Doublet Group distance statistics: 51949

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 5, 10, 11, 21, 14, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.013, 0.019, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.014, 0.025, 0.035, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.016, 0.027, 0.038, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.016, 0.029, 0.043, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.013, 0.027, 0.042, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.020, 0.040, 0.060, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.018, 0.039, 0.060, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.039 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.020, 0.045, 0.069, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.045 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.027, 0.114, 0.202, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.114 std_dev=0.087
C2'	A	0, 0.026, 0.125, 0.225, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.125 std_dev=0.100
C6	B	0, 0.228, 0.351, 0.475, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.351 std_dev=0.123
C4'	A	0, 0.063, 0.191, 0.318, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.191 std_dev=0.128
O2'	A	0, 0.085, 0.218, 0.350, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.218 std_dev=0.132
C5	B	0, 0.229, 0.375, 0.521, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.375 std_dev=0.146
C3'	A	0, 0.058, 0.206, 0.353, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.206 std_dev=0.148
N1	B	0, 0.307, 0.462, 0.616, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.462 std_dev=0.154
N3	B	0, 0.318, 0.496, 0.674, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.496 std_dev=0.178
C4	B	0, 0.222, 0.406, 0.590, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.406 std_dev=0.184
C2	B	0, 0.355, 0.548, 0.742, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.548 std_dev=0.194
O4'	B	0, 0.334, 0.543, 0.753, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.543 std_dev=0.209
C5'	A	0, 0.120, 0.334, 0.548, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.334 std_dev=0.214
O3'	A	0, 0.106, 0.324, 0.542, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.324 std_dev=0.218
C1'	B	0, 0.355, 0.603, 0.851, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.603 std_dev=0.248
N4	B	0, 0.198, 0.468, 0.739, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.468 std_dev=0.270
C5'	B	0, 0.178, 0.451, 0.724, 1.825 max_d=1.825 avg_d=0.451 std_dev=0.273
C4'	B	0, 0.263, 0.543, 0.823, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.543 std_dev=0.280
O2	B	0, 0.412, 0.715, 1.018, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.715 std_dev=0.303
P	B	0, 0.124, 0.428, 0.732, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.428 std_dev=0.304
OP2	B	0, 0.141, 0.478, 0.815, 1.915 max_d=1.915 avg_d=0.478 std_dev=0.337
O5'	B	0, 0.102, 0.439, 0.777, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.439 std_dev=0.337
C3'	B	0, 0.276, 0.623, 0.970, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.623 std_dev=0.347
C2'	B	0, 0.354, 0.715, 1.076, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.715 std_dev=0.361
OP1	B	0, 0.181, 0.573, 0.965, 2.314 max_d=2.314 avg_d=0.573 std_dev=0.392
O5'	A	0, 0.049, 0.460, 0.870, 2.300 max_d=2.300 avg_d=0.460 std_dev=0.411
O3'	B	0, 0.316, 0.798, 1.280, 2.973 max_d=2.973 avg_d=0.798 std_dev=0.482
