Doublet Group distance statistics: 51903

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 3, 2, 2, 4, 2, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.003
C1'	A	0, 0.010, 0.016, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.008, 0.015, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.010 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.018, 0.035, 0.051, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.035 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.021, 0.044, 0.068, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.044 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.043, 0.119, 0.196, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.119 std_dev=0.077
O2'	A	0, 0.032, 0.115, 0.199, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.115 std_dev=0.083
O4'	A	0, 0.038, 0.126, 0.215, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.126 std_dev=0.088
C3'	A	0, 0.094, 0.225, 0.355, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.225 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.093, 0.227, 0.360, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.227 std_dev=0.133
O3'	A	0, 0.133, 0.309, 0.484, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.309 std_dev=0.175
O6	B	0, 0.105, 0.297, 0.489, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.297 std_dev=0.192
C6	B	0, 0.136, 0.334, 0.532, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.334 std_dev=0.198
N1	B	0, 0.163, 0.371, 0.579, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.371 std_dev=0.208
C5'	A	0, 0.143, 0.360, 0.578, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.360 std_dev=0.217
C2	B	0, 0.203, 0.431, 0.659, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.431 std_dev=0.228
C5	B	0, 0.158, 0.407, 0.655, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.407 std_dev=0.249
N2	B	0, 0.211, 0.468, 0.726, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.468 std_dev=0.258
O5'	A	0, 0.151, 0.416, 0.681, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.416 std_dev=0.265
N3	B	0, 0.219, 0.489, 0.759, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.489 std_dev=0.270
C4	B	0, 0.191, 0.480, 0.769, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.480 std_dev=0.289
P	A	0, 0.176, 0.475, 0.774, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.475 std_dev=0.299
N7	B	0, 0.123, 0.445, 0.767, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.445 std_dev=0.322
OP2	A	0, 0.197, 0.527, 0.856, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.527 std_dev=0.330
OP1	A	0, 0.192, 0.540, 0.887, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.540 std_dev=0.347
N9	B	0, 0.158, 0.563, 0.968, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.563 std_dev=0.405
C8	B	0, 0.118, 0.538, 0.959, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.538 std_dev=0.421
O4'	B	0, 0.204, 0.639, 1.075, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.639 std_dev=0.435
C1'	B	0, 0.137, 0.674, 1.212, 2.340 max_d=2.340 avg_d=0.674 std_dev=0.537
C4'	B	0, 0.137, 0.859, 1.580, 3.114 max_d=3.114 avg_d=0.859 std_dev=0.721
C2'	B	0, -0.088, 0.914, 1.915, 4.819 max_d=4.819 avg_d=0.914 std_dev=1.001
C5'	B	0, -0.112, 0.996, 2.104, 5.198 max_d=5.198 avg_d=0.996 std_dev=1.108
C3'	B	0, -0.092, 1.026, 2.145, 5.335 max_d=5.335 avg_d=1.026 std_dev=1.119
O5'	B	0, -0.311, 0.909, 2.129, 5.980 max_d=5.980 avg_d=0.909 std_dev=1.220
O2'	B	0, -0.238, 1.092, 2.421, 6.496 max_d=6.496 avg_d=1.092 std_dev=1.329
O3'	B	0, -0.275, 1.147, 2.569, 6.865 max_d=6.865 avg_d=1.147 std_dev=1.422
