Doublet Group distance statistics: 51893

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.005, 0.030, 0.054, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.011, 0.046, 0.081, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.046 std_dev=0.035
O2	A	0, 0.004, 0.056, 0.108, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.056 std_dev=0.052
C2	B	0, 0.325, 0.591, 0.858, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.591 std_dev=0.267
N2	B	0, 0.350, 0.703, 1.056, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.703 std_dev=0.353
C4	B	0, 0.173, 0.556, 0.940, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.556 std_dev=0.383
C6	B	0, 0.205, 0.591, 0.977, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.591 std_dev=0.386
C5	B	0, 0.040, 0.436, 0.833, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.436 std_dev=0.396
N1	B	0, 0.272, 0.671, 1.070, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.671 std_dev=0.399
N3	B	0, 0.110, 0.513, 0.916, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.513 std_dev=0.403
O4'	A	0, 0.188, 0.601, 1.013, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.601 std_dev=0.413
C2'	A	0, 0.231, 0.662, 1.093, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.662 std_dev=0.431
N9	B	0, 0.422, 0.857, 1.292, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.857 std_dev=0.435
N7	B	0, 0.083, 0.523, 0.963, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.523 std_dev=0.440
C8	B	0, 0.345, 0.809, 1.274, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.809 std_dev=0.465
O2'	A	0, 0.248, 0.768, 1.288, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.768 std_dev=0.520
O6	B	0, 0.213, 0.743, 1.273, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.743 std_dev=0.530
C1'	B	0, 0.595, 1.206, 1.817, 1.826 max_d=1.826 avg_d=1.206 std_dev=0.611
C4'	A	0, 0.287, 0.902, 1.517, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.902 std_dev=0.615
C3'	A	0, 0.350, 1.035, 1.720, 1.690 max_d=1.690 avg_d=1.035 std_dev=0.685
C2'	B	0, 0.619, 1.346, 2.073, 2.337 max_d=2.337 avg_d=1.346 std_dev=0.727
O2'	B	0, 0.533, 1.268, 2.003, 2.352 max_d=2.352 avg_d=1.268 std_dev=0.735
O5'	A	0, 0.623, 1.413, 2.203, 2.065 max_d=2.065 avg_d=1.413 std_dev=0.790
OP2	B	0, 1.026, 1.919, 2.812, 2.624 max_d=2.624 avg_d=1.919 std_dev=0.893
O3'	A	0, 0.534, 1.516, 2.498, 2.787 max_d=2.787 avg_d=1.516 std_dev=0.982
OP2	A	0, 0.264, 1.293, 2.321, 2.532 max_d=2.532 avg_d=1.293 std_dev=1.028
P	A	0, 0.375, 1.413, 2.452, 2.605 max_d=2.605 avg_d=1.413 std_dev=1.038
C5'	A	0, 0.511, 1.580, 2.649, 2.438 max_d=2.438 avg_d=1.580 std_dev=1.069
O4'	B	0, 1.053, 2.141, 3.229, 3.050 max_d=3.050 avg_d=2.141 std_dev=1.088
C3'	B	0, 1.096, 2.305, 3.515, 3.594 max_d=3.594 avg_d=2.305 std_dev=1.210
OP1	A	0, 0.401, 1.681, 2.960, 3.254 max_d=3.254 avg_d=1.681 std_dev=1.280
P	B	0, 1.327, 2.689, 4.051, 3.982 max_d=3.982 avg_d=2.689 std_dev=1.362
C4'	B	0, 1.268, 2.644, 4.020, 3.918 max_d=3.918 avg_d=2.644 std_dev=1.376
O5'	B	0, 1.532, 3.054, 4.576, 4.483 max_d=4.483 avg_d=3.054 std_dev=1.522
O3'	B	0, 1.298, 2.887, 4.476, 4.643 max_d=4.643 avg_d=2.887 std_dev=1.589
OP1	B	0, 1.705, 3.328, 4.950, 4.881 max_d=4.881 avg_d=3.328 std_dev=1.622
C5'	B	0, 1.724, 3.522, 5.320, 5.187 max_d=5.187 avg_d=3.522 std_dev=1.798

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.00	0.08	0.13	0.12	0.12
C2	0.02	0.00	0.13	0.19	0.01	0.09	0.02	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.20	0.03	0.18	0.22	0.26	0.23
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.05	0.02	0.09	0.03	0.11	0.01	0.10	0.05	0.24	0.01	0.03	0.01	0.13	0.30	0.25	0.20
