Doublet Group distance statistics: 51895

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.006, 0.025, 0.043, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.004, 0.025, 0.046, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.021
O2'	A	0, 0.010, 0.064, 0.117, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.064 std_dev=0.053
C2'	A	0, 0.025, 0.113, 0.201, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.113 std_dev=0.088
O4'	A	0, 0.028, 0.137, 0.247, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.137 std_dev=0.109
C3'	A	0, 0.062, 0.259, 0.455, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.259 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.054, 0.253, 0.451, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.253 std_dev=0.198
O5'	A	0, 0.101, 0.351, 0.601, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.351 std_dev=0.250
O3'	A	0, 0.106, 0.398, 0.691, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.398 std_dev=0.293
C5'	A	0, 0.068, 0.370, 0.672, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.370 std_dev=0.302
N9	B	0, 0.122, 0.436, 0.750, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.436 std_dev=0.314
N3	B	0, 0.132, 0.455, 0.778, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.455 std_dev=0.323
C4	B	0, 0.123, 0.447, 0.772, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.447 std_dev=0.324
C1'	B	0, 0.134, 0.472, 0.810, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.472 std_dev=0.338
C8	B	0, 0.141, 0.484, 0.826, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.484 std_dev=0.343
C5	B	0, 0.130, 0.474, 0.817, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.474 std_dev=0.343
P	A	0, 0.040, 0.385, 0.729, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.385 std_dev=0.345
C2	B	0, 0.145, 0.496, 0.847, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.496 std_dev=0.351
N1	B	0, 0.139, 0.497, 0.854, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.497 std_dev=0.357
C6	B	0, 0.134, 0.492, 0.851, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.492 std_dev=0.358
N7	B	0, 0.147, 0.508, 0.869, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.508 std_dev=0.361
O6	B	0, 0.147, 0.543, 0.938, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.543 std_dev=0.395
N2	B	0, 0.164, 0.563, 0.963, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.563 std_dev=0.400
OP1	A	0, 0.044, 0.448, 0.851, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.448 std_dev=0.404
OP2	A	0, 0.031, 0.447, 0.863, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.447 std_dev=0.416
C2'	B	0, 0.169, 0.587, 1.006, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.587 std_dev=0.418
O2'	B	0, 0.171, 0.662, 1.153, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.662 std_dev=0.491
O4'	B	0, 0.361, 1.234, 2.107, 1.896 max_d=1.896 avg_d=1.234 std_dev=0.873
C3'	B	0, 0.373, 1.275, 2.176, 1.930 max_d=1.930 avg_d=1.275 std_dev=0.901
C4'	B	0, 0.434, 1.484, 2.534, 2.271 max_d=2.271 avg_d=1.484 std_dev=1.050
O3'	B	0, 0.515, 1.770, 3.026, 2.770 max_d=2.770 avg_d=1.770 std_dev=1.255
O5'	B	0, 0.600, 2.088, 3.576, 3.356 max_d=3.356 avg_d=2.088 std_dev=1.488
C5'	B	0, 0.719, 2.472, 4.225, 3.863 max_d=3.863 avg_d=2.472 std_dev=1.753
OP2	B	0, 0.863, 2.974, 5.085, 4.688 max_d=4.688 avg_d=2.974 std_dev=2.111
P	B	0, 0.901, 3.094, 5.287, 4.833 max_d=4.833 avg_d=3.094 std_dev=2.193
OP1	B	0, 1.151, 3.936, 6.722, 6.039 max_d=6.039 avg_d=3.936 std_dev=2.786

