Doublet Group distance statistics: 51888

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 14, 28, 8, 4, 1, 3, 8, 5, 6, 4, 6, 4, 3, 3, 1, 1, 1, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.015, 0.024, 0.034, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.024 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.020 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.030, 0.056, 0.083, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.056 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.030, 0.071, 0.112, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.071 std_dev=0.041
C2'	A	0, 0.040, 0.159, 0.277, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.159 std_dev=0.119
O4'	A	0, 0.017, 0.139, 0.261, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.139 std_dev=0.122
O2'	A	0, 0.071, 0.219, 0.367, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.219 std_dev=0.148
C4'	A	0, 0.042, 0.220, 0.398, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.220 std_dev=0.178
C3'	A	0, 0.044, 0.244, 0.444, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.244 std_dev=0.200
O5'	A	0, 0.116, 0.396, 0.677, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.396 std_dev=0.281
N3	B	0, 0.136, 0.422, 0.708, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.422 std_dev=0.286
C2	B	0, 0.130, 0.417, 0.703, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.417 std_dev=0.286
O3'	A	0, 0.063, 0.352, 0.641, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.352 std_dev=0.289
C5'	A	0, 0.048, 0.370, 0.692, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.370 std_dev=0.322
N2	B	0, 0.113, 0.438, 0.762, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.438 std_dev=0.325
N1	B	0, 0.190, 0.545, 0.900, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.545 std_dev=0.355
P	A	0, 0.153, 0.588, 1.024, 2.048 max_d=2.048 avg_d=0.588 std_dev=0.436
C4	B	0, 0.104, 0.554, 1.004, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.554 std_dev=0.450
OP2	A	0, 0.147, 0.607, 1.066, 2.805 max_d=2.805 avg_d=0.607 std_dev=0.460
C6	B	0, 0.195, 0.683, 1.172, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.683 std_dev=0.489
C5	B	0, 0.117, 0.679, 1.240, 2.112 max_d=2.112 avg_d=0.679 std_dev=0.562
O6	B	0, 0.256, 0.839, 1.422, 2.290 max_d=2.290 avg_d=0.839 std_dev=0.583
N9	B	0, 0.059, 0.672, 1.285, 2.153 max_d=2.153 avg_d=0.672 std_dev=0.613
C1'	B	0, 0.066, 0.684, 1.301, 2.890 max_d=2.890 avg_d=0.684 std_dev=0.617
OP1	A	0, 0.152, 0.815, 1.478, 2.882 max_d=2.882 avg_d=0.815 std_dev=0.663
O2'	B	0, -0.032, 0.632, 1.297, 3.818 max_d=3.818 avg_d=0.632 std_dev=0.664
C2'	B	0, -0.004, 0.692, 1.389, 3.789 max_d=3.789 avg_d=0.692 std_dev=0.697
N7	B	0, 0.062, 0.840, 1.618, 2.879 max_d=2.879 avg_d=0.840 std_dev=0.778
C8	B	0, 0.016, 0.821, 1.626, 2.837 max_d=2.837 avg_d=0.821 std_dev=0.805
O4'	B	0, 0.036, 0.879, 1.722, 4.192 max_d=4.192 avg_d=0.879 std_dev=0.843
C3'	B	0, -0.075, 0.897, 1.869, 5.329 max_d=5.329 avg_d=0.897 std_dev=0.972
C4'	B	0, -0.062, 0.968, 1.999, 5.540 max_d=5.540 avg_d=0.968 std_dev=1.030
O3'	B	0, -0.084, 1.001, 2.086, 6.655 max_d=6.655 avg_d=1.001 std_dev=1.085
C5'	B	0, -0.119, 1.197, 2.512, 6.604 max_d=6.604 avg_d=1.197 std_dev=1.315
O5'	B	0, -0.155, 1.194, 2.543, 6.088 max_d=6.088 avg_d=1.194 std_dev=1.349
P	B	0, -0.264, 1.443, 3.150, 7.109 max_d=7.109 avg_d=1.443 std_dev=1.707
OP2	B	0, -0.248, 1.542, 3.331, 6.517 max_d=6.517 avg_d=1.542 std_dev=1.790
OP1	B	0, -0.295, 1.611, 3.517, 8.859 max_d=8.859 avg_d=1.611 std_dev=1.906

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.07	0.11	0.05
