Doublet Group distance statistics: 51913

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 2, 2, 0, 1, 3, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.011, 0.020, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.019, 0.027, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.024, 0.047, 0.070, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.047 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.031, 0.061, 0.091, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.061 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.162, 0.285, 0.409, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.285 std_dev=0.124
C2'	A	0, 0.140, 0.269, 0.399, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.269 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.166, 0.333, 0.500, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.333 std_dev=0.167
C4'	A	0, 0.243, 0.421, 0.600, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.421 std_dev=0.179
C3'	A	0, 0.247, 0.451, 0.656, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.451 std_dev=0.204
O3'	A	0, 0.366, 0.663, 0.959, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.663 std_dev=0.296
C5'	A	0, 0.428, 0.727, 1.025, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.727 std_dev=0.298
N4	B	0, 0.440, 0.758, 1.077, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.758 std_dev=0.318
C4	B	0, 0.435, 0.799, 1.164, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.799 std_dev=0.365
O5'	A	0, 0.527, 0.897, 1.266, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.897 std_dev=0.369
N3	B	0, 0.496, 0.875, 1.254, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.875 std_dev=0.379
O5'	B	0, 0.491, 0.872, 1.253, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.872 std_dev=0.381
OP2	B	0, 0.883, 1.281, 1.679, 1.754 max_d=1.754 avg_d=1.281 std_dev=0.398
OP2	A	0, 0.685, 1.090, 1.495, 1.645 max_d=1.645 avg_d=1.090 std_dev=0.405
P	B	0, 0.690, 1.100, 1.511, 1.580 max_d=1.580 avg_d=1.100 std_dev=0.410
C5	B	0, 0.412, 0.841, 1.270, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.841 std_dev=0.429
OP1	B	0, 0.858, 1.312, 1.765, 1.807 max_d=1.807 avg_d=1.312 std_dev=0.453
C2	B	0, 0.559, 1.015, 1.471, 1.593 max_d=1.593 avg_d=1.015 std_dev=0.456
P	A	0, 0.544, 1.028, 1.511, 1.627 max_d=1.627 avg_d=1.028 std_dev=0.484
C6	B	0, 0.482, 0.972, 1.463, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.972 std_dev=0.490
O2	B	0, 0.643, 1.142, 1.641, 1.817 max_d=1.817 avg_d=1.142 std_dev=0.499
N1	B	0, 0.543, 1.057, 1.570, 1.703 max_d=1.703 avg_d=1.057 std_dev=0.513
OP1	A	0, 0.630, 1.191, 1.752, 1.967 max_d=1.967 avg_d=1.191 std_dev=0.561
C1'	B	0, 0.635, 1.225, 1.815, 2.041 max_d=2.041 avg_d=1.225 std_dev=0.590
O2'	B	0, 0.898, 1.503, 2.109, 2.536 max_d=2.536 avg_d=1.503 std_dev=0.606
C2'	B	0, 0.738, 1.357, 1.976, 2.283 max_d=2.283 avg_d=1.357 std_dev=0.619
O4'	B	0, 0.686, 1.341, 1.997, 2.372 max_d=2.372 avg_d=1.341 std_dev=0.656
C3'	B	0, 0.711, 1.471, 2.231, 2.700 max_d=2.700 avg_d=1.471 std_dev=0.760
C4'	B	0, 0.724, 1.515, 2.306, 2.814 max_d=2.814 avg_d=1.515 std_dev=0.791