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.16	0.07	0.06
C2	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.16	0.21	0.16	0.13
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.16	0.04	0.02
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.03	0.04	0.06	0.07	0.06	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.03	0.00
C4	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.20	0.23	0.21	0.18
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.15	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.22	0.22	0.19	0.18
C5'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.08	0.04	0.03	0.02	0.00	0.00	0.14	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.20	0.20	0.14	0.14
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.16	0.19	0.12	0.11
N3	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.00	0.17	0.22	0.19	0.15
N4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.01	0.21	0.24	0.24	0.20
O2	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.02	0.14	0.21	0.15	0.12
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.14	0.04	0.02
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.07	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.18	0.14	0.04	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.14	0.05	0.05
O5'	0.10	0.16	0.02	0.10	0.20	0.01	0.22	0.00	0.20	0.16	0.17	0.21	0.14	0.03	0.18	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.16	0.21	0.16	0.16	0.23	0.15	0.22	0.14	0.20	0.19	0.22	0.24	0.21	0.14	0.14	0.14	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.07	0.16	0.04	0.03	0.21	0.03	0.19	0.02	0.14	0.12	0.19	0.24	0.15	0.04	0.04	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.02	0.00	0.18	0.01	0.18	0.01	0.14	0.11	0.15	0.20	0.12	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.10	0.20	0.16	0.09	0.40	0.09	0.54	0.08	0.12	0.09	0.14	0.09	0.10	0.10	0.25	0.13	0.46	0.42	0.08	0.54	0.56	0.55
C2	0.15	0.05	0.22	0.14	0.08	0.27	0.06	0.37	0.04	0.10	0.05	0.04	0.08	0.08	0.10	0.21	0.22	0.41	0.30	0.03	0.36	0.47	0.41
C2'	0.12	0.15	0.18	0.22	0.13	0.50	0.14	0.71	0.15	0.16	0.15	0.20	0.13	0.15	0.13	0.24	0.19	0.50	0.57	0.14	0.78	0.71	0.75
C3'	0.12	0.13	0.12	0.30	0.10	0.60	0.11	0.85	0.12	0.15	0.13	0.19	0.10	0.13	0.11	0.21	0.29	0.52	0.66	0.12	0.92	0.76	0.84
C4	0.12	0.06	0.24	0.19	0.06	0.19	0.04	0.26	0.03	0.06	0.04	0.05	0.07	0.05	0.07	0.23	0.31	0.33	0.19	0.02	0.22	0.41	0.29
C4'	0.11	0.10	0.10	0.35	0.06	0.61	0.07	0.82	0.06	0.12	0.08	0.15	0.07	0.10	0.08	0.17	0.35	0.50	0.61	0.06	0.81	0.66	0.74
C5	0.09	0.05	0.24	0.17	0.05	0.20	0.04	0.28	0.03	0.05	0.04	0.03	0.06	0.03	0.06	0.26	0.26	0.30	0.20	0.01	0.25	0.42	0.31
C5'	0.09	0.09	0.08	0.38	0.03	0.60	0.03	0.81	0.04	0.09	0.07	0.14	0.06	0.07	0.05	0.13	0.43	0.42	0.57	0.04	0.79	0.59	0.69
C6	0.09	0.06	0.24	0.13	0.07	0.26	0.05	0.36	0.05	0.07	0.06	0.06	0.07	0.05	0.07	0.29	0.18	0.34	0.27	0.04	0.34	0.46	0.38
N1	0.12	0.06	0.23	0.13	0.07	0.31	0.06	0.42	0.05	0.09	0.06	0.08	0.06	0.07	0.08	0.26	0.17	0.40	0.32	0.04	0.41	0.49	0.44
N3	0.15	0.07	0.23	0.18	0.09	0.22	0.07	0.30	0.05	0.09	0.06	0.06	0.09	0.07	0.10	0.21	0.29	0.37	0.24	0.04	0.28	0.44	0.34
N4	0.11	0.07	0.24	0.22	0.06	0.14	0.05	0.21	0.04	0.06	0.05	0.07	0.08	0.05	0.07	0.22	0.37	0.30	0.15	0.05	0.15	0.38	0.24
O2	0.17	0.06	0.20	0.14	0.11	0.30	0.09	0.40	0.06	0.12	0.05	0.04	0.09	0.10	0.13	0.18	0.20	0.43	0.34	0.05	0.41	0.51	0.46
O2'	0.12	0.16	0.18	0.25	0.16	0.50	0.18	0.73	0.17	0.20	0.16	0.20	0.14	0.20	0.16	0.23	0.22	0.48	0.61	0.17	0.85	0.78	0.82
O3'	0.13	0.13	0.12	0.40	0.11	0.68	0.14	1.00	0.13	0.19	0.13	0.20	0.10	0.18	0.13	0.18	0.41	0.55	0.80	0.14	1.16	0.93	1.04
