Doublet Group distance statistics: 51921

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
O2	B	0, 0.009, 1.189, 2.369, 2.938 max_d=2.938 avg_d=1.189 std_dev=1.180
O2	A	0, -0.449, 0.940, 2.328, 3.113 max_d=3.113 avg_d=0.940 std_dev=1.388
C2	B	0, -0.296, 1.319, 2.933, 3.781 max_d=3.781 avg_d=1.319 std_dev=1.614
N3	B	0, -0.385, 1.303, 2.990, 3.878 max_d=3.878 avg_d=1.303 std_dev=1.687
C2	A	0, -0.595, 1.161, 2.917, 3.913 max_d=3.913 avg_d=1.161 std_dev=1.756
N3	A	0, -0.608, 1.168, 2.943, 3.949 max_d=3.949 avg_d=1.168 std_dev=1.775
C4	B	0, -0.697, 2.177, 5.050, 6.559 max_d=6.559 avg_d=2.177 std_dev=2.873
N1	B	0, -0.825, 2.077, 4.978, 6.512 max_d=6.512 avg_d=2.077 std_dev=2.902
C4	A	0, -1.021, 1.975, 4.971, 6.613 max_d=6.613 avg_d=1.975 std_dev=2.996
N1	A	0, -1.027, 1.970, 4.968, 6.614 max_d=6.614 avg_d=1.970 std_dev=2.998
O4	B	0, -0.680, 2.661, 6.002, 7.751 max_d=7.751 avg_d=2.661 std_dev=3.341
O4	A	0, -1.132, 2.375, 5.881, 7.779 max_d=7.779 avg_d=2.375 std_dev=3.507
C1'	B	0, -1.026, 2.600, 6.225, 8.139 max_d=8.139 avg_d=2.600 std_dev=3.625
C5	B	0, -0.910, 2.802, 6.514, 8.464 max_d=8.464 avg_d=2.802 std_dev=3.712
C6	B	0, -1.021, 2.696, 6.412, 8.372 max_d=8.372 avg_d=2.696 std_dev=3.716
O4'	A	0, -1.225, 2.508, 6.240, 8.283 max_d=8.283 avg_d=2.508 std_dev=3.732
C1'	A	0, -1.284, 2.469, 6.223, 8.278 max_d=8.278 avg_d=2.469 std_dev=3.753
C6	A	0, -1.311, 2.519, 6.349, 8.428 max_d=8.428 avg_d=2.519 std_dev=3.830
C5	A	0, -1.328, 2.540, 6.408, 8.503 max_d=8.503 avg_d=2.540 std_dev=3.868
C2'	B	0, -1.119, 2.950, 7.019, 9.172 max_d=9.172 avg_d=2.950 std_dev=4.069
O2'	B	0, -1.257, 3.347, 7.950, 10.389 max_d=10.389 avg_d=3.347 std_dev=4.603
O4'	B	0, -1.378, 3.306, 7.989, 10.462 max_d=10.462 avg_d=3.306 std_dev=4.684
C4'	A	0, -1.659, 3.337, 8.333, 11.042 max_d=11.042 avg_d=3.337 std_dev=4.996
C2'	A	0, -1.656, 3.404, 8.463, 11.208 max_d=11.208 avg_d=3.404 std_dev=5.060
C3'	B	0, -1.471, 3.726, 8.923, 11.684 max_d=11.684 avg_d=3.726 std_dev=5.197
O2'	A	0, -1.677, 3.564, 8.805, 11.644 max_d=11.644 avg_d=3.564 std_dev=5.241
C5'	A	0, -1.692, 3.594, 8.881, 11.734 max_d=11.734 avg_d=3.594 std_dev=5.286
O5'	A	0, -1.702, 3.793, 9.287, 12.284 max_d=12.284 avg_d=3.793 std_dev=5.494
C4'	B	0, -1.665, 4.045, 9.756, 12.768 max_d=12.768 avg_d=4.045 std_dev=5.711
C3'	A	0, -1.888, 3.873, 9.633, 12.751 max_d=12.751 avg_d=3.873 std_dev=5.760
O3'	A	0, -1.945, 4.028, 10.001, 13.237 max_d=13.237 avg_d=4.028 std_dev=5.973
O3'	B	0, -1.675, 4.331, 10.337, 13.533 max_d=13.533 avg_d=4.331 std_dev=6.006
O5'	B	0, -1.877, 4.658, 11.192, 14.652 max_d=14.652 avg_d=4.658 std_dev=6.535
C5'	B	0, -1.968, 4.738, 11.444, 14.984 max_d=14.984 avg_d=4.738 std_dev=6.706
P	A	0, -2.097, 4.681, 11.460, 15.119 max_d=15.119 avg_d=4.681 std_dev=6.778
OP2	A	0, -2.160, 4.969, 12.098, 15.955 max_d=15.955 avg_d=4.969 std_dev=7.129
OP2	B	0, -2.222, 5.386, 12.994, 17.034 max_d=17.034 avg_d=5.386 std_dev=7.608
OP1	A	0, -2.321, 5.337, 12.994, 17.122 max_d=17.122 avg_d=5.337 std_dev=7.657
P	B	0, -2.239, 5.428, 13.095, 17.161 max_d=17.161 avg_d=5.428 std_dev=7.667
OP1	B	0, -2.577, 6.184, 14.946, 19.589 max_d=19.589 avg_d=6.184 std_dev=8.762

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.11	0.09	0.06
C2	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.05	0.10	0.07	0.06
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.14	0.15	0.10
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.16	0.14	0.10
C4	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.06	0.09	0.09	0.07
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.10	0.06	0.05
C5	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.09	0.08	0.07
C5'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.04	0.03	0.05	0.06	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.04	0.09	0.07	0.05
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.09	0.07	0.05
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.06	0.10	0.08	0.07
O2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.05	0.06	0.11	0.07	0.07
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.04	0.05	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.16	0.18	0.12
O3'	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.17	0.15	0.11