O2'	B	0, 0.490, 0.982, 1.474, 2.392 max_d=2.392 avg_d=0.982 std_dev=0.492
OP1	A	0, 0.559, 1.175, 1.791, 4.792 max_d=4.792 avg_d=1.175 std_dev=0.616
P	A	0, 0.336, 0.969, 1.602, 3.919 max_d=3.919 avg_d=0.969 std_dev=0.633
OP2	A	0, 0.238, 1.291, 2.343, 6.628 max_d=6.628 avg_d=1.291 std_dev=1.053

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.18	0.27	0.17
C2	0.03	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.04	0.25	0.28	0.52	0.32
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.08	0.08	0.07	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.18	0.18	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.10	0.10	0.10	0.09	0.11	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.19	0.22	0.18	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.02	0.25	0.27	0.51	0.32
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.05	0.04	0.07	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.16	0.15	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.31	0.35	0.67	0.42
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.13	0.10	0.07	0.14	0.14	0.08	0.04	0.03	0.02	0.01	0.14	0.15	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.32	0.38	0.71	0.44
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.30	0.32	0.62	0.40
N1	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.29	0.34	0.63	0.40
N3	0.03	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.04	0.21	0.24	0.44	0.27
N6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.14	0.03	0.35	0.45	0.81	0.51
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.12	0.04	0.34	0.40	0.75	0.47
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.22	0.23	0.46	0.28
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.04	0.08	0.04	0.10	0.10	0.08	0.04	0.03	0.00	0.04	0.04	0.06	0.25	0.14	0.09
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.08	0.02	0.11	0.03	0.12	0.11	0.13	0.11	0.14	0.12	0.05	0.04	0.00	0.02	0.18	0.33	0.22	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.08	0.20	0.27	0.18
O5'	0.11	0.25	0.15	0.19	0.25	0.01	0.31	0.01	0.32	0.30	0.29	0.21	0.35	0.34	0.22	0.06	0.18	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.28	0.18	0.22	0.27	0.16	0.35	0.14	0.38	0.32	0.34	0.24	0.45	0.40	0.23	0.25	0.33	0.20	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.27	0.52	0.18	0.18	0.51	0.15	0.67	0.15	0.71	0.62	0.63	0.44	0.81	0.75	0.46	0.14	0.22	0.27	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.32	0.11	0.13	0.32	0.07	0.42	0.01	0.44	0.40	0.40	0.27	0.51	0.47	0.28	0.09	0.16	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.22	0.18	0.14	0.17	0.17	0.17	0.19	0.15	0.18	0.20	0.20	0.28	0.26	0.15	0.20	0.16	0.04	0.09	0.05
C2	0.28	0.21	0.30	0.25	0.21	0.25	0.22	0.23	0.17	0.18	0.19	0.29	0.35	0.37	0.27	0.25	0.19	0.15	0.21	0.14
C2'	0.20	0.21	0.16	0.15	0.19	0.15	0.20	0.19	0.18	0.19	0.21	0.20	0.24	0.22	0.15	0.18	0.18	0.08	0.11	0.09
C3'	0.16	0.21	0.13	0.15	0.24	0.11	0.24	0.14	0.21	0.19	0.23	0.26	0.22	0.15	0.15	0.16	0.07	0.02	0.06	0.01
C4	0.23	0.23	0.21	0.17	0.16	0.18	0.18	0.18	0.14	0.17	0.19	0.22	0.31	0.28	0.17	0.20	0.16	0.09	0.20	0.11
C4'	0.17	0.21	0.13	0.14	0.23	0.13	0.23	0.17	0.18	0.18	0.22	0.26	0.23	0.18	0.15	0.17	0.06	0.07	0.12	0.05
C5	0.23	0.24	0.20	0.17	0.16	0.17	0.20	0.16	0.16	0.18	0.21	0.24	0.32	0.26	0.17	0.20	0.19	0.15	0.26	0.16
C5'	0.17	0.25	0.15	0.17	0.32	0.12	0.31	0.15	0.24	0.21	0.29	0.37	0.25	0.14	0.19	0.16	0.08	0.15	0.23	0.12
