Doublet Group distance statistics: 51901

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 3,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.008, 0.013, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.015, 0.025, 0.035, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.015, 0.025, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.015, 0.026, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.017, 0.029, 0.041, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.029 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.038, 0.060, 0.082, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.060 std_dev=0.022
N4	A	0, 0.060, 0.109, 0.159, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.109 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.197, 0.388, 0.579, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.388 std_dev=0.191
C2'	A	0, 0.221, 0.420, 0.620, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.420 std_dev=0.200
O2'	A	0, 0.201, 0.432, 0.663, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.432 std_dev=0.231
C4'	A	0, 0.339, 0.641, 0.943, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.641 std_dev=0.302
C3'	A	0, 0.377, 0.689, 1.000, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.689 std_dev=0.311
N6	B	0, 0.153, 0.469, 0.784, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.469 std_dev=0.316
N7	B	0, 0.274, 0.621, 0.968, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.621 std_dev=0.347
C6	B	0, 0.294, 0.654, 1.015, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.654 std_dev=0.360
C5	B	0, 0.474, 0.850, 1.226, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.850 std_dev=0.376
O3'	A	0, 0.581, 1.026, 1.470, 1.497 max_d=1.497 avg_d=1.026 std_dev=0.444
N1	B	0, 0.576, 1.058, 1.541, 1.622 max_d=1.622 avg_d=1.058 std_dev=0.483
C8	B	0, 0.528, 1.022, 1.515, 1.524 max_d=1.524 avg_d=1.022 std_dev=0.493
C5'	A	0, 0.566, 1.096, 1.625, 1.761 max_d=1.761 avg_d=1.096 std_dev=0.530
C4	B	0, 0.887, 1.461, 2.036, 1.975 max_d=1.975 avg_d=1.461 std_dev=0.574
OP1	A	0, 1.002, 1.630, 2.258, 2.143 max_d=2.143 avg_d=1.630 std_dev=0.628
C2	B	0, 1.000, 1.643, 2.286, 2.291 max_d=2.291 avg_d=1.643 std_dev=0.643
N9	B	0, 0.908, 1.558, 2.207, 2.083 max_d=2.083 avg_d=1.558 std_dev=0.649
O5'	A	0, 0.848, 1.508, 2.168, 2.254 max_d=2.254 avg_d=1.508 std_dev=0.660
N3	B	0, 1.164, 1.894, 2.623, 2.524 max_d=2.524 avg_d=1.894 std_dev=0.729
O4'	B	0, 1.149, 1.881, 2.613, 2.550 max_d=2.550 avg_d=1.881 std_dev=0.732
C4'	B	0, 1.104, 1.842, 2.579, 2.630 max_d=2.630 avg_d=1.842 std_dev=0.738
C3'	B	0, 1.059, 1.800, 2.541, 2.944 max_d=2.944 avg_d=1.800 std_dev=0.741
O3'	B	0, 0.979, 1.833, 2.686, 3.377 max_d=3.377 avg_d=1.833 std_dev=0.854
C1'	B	0, 1.223, 2.112, 3.000, 2.757 max_d=2.757 avg_d=2.112 std_dev=0.888
P	A	0, 1.041, 1.952, 2.863, 2.814 max_d=2.814 avg_d=1.952 std_dev=0.911
C2'	B	0, 1.614, 2.549, 3.484, 3.446 max_d=3.446 avg_d=2.549 std_dev=0.935
OP2	A	0, 1.631, 2.655, 3.680, 3.519 max_d=3.519 avg_d=2.655 std_dev=1.024
C5'	B	0, 1.384, 2.543, 3.701, 4.553 max_d=4.553 avg_d=2.543 std_dev=1.159
O2'	B	0, 2.622, 4.097, 5.573, 5.264 max_d=5.264 avg_d=4.097 std_dev=1.475
O5'	B	0, 1.163, 2.731, 4.300, 6.333 max_d=6.333 avg_d=2.731 std_dev=1.568
P	B	0, 1.840, 4.101, 6.362, 9.299 max_d=9.299 avg_d=4.101 std_dev=2.261
OP2	B	0, 2.006, 4.564, 7.122, 10.576 max_d=10.576 avg_d=4.564 std_dev=2.558
OP1	B	0, 1.864, 4.489, 7.113, 10.679 max_d=10.679 avg_d=4.489 std_dev=2.625

