Doublet Group distance statistics: 51923

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 1.679, 3.359, 3.359 max_d=3.359 avg_d=1.679 std_dev=1.679
N3	B	0, 0.000, 1.819, 3.638, 3.638 max_d=3.638 avg_d=1.819 std_dev=1.819
O2	A	0, 0.000, 1.897, 3.794, 3.794 max_d=3.794 avg_d=1.897 std_dev=1.897
C2	A	0, 0.000, 1.999, 3.997, 3.997 max_d=3.997 avg_d=1.999 std_dev=1.999
O2	B	0, 0.000, 2.046, 4.091, 4.091 max_d=4.091 avg_d=2.046 std_dev=2.046
C2	B	0, 0.000, 2.210, 4.420, 4.420 max_d=4.420 avg_d=2.210 std_dev=2.210
C4	A	0, 0.000, 2.923, 5.847, 5.847 max_d=5.847 avg_d=2.923 std_dev=2.923
C4	B	0, 0.000, 3.048, 6.095, 6.095 max_d=6.095 avg_d=3.048 std_dev=3.048
N1	A	0, 0.000, 3.336, 6.671, 6.671 max_d=6.671 avg_d=3.336 std_dev=3.336
O4	A	0, 0.000, 3.423, 6.846, 6.846 max_d=6.846 avg_d=3.423 std_dev=3.423
O4	B	0, 0.000, 3.442, 6.884, 6.884 max_d=6.884 avg_d=3.442 std_dev=3.442
N1	B	0, 0.000, 3.549, 7.098, 7.098 max_d=7.098 avg_d=3.549 std_dev=3.549
C5	A	0, 0.000, 3.986, 7.972, 7.972 max_d=7.972 avg_d=3.986 std_dev=3.986
C6	A	0, 0.000, 4.104, 8.208, 8.208 max_d=8.208 avg_d=4.104 std_dev=4.104
C5	B	0, 0.000, 4.179, 8.359, 8.359 max_d=8.359 avg_d=4.179 std_dev=4.179
C2'	B	0, 0.000, 4.241, 8.482, 8.482 max_d=8.482 avg_d=4.241 std_dev=4.241
C6	B	0, 0.000, 4.317, 8.633, 8.633 max_d=8.633 avg_d=4.317 std_dev=4.317
C1'	A	0, 0.000, 4.334, 8.669, 8.669 max_d=8.669 avg_d=4.334 std_dev=4.334
O2'	B	0, 0.000, 4.500, 9.001, 9.001 max_d=9.001 avg_d=4.500 std_dev=4.500
C1'	B	0, 0.000, 4.502, 9.003, 9.003 max_d=9.003 avg_d=4.502 std_dev=4.502
C2'	A	0, 0.000, 5.020, 10.040, 10.040 max_d=10.040 avg_d=5.020 std_dev=5.020
O2'	A	0, 0.000, 5.077, 10.154, 10.154 max_d=10.154 avg_d=5.077 std_dev=5.077
O4'	A	0, 0.000, 5.265, 10.529, 10.529 max_d=10.529 avg_d=5.265 std_dev=5.265
C3'	B	0, 0.000, 5.357, 10.713, 10.713 max_d=10.713 avg_d=5.357 std_dev=5.357
O4'	B	0, 0.000, 5.791, 11.581, 11.581 max_d=11.581 avg_d=5.791 std_dev=5.791
O3'	B	0, 0.000, 5.852, 11.705, 11.705 max_d=11.705 avg_d=5.852 std_dev=5.852
C3'	A	0, 0.000, 6.319, 12.638, 12.638 max_d=12.638 avg_d=6.319 std_dev=6.319
C4'	B	0, 0.000, 6.448, 12.896, 12.896 max_d=12.896 avg_d=6.448 std_dev=6.448
C4'	A	0, 0.000, 6.555, 13.111, 13.111 max_d=13.111 avg_d=6.555 std_dev=6.555
O5'	B	0, 0.000, 6.768, 13.537, 13.537 max_d=13.537 avg_d=6.768 std_dev=6.768
O3'	A	0, 0.000, 6.869, 13.737, 13.737 max_d=13.737 avg_d=6.869 std_dev=6.869
O5'	A	0, 0.000, 7.039, 14.078, 14.078 max_d=14.078 avg_d=7.039 std_dev=7.039
C5'	B	0, 0.000, 7.328, 14.657, 14.657 max_d=14.657 avg_d=7.328 std_dev=7.328
C5'	A	0, 0.000, 7.373, 14.746, 14.746 max_d=14.746 avg_d=7.373 std_dev=7.373
OP1	B	0, 0.000, 7.754, 15.509, 15.509 max_d=15.509 avg_d=7.754 std_dev=7.754
P	B	0, 0.000, 7.784, 15.568, 15.568 max_d=15.568 avg_d=7.784 std_dev=7.784
OP2	A	0, 0.000, 8.031, 16.061, 16.061 max_d=16.061 avg_d=8.031 std_dev=8.031
P	A	0, 0.000, 8.190, 16.381, 16.381 max_d=16.381 avg_d=8.190 std_dev=8.190
OP2	B	0, 0.000, 9.064, 18.128, 18.128 max_d=18.128 avg_d=9.064 std_dev=9.064
OP1	A	0, 0.000, 9.416, 18.833, 18.833 max_d=18.833 avg_d=9.416 std_dev=9.416

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.24	0.00	0.00	0.12	0.23	0.39	0.17
C2	0.01	0.00	0.18	0.21	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.12	0.02	0.05	0.03	0.03
