Doublet Group distance statistics: 51889

back

Distances from reference structure (by RMSD)

5, 6, 6, 4, 0, 2, 2, 1, 3, 4, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.001, 0.017, 0.033, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.009, 0.037, 0.064, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.037 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.013, 0.047, 0.080, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.047 std_dev=0.033
O4'	A	0, -0.004, 0.086, 0.176, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.086 std_dev=0.090
C2'	A	0, -0.004, 0.106, 0.216, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.106 std_dev=0.110
C4'	A	0, 0.015, 0.141, 0.267, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.141 std_dev=0.126
O2'	A	0, -0.002, 0.169, 0.341, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.169 std_dev=0.171
C3'	A	0, 0.020, 0.200, 0.379, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.200 std_dev=0.180
O5'	A	0, 0.075, 0.286, 0.496, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.286 std_dev=0.210
C5'	A	0, -0.001, 0.221, 0.443, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.221 std_dev=0.222
C1'	B	0, 0.047, 0.322, 0.598, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.322 std_dev=0.275
N9	B	0, 0.085, 0.366, 0.647, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.366 std_dev=0.281
C2'	B	0, 0.084, 0.370, 0.656, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.370 std_dev=0.286
C4	B	0, 0.093, 0.400, 0.707, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.400 std_dev=0.307
OP2	A	0, 0.051, 0.359, 0.667, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.359 std_dev=0.308
N3	B	0, 0.062, 0.371, 0.679, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.371 std_dev=0.309
C8	B	0, 0.120, 0.444, 0.767, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.444 std_dev=0.324
P	A	0, 0.037, 0.366, 0.695, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.366 std_dev=0.329
O3'	A	0, 0.017, 0.350, 0.683, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.350 std_dev=0.333
C3'	B	0, 0.088, 0.430, 0.772, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.430 std_dev=0.342
O2'	B	0, 0.075, 0.424, 0.772, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.424 std_dev=0.348
O4'	B	0, 0.065, 0.430, 0.795, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.430 std_dev=0.365
N7	B	0, 0.143, 0.524, 0.905, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.524 std_dev=0.381
O3'	B	0, 0.138, 0.519, 0.901, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.519 std_dev=0.382
OP1	A	0, 0.062, 0.451, 0.840, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.451 std_dev=0.389
C5	B	0, 0.114, 0.509, 0.905, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.509 std_dev=0.396
C4'	B	0, 0.047, 0.454, 0.861, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.454 std_dev=0.407
C2	B	0, 0.055, 0.474, 0.893, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.474 std_dev=0.419
N2	B	0, 0.044, 0.496, 0.948, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.496 std_dev=0.452
C6	B	0, 0.096, 0.619, 1.143, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.619 std_dev=0.524
N1	B	0, 0.067, 0.596, 1.125, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.596 std_dev=0.529
C5'	B	0, 0.060, 0.605, 1.150, 1.842 max_d=1.842 avg_d=0.605 std_dev=0.545
O6	B	0, 0.105, 0.748, 1.391, 2.058 max_d=2.058 avg_d=0.748 std_dev=0.643
O5'	B	0, 0.043, 0.760, 1.476, 2.540 max_d=2.540 avg_d=0.760 std_dev=0.717
P	B	0, 0.124, 1.166, 2.208, 3.479 max_d=3.479 avg_d=1.166 std_dev=1.042