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.11	0.14	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.11	0.02	0.13	0.17	0.25	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.05	0.05	0.11	0.00	0.02	0.01	0.08	0.11	0.16	0.09
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.12	0.00	0.11	0.02	0.10	0.06	0.11	0.13	0.12	0.01	0.00	0.01	0.10	0.14	0.11	0.10
C4	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.14	0.02	0.15	0.24	0.32	0.19
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.06	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.15	0.24	0.30	0.19
C5'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.09	0.03	0.06	0.03	0.02	0.00	0.08	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.11	0.04	0.14	0.20	0.25	0.15
N1	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.12	0.16	0.22	0.12
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.13	0.01	0.15	0.21	0.30	0.17
N4	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.16	0.02	0.16	0.26	0.33	0.21
O2	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.14	0.04	0.12	0.15	0.23	0.11
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.06	0.04	0.06	0.04	0.02	0.04	0.04	0.08	0.00	0.02	0.03	0.05	0.09	0.10	0.05
O3'	0.02	0.11	0.02	0.00	0.14	0.02	0.13	0.03	0.11	0.07	0.13	0.16	0.14	0.02	0.00	0.02	0.12	0.16	0.12	0.12
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.08	0.15	0.07	0.08
O5'	0.08	0.13	0.08	0.10	0.15	0.02	0.15	0.00	0.14	0.12	0.15	0.16	0.12	0.05	0.12	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.17	0.11	0.14	0.24	0.06	0.24	0.08	0.20	0.16	0.21	0.26	0.15	0.09	0.16	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.25	0.16	0.11	0.32	0.04	0.30	0.05	0.25	0.22	0.30	0.33	0.23	0.10	0.12	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.09	0.10	0.19	0.01	0.19	0.01	0.15	0.12	0.17	0.21	0.11	0.05	0.12	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.29	0.29	0.14	0.20	0.18	0.12	0.58	0.13	0.12	0.18	0.30	0.21	0.11	0.19	0.48	0.09	0.09	0.81	1.62	0.58	1.13
C2	0.22	0.22	0.28	0.20	0.14	0.33	0.06	0.80	0.08	0.06	0.10	0.24	0.21	0.07	0.14	0.52	0.14	0.23	1.07	1.94	0.95	1.47
C2'	0.37	0.34	0.32	0.15	0.27	0.12	0.18	0.51	0.18	0.18	0.23	0.36	0.24	0.15	0.27	0.54	0.10	0.12	0.78	1.57	0.62	1.12
C3'	0.41	0.39	0.31	0.14	0.34	0.09	0.29	0.33	0.29	0.28	0.32	0.40	0.33	0.27	0.34	0.49	0.11	0.22	0.56	1.27	0.36	0.83
C4	0.21	0.26	0.30	0.15	0.15	0.27	0.06	0.69	0.08	0.06	0.12	0.26	0.22	0.07	0.14	0.50	0.11	0.21	0.92	1.69	0.70	1.24
C4'	0.32	0.32	0.26	0.12	0.25	0.07	0.21	0.36	0.21	0.20	0.24	0.33	0.26	0.21	0.25	0.41	0.08	0.13	0.54	1.25	0.26	0.77
C5	0.25	0.33	0.30	0.13	0.20	0.13	0.11	0.47	0.12	0.10	0.22	0.31	0.22	0.10	0.18	0.45	0.13	0.08	0.64	1.34	0.31	0.87
C5'	0.27	0.27	0.19	0.14	0.22	0.14	0.19	0.31	0.18	0.20	0.20	0.27	0.24	0.22	0.22	0.28	0.09	0.19	0.42	1.03	0.25	0.56
C6	0.27	0.32	0.29	0.12	0.21	0.11	0.13	0.46	0.14	0.12	0.22	0.32	0.21	0.11	0.20	0.44	0.11	0.06	0.64	1.35	0.32	0.88
N1	0.26	0.28	0.29	0.14	0.19	0.20	0.10	0.61	0.11	0.10	0.17	0.29	0.21	0.09	0.18	0.48	0.09	0.12	0.83	1.63	0.61	1.16
N3	0.20	0.21	0.29	0.21	0.13	0.37	0.05	0.85	0.08	0.05	0.07	0.23	0.22	0.08	0.12	0.53	0.14	0.28	1.12	1.99	1.02	1.53
N4	0.19	0.26	0.31	0.15	0.13	0.31	0.06	0.74	0.09	0.06	0.10	0.25	0.24	0.08	0.12	0.52	0.13	0.28	0.97	1.73	0.75	1.28
O2	0.22	0.19	0.28	0.26	0.13	0.40	0.05	0.91	0.08	0.06	0.08	0.22	0.21	0.07	0.13	0.54	0.20	0.28	1.21	2.15	1.19	1.68