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.18	0.01	0.23	0.03	0.23	0.11	0.20	0.20	0.28	0.02	0.01	0.01	0.24	0.40	0.37	0.32
C4	0.02	0.01	0.05	0.18	0.00	0.09	0.01	0.17	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.24	0.03	0.22	0.28	0.34	0.30
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.11	0.06	0.09	0.10	0.12	0.09	0.02	0.00	0.03	0.19	0.09	0.07
C5	0.02	0.02	0.09	0.23	0.01	0.11	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.30	0.04	0.23	0.29	0.34	0.31
C5'	0.03	0.14	0.03	0.03	0.17	0.01	0.20	0.00	0.19	0.12	0.16	0.19	0.15	0.10	0.08	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.23	0.02	0.11	0.00	0.19	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.27	0.04	0.21	0.24	0.27	0.26
N1	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.10	0.01	0.15	0.19	0.21	0.20
N3	0.02	0.00	0.10	0.20	0.01	0.09	0.01	0.16	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.22	0.03	0.21	0.25	0.31	0.27
N4	0.02	0.02	0.05	0.20	0.00	0.10	0.02	0.19	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.04	0.27	0.04	0.24	0.30	0.36	0.32
O2	0.06	0.01	0.24	0.28	0.03	0.12	0.02	0.15	0.01	0.03	0.03	0.05	0.00	0.18	0.32	0.08	0.16	0.22	0.25	0.20
O2'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.04	0.09	0.06	0.10	0.07	0.03	0.08	0.04	0.18	0.00	0.08	0.08	0.14	0.41	0.28	0.24
O3'	0.02	0.20	0.03	0.01	0.24	0.02	0.30	0.08	0.27	0.10	0.22	0.27	0.32	0.08	0.00	0.02	0.37	0.71	0.68	0.58
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.04	0.08	0.08	0.02	0.00	0.16	0.14	0.17	0.18
O5'	0.08	0.18	0.13	0.24	0.22	0.03	0.23	0.01	0.21	0.15	0.21	0.24	0.16	0.14	0.37	0.16	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.13	0.22	0.30	0.40	0.28	0.19	0.29	0.10	0.24	0.19	0.25	0.30	0.22	0.41	0.71	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.26	0.25	0.37	0.34	0.09	0.34	0.06	0.27	0.21	0.31	0.36	0.25	0.28	0.68	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.23	0.20	0.32	0.30	0.07	0.31	0.01	0.26	0.20	0.27	0.32	0.20	0.24	0.58	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.13	0.34	0.36	0.26	0.36	0.22	0.36	0.15	0.30	0.12	0.11	0.23	0.25	0.31	0.33	0.38	0.35	0.31	0.13	0.34	0.37	0.30
C2	0.31	0.12	0.30	0.33	0.24	0.31	0.19	0.31	0.11	0.28	0.09	0.13	0.23	0.22	0.30	0.28	0.39	0.34	0.30	0.08	0.30	0.36	0.27
C2'	0.28	0.29	0.25	0.26	0.15	0.32	0.16	0.32	0.21	0.22	0.29	0.46	0.17	0.17	0.21	0.23	0.22	0.33	0.29	0.23	0.32	0.36	0.27
C3'	0.24	0.42	0.18	0.19	0.27	0.30	0.29	0.31	0.36	0.23	0.42	0.55	0.32	0.25	0.23	0.19	0.19	0.30	0.26	0.37	0.32	0.41	0.30
C4	0.32	0.11	0.29	0.32	0.24	0.31	0.19	0.32	0.10	0.29	0.08	0.11	0.22	0.23	0.30	0.26	0.37	0.36	0.32	0.07	0.32	0.37	0.28
C4'	0.27	0.14	0.22	0.22	0.12	0.36	0.10	0.37	0.10	0.18	0.13	0.23	0.11	0.13	0.19	0.26	0.16	0.35	0.27	0.10	0.37	0.40	0.35
C5	0.32	0.11	0.30	0.32	0.24	0.33	0.20	0.33	0.11	0.30	0.09	0.10	0.22	0.24	0.31	0.28	0.35	0.36	0.32	0.08	0.33	0.37	0.28
C5'	0.28	0.16	0.18	0.16	0.15	0.35	0.14	0.38	0.15	0.19	0.16	0.23	0.15	0.16	0.20	0.21	0.13	0.38	0.28	0.15	0.40	0.44	0.40
C6	0.33	0.11	0.31	0.32	0.25	0.34	0.20	0.35	0.12	0.30	0.10	0.10	0.22	0.24	0.31	0.29	0.35	0.36	0.32	0.09	0.34	0.37	0.29
N1	0.33	0.12	0.31	0.34	0.25	0.34	0.21	0.34	0.12	0.29	0.10	0.10	0.23	0.24	0.31	0.30	0.37	0.36	0.31	0.10	0.33	0.36	0.28
N3	0.31	0.11	0.29	0.32	0.24	0.31	0.19	0.31	0.09	0.28	0.08	0.13	0.22	0.22	0.30	0.26	0.38	0.36	0.32	0.07	0.30	0.37	0.28
N4	0.32	0.11	0.28	0.31	0.24	0.31	0.19	0.32	0.09	0.30	0.07	0.10	0.22	0.23	0.31	0.25	0.37	0.37	0.34	0.06	0.32	0.38	0.30
O2	0.30	0.13	0.31	0.34	0.25	0.30	0.19	0.30	0.11	0.28	0.10	0.16	0.24	0.22	0.29	0.28	0.41	0.33	0.30	0.09	0.29	0.36	0.27
O2'	0.29	0.25	0.28	0.30	0.08	0.33	0.06	0.33	0.14	0.19	0.23	0.42	0.11	0.11	0.20	0.28	0.28	0.34	0.30	0.15	0.33	0.35	0.27