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.03	0.13	0.19	0.23	0.14
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.06	0.10	0.00	0.02	0.01	0.04	0.11	0.10	0.06
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.10	0.01	0.12	0.02	0.12	0.07	0.10	0.11	0.11	0.02	0.01	0.01	0.06	0.13	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04	0.18	0.27	0.32	0.20
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.05	0.06	0.08	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.09	0.07	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.03	0.19	0.26	0.31	0.20
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.08	0.10	0.14	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.11	0.09	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.13	0.03	0.16	0.20	0.23	0.16
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.02	0.11	0.15	0.19	0.12
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.15	0.23	0.29	0.17
N4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.14	0.04	0.19	0.30	0.37	0.23
O2	0.04	0.01	0.10	0.11	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.13	0.05	0.12	0.17	0.22	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.06	0.05	0.10	0.00	0.05	0.05	0.05	0.12	0.09	0.06
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.13	0.03	0.14	0.03	0.13	0.07	0.12	0.14	0.13	0.05	0.00	0.02	0.09	0.19	0.14	0.10
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.07	0.07	0.10	0.07
O5'	0.05	0.13	0.04	0.06	0.18	0.02	0.19	0.01	0.16	0.11	0.15	0.19	0.12	0.05	0.09	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.19	0.11	0.13	0.27	0.09	0.26	0.11	0.20	0.15	0.23	0.30	0.17	0.12	0.19	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.23	0.10	0.10	0.32	0.07	0.31	0.09	0.23	0.19	0.29	0.37	0.22	0.09	0.14	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.14	0.06	0.07	0.20	0.02	0.20	0.02	0.16	0.12	0.17	0.23	0.13	0.06	0.10	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.12	0.34	0.38	0.15	0.34	0.17	0.35	0.14	0.23	0.11	0.21	0.12	0.22	0.20	0.40	0.51	0.27	0.31	0.16	0.41	0.41	0.34
C2	0.21	0.16	0.35	0.37	0.20	0.30	0.24	0.30	0.24	0.26	0.19	0.19	0.16	0.27	0.22	0.37	0.50	0.24	0.27	0.27	0.36	0.37	0.29
C2'	0.15	0.09	0.19	0.20	0.11	0.23	0.12	0.25	0.11	0.14	0.10	0.10	0.09	0.13	0.14	0.27	0.31	0.22	0.21	0.12	0.32	0.34	0.25
C3'	0.17	0.10	0.20	0.23	0.12	0.28	0.13	0.31	0.12	0.15	0.10	0.11	0.10	0.14	0.15	0.29	0.33	0.24	0.28	0.12	0.41	0.44	0.34
C4	0.20	0.17	0.34	0.38	0.20	0.30	0.25	0.31	0.26	0.26	0.21	0.20	0.17	0.28	0.22	0.36	0.53	0.24	0.28	0.30	0.39	0.40	0.31
C4'	0.23	0.10	0.29	0.37	0.13	0.40	0.14	0.42	0.11	0.21	0.09	0.15	0.09	0.18	0.19	0.37	0.50	0.31	0.37	0.13	0.50	0.51	0.43
C5	0.19	0.15	0.32	0.38	0.17	0.30	0.22	0.32	0.23	0.24	0.18	0.19	0.14	0.26	0.20	0.36	0.53	0.24	0.30	0.27	0.42	0.43	0.33
C5'	0.24	0.10	0.28	0.41	0.13	0.43	0.14	0.47	0.12	0.22	0.09	0.15	0.10	0.19	0.19	0.35	0.54	0.33	0.44	0.13	0.59	0.60	0.51
C6	0.19	0.13	0.32	0.38	0.16	0.31	0.20	0.33	0.19	0.23	0.15	0.19	0.13	0.24	0.19	0.36	0.53	0.24	0.31	0.23	0.43	0.43	0.34
N1	0.20	0.13	0.33	0.37	0.17	0.31	0.20	0.32	0.19	0.24	0.15	0.19	0.13	0.24	0.20	0.37	0.51	0.24	0.29	0.22	0.39	0.40	0.32
N3	0.20	0.18	0.34	0.37	0.21	0.29	0.26	0.30	0.27	0.27	0.22	0.20	0.18	0.29	0.23	0.36	0.51	0.24	0.27	0.31	0.36	0.38	0.29
N4	0.20	0.19	0.34	0.38	0.21	0.30	0.27	0.31	0.28	0.27	0.24	0.20	0.18	0.30	0.22	0.36	0.53	0.25	0.28	0.33	0.39	0.40	0.31
O2	0.22	0.16	0.35	0.36	0.22	0.29	0.25	0.30	0.24	0.27	0.19	0.20	0.18	0.28	0.24	0.36	0.47	0.25	0.26	0.26	0.34	0.35	0.28