P	B	0, -0.829, 1.061, 2.952, 9.118 max_d=9.118 avg_d=1.061 std_dev=1.890
OP2	B	0, -0.919, 1.160, 3.239, 10.003 max_d=10.003 avg_d=1.160 std_dev=2.079
OP1	B	0, -0.881, 1.291, 3.463, 10.409 max_d=10.409 avg_d=1.291 std_dev=2.172

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.06	0.06	0.11	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.09	0.07	0.03
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.06	0.07	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.08	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.10	0.12	0.18	0.12
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.10	0.12	0.17	0.12
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.07	0.04	0.06	0.09	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.08	0.08	0.12	0.09
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.06	0.10	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.08	0.09	0.15	0.10
N4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.11	0.15	0.21	0.14
O2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.04	0.05	0.06	0.10	0.05
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.07	0.00	0.02	0.02	0.02	0.09	0.06	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.07	0.09	0.08	0.02	0.00	0.01	0.05	0.14	0.13	0.07
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.10	0.07
O5'	0.03	0.06	0.02	0.03	0.10	0.01	0.10	0.01	0.08	0.05	0.08	0.11	0.05	0.02	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.06	0.09	0.10	0.12	0.07	0.12	0.07	0.08	0.06	0.09	0.15	0.06	0.09	0.14	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.11	0.07	0.08	0.18	0.04	0.17	0.02	0.12	0.10	0.15	0.21	0.10	0.06	0.13	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.07	0.03	0.04	0.12	0.02	0.12	0.01	0.09	0.06	0.10	0.14	0.05	0.03	0.07	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.15	0.13	0.12	0.12	0.26	0.13	0.61	0.16	0.09	0.17	0.17	0.13	0.10	0.10	0.18	0.09	0.18	1.06	0.17	1.88	1.93	1.64
C2	0.07	0.15	0.09	0.07	0.10	0.18	0.11	0.47	0.15	0.07	0.16	0.17	0.12	0.07	0.08	0.17	0.08	0.14	0.91	0.17	1.62	1.73	1.42
C2'	0.10	0.16	0.20	0.21	0.13	0.29	0.14	0.66	0.16	0.10	0.17	0.17	0.14	0.12	0.11	0.26	0.18	0.17	1.08	0.18	1.96	1.91	1.66
C3'	0.12	0.17	0.24	0.23	0.13	0.28	0.14	0.63	0.17	0.11	0.19	0.19	0.15	0.12	0.12	0.32	0.21	0.14	1.03	0.18	1.89	1.86	1.60
C4	0.10	0.12	0.15	0.09	0.09	0.12	0.08	0.29	0.09	0.10	0.12	0.14	0.11	0.09	0.09	0.33	0.09	0.10	0.69	0.09	1.24	1.42	1.11
C4'	0.10	0.16	0.17	0.16	0.12	0.27	0.13	0.63	0.16	0.09	0.17	0.18	0.14	0.10	0.10	0.24	0.13	0.16	1.07	0.17	1.91	1.94	1.65
C5	0.11	0.12	0.17	0.09	0.09	0.15	0.09	0.33	0.09	0.10	0.12	0.14	0.11	0.09	0.10	0.36	0.11	0.11	0.74	0.09	1.34	1.51	1.19
C5'	0.11	0.18	0.19	0.16	0.14	0.25	0.14	0.59	0.17	0.10	0.19	0.20	0.16	0.11	0.11	0.28	0.14	0.15	1.02	0.18	1.84	1.89	1.59
C6	0.09	0.13	0.16	0.09	0.09	0.18	0.09	0.43	0.11	0.08	0.14	0.15	0.11	0.08	0.09	0.30	0.10	0.13	0.86	0.12	1.55	1.67	1.36
N1	0.07	0.14	0.12	0.08	0.10	0.20	0.10	0.50	0.14	0.07	0.16	0.16	0.12	0.07	0.08	0.21	0.07	0.15	0.94	0.16	1.69	1.78	1.47
N3	0.08	0.14	0.11	0.09	0.09	0.13	0.08	0.35	0.12	0.08	0.15	0.16	0.11	0.07	0.08	0.23	0.08	0.11	0.77	0.15	1.37	1.53	1.22
N4	0.13	0.12	0.18	0.13	0.11	0.10	0.11	0.20	0.08	0.13	0.11	0.14	0.12	0.13	0.12	0.39	0.11	0.10	0.55	0.06	0.98	1.21	0.90
O2	0.11	0.17	0.11	0.10	0.13	0.20	0.14	0.55	0.17	0.11	0.18	0.18	0.14	0.12	0.11	0.14	0.12	0.16	1.00	0.19	1.76	1.84	1.54
O2'	0.11	0.15	0.20	0.25	0.13	0.36	0.14	0.78	0.16	0.12	0.16	0.16	0.13	0.13	0.12	0.22	0.19	0.22	1.20	0.18	2.13	2.05	1.81
O3'	0.13	0.18	0.29	0.30	0.14	0.31	0.14	0.67	0.18	0.13	0.20	0.21	0.16	0.13	0.13	0.37	0.29	0.15	1.06	0.19	1.95	1.86	1.63