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.02	0.01	0.17	0.18	0.22	0.01	0.12	0.34	0.00	0.02	0.02	0.01	0.35	0.58	0.96	0.61
C3'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.25	0.00	0.21	0.01	0.16	0.16	0.25	0.19	0.01	0.00	0.27	0.01	0.03	0.36	0.63	0.32
C4	0.00	0.00	0.02	0.25	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.09	0.00	0.01	0.10	0.18	0.43	0.23
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.16	0.06	0.03	0.07	0.21	0.01	0.10	0.00	0.00	0.20	0.32	0.10
C5	0.00	0.01	0.17	0.21	0.01	0.16	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.44	0.10	0.00	0.11	0.15	0.22	0.41	0.25
C5'	0.06	0.07	0.18	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.13	0.00	0.03	0.13	0.03	0.14	0.06	0.01	0.00	0.11	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.22	0.16	0.01	0.16	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.41	0.03	0.01	0.15	0.10	0.09	0.12	0.13
N1	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.06	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.00
N3	0.01	0.00	0.12	0.25	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.02	0.00	0.09	0.03	0.06	0.25	0.13
O2	0.03	0.00	0.34	0.19	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.11	0.00	0.21	0.07	0.13	0.07	0.04
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.21	0.44	0.03	0.41	0.17	0.13	0.25	0.00	0.02	0.32	0.17	0.28	0.53	1.15	0.63
O3'	0.24	0.05	0.02	0.00	0.09	0.01	0.10	0.14	0.03	0.06	0.02	0.11	0.02	0.00	0.12	0.17	0.13	0.12	0.51	0.13
O4	0.00	0.00	0.02	0.27	0.00	0.10	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.12	0.00	0.00	0.13	0.25	0.57	0.29
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.00	0.09	0.21	0.17	0.17	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.05
O5'	0.12	0.02	0.35	0.03	0.10	0.00	0.15	0.00	0.10	0.01	0.03	0.07	0.28	0.13	0.13	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00
OP1	0.23	0.05	0.58	0.36	0.18	0.20	0.22	0.11	0.09	0.05	0.06	0.13	0.53	0.12	0.25	0.07	0.04	0.00	0.00	0.00
OP2	0.39	0.03	0.96	0.63	0.43	0.32	0.41	0.14	0.12	0.07	0.25	0.07	1.15	0.51	0.57	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.03	0.61	0.32	0.23	0.10	0.25	0.01	0.13	0.00	0.13	0.04	0.63	0.13	0.29	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.18	0.10	0.05	0.34	0.04	0.32	0.04	0.26	0.19	0.26	0.11	0.40	0.18	0.41	0.15	0.13	0.39	0.21	0.17
C2	0.12	0.15	0.02	0.04	0.20	0.08	0.20	0.00	0.19	0.16	0.18	0.12	0.28	0.07	0.20	0.14	0.09	0.37	0.17	0.13
C2'	0.27	0.35	0.07	0.13	0.60	0.21	0.59	0.15	0.50	0.38	0.47	0.23	0.29	0.02	0.70	0.32	0.10	0.10	0.08	0.10
C3'	0.30	0.33	0.13	0.17	0.40	0.22	0.41	0.12	0.38	0.34	0.36	0.30	0.15	0.07	0.43	0.31	0.02	0.28	0.04	0.03
C4	0.01	0.06	0.08	0.08	0.09	0.02	0.08	0.08	0.06	0.04	0.08	0.05	0.33	0.24	0.10	0.03	0.17	0.41	0.21	0.19
C4'	0.11	0.13	0.05	0.00	0.20	0.05	0.20	0.05	0.18	0.14	0.16	0.11	0.32	0.10	0.23	0.13	0.15	0.46	0.25	0.21
C5	0.01	0.08	0.15	0.17	0.16	0.07	0.14	0.12	0.09	0.06	0.14	0.04	0.43	0.36	0.21	0.02	0.21	0.45	0.25	0.23
C5'	0.06	0.09	0.07	0.03	0.13	0.01	0.13	0.08	0.12	0.09	0.11	0.07	0.33	0.15	0.16	0.08	0.18	0.48	0.27	0.23
C6	0.03	0.11	0.16	0.15	0.23	0.05	0.20	0.11	0.15	0.10	0.19	0.07	0.46	0.33	0.29	0.06	0.20	0.45	0.25	0.23
N1	0.08	0.14	0.10	0.06	0.25	0.01	0.23	0.06	0.19	0.14	0.21	0.09	0.40	0.21	0.30	0.11	0.15	0.41	0.22	0.19