OP2	B	0, 0.182, 1.342, 2.501, 3.666 max_d=3.666 avg_d=1.342 std_dev=1.160
OP1	B	0, 0.086, 1.277, 2.468, 4.059 max_d=4.059 avg_d=1.277 std_dev=1.191

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.06	0.09	0.07	0.06
C2	0.03	0.00	0.06	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.12	0.02	0.08	0.13	0.12	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.06	0.04	0.07	0.08	0.09	0.00	0.02	0.01	0.04	0.12	0.09	0.05
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.02	0.13	0.09	0.13	0.15	0.11	0.02	0.01	0.01	0.05	0.14	0.14	0.05
C4	0.02	0.01	0.07	0.14	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.18	0.03	0.10	0.13	0.14	0.13
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.05	0.06	0.06	0.06	0.03	0.00	0.01	0.09	0.06	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.17	0.04	0.11	0.12	0.13	0.12
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.08	0.05	0.06	0.04	0.01	0.01	0.07	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.04	0.10	0.10	0.10	0.09
N1	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.07	0.10	0.10	0.08
N3	0.02	0.00	0.07	0.13	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.09	0.13	0.14	0.12
N4	0.02	0.02	0.08	0.15	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.20	0.03	0.11	0.14	0.16	0.14
O2	0.05	0.00	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.13	0.04	0.09	0.14	0.12	0.10
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.04	0.06	0.04	0.06	0.03	0.02	0.05	0.05	0.07	0.00	0.05	0.04	0.04	0.14	0.10	0.05
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.18	0.03	0.17	0.04	0.14	0.09	0.16	0.20	0.13	0.05	0.00	0.02	0.08	0.18	0.19	0.09
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.08	0.08	0.07	0.06
O5'	0.06	0.08	0.04	0.05	0.10	0.01	0.11	0.01	0.10	0.07	0.09	0.11	0.09	0.04	0.08	0.08	0.00	0.02	0.05	0.01
OP1	0.09	0.13	0.12	0.14	0.13	0.09	0.12	0.07	0.10	0.10	0.13	0.14	0.14	0.14	0.18	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.07	0.12	0.09	0.14	0.14	0.06	0.13	0.04	0.10	0.10	0.14	0.16	0.12	0.10	0.19	0.07	0.05	0.03	0.00	0.01
P	0.06	0.10	0.05	0.05	0.13	0.02	0.12	0.02	0.09	0.08	0.12	0.14	0.10	0.05	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.23	0.12	0.12	0.16	0.15	0.19	0.13	0.23	0.14	0.25	0.25	0.18	0.17	0.13	0.18	0.15	0.16	0.14	0.25	0.17	0.22	0.13
C2	0.11	0.22	0.10	0.10	0.16	0.12	0.19	0.11	0.23	0.13	0.25	0.25	0.17	0.17	0.12	0.15	0.13	0.13	0.12	0.26	0.13	0.19	0.11
C2'	0.13	0.14	0.13	0.12	0.14	0.12	0.15	0.12	0.15	0.14	0.15	0.14	0.14	0.15	0.14	0.11	0.14	0.15	0.12	0.16	0.11	0.17	0.11
C3'	0.17	0.15	0.20	0.17	0.17	0.15	0.17	0.15	0.16	0.18	0.16	0.14	0.15	0.18	0.18	0.15	0.20	0.20	0.15	0.17	0.15	0.19	0.14
C4	0.11	0.23	0.10	0.11	0.16	0.13	0.20	0.11	0.25	0.14	0.27	0.26	0.17	0.18	0.13	0.14	0.14	0.14	0.12	0.29	0.15	0.21	0.11
C4'	0.18	0.19	0.15	0.14	0.16	0.21	0.18	0.20	0.21	0.16	0.21	0.20	0.15	0.17	0.15	0.19	0.15	0.24	0.17	0.22	0.19	0.23	0.16
C5	0.12	0.24	0.12	0.12	0.17	0.15	0.21	0.14	0.26	0.14	0.28	0.28	0.18	0.18	0.13	0.15	0.16	0.16	0.14	0.29	0.19	0.24	0.14
C5'	0.19	0.20	0.16	0.15	0.16	0.25	0.18	0.24	0.22	0.16	0.23	0.21	0.15	0.18	0.15	0.20	0.16	0.26	0.18	0.24	0.21	0.24	0.18
C6	0.13	0.24	0.13	0.13	0.17	0.16	0.20	0.14	0.25	0.15	0.28	0.27	0.18	0.18	0.14	0.16	0.16	0.17	0.15	0.28	0.19	0.25	0.14
N1	0.12	0.23	0.11	0.11	0.16	0.14	0.19	0.12	0.24	0.14	0.26	0.27	0.18	0.17	0.13	0.16	0.14	0.15	0.13	0.26	0.16	0.22	0.12
N3	0.10	0.22	0.10	0.10	0.16	0.12	0.19	0.11	0.24	0.14	0.26	0.25	0.17	0.18	0.13	0.14	0.13	0.13	0.11	0.27	0.12	0.19	0.11
N4	0.11	0.23	0.10	0.11	0.17	0.13	0.21	0.11	0.26	0.14	0.28	0.26	0.18	0.19	0.13	0.13	0.14	0.14	0.12	0.30	0.14	0.21	0.11
