Doublet Group distance statistics: 51941

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 1, 7, 3, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.020, 0.048, 0.077, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.048 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.032, 0.079, 0.126, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.079 std_dev=0.047
O4'	A	0, -0.006, 0.144, 0.294, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.144 std_dev=0.150
C2'	A	0, -0.012, 0.172, 0.356, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.172 std_dev=0.184
O2'	A	0, 0.012, 0.246, 0.479, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.246 std_dev=0.233
C4'	A	0, 0.000, 0.238, 0.476, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.238 std_dev=0.238
C3'	A	0, -0.028, 0.252, 0.532, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.252 std_dev=0.280
C4	B	0, 0.050, 0.409, 0.768, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.409 std_dev=0.359
C5	B	0, 0.010, 0.372, 0.734, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.372 std_dev=0.362
N1	B	0, -0.029, 0.353, 0.734, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.353 std_dev=0.381
C2	B	0, -0.008, 0.375, 0.757, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.375 std_dev=0.382
C6	B	0, -0.004, 0.386, 0.775, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.386 std_dev=0.389
N7	B	0, 0.047, 0.439, 0.830, 1.629 max_d=1.629 avg_d=0.439 std_dev=0.392
C8	B	0, 0.073, 0.476, 0.879, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.476 std_dev=0.403
N3	B	0, 0.026, 0.430, 0.833, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.430 std_dev=0.403
N9	B	0, 0.091, 0.497, 0.903, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.497 std_dev=0.406
O3'	A	0, -0.070, 0.345, 0.761, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.345 std_dev=0.416
C5'	A	0, -0.030, 0.398, 0.826, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.398 std_dev=0.428
N2	B	0, -0.021, 0.425, 0.872, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.425 std_dev=0.447
O6	B	0, -0.039, 0.463, 0.964, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.463 std_dev=0.502
O5'	A	0, -0.032, 0.472, 0.976, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.472 std_dev=0.504
O4'	B	0, 0.034, 0.613, 1.193, 2.513 max_d=2.513 avg_d=0.613 std_dev=0.580
C1'	B	0, 0.040, 0.638, 1.237, 2.132 max_d=2.132 avg_d=0.638 std_dev=0.599
P	A	0, -0.044, 0.609, 1.262, 2.240 max_d=2.240 avg_d=0.609 std_dev=0.653
OP2	A	0, -0.042, 0.644, 1.330, 2.433 max_d=2.433 avg_d=0.644 std_dev=0.686
C4'	B	0, -0.036, 0.666, 1.368, 3.341 max_d=3.341 avg_d=0.666 std_dev=0.702
OP1	A	0, -0.032, 0.680, 1.393, 2.486 max_d=2.486 avg_d=0.680 std_dev=0.713
C2'	B	0, -0.237, 0.894, 2.024, 3.978 max_d=3.978 avg_d=0.894 std_dev=1.130
C3'	B	0, -0.203, 0.983, 2.170, 4.004 max_d=4.004 avg_d=0.983 std_dev=1.187
C5'	B	0, -0.416, 0.858, 2.132, 6.099 max_d=6.099 avg_d=0.858 std_dev=1.274
O3'	B	0, -0.381, 1.293, 2.966, 5.691 max_d=5.691 avg_d=1.293 std_dev=1.674
O2'	B	0, -0.568, 1.188, 2.944, 6.266 max_d=6.266 avg_d=1.188 std_dev=1.756
O5'	B	0, -0.696, 1.130, 2.956, 7.638 max_d=7.638 avg_d=1.130 std_dev=1.826
P	B	0, -1.300, 1.522, 4.345, 10.770 max_d=10.770 avg_d=1.522 std_dev=2.822
OP1	B	0, -1.413, 1.624, 4.662, 12.181 max_d=12.181 avg_d=1.624 std_dev=3.037
OP2	B	0, -1.644, 1.781, 5.207, 12.025 max_d=12.025 avg_d=1.781 std_dev=3.426

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.15	0.18	0.09	0.12