N3	0.09	0.11	0.01	0.04	0.10	0.07	0.11	0.01	0.11	0.11	0.10	0.11	0.24	0.08	0.08	0.10	0.10	0.37	0.17	0.13
O2	0.18	0.17	0.05	0.15	0.21	0.15	0.23	0.06	0.23	0.20	0.19	0.13	0.20	0.07	0.19	0.20	0.02	0.33	0.13	0.08
O2'	0.01	0.13	0.30	0.23	0.57	0.11	0.54	0.12	0.36	0.17	0.34	0.06	0.71	0.41	0.77	0.06	0.14	0.24	0.13	0.11
O3'	0.00	0.01	0.15	0.11	0.03	0.09	0.04	0.22	0.03	0.02	0.02	0.01	0.40	0.16	0.05	0.01	0.33	0.66	0.40	0.40
O4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.24	0.01	0.01	0.17	0.40	0.19	0.18
O4'	0.01	0.05	0.16	0.11	0.12	0.05	0.12	0.14	0.09	0.05	0.08	0.02	0.43	0.23	0.16	0.05	0.24	0.54	0.35	0.31
O5'	0.11	0.14	0.02	0.01	0.18	0.05	0.18	0.03	0.16	0.14	0.16	0.13	0.29	0.14	0.20	0.13	0.14	0.44	0.20	0.18
OP1	0.13	0.15	0.02	0.03	0.15	0.06	0.15	0.05	0.15	0.14	0.15	0.16	0.26	0.17	0.15	0.15	0.18	0.52	0.25	0.25
OP2	0.27	0.29	0.06	0.00	0.23	0.14	0.23	0.02	0.25	0.27	0.27	0.33	0.15	0.17	0.22	0.28	0.16	0.52	0.19	0.24
P	0.19	0.23	0.01	0.01	0.26	0.10	0.25	0.01	0.24	0.22	0.25	0.23	0.25	0.18	0.28	0.21	0.12	0.44	0.18	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.21	0.14	0.07
C2	0.01	0.00	0.13	0.04	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.12	0.00	0.01	0.18	0.41	0.29	0.22
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.12	0.01	0.09	0.07	0.07	0.07	0.14	0.14	0.00	0.02	0.13	0.00	0.16	0.30	0.07	0.11
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.03	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.12	0.07
C4	0.01	0.00	0.12	0.01	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.01	0.00	0.02	0.18	0.48	0.42	0.28
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.14	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02
C5	0.01	0.00	0.09	0.06	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.06	0.00	0.01	0.13	0.40	0.42	0.24
C5'	0.04	0.12	0.07	0.00	0.14	0.00	0.13	0.00	0.11	0.09	0.13	0.12	0.09	0.12	0.15	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01
C6	0.00	0.00	0.07	0.07	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.06	0.00	0.01	0.10	0.31	0.34	0.18
N1	0.00	0.01	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.03	0.01	0.01	0.12	0.32	0.26	0.16
N3	0.01	0.00	0.14	0.03	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.28	0.08	0.00	0.01	0.20	0.48	0.37	0.27
O2	0.03	0.00	0.14	0.10	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.32	0.22	0.01	0.01	0.20	0.41	0.26	0.22
O2'	0.01	0.26	0.00	0.01	0.24	0.14	0.16	0.09	0.11	0.14	0.28	0.32	0.00	0.06	0.26	0.08	0.08	0.25	0.08	0.02
O3'	0.08	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.06	0.03	0.08	0.22	0.06	0.00	0.01	0.05	0.13	0.14	0.40	0.29
O4	0.01	0.00	0.13	0.01	0.00	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.19	0.51	0.47	0.31
O4'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.00	0.02	0.08	0.12	0.02
O5'	0.07	0.18	0.16	0.01	0.18	0.00	0.13	0.00	0.10	0.12	0.20	0.20	0.08	0.13	0.19	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00
OP1	0.21	0.41	0.30	0.05	0.48	0.05	0.40	0.03	0.31	0.32	0.48	0.41	0.25	0.14	0.51	0.08	0.04	0.00	0.00	0.00
OP2	0.14	0.29	0.07	0.12	0.42	0.00	0.42	0.02	0.34	0.26	0.37	0.26	0.08	0.40	0.47	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.22	0.11	0.07	0.28	0.02	0.24	0.01	0.18	0.16	0.27	0.22	0.02	0.29	0.31	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00