O2'	0.15	0.11	0.18	0.17	0.12	0.22	0.12	0.23	0.12	0.14	0.11	0.13	0.11	0.13	0.14	0.25	0.26	0.22	0.19	0.12	0.28	0.32	0.23
O3'	0.21	0.15	0.24	0.26	0.17	0.32	0.16	0.36	0.15	0.19	0.15	0.17	0.16	0.17	0.19	0.35	0.33	0.28	0.36	0.15	0.49	0.52	0.42
O4'	0.28	0.14	0.38	0.47	0.16	0.44	0.18	0.46	0.14	0.26	0.12	0.23	0.13	0.24	0.23	0.46	0.61	0.34	0.42	0.16	0.53	0.52	0.46
O5'	0.21	0.10	0.27	0.38	0.13	0.37	0.14	0.41	0.13	0.20	0.10	0.15	0.10	0.18	0.18	0.33	0.52	0.28	0.38	0.14	0.54	0.56	0.45
OP1	0.21	0.13	0.21	0.32	0.14	0.37	0.14	0.43	0.13	0.18	0.13	0.16	0.13	0.16	0.17	0.27	0.43	0.30	0.42	0.13	0.57	0.56	0.48
OP2	0.22	0.16	0.27	0.38	0.17	0.36	0.18	0.41	0.18	0.22	0.17	0.19	0.15	0.21	0.20	0.32	0.52	0.28	0.40	0.20	0.60	0.67	0.51
P	0.21	0.11	0.25	0.38	0.13	0.38	0.14	0.43	0.12	0.20	0.11	0.15	0.10	0.18	0.18	0.30	0.52	0.28	0.41	0.14	0.59	0.61	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.11	0.03	0.13	0.21	0.11
C2	0.03	0.00	0.14	0.11	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.17	0.10	0.19	0.02	0.15	0.34	0.17
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.03	0.09	0.06	0.12	0.16	0.13	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.14	0.08	0.23	0.27	0.18
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.10	0.12	0.11	0.13	0.10	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.15	0.11	0.25	0.20	0.15
C4	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.06	0.22	0.02	0.17	0.33	0.19
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.11	0.06	0.12	0.08	0.10	0.04	0.08	0.02	0.00	0.02	0.08	0.12	0.21	0.08
C5	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.04	0.31	0.02	0.27	0.47	0.31
C5'	0.03	0.11	0.03	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.19	0.12	0.13	0.10	0.20	0.09	0.06	0.05	0.02	0.01	0.18	0.14	0.16	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.10	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.06	0.31	0.01	0.28	0.52	0.32
C8	0.01	0.02	0.06	0.12	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.11	0.10	0.06	0.35	0.03	0.31	0.42	0.32
N1	0.03	0.01	0.12	0.11	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.14	0.08	0.25	0.01	0.20	0.44	0.25
N2	0.04	0.01	0.16	0.13	0.02	0.12	0.02	0.13	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.20	0.21	0.12	0.16	0.02	0.15	0.32	0.14
N3	0.03	0.01	0.13	0.10	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.14	0.15	0.10	0.16	0.02	0.14	0.29	0.14
N7	0.02	0.02	0.05	0.11	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.09	0.05	0.38	0.03	0.37	0.56	0.40
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.22	0.03	0.17	0.27	0.18
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.08	0.09	0.06	0.11	0.11	0.14	0.20	0.14	0.11	0.05	0.00	0.06	0.07	0.07	0.11	0.20	0.34	0.16
O3'	0.07	0.17	0.03	0.01	0.08	0.02	0.07	0.05	0.10	0.10	0.14	0.21	0.15	0.09	0.04	0.06	0.00	0.04	0.15	0.10	0.26	0.27	0.16
O4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.06	0.08	0.12	0.10	0.05	0.02	0.07	0.04	0.00	0.12	0.07	0.15	0.26	0.16
O5'	0.11	0.19	0.14	0.15	0.22	0.02	0.31	0.01	0.31	0.35	0.25	0.16	0.16	0.38	0.22	0.07	0.15	0.12	0.00	0.35	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.08	0.11	0.02	0.08	0.02	0.18	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.11	0.10	0.07	0.35	0.00	0.35	0.62	0.40
OP1	0.13	0.15	0.23	0.25	0.17	0.12	0.27	0.14	0.28	0.31	0.20	0.15	0.14	0.37	0.17	0.20	0.26	0.15	0.02	0.35	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.34	0.27	0.20	0.33	0.21	0.47	0.16	0.52	0.42	0.44	0.32	0.29	0.56	0.27	0.34	0.27	0.26	0.02	0.62	0.02	0.00	0.02
P	0.11	0.17	0.18	0.15	0.19	0.08	0.31	0.01	0.32	0.32	0.25	0.14	0.14	0.40	0.18	0.16	0.16	0.16	0.01	0.40	0.01	0.02	0.00