O3'	B	0, 0.756, 1.575, 2.395, 3.036 max_d=3.036 avg_d=1.575 std_dev=0.820
C5'	B	0, 0.784, 1.661, 2.538, 3.142 max_d=3.142 avg_d=1.661 std_dev=0.877

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.20	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.04	0.11	0.10	0.22	0.12
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.03	0.05	0.04	0.06	0.02	0.05	0.04	0.10	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.18	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.04	0.10	0.04	0.07	0.08	0.08	0.01	0.01	0.01	0.11	0.09	0.18	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.18	0.17	0.24	0.17
C4'	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03	0.01	0.02	0.08	0.17	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.20	0.18	0.24	0.18
C5'	0.02	0.05	0.04	0.04	0.09	0.00	0.11	0.00	0.10	0.06	0.07	0.10	0.03	0.07	0.07	0.01	0.02	0.09	0.15	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.17	0.14	0.21	0.15
N1	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.11	0.10	0.21	0.12
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.04	0.15	0.14	0.23	0.15
N4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.09	0.03	0.19	0.19	0.26	0.19
O2	0.02	0.00	0.10	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.11	0.05	0.08	0.08	0.22	0.11
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.07	0.05	0.07	0.05	0.03	0.06	0.05	0.10	0.00	0.04	0.03	0.03	0.09	0.20	0.06
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.07	0.03	0.11	0.07	0.11	0.04	0.08	0.09	0.11	0.04	0.00	0.02	0.14	0.13	0.17	0.04
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.10	0.05	0.22	0.11
O5'	0.05	0.11	0.07	0.11	0.18	0.02	0.20	0.02	0.17	0.11	0.15	0.19	0.08	0.03	0.14	0.10	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.06	0.10	0.07	0.09	0.17	0.08	0.18	0.09	0.14	0.10	0.14	0.19	0.08	0.09	0.13	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.22	0.18	0.18	0.24	0.17	0.24	0.15	0.21	0.21	0.23	0.26	0.22	0.20	0.17	0.22	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.12	0.06	0.04	0.17	0.04	0.18	0.02	0.15	0.12	0.15	0.19	0.11	0.06	0.04	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.09	0.11	0.10	0.14	0.23	0.07	0.41	0.07	0.06	0.15	0.22	0.10	0.10	0.10	0.16	0.34	0.41	0.38	0.37
C2	0.13	0.08	0.15	0.16	0.11	0.28	0.10	0.46	0.15	0.10	0.12	0.21	0.09	0.14	0.15	0.22	0.31	0.36	0.35	0.33
C2'	0.10	0.17	0.12	0.09	0.23	0.16	0.17	0.33	0.12	0.12	0.22	0.30	0.18	0.12	0.09	0.11	0.49	0.58	0.53	0.53
C3'	0.11	0.16	0.14	0.12	0.19	0.17	0.15	0.32	0.13	0.13	0.19	0.25	0.16	0.14	0.14	0.13	0.52	0.64	0.57	0.56
C4	0.22	0.16	0.25	0.27	0.17	0.35	0.26	0.51	0.27	0.21	0.13	0.13	0.13	0.25	0.25	0.29	0.29	0.34	0.34	0.31
C4'	0.07	0.11	0.10	0.08	0.15	0.16	0.09	0.32	0.07	0.07	0.15	0.20	0.12	0.09	0.09	0.11	0.43	0.54	0.48	0.47
C5	0.21	0.14	0.24	0.26	0.14	0.34	0.22	0.51	0.24	0.19	0.13	0.12	0.13	0.24	0.25	0.27	0.31	0.37	0.36	0.33
C5'	0.08	0.09	0.11	0.10	0.11	0.18	0.08	0.34	0.08	0.07	0.12	0.15	0.10	0.10	0.11	0.13	0.43	0.55	0.48	0.47
C6	0.16	0.10	0.19	0.21	0.09	0.31	0.15	0.48	0.18	0.14	0.10	0.12	0.09	0.19	0.20	0.24	0.32	0.39	0.37	0.35
N1	0.13	0.08	0.15	0.16	0.10	0.28	0.09	0.45	0.13	0.10	0.11	0.18	0.09	0.14	0.15	0.21	0.33	0.39	0.37	0.35