O4'	0.11	0.08	0.13	0.20	0.06	0.45	0.06	0.57	0.05	0.10	0.07	0.12	0.06	0.07	0.07	0.22	0.17	0.44	0.42	0.05	0.53	0.52	0.52
O5'	0.19	0.18	0.29	0.33	0.20	0.48	0.19	0.64	0.17	0.21	0.18	0.18	0.19	0.19	0.20	0.36	0.36	0.36	0.52	0.17	0.67	0.61	0.61
OP1	0.08	0.19	0.10	0.30	0.16	0.46	0.15	0.70	0.17	0.12	0.19	0.21	0.17	0.13	0.12	0.20	0.38	0.27	0.50	0.17	0.79	0.55	0.63
OP2	0.04	0.14	0.10	0.15	0.09	0.36	0.08	0.52	0.11	0.05	0.14	0.18	0.12	0.05	0.04	0.20	0.16	0.28	0.35	0.10	0.55	0.42	0.47
P	0.04	0.12	0.09	0.23	0.08	0.41	0.07	0.59	0.09	0.06	0.12	0.16	0.11	0.05	0.05	0.20	0.27	0.28	0.41	0.09	0.62	0.46	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.36	0.10
C2	0.04	0.00	0.20	0.19	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.25	0.18	0.17	0.03	0.11	0.34	0.16
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.09	0.16	0.24	0.20	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.07	0.29	0.04
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.12	0.01	0.09	0.02	0.13	0.06	0.17	0.22	0.17	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.22	0.13	0.11	0.25	0.06
C4	0.01	0.01	0.11	0.12	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.14	0.08	0.14	0.02	0.06	0.34	0.10
C4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.05	0.08	0.06	0.05	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.30	0.06
C5	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.18	0.01	0.08	0.32	0.09
C5'	0.01	0.11	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.06	0.09	0.09	0.14	0.10	0.08	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.06	0.05	0.25	0.02
C6	0.01	0.02	0.10	0.13	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.17	0.07	0.19	0.01	0.08	0.30	0.10
C8	0.02	0.01	0.09	0.06	0.00	0.06	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.11	0.19	0.01	0.11	0.35	0.12
N1	0.03	0.00	0.16	0.17	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.23	0.13	0.18	0.03	0.10	0.33	0.14
N2	0.05	0.00	0.24	0.22	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.18	0.30	0.21	0.17	0.02	0.13	0.36	0.19
N3	0.04	0.00	0.20	0.17	0.01	0.06	0.02	0.10	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.13	0.22	0.17	0.15	0.03	0.08	0.34	0.14
N7	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.03	0.07	0.20	0.01	0.12	0.32	0.11
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.05	0.35	0.09
O2'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.07	0.04	0.03	0.04	0.06	0.07	0.10	0.18	0.13	0.05	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.05	0.07	0.30	0.05
O3'	0.00	0.25	0.01	0.00	0.14	0.01	0.11	0.03	0.17	0.07	0.23	0.30	0.22	0.03	0.03	0.03	0.00	0.00	0.21	0.16	0.16	0.21	0.08
O4'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.11	0.13	0.21	0.17	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.13	0.04	0.10	0.38	0.16
O5'	0.03	0.17	0.14	0.22	0.14	0.02	0.18	0.02	0.19	0.19	0.18	0.17	0.15	0.20	0.12	0.02	0.21	0.13	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.03	0.08	0.13	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.16	0.04	0.20	0.00	0.10	0.27	0.08
OP1	0.05	0.11	0.07	0.11	0.06	0.05	0.08	0.05	0.08	0.11	0.10	0.13	0.08	0.12	0.05	0.07	0.16	0.10	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00
OP2	0.36	0.34	0.29	0.25	0.34	0.30	0.32	0.25	0.30	0.35	0.33	0.36	0.34	0.32	0.35	0.30	0.21	0.38	0.01	0.27	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.16	0.04	0.06	0.10	0.06	0.09	0.02	0.10	0.12	0.14	0.19	0.14	0.11	0.09	0.05	0.08	0.16	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00