C6	0.25	0.24	0.24	0.20	0.19	0.20	0.23	0.18	0.18	0.19	0.19	0.30	0.35	0.29	0.21	0.21	0.21	0.18	0.28	0.19
C8	0.20	0.24	0.16	0.14	0.20	0.15	0.18	0.15	0.15	0.18	0.24	0.23	0.29	0.20	0.14	0.18	0.18	0.15	0.25	0.16
N1	0.27	0.23	0.28	0.24	0.23	0.24	0.24	0.21	0.19	0.20	0.19	0.33	0.36	0.35	0.25	0.24	0.20	0.16	0.26	0.17
N3	0.26	0.21	0.26	0.22	0.17	0.23	0.19	0.22	0.15	0.16	0.18	0.24	0.32	0.34	0.23	0.24	0.18	0.12	0.18	0.11
N6	0.24	0.25	0.24	0.21	0.20	0.19	0.24	0.17	0.19	0.20	0.21	0.31	0.35	0.28	0.22	0.21	0.23	0.22	0.33	0.22
N7	0.21	0.25	0.17	0.15	0.19	0.15	0.19	0.15	0.16	0.18	0.24	0.24	0.31	0.21	0.15	0.18	0.20	0.19	0.30	0.20
N9	0.21	0.23	0.17	0.14	0.17	0.16	0.17	0.16	0.14	0.17	0.21	0.21	0.29	0.24	0.14	0.19	0.15	0.07	0.17	0.09
O2'	0.29	0.27	0.27	0.24	0.21	0.25	0.21	0.28	0.23	0.25	0.24	0.21	0.31	0.34	0.24	0.28	0.26	0.15	0.12	0.14
O3'	0.19	0.23	0.18	0.21	0.28	0.16	0.29	0.20	0.26	0.22	0.25	0.29	0.22	0.16	0.22	0.18	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.20	0.21	0.15	0.12	0.19	0.14	0.19	0.17	0.15	0.17	0.21	0.23	0.27	0.23	0.13	0.18	0.11	0.04	0.10	0.02
O5'	0.31	0.40	0.33	0.34	0.47	0.24	0.45	0.22	0.38	0.36	0.44	0.51	0.39	0.29	0.35	0.27	0.31	0.26	0.40	0.28
OP1	0.32	0.45	0.39	0.44	0.58	0.33	0.53	0.37	0.42	0.39	0.54	0.68	0.43	0.33	0.49	0.28	0.43	0.56	0.60	0.48
OP2	0.44	0.59	0.51	0.51	0.73	0.35	0.67	0.31	0.56	0.53	0.69	0.82	0.57	0.44	0.53	0.36	0.44	0.47	0.61	0.42
P	0.31	0.44	0.36	0.36	0.56	0.22	0.52	0.21	0.42	0.39	0.52	0.64	0.43	0.29	0.38	0.24	0.31	0.37	0.48	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.09	0.09	0.15	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.09	0.03	0.21	0.20	0.25	0.21
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.07	0.07	0.10	0.00	0.02	0.01	0.15	0.17	0.12	0.12
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.10	0.06	0.10	0.13	0.09	0.02	0.01	0.01	0.21	0.23	0.12	0.16
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.03	0.33	0.34	0.38	0.33
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.07	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.09	0.17	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.03	0.35	0.34	0.37	0.34
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.11	0.07	0.09	0.13	0.05	0.07	0.04	0.01	0.01	0.10	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.03	0.30	0.26	0.25	0.26
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.20	0.18	0.20	0.18
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03	0.28	0.28	0.32	0.27
N4	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.17	0.03	0.36	0.39	0.44	0.37
O2	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.12	0.11	0.05	0.16	0.15	0.22	0.17
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.07	0.07	0.05	0.07	0.04	0.04	0.09	0.08	0.12	0.00	0.05	0.06	0.06	0.12	0.13	0.06
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.14	0.02	0.15	0.04	0.12	0.07	0.13	0.17	0.11	0.05	0.00	0.02	0.20	0.28	0.18	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.06	0.02	0.00	0.08	0.08	0.20	0.11
O5'	0.09	0.21	0.15	0.21	0.33	0.02	0.35	0.01	0.30	0.20	0.28	0.36	0.16	0.06	0.20	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.20	0.17	0.23	0.34	0.09	0.34	0.10	0.26	0.18	0.28	0.39	0.15	0.12	0.28	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.25	0.12	0.12	0.38	0.17	0.37	0.22	0.25	0.20	0.32	0.44	0.22	0.13	0.18	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.21	0.12	0.16	0.33	0.03	0.34	0.01	0.26	0.18	0.27	0.37	0.17	0.06	0.19	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00