N3	0.19	0.11	0.20	0.22	0.10	0.32	0.21	0.49	0.23	0.17	0.10	0.13	0.10	0.20	0.21	0.27	0.29	0.33	0.33	0.30
N4	0.27	0.22	0.29	0.31	0.26	0.37	0.33	0.52	0.32	0.27	0.20	0.24	0.19	0.30	0.29	0.32	0.26	0.32	0.33	0.29
O2	0.09	0.11	0.10	0.12	0.19	0.24	0.08	0.42	0.08	0.06	0.19	0.31	0.12	0.10	0.11	0.18	0.32	0.35	0.33	0.32
O2'	0.13	0.24	0.18	0.12	0.31	0.10	0.25	0.26	0.18	0.18	0.29	0.37	0.24	0.16	0.11	0.07	0.50	0.59	0.53	0.54
O3'	0.18	0.21	0.19	0.18	0.24	0.15	0.22	0.26	0.20	0.19	0.24	0.29	0.22	0.20	0.20	0.15	0.62	0.76	0.66	0.67
O4'	0.10	0.08	0.13	0.11	0.11	0.24	0.07	0.41	0.09	0.07	0.12	0.17	0.09	0.11	0.10	0.18	0.31	0.39	0.35	0.33
O5'	0.17	0.16	0.22	0.20	0.15	0.28	0.16	0.43	0.17	0.16	0.16	0.16	0.16	0.21	0.20	0.22	0.39	0.52	0.46	0.44
OP1	0.16	0.16	0.20	0.19	0.15	0.28	0.15	0.43	0.16	0.15	0.16	0.16	0.16	0.20	0.19	0.21	0.38	0.51	0.44	0.42
OP2	0.23	0.24	0.25	0.26	0.23	0.27	0.23	0.37	0.23	0.23	0.25	0.24	0.25	0.26	0.26	0.24	0.58	0.67	0.63	0.61
P	0.16	0.17	0.21	0.19	0.16	0.25	0.16	0.39	0.16	0.16	0.17	0.17	0.17	0.21	0.19	0.19	0.44	0.55	0.50	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.20	0.23	0.12	0.18
C2	0.03	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.06	0.03	0.40	0.40	0.33	0.37
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.07	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.06	0.08	0.08	0.01	0.02	0.02	0.26	0.31	0.13	0.24
C3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.04	0.08	0.04	0.05	0.04	0.09	0.02	0.00	0.03	0.37	0.41	0.13	0.32
C4	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02	0.53	0.53	0.51	0.52
C4'	0.03	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.14	0.02	0.01	0.01	0.15	0.20	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.54	0.54	0.50	0.53
C5'	0.03	0.07	0.05	0.04	0.13	0.01	0.14	0.00	0.11	0.07	0.10	0.14	0.05	0.17	0.08	0.01	0.01	0.22	0.36	0.04
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.02	0.48	0.46	0.37	0.45
N1	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.37	0.37	0.27	0.34
N3	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.47	0.47	0.43	0.45
N4	0.02	0.02	0.08	0.04	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.06	0.02	0.56	0.58	0.58	0.57
O2	0.04	0.01	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.10	0.05	0.33	0.34	0.27	0.31
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.09	0.14	0.06	0.17	0.04	0.05	0.10	0.11	0.12	0.00	0.05	0.08	0.13	0.25	0.09	0.16
O3'	0.03	0.06	0.02	0.00	0.05	0.02	0.08	0.08	0.09	0.04	0.06	0.06	0.10	0.05	0.00	0.02	0.30	0.42	0.11	0.29
O4'	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.08	0.02	0.00	0.08	0.15	0.15	0.09
O5'	0.20	0.40	0.26	0.37	0.53	0.01	0.54	0.01	0.48	0.37	0.47	0.56	0.33	0.13	0.30	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.23	0.40	0.31	0.41	0.53	0.15	0.54	0.22	0.46	0.37	0.47	0.58	0.34	0.25	0.42	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.33	0.13	0.13	0.51	0.20	0.50	0.36	0.37	0.27	0.43	0.58	0.27	0.09	0.11	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.37	0.24	0.32	0.52	0.04	0.53	0.04	0.45	0.34	0.45	0.57	0.31	0.16	0.29	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00