O3'	0.39	0.66	0.36	0.40	0.51	0.41	0.53	0.43	0.60	0.42	0.66	0.75	0.59	0.48	0.43	0.40	0.52	0.39	0.36	0.61	0.43	0.56	0.42
O4'	0.34	0.15	0.38	0.40	0.24	0.45	0.22	0.45	0.17	0.28	0.15	0.11	0.20	0.24	0.29	0.41	0.42	0.39	0.35	0.16	0.42	0.40	0.36
O5'	0.22	0.10	0.18	0.15	0.15	0.25	0.14	0.27	0.11	0.20	0.10	0.16	0.11	0.16	0.19	0.17	0.10	0.26	0.22	0.11	0.31	0.38	0.29
OP1	0.51	0.30	0.42	0.41	0.39	0.53	0.40	0.56	0.35	0.49	0.31	0.29	0.33	0.45	0.47	0.43	0.39	0.60	0.56	0.35	0.63	0.66	0.66
OP2	0.37	0.23	0.30	0.27	0.31	0.36	0.31	0.37	0.27	0.38	0.24	0.23	0.26	0.35	0.36	0.28	0.21	0.42	0.39	0.27	0.44	0.48	0.44
P	0.32	0.13	0.25	0.23	0.22	0.34	0.21	0.37	0.16	0.29	0.13	0.14	0.17	0.25	0.28	0.25	0.20	0.39	0.34	0.16	0.43	0.46	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.12	0.09	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.03	0.07	0.30	0.13
C2	0.09	0.00	0.17	0.19	0.01	0.10	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.19	0.24	0.06	0.10	0.01	0.16	0.29	0.16
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.09	0.02	0.08	0.02	0.11	0.07	0.14	0.21	0.16	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.09	0.22	0.09
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.11	0.01	0.10	0.02	0.13	0.09	0.16	0.23	0.17	0.09	0.05	0.02	0.02	0.03	0.07	0.13	0.14	0.17	0.08
C4	0.04	0.01	0.09	0.11	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.14	0.02	0.10	0.01	0.16	0.28	0.16
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.09	0.06	0.16	0.11	0.08	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.06	0.08	0.18	0.07
C5	0.02	0.02	0.08	0.10	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.15	0.04	0.17	0.01	0.25	0.31	0.23
C5'	0.01	0.07	0.02	0.02	0.04	0.01	0.10	0.00	0.11	0.14	0.08	0.12	0.07	0.16	0.04	0.07	0.06	0.01	0.01	0.15	0.12	0.07	0.02
C6	0.04	0.01	0.11	0.13	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.11	0.19	0.03	0.19	0.01	0.28	0.35	0.26
C8	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.09	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.07	0.18	0.03	0.21	0.28	0.19
N1	0.06	0.01	0.14	0.16	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.16	0.22	0.04	0.15	0.01	0.23	0.32	0.22
N2	0.12	0.00	0.21	0.23	0.01	0.16	0.02	0.12	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.26	0.30	0.11	0.08	0.03	0.14	0.28	0.15
N3	0.09	0.00	0.16	0.17	0.00	0.11	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.16	0.20	0.07	0.07	0.01	0.13	0.28	0.15
N7	0.03	0.02	0.07	0.09	0.02	0.08	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.13	0.07	0.22	0.04	0.28	0.32	0.26
N9	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.01	0.09	0.02	0.13	0.28	0.15
O2'	0.01	0.19	0.01	0.02	0.08	0.06	0.08	0.07	0.11	0.06	0.16	0.26	0.16	0.06	0.02	0.00	0.04	0.03	0.05	0.11	0.11	0.24	0.09
O3'	0.02	0.24	0.01	0.02	0.14	0.02	0.15	0.06	0.19	0.11	0.22	0.30	0.20	0.13	0.07	0.04	0.00	0.02	0.10	0.20	0.22	0.20	0.13
O4'	0.00	0.06	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.07	0.04	0.11	0.07	0.07	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.06	0.08	0.32	0.17
O5'	0.06	0.10	0.06	0.07	0.10	0.02	0.17	0.01	0.19	0.18	0.15	0.08	0.07	0.22	0.09	0.05	0.10	0.07	0.00	0.23	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.11	0.20	0.06	0.23	0.00	0.34	0.40	0.32
OP1	0.07	0.16	0.09	0.14	0.16	0.08	0.25	0.12	0.28	0.21	0.23	0.14	0.13	0.28	0.13	0.11	0.22	0.08	0.02	0.34	0.00	0.02	0.01
OP2	0.30	0.29	0.22	0.17	0.28	0.18	0.31	0.07	0.35	0.28	0.32	0.28	0.28	0.32	0.28	0.24	0.20	0.32	0.03	0.40	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.16	0.09	0.08	0.16	0.07	0.23	0.02	0.26	0.19	0.22	0.15	0.15	0.26	0.15	0.09	0.13	0.17	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00