O2'	0.37	0.32	0.34	0.20	0.26	0.18	0.16	0.60	0.16	0.17	0.21	0.36	0.22	0.13	0.26	0.57	0.16	0.13	0.89	1.73	0.77	1.27
O3'	0.50	0.45	0.36	0.17	0.41	0.17	0.35	0.27	0.35	0.35	0.39	0.47	0.38	0.33	0.42	0.54	0.14	0.33	0.52	1.21	0.37	0.78
O4'	0.26	0.30	0.27	0.12	0.21	0.10	0.16	0.45	0.16	0.15	0.21	0.30	0.22	0.16	0.20	0.42	0.09	0.05	0.63	1.38	0.32	0.88
O5'	0.25	0.23	0.17	0.16	0.20	0.16	0.20	0.29	0.19	0.22	0.18	0.24	0.25	0.24	0.21	0.21	0.13	0.19	0.37	0.90	0.32	0.46
OP1	0.19	0.15	0.20	0.23	0.17	0.23	0.21	0.29	0.19	0.25	0.14	0.15	0.26	0.27	0.19	0.23	0.25	0.23	0.28	0.64	0.53	0.26
OP2	0.21	0.18	0.27	0.29	0.20	0.22	0.23	0.28	0.21	0.26	0.17	0.19	0.27	0.29	0.22	0.23	0.26	0.21	0.28	0.61	0.60	0.26
P	0.18	0.16	0.13	0.17	0.14	0.19	0.16	0.25	0.14	0.21	0.11	0.16	0.21	0.23	0.17	0.13	0.16	0.20	0.26	0.66	0.54	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.08	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.34	0.00	0.45	0.01	0.81	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.25	0.34	1.06	1.50	0.82	1.24
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.02	0.08	0.02	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.09	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.09	0.19	0.13
C3'	0.01	0.34	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.02	0.10	0.37	0.20	0.34	0.13	0.32	0.13	0.03	0.01	0.01	0.12	0.09	0.33	0.18
C4	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.18	0.00	0.33	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.02	0.18	0.37	0.62	0.10	0.37
C4'	0.01	0.45	0.02	0.00	0.18	0.00	0.05	0.01	0.15	0.30	0.33	0.43	0.08	0.20	0.05	0.12	0.01	0.00	0.02	0.04	0.22	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.15	0.09	0.12	0.37	0.48	0.13
C5'	0.02	0.81	0.02	0.02	0.33	0.01	0.13	0.00	0.32	0.44	0.62	0.74	0.21	0.30	0.05	0.11	0.04	0.01	0.00	0.06	0.25	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.10	0.00	0.15	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.08	0.17	0.35	0.73	0.24	0.37
C8	0.01	0.01	0.08	0.37	0.00	0.30	0.00	0.44	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.36	0.18	0.68	0.51	1.16	0.81
N1	0.02	0.00	0.09	0.20	0.01	0.33	0.00	0.62	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.11	0.27	0.78	1.26	0.42	0.92
N3	0.03	0.00	0.08	0.34	0.00	0.43	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.25	0.33	0.96	1.24	0.72	1.05
N6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.17	0.12	0.19	0.56	0.53	0.19
N7	0.01	0.01	0.09	0.32	0.00	0.20	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.34	0.09	0.52	0.33	1.16	0.67
N9	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.01	0.12	0.09	0.41	0.18
O2'	0.01	0.27	0.00	0.03	0.12	0.12	0.08	0.11	0.13	0.15	0.21	0.26	0.10	0.11	0.05	0.00	0.07	0.09	0.05	0.10	0.24	0.08
O3'	0.06	0.25	0.05	0.01	0.02	0.01	0.15	0.04	0.08	0.36	0.11	0.25	0.17	0.34	0.14	0.07	0.00	0.03	0.18	0.17	0.65	0.31
O4'	0.00	0.34	0.01	0.01	0.18	0.00	0.09	0.01	0.17	0.18	0.27	0.33	0.12	0.09	0.01	0.09	0.03	0.00	0.09	0.07	0.15	0.15
O5'	0.04	1.06	0.10	0.12	0.37	0.02	0.12	0.00	0.35	0.68	0.78	0.96	0.19	0.52	0.12	0.05	0.18	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	1.50	0.09	0.09	0.62	0.04	0.37	0.06	0.73	0.51	1.26	1.24	0.56	0.33	0.09	0.10	0.17	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.82	0.19	0.33	0.10	0.22	0.48	0.25	0.24	1.16	0.42	0.72	0.53	1.16	0.41	0.24	0.65	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	1.24	0.13	0.18	0.37	0.02	0.13	0.01	0.37	0.81	0.92	1.05	0.19	0.67	0.18	0.08	0.31	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00