C2	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.08	0.01	0.05	0.20	0.19	0.15	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.05	0.16	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.14	0.03	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.13	0.04	0.05	0.12	0.01	0.01	0.09	0.01	0.03	0.13	0.06	0.03
C4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.03	0.21	0.22	0.21	0.19
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.10	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.11	0.06	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.11	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.15	0.01	0.03	0.21	0.22	0.20	0.18
C5'	0.04	0.11	0.01	0.01	0.20	0.00	0.22	0.00	0.19	0.12	0.15	0.07	0.03	0.04	0.21	0.01	0.01	0.17	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.13	0.01	0.10	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.15	0.01	0.04	0.20	0.20	0.15	0.15
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.19	0.19	0.13	0.15
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.21	0.20	0.19	0.18
O2	0.02	0.00	0.16	0.12	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00	0.16	0.16	0.01	0.07	0.19	0.19	0.14	0.16
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.03	0.07	0.01	0.06	0.16	0.00	0.03	0.03	0.04	0.02	0.09	0.05	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.08	0.01	0.15	0.04	0.15	0.03	0.06	0.16	0.03	0.00	0.09	0.01	0.12	0.09	0.13	0.08
O4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.03	0.21	0.22	0.23	0.19
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.04	0.01	0.03	0.00	0.17	0.19	0.09	0.14
O5'	0.15	0.20	0.07	0.03	0.21	0.01	0.21	0.01	0.20	0.19	0.21	0.19	0.02	0.12	0.21	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.19	0.14	0.13	0.22	0.11	0.22	0.17	0.20	0.19	0.20	0.19	0.09	0.09	0.22	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.15	0.03	0.06	0.21	0.06	0.20	0.11	0.15	0.13	0.19	0.14	0.05	0.13	0.23	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.16	0.06	0.03	0.19	0.01	0.18	0.01	0.15	0.15	0.18	0.16	0.03	0.08	0.19	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.28	0.27	0.21	0.15	0.16	0.09	0.24	0.10	0.12	0.21	0.38	0.24	0.12	0.13	0.40	0.14	0.21	0.52	0.13	0.73	1.31	0.85
C2	0.16	0.28	0.27	0.21	0.14	0.15	0.08	0.22	0.10	0.11	0.21	0.37	0.24	0.13	0.12	0.38	0.13	0.20	0.53	0.19	0.69	1.29	0.84
C2'	0.23	0.35	0.10	0.18	0.23	0.19	0.16	0.22	0.17	0.13	0.28	0.43	0.32	0.11	0.20	0.19	0.22	0.24	0.44	0.11	0.64	1.21	0.78
C3'	0.25	0.36	0.14	0.18	0.25	0.17	0.17	0.23	0.18	0.14	0.29	0.45	0.33	0.12	0.21	0.16	0.23	0.24	0.58	0.10	0.82	1.48	0.99
C4	0.16	0.25	0.29	0.18	0.13	0.07	0.11	0.32	0.15	0.10	0.16	0.38	0.23	0.15	0.11	0.34	0.16	0.16	0.85	0.29	1.09	1.89	1.29
C4'	0.19	0.31	0.28	0.22	0.18	0.15	0.11	0.26	0.11	0.11	0.23	0.42	0.28	0.11	0.15	0.37	0.11	0.21	0.64	0.09	0.90	1.56	1.04
C5	0.17	0.25	0.30	0.19	0.13	0.08	0.10	0.35	0.13	0.09	0.16	0.38	0.23	0.14	0.11	0.35	0.17	0.17	0.90	0.24	1.19	2.01	1.39
C5'	0.27	0.38	0.38	0.31	0.25	0.20	0.17	0.33	0.16	0.17	0.28	0.50	0.35	0.14	0.23	0.42	0.10	0.26	0.77	0.09	1.09	1.79	1.23
C6	0.16	0.26	0.29	0.19	0.13	0.06	0.09	0.28	0.10	0.09	0.17	0.38	0.24	0.12	0.11	0.37	0.14	0.17	0.78	0.19	1.03	1.81	1.22
N1	0.16	0.27	0.28	0.20	0.14	0.12	0.08	0.23	0.09	0.10	0.20	0.38	0.24	0.12	0.11	0.38	0.12	0.18	0.61	0.17	0.81	1.48	0.98
N3	0.16	0.27	0.27	0.19	0.13	0.10	0.09	0.23	0.12	0.09	0.18	0.37	0.24	0.14	0.11	0.36	0.12	0.16	0.64	0.28	0.80	1.50	0.99
O2	0.19	0.28	0.25	0.24	0.16	0.23	0.09	0.28	0.11	0.13	0.22	0.36	0.25	0.13	0.15	0.39	0.16	0.25	0.39	0.16	0.57	0.96	0.63
O2'	0.20	0.33	0.09	0.18	0.21	0.21	0.15	0.23	0.17	0.12	0.28	0.41	0.30	0.11	0.17	0.25	0.20	0.24	0.33	0.12	0.52	0.97	0.61
O3'	0.31	0.38	0.12	0.23	0.29	0.20	0.21	0.22	0.22	0.19	0.32	0.46	0.36	0.16	0.26	0.17	0.35	0.26	0.53	0.15	0.76	1.41	0.94
