Doublet Group distance statistics: 51892

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.010, 0.018, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.033 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.002, 0.021, 0.039, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.014, 0.034, 0.053, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.034 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.022, 0.053, 0.085, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.053 std_dev=0.031
C4	B	0, 0.296, 0.538, 0.780, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.538 std_dev=0.242
N9	B	0, 0.369, 0.633, 0.896, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.633 std_dev=0.263
N3	B	0, 0.244, 0.512, 0.780, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.512 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.376, 0.646, 0.917, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.646 std_dev=0.270
C8	B	0, 0.391, 0.664, 0.937, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.664 std_dev=0.273
N7	B	0, 0.394, 0.671, 0.948, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.671 std_dev=0.277
C2	B	0, 0.366, 0.651, 0.935, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.651 std_dev=0.284
N2	B	0, 0.379, 0.719, 1.058, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.719 std_dev=0.339
C6	B	0, 0.483, 0.855, 1.227, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.855 std_dev=0.372
C1'	B	0, 0.466, 0.838, 1.211, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.838 std_dev=0.373
O4'	A	0, -0.128, 0.247, 0.622, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.247 std_dev=0.375
N1	B	0, 0.457, 0.837, 1.218, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.837 std_dev=0.380
C2'	A	0, -0.133, 0.289, 0.711, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.289 std_dev=0.422
C2'	B	0, 0.255, 0.681, 1.106, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.681 std_dev=0.426
O6	B	0, 0.610, 1.086, 1.561, 1.528 max_d=1.528 avg_d=1.086 std_dev=0.475
O2'	B	0, 0.213, 0.709, 1.206, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.709 std_dev=0.497
O2'	A	0, -0.139, 0.370, 0.879, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.370 std_dev=0.509
C4'	A	0, -0.160, 0.363, 0.886, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.363 std_dev=0.523
OP2	B	0, 0.851, 1.450, 2.048, 1.813 max_d=1.813 avg_d=1.450 std_dev=0.598
O4'	B	0, 0.750, 1.375, 1.999, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.375 std_dev=0.624
C3'	A	0, -0.218, 0.413, 1.043, 1.932 max_d=1.932 avg_d=0.413 std_dev=0.631
C3'	B	0, 0.574, 1.213, 1.853, 1.940 max_d=1.940 avg_d=1.213 std_dev=0.639
C4'	B	0, 0.806, 1.550, 2.294, 2.259 max_d=2.259 avg_d=1.550 std_dev=0.744
O3'	B	0, 0.721, 1.531, 2.341, 2.479 max_d=2.479 avg_d=1.531 std_dev=0.810
O5'	B	0, 0.842, 1.656, 2.470, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.656 std_dev=0.814
P	B	0, 0.643, 1.468, 2.293, 2.313 max_d=2.313 avg_d=1.468 std_dev=0.825
O3'	A	0, -0.185, 0.654, 1.493, 2.655 max_d=2.655 avg_d=0.654 std_dev=0.839
C5'	A	0, -0.345, 0.635, 1.615, 3.017 max_d=3.017 avg_d=0.635 std_dev=0.980
C5'	B	0, 1.171, 2.156, 3.140, 3.170 max_d=3.170 avg_d=2.156 std_dev=0.985
OP1	B	0, 1.246, 2.467, 3.689, 4.039 max_d=4.039 avg_d=2.467 std_dev=1.221
O5'	A	0, -0.568, 0.744, 2.056, 3.948 max_d=3.948 avg_d=0.744 std_dev=1.312
P	A	0, -0.694, 0.960, 2.614, 4.986 max_d=4.986 avg_d=0.960 std_dev=1.654
OP2	A	0, -0.756, 0.905, 2.566, 4.929 max_d=4.929 avg_d=0.905 std_dev=1.661
OP1	A	0, -0.581, 1.454, 3.489, 6.375 max_d=6.375 avg_d=1.454 std_dev=2.035

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.15	0.08