O4	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.07	0.10	0.10	0.08
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.08	0.05	0.03
O5'	0.02	0.05	0.03	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.11	0.10	0.14	0.16	0.09	0.10	0.09	0.05	0.09	0.09	0.10	0.11	0.16	0.17	0.10	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.07	0.15	0.14	0.09	0.06	0.08	0.02	0.07	0.07	0.08	0.07	0.18	0.15	0.10	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.06	0.10	0.10	0.07	0.05	0.07	0.02	0.05	0.05	0.07	0.07	0.12	0.11	0.08	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.06	0.06	0.06	0.12	0.07	0.12	0.09	0.10	0.07	0.08	0.06	0.06	0.06	0.15	0.07	0.11	0.10	0.12	0.11
C2	0.06	0.06	0.05	0.05	0.09	0.06	0.09	0.08	0.08	0.07	0.07	0.06	0.06	0.06	0.10	0.07	0.09	0.09	0.10	0.09
C2'	0.07	0.06	0.07	0.07	0.12	0.07	0.12	0.09	0.10	0.08	0.08	0.06	0.07	0.07	0.15	0.07	0.11	0.11	0.12	0.11
C3'	0.07	0.06	0.07	0.07	0.13	0.07	0.14	0.09	0.11	0.07	0.08	0.06	0.07	0.07	0.18	0.07	0.12	0.12	0.13	0.12
C4	0.06	0.07	0.08	0.08	0.07	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.07	0.09	0.07	0.11	0.07	0.06	0.07	0.08	0.09	0.08
C4'	0.06	0.05	0.06	0.06	0.13	0.06	0.15	0.08	0.11	0.06	0.07	0.10	0.06	0.06	0.20	0.06	0.11	0.11	0.12	0.11
C5	0.05	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.07	0.05	0.06	0.05	0.07	0.09	0.07	0.11	0.09	0.05	0.07	0.07	0.09	0.08
C5'	0.07	0.08	0.07	0.07	0.13	0.07	0.15	0.07	0.12	0.07	0.07	0.16	0.08	0.08	0.21	0.07	0.10	0.11	0.13	0.11
C6	0.05	0.05	0.06	0.06	0.09	0.05	0.09	0.06	0.07	0.05	0.07	0.08	0.06	0.08	0.12	0.05	0.07	0.07	0.09	0.08
N1	0.06	0.05	0.05	0.05	0.10	0.06	0.10	0.07	0.08	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.12	0.06	0.09	0.09	0.10	0.09
N3	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.08	0.06	0.08	0.07	0.07	0.08	0.08	0.09	0.09
O2	0.08	0.06	0.06	0.06	0.10	0.08	0.10	0.10	0.09	0.08	0.08	0.05	0.07	0.06	0.10	0.09	0.11	0.10	0.11	0.11
O2'	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.10	0.10	0.11	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.12	0.10	0.13	0.13	0.14	0.13
O3'	0.10	0.09	0.10	0.11	0.14	0.11	0.14	0.13	0.13	0.10	0.11	0.08	0.10	0.10	0.18	0.10	0.15	0.15	0.16	0.16
O4	0.07	0.08	0.10	0.10	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06	0.06	0.08	0.09	0.09	0.14	0.07	0.07	0.09	0.09	0.11	0.09
O4'	0.06	0.06	0.06	0.06	0.13	0.06	0.14	0.08	0.11	0.07	0.07	0.11	0.06	0.06	0.19	0.06	0.10	0.11	0.12	0.11
O5'	0.08	0.09	0.08	0.08	0.14	0.08	0.16	0.08	0.12	0.08	0.09	0.15	0.09	0.09	0.20	0.08	0.11	0.12	0.13	0.12
OP1	0.11	0.12	0.12	0.11	0.16	0.11	0.17	0.11	0.14	0.12	0.13	0.16	0.12	0.12	0.20	0.10	0.14	0.15	0.17	0.15
OP2	0.08	0.09	0.09	0.09	0.15	0.08	0.16	0.09	0.13	0.09	0.11	0.14	0.10	0.10	0.20	0.08	0.11	0.11	0.13	0.12
P	0.07	0.09	0.08	0.08	0.13	0.08	0.15	0.08	0.12	0.08	0.09	0.15	0.10	0.09	0.20	0.07	0.10	0.11	0.13	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.04
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.10	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.02	0.06	0.06	0.07	0.06
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.03	0.05	0.05	0.08	0.06
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.04	0.05	0.08	0.05
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04
N3	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.01	0.06	0.06	0.06	0.06
O2	0.01	0.00	0.10	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.11	0.00	0.03	0.06	0.06	0.06	0.05
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.09	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.08	0.03	0.05	0.11	0.04	0.00	0.08	0.02	0.04	0.05	0.07	0.05
O4	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.00	0.02	0.06	0.07	0.08	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.07	0.06
O5'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.04	0.04	0.06	0.06	0.02	0.04	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.03	0.05	0.02	0.02	0.06	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.06	0.06	0.02	0.05	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.06	0.04	0.04	0.07	0.02	0.08	0.01	0.08	0.05	0.06	0.06	0.03	0.07	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.05	0.02	0.03	0.06	0.02	0.06	0.01	0.05	0.04	0.06	0.05	0.03	0.05	0.07	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00