O2	0.11	0.20	0.11	0.10	0.15	0.12	0.18	0.11	0.22	0.13	0.23	0.24	0.15	0.16	0.12	0.17	0.13	0.13	0.12	0.23	0.11	0.17	0.12
O2'	0.12	0.14	0.13	0.12	0.15	0.11	0.16	0.11	0.16	0.15	0.15	0.13	0.14	0.16	0.14	0.14	0.15	0.14	0.11	0.16	0.11	0.17	0.11
O3'	0.25	0.17	0.32	0.28	0.22	0.19	0.22	0.18	0.20	0.26	0.18	0.16	0.20	0.25	0.25	0.32	0.32	0.26	0.20	0.20	0.16	0.22	0.18
O4'	0.18	0.26	0.15	0.14	0.18	0.21	0.22	0.19	0.27	0.16	0.29	0.28	0.20	0.19	0.15	0.25	0.17	0.22	0.18	0.29	0.23	0.27	0.18
O5'	0.18	0.19	0.16	0.14	0.16	0.21	0.18	0.21	0.20	0.16	0.21	0.20	0.16	0.17	0.15	0.17	0.16	0.24	0.17	0.22	0.21	0.23	0.17
OP1	0.23	0.13	0.16	0.16	0.13	0.30	0.14	0.33	0.15	0.17	0.15	0.14	0.12	0.15	0.17	0.20	0.17	0.33	0.22	0.17	0.24	0.22	0.23
OP2	0.18	0.19	0.15	0.13	0.15	0.24	0.17	0.25	0.20	0.15	0.22	0.20	0.15	0.16	0.15	0.17	0.14	0.26	0.17	0.23	0.19	0.21	0.17
P	0.19	0.19	0.16	0.15	0.15	0.24	0.18	0.25	0.22	0.16	0.23	0.21	0.15	0.18	0.15	0.18	0.16	0.26	0.18	0.25	0.22	0.24	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.04	0.05	0.10	0.07
C2	0.04	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.07	0.09	0.02	0.08	0.15	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.06	0.14	0.15	0.09
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.07	0.07	0.07	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.13	0.08	0.19	0.20	0.15
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.03	0.09	0.02	0.08	0.14	0.08
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.03	0.06	0.04	0.07	0.03	0.08	0.02	0.00	0.02	0.05	0.08	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02	0.12	0.02	0.12	0.17	0.12
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.14	0.08	0.05	0.04	0.16	0.07	0.06	0.04	0.01	0.01	0.13	0.09	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.07	0.02	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.08	0.04	0.13	0.01	0.13	0.19	0.12
C8	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.05	0.12	0.02	0.12	0.15	0.12
N1	0.04	0.01	0.06	0.07	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.09	0.06	0.11	0.01	0.11	0.17	0.10
N2	0.06	0.01	0.08	0.07	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.10	0.10	0.09	0.03	0.08	0.15	0.09
N3	0.04	0.01	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.07	0.08	0.02	0.07	0.14	0.08
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.04	0.15	0.02	0.15	0.19	0.16
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.08	0.03	0.07	0.13	0.07
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.08	0.08	0.09	0.06	0.11	0.05	0.12	0.13	0.11	0.07	0.04	0.00	0.04	0.06	0.08	0.11	0.14	0.14	0.07
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.08	0.08	0.09	0.10	0.08	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.17	0.09	0.28	0.30	0.23
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.06	0.10	0.07	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.04	0.12	0.16	0.15
O5'	0.05	0.09	0.09	0.13	0.09	0.02	0.12	0.01	0.13	0.12	0.11	0.09	0.08	0.15	0.08	0.08	0.17	0.11	0.00	0.15	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.06	0.08	0.02	0.05	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.11	0.09	0.04	0.15	0.00	0.16	0.21	0.15
OP1	0.05	0.08	0.14	0.19	0.08	0.08	0.12	0.09	0.13	0.12	0.11	0.08	0.07	0.15	0.07	0.14	0.28	0.12	0.02	0.16	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.15	0.15	0.20	0.14	0.05	0.17	0.02	0.19	0.15	0.17	0.15	0.14	0.19	0.13	0.14	0.30	0.16	0.02	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.08	0.09	0.15	0.08	0.02	0.12	0.02	0.12	0.12	0.10	0.09	0.08	0.16	0.07	0.07	0.23	0.15	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00