.01	0.27	0.17	0.26	0.13	0.03	0.06	0.36	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.20	0.15	0.17	0.39	0.09	0.40	0.06	0.30	0.18	0.30	0.13	0.12	0.23	0.45	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.30	0.12	0.10	0.49	0.03	0.47	0.01	0.32	0.24	0.41	0.25	0.09	0.13	0.57	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.22	0.07	0.09	0.40	0.02	0.40	0.02	0.29	0.19	0.32	0.17	0.04	0.13	0.46	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00