O4	0.18	0.23	0.31	0.19	0.13	0.11	0.14	0.41	0.20	0.11	0.15	0.37	0.23	0.16	0.12	0.34	0.20	0.18	0.98	0.33	1.25	2.09	1.47
O4'	0.16	0.24	0.39	0.29	0.12	0.15	0.09	0.27	0.09	0.15	0.17	0.35	0.20	0.16	0.13	0.54	0.21	0.18	0.64	0.16	0.87	1.52	1.00
O5'	0.10	0.13	0.45	0.34	0.12	0.23	0.18	0.50	0.18	0.21	0.13	0.22	0.11	0.24	0.13	0.56	0.28	0.17	1.06	0.25	1.37	2.18	1.54
OP1	0.10	0.14	0.46	0.35	0.12	0.26	0.18	0.60	0.18	0.19	0.13	0.22	0.13	0.23	0.13	0.52	0.26	0.19	1.20	0.25	1.60	2.44	1.77
OP2	0.12	0.15	0.49	0.38	0.13	0.28	0.18	0.67	0.19	0.18	0.14	0.22	0.14	0.22	0.14	0.52	0.24	0.21	1.31	0.24	1.76	2.62	1.92
P	0.10	0.14	0.50	0.39	0.12	0.26	0.18	0.59	0.18	0.20	0.13	0.23	0.13	0.23	0.13	0.58	0.27	0.18	1.20	0.25	1.59	2.43	1.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.17	0.01	0.18	0.02	0.17	0.26	0.16
C2	0.03	0.00	0.43	0.33	0.01	0.31	0.01	0.69	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.37	0.18	0.22	1.29	0.03	1.43	2.19	1.68
C2'	0.00	0.43	0.00	0.01	0.22	0.01	0.12	0.09	0.21	0.20	0.34	0.52	0.42	0.09	0.02	0.00	0.03	0.02	0.35	0.17	0.46	0.41	0.37
C3'	0.02	0.33	0.01	0.00	0.14	0.00	0.14	0.01	0.15	0.29	0.24	0.44	0.32	0.25	0.11	0.02	0.01	0.01	0.19	0.16	0.45	0.15	0.23
C4	0.02	0.01	0.22	0.14	0.00	0.12	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	0.12	0.11	0.64	0.01	0.59	1.04	0.77
C4'	0.01	0.31	0.01	0.00	0.12	0.00	0.06	0.00	0.08	0.25	0.21	0.42	0.31	0.19	0.05	0.15	0.02	0.00	0.01	0.06	0.19	0.09	0.05
C5	0.01	0.01	0.12	0.14	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.09	0.03	0.40	0.01	0.36	0.78	0.52
C5'	0.03	0.69	0.09	0.01	0.28	0.00	0.14	0.00	0.24	0.40	0.49	0.92	0.64	0.32	0.08	0.06	0.10	0.01	0.01	0.19	0.18	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.21	0.15	0.01	0.08	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.29	0.10	0.08	0.63	0.01	0.66	1.21	0.86
C8	0.02	0.01	0.20	0.29	0.01	0.25	0.01	0.40	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.24	0.10	0.14	0.27	0.02	0.42	0.26	0.32
N1	0.03	0.01	0.34	0.24	0.01	0.21	0.01	0.49	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.34	0.13	0.16	1.02	0.02	1.15	1.85	1.37
N2	0.04	0.01	0.52	0.44	0.02	0.42	0.01	0.92	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.43	0.22	0.28	1.62	0.03	1.93	2.84	2.18
N3	0.03	0.01	0.42	0.32	0.01	0.31	0.01	0.64	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.33	0.18	0.22	1.18	0.02	1.19	1.81	1.43
N7	0.01	0.01	0.09	0.25	0.01	0.19	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.10	0.09	0.12	0.02	0.26	0.11	0.16
N9	0.01	0.02	0.02	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.13	0.10	0.01	0.19	0.01	0.11	0.36	0.20
O2'	0.02	0.37	0.00	0.02	0.23	0.15	0.23	0.06	0.29	0.24	0.34	0.43	0.33	0.24	0.13	0.00	0.05	0.11	0.19	0.30	0.37	0.34	0.26
O3'	0.17	0.18	0.03	0.01	0.12	0.02	0.09	0.10	0.10	0.10	0.13	0.22	0.18	0.10	0.10	0.05	0.00	0.10	0.03	0.09	0.40	0.22	0.17
O4'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.11	0.00	0.03	0.01	0.08	0.14	0.16	0.28	0.22	0.09	0.01	0.11	0.10	0.00	0.06	0.04	0.07	0.13	0.08
O5'	0.18	1.29	0.35	0.19	0.64	0.01	0.40	0.01	0.63	0.27	1.02	1.62	1.18	0.12	0.19	0.19	0.03	0.06	0.00	0.51	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.17	0.16	0.01	0.06	0.01	0.19	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.30	0.09	0.04	0.51	0.00	0.56	1.07	0.73
OP1	0.17	1.43	0.46	0.45	0.59	0.19	0.36	0.18	0.66	0.42	1.15	1.93	1.19	0.26	0.11	0.37	0.40	0.07	0.02	0.56	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	2.19	0.41	0.15	1.04	0.09	0.78	0.16	1.21	0.26	1.85	2.84	1.81	0.11	0.36	0.34	0.22	0.13	0.02	1.07	0.01	0.00	0.01
P	0.16	1.68	0.37	0.23	0.77	0.05	0.52	0.02	0.86	0.32	1.37	2.18	1.43	0.16	0.20	0.26	0.17	0.08	0.01	0.73	0.01	0.01	0.00