C2	0.03	0.00	0.15	0.15	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.18	0.09	0.08	0.14	0.31	0.14
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.19	0.03	0.11	0.07	0.28	0.00	0.02	0.00	0.06	0.15	0.14	0.08
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.11	0.04	0.14	0.08	0.22	0.02	0.01	0.01	0.09	0.19	0.15	0.08
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.19	0.29	0.49	0.27
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.05	0.07	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.11	0.03
C5	0.02	0.01	0.16	0.09	0.00	0.07	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.14	0.09	0.28	0.39	0.52	0.37
C5'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.13	0.01	0.20	0.00	0.19	0.07	0.07	0.14	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02
C6	0.01	0.00	0.19	0.11	0.01	0.07	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.16	0.12	0.27	0.33	0.40	0.32
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.12	0.16	0.28	0.16
N3	0.03	0.00	0.11	0.14	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.17	0.06	0.10	0.18	0.40	0.17
N4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.02	0.20	0.32	0.54	0.29
O2	0.05	0.00	0.28	0.22	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.29	0.15	0.09	0.14	0.26	0.13
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.07	0.04	0.15	0.04	0.16	0.03	0.08	0.07	0.25	0.00	0.02	0.03	0.04	0.12	0.14	0.07
O3'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.10	0.01	0.14	0.02	0.16	0.05	0.17	0.11	0.29	0.02	0.00	0.01	0.10	0.23	0.22	0.07
O4'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.06	0.02	0.15	0.03	0.01	0.00	0.11	0.12	0.11	0.09
O5'	0.06	0.08	0.06	0.09	0.19	0.02	0.28	0.01	0.27	0.12	0.10	0.20	0.09	0.04	0.10	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.08	0.14	0.15	0.19	0.29	0.06	0.39	0.06	0.33	0.16	0.18	0.32	0.14	0.12	0.23	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.31	0.14	0.15	0.49	0.11	0.52	0.11	0.40	0.28	0.40	0.54	0.26	0.14	0.22	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.14	0.08	0.08	0.27	0.03	0.37	0.02	0.32	0.16	0.17	0.29	0.13	0.07	0.07	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.23	0.09	0.11	0.22	0.16	0.24	0.17	0.25	0.23	0.24	0.22	0.21	0.24	0.22	0.20	0.18	0.22	0.17	0.26	0.21	0.25	0.17
C2	0.14	0.20	0.13	0.14	0.16	0.14	0.18	0.14	0.21	0.15	0.22	0.22	0.16	0.17	0.15	0.26	0.23	0.17	0.19	0.22	0.23	0.25	0.19
C2'	0.11	0.17	0.15	0.13	0.13	0.13	0.14	0.13	0.16	0.11	0.18	0.19	0.14	0.12	0.10	0.16	0.19	0.14	0.20	0.16	0.22	0.27	0.19
C3'	0.14	0.19	0.12	0.10	0.17	0.14	0.19	0.17	0.20	0.16	0.20	0.20	0.18	0.18	0.15	0.11	0.12	0.16	0.16	0.20	0.17	0.25	0.18
C4	0.15	0.22	0.10	0.11	0.17	0.12	0.17	0.15	0.20	0.15	0.22	0.26	0.19	0.15	0.15	0.20	0.20	0.18	0.16	0.21	0.18	0.22	0.14
C4'	0.11	0.19	0.15	0.15	0.17	0.14	0.19	0.16	0.22	0.17	0.21	0.19	0.16	0.19	0.14	0.13	0.17	0.13	0.16	0.23	0.16	0.26	0.16
C5	0.18	0.25	0.07	0.09	0.21	0.13	0.21	0.16	0.23	0.18	0.24	0.28	0.22	0.19	0.19	0.15	0.16	0.21	0.13	0.24	0.15	0.20	0.11
C5'	0.11	0.21	0.23	0.23	0.19	0.15	0.23	0.17	0.26	0.20	0.25	0.21	0.18	0.23	0.16	0.19	0.27	0.12	0.20	0.29	0.17	0.30	0.18
C6	0.19	0.25	0.07	0.09	0.22	0.14	0.23	0.17	0.24	0.21	0.25	0.27	0.23	0.22	0.21	0.15	0.16	0.23	0.14	0.25	0.16	0.21	0.13
N1	0.18	0.23	0.09	0.10	0.20	0.14	0.21	0.16	0.23	0.19	0.24	0.25	0.21	0.21	0.19	0.20	0.19	0.20	0.16	0.25	0.19	0.23	0.15
N3	0.13	0.20	0.13	0.13	0.15	0.13	0.16	0.14	0.19	0.13	0.20	0.23	0.16	0.14	0.13	0.25	0.23	0.16	0.20	0.20	0.23	0.25	0.19
N4	0.14	0.21	0.10	0.11	0.16	0.12	0.15	0.14	0.18	0.13	0.21	0.26	0.18	0.13	0.14	0.20	0.20	0.18	0.16	0.19	0.18	0.22	0.15
O2	0.14	0.16	0.19	0.18	0.13	0.16	0.16	0.14	0.19	0.13	0.19	0.15	0.12	0.15	0.13	0.31	0.27	0.15	0.24	0.22	0.29	0.28	0.24