O4'	0.09	0.15	0.12	0.11	0.11	0.25	0.12	0.60	0.15	0.08	0.17	0.17	0.13	0.09	0.09	0.18	0.09	0.18	1.05	0.17	1.86	1.94	1.63
O5'	0.14	0.20	0.24	0.18	0.16	0.25	0.16	0.53	0.18	0.13	0.21	0.22	0.18	0.13	0.14	0.37	0.18	0.15	0.95	0.19	1.72	1.79	1.48
OP1	0.18	0.22	0.29	0.22	0.18	0.26	0.17	0.53	0.19	0.16	0.22	0.25	0.20	0.15	0.17	0.45	0.24	0.16	0.94	0.19	1.70	1.77	1.47
OP2	0.18	0.25	0.26	0.16	0.19	0.19	0.17	0.37	0.21	0.14	0.25	0.29	0.22	0.14	0.17	0.46	0.20	0.14	0.77	0.22	1.44	1.53	1.23
P	0.15	0.22	0.23	0.15	0.16	0.21	0.15	0.45	0.18	0.12	0.22	0.24	0.19	0.12	0.14	0.39	0.17	0.13	0.87	0.19	1.60	1.69	1.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.23	0.02	0.58	0.35	0.33
C2	0.03	0.00	0.08	0.31	0.01	0.29	0.00	0.46	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.22	0.13	0.21	0.22	0.01	0.16	0.25	0.11
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.12	0.05	0.05	0.07	0.10	0.08	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.44	0.05	0.76	0.30	0.42
C3'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.19	0.00	0.16	0.02	0.22	0.04	0.28	0.35	0.29	0.05	0.07	0.02	0.01	0.02	0.30	0.21	0.51	0.26	0.17
C4	0.02	0.01	0.04	0.19	0.00	0.12	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.06	0.09	0.23	0.01	0.48	0.57	0.40
C4'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.12	0.00	0.07	0.00	0.12	0.16	0.21	0.36	0.28	0.12	0.03	0.16	0.02	0.00	0.01	0.09	0.39	0.30	0.05
C5	0.01	0.00	0.03	0.16	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.03	0.44	0.01	0.80	0.91	0.70
C5'	0.08	0.46	0.12	0.02	0.17	0.00	0.17	0.00	0.18	0.40	0.32	0.63	0.42	0.35	0.16	0.07	0.11	0.01	0.00	0.18	0.31	0.38	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.22	0.01	0.12	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.12	0.07	0.34	0.00	0.63	0.85	0.59
C8	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.16	0.02	0.40	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.09	0.06	0.13	0.76	0.03	1.25	1.11	1.05
N1	0.02	0.00	0.07	0.28	0.01	0.21	0.01	0.32	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.13	0.15	0.14	0.01	0.24	0.52	0.25
N2	0.04	0.00	0.10	0.35	0.01	0.36	0.01	0.63	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.14	0.26	0.44	0.01	0.51	0.21	0.39
N3	0.03	0.00	0.08	0.29	0.00	0.28	0.01	0.42	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.09	0.22	0.19	0.01	0.15	0.23	0.08
N7	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.04	0.10	0.73	0.03	1.25	1.24	1.08
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.02	0.41	0.02	0.76	0.67	0.60
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.16	0.16	0.15	0.07	0.18	0.09	0.21	0.24	0.20	0.12	0.09	0.00	0.04	0.09	0.37	0.17	0.63	0.17	0.22
O3'	0.14	0.13	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.11	0.12	0.06	0.13	0.14	0.09	0.04	0.06	0.04	0.00	0.12	0.22	0.13	0.40	0.48	0.12
O4'	0.00	0.21	0.01	0.02	0.09	0.00	0.03	0.01	0.07	0.13	0.15	0.26	0.22	0.10	0.02	0.09	0.12	0.00	0.19	0.05	0.42	0.26	0.20
O5'	0.23	0.22	0.44	0.30	0.23	0.01	0.44	0.00	0.34	0.76	0.14	0.44	0.19	0.73	0.41	0.37	0.22	0.19	0.00	0.43	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.21	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.17	0.13	0.05	0.43	0.00	0.80	1.03	0.74
OP1	0.58	0.16	0.76	0.51	0.48	0.39	0.80	0.31	0.63	1.25	0.24	0.51	0.15	1.25	0.76	0.63	0.40	0.42	0.01	0.80	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.25	0.30	0.26	0.57	0.30	0.91	0.38	0.85	1.11	0.52	0.21	0.23	1.24	0.67	0.17	0.48	0.26	0.01	1.03	0.01	0.00	0.00
P	0.33	0.11	0.42	0.17	0.40	0.05	0.70	0.01	0.59	1.05	0.25	0.39	0.08	1.08	0.60	0.22	0.12	0.20	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00