O2'	0.14	0.18	0.20	0.17	0.11	0.13	0.12	0.14	0.15	0.10	0.18	0.21	0.15	0.10	0.10	0.21	0.25	0.20	0.21	0.15	0.23	0.28	0.20
O3'	0.33	0.37	0.24	0.19	0.39	0.23	0.42	0.26	0.42	0.39	0.40	0.33	0.37	0.42	0.37	0.20	0.15	0.31	0.26	0.43	0.24	0.37	0.29
O4'	0.20	0.31	0.13	0.15	0.29	0.17	0.33	0.18	0.37	0.29	0.35	0.30	0.27	0.33	0.26	0.18	0.18	0.19	0.20	0.39	0.21	0.30	0.20
O5'	0.04	0.16	0.16	0.17	0.11	0.14	0.15	0.17	0.19	0.09	0.20	0.18	0.11	0.14	0.07	0.14	0.25	0.14	0.12	0.22	0.13	0.23	0.10
OP1	0.13	0.18	0.25	0.27	0.13	0.20	0.16	0.26	0.21	0.10	0.21	0.20	0.13	0.14	0.09	0.23	0.42	0.28	0.15	0.24	0.16	0.23	0.11
OP2	0.15	0.21	0.27	0.30	0.18	0.18	0.19	0.18	0.20	0.16	0.21	0.23	0.19	0.17	0.15	0.28	0.39	0.15	0.23	0.21	0.23	0.28	0.20
P	0.08	0.18	0.20	0.21	0.13	0.15	0.16	0.19	0.21	0.10	0.21	0.20	0.13	0.14	0.09	0.18	0.30	0.18	0.14	0.24	0.14	0.23	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.20	0.03	0.25	0.25	0.20
C2	0.03	0.00	0.19	0.21	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.28	0.05	0.33	0.01	0.39	0.38	0.33
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.02	0.07	0.02	0.11	0.09	0.16	0.22	0.18	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.10	0.11	0.19	0.09
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.13	0.00	0.13	0.02	0.16	0.15	0.20	0.24	0.19	0.13	0.07	0.01	0.01	0.01	0.18	0.16	0.12	0.25	0.16
C4	0.01	0.01	0.10	0.13	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.15	0.03	0.32	0.01	0.37	0.35	0.31
C4'	0.00	0.08	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.07	0.07	0.08	0.09	0.07	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.04	0.07	0.13	0.13	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.15	0.01	0.36	0.01	0.41	0.39	0.35
C5'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.12	0.06	0.06	0.04	0.11	0.06	0.04	0.02	0.02	0.01	0.09	0.25	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.16	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.19	0.02	0.38	0.00	0.44	0.42	0.38
C8	0.01	0.01	0.09	0.15	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.17	0.03	0.33	0.03	0.36	0.33	0.32
N1	0.03	0.00	0.16	0.20	0.02	0.08	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.25	0.03	0.37	0.01	0.43	0.41	0.36
N2	0.03	0.00	0.22	0.24	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.34	0.06	0.32	0.02	0.38	0.38	0.31
N3	0.02	0.01	0.18	0.19	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.24	0.05	0.30	0.01	0.36	0.34	0.29
N7	0.00	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.00	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.16	0.02	0.36	0.03	0.40	0.38	0.35
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.29	0.02	0.33	0.31	0.28
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.09	0.04	0.07	0.04	0.11	0.06	0.16	0.23	0.17	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.10	0.10	0.09	0.18	0.09
O3'	0.02	0.28	0.02	0.01	0.15	0.01	0.15	0.02	0.19	0.17	0.25	0.34	0.24	0.16	0.07	0.02	0.00	0.01	0.38	0.20	0.29	0.44	0.37
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.25	0.01	0.31	0.28	0.25
O5'	0.20	0.33	0.09	0.18	0.32	0.04	0.36	0.01	0.38	0.33	0.37	0.32	0.30	0.36	0.29	0.10	0.38	0.25	0.00	0.40	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.10	0.16	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.10	0.20	0.01	0.40	0.00	0.47	0.45	0.41
OP1	0.25	0.39	0.11	0.12	0.37	0.13	0.41	0.25	0.44	0.36	0.43	0.38	0.36	0.40	0.33	0.09	0.29	0.31	0.02	0.47	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.38	0.19	0.25	0.35	0.13	0.39	0.10	0.42	0.33	0.41	0.38	0.34	0.38	0.31	0.18	0.44	0.28	0.03	0.45	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.33	0.09	0.16	0.31	0.04	0.35	0.01	0.38	0.32	0.36	0.31	0.29	0.35	0.28	0.09	0.37	0.25	0.01	0.41	0.01	0.01	0.00