Doublet Group distance statistics: 51951

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 4, 3, 1, 0, 2, 6, 12, 5, 9, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.011, 0.019, 0.027, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.014, 0.030, 0.045, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.028, 0.043, 0.059, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.043 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.029, 0.047, 0.065, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.047 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.009, 0.027, 0.046, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.006, 0.025, 0.045, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.008, 0.031, 0.053, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.031 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.007, 0.171, 0.335, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.171 std_dev=0.164
C2'	A	0, 0.018, 0.208, 0.397, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.208 std_dev=0.190
O2'	A	0, 0.090, 0.323, 0.557, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.323 std_dev=0.233
C4'	A	0, 0.108, 0.345, 0.581, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.345 std_dev=0.237
C5	B	0, 0.510, 0.755, 0.999, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.755 std_dev=0.245
C6	B	0, 0.519, 0.773, 1.027, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.773 std_dev=0.254
C4	B	0, 0.610, 0.868, 1.126, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.868 std_dev=0.258
C3'	A	0, 0.044, 0.332, 0.621, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.332 std_dev=0.288
N4	B	0, 0.808, 1.099, 1.390, 1.624 max_d=1.624 avg_d=1.099 std_dev=0.291
N3	B	0, 0.644, 0.973, 1.303, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.973 std_dev=0.330
C2	B	0, 0.760, 1.101, 1.441, 1.532 max_d=1.532 avg_d=1.101 std_dev=0.341
N1	B	0, 0.650, 0.993, 1.336, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.993 std_dev=0.343
O3'	A	0, 0.050, 0.460, 0.870, 1.818 max_d=1.818 avg_d=0.460 std_dev=0.410
O2	B	0, 1.014, 1.435, 1.856, 2.085 max_d=2.085 avg_d=1.435 std_dev=0.421
C5'	A	0, 0.179, 0.605, 1.031, 2.096 max_d=2.096 avg_d=0.605 std_dev=0.426
C1'	B	0, 0.842, 1.330, 1.819, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.330 std_dev=0.489
O4'	B	0, 0.779, 1.271, 1.762, 2.060 max_d=2.060 avg_d=1.271 std_dev=0.491
O5'	B	0, 0.636, 1.168, 1.701, 2.280 max_d=2.280 avg_d=1.168 std_dev=0.533
P	B	0, 0.315, 0.882, 1.450, 2.472 max_d=2.472 avg_d=0.882 std_dev=0.567
OP2	B	0, 0.208, 0.781, 1.354, 2.466 max_d=2.466 avg_d=0.781 std_dev=0.573
O5'	A	0, 1.564, 2.158, 2.752, 3.719 max_d=3.719 avg_d=2.158 std_dev=0.594
C2'	B	0, 0.905, 1.517, 2.128, 2.727 max_d=2.727 avg_d=1.517 std_dev=0.612
C5'	B	0, 0.654, 1.283, 1.913, 2.567 max_d=2.567 avg_d=1.283 std_dev=0.630
C4'	B	0, 0.787, 1.418, 2.049, 2.577 max_d=2.577 avg_d=1.418 std_dev=0.631
C3'	B	0, 0.833, 1.486, 2.139, 2.760 max_d=2.760 avg_d=1.486 std_dev=0.653
P	A	0, 2.217, 2.972, 3.726, 4.833 max_d=4.833 avg_d=2.972 std_dev=0.754
OP1	B	0, 0.669, 1.454, 2.239, 3.421 max_d=3.421 avg_d=1.454 std_dev=0.785
O2'	B	0, 1.095, 1.891, 2.687, 3.342 max_d=3.342 avg_d=1.891 std_dev=0.796
O3'	B	0, 0.986, 1.841, 2.696, 3.503 max_d=3.503 avg_d=1.841 std_dev=0.855
OP1	A	0, 2.382, 3.270, 4.157, 5.075 max_d=5.075 avg_d=3.270 std_dev=0.887
OP2	A	0, 2.924, 3.838, 4.752, 6.820 max_d=6.820 avg_d=3.838 std_dev=0.914

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.21	0.20	0.34	0.17
C2	0.04	0.00	0.13	0.16	0.02	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.13	0.19	0.05	0.40	0.34	0.73	0.45
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.10	0.14	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.29	0.22	0.14
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.10	0.13	0.14	0.15	0.10	0.11	0.05	0.02	0.01	0.02	0.25	0.31	0.21	0.19
C4	0.02	0.02	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.42	0.34	0.71	0.46
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.08	0.07	0.09	0.09	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.24	0.19	0.10
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.50	0.48	0.91	0.61
C5'	0.04	0.15	0.02	0.03	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.17	0.18	0.13	0.21	0.20	0.12	0.05	0.04	0.02	0.01	0.15	0.24	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.52	0.51	0.97	0.65
C8	0.01	0.02	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	0.51	0.45	0.81	0.58
N1	0.04	0.00	0.10	0.14	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.16	0.04	0.47	0.43	0.88	0.57
N3	0.04	0.00	0.14	0.15	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.13	0.17	0.05	0.36	0.28	0.62	0.37
N6	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.12	0.03	0.56	0.62	1.09	0.74
N7	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.56	0.56	0.99	0.70
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.39	0.29	0.61	0.40
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.11	0.13	0.07	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.10	0.41	0.21	0.18
O3'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.12	0.14	0.16	0.17	0.12	0.13	0.05	0.05	0.00	0.01	0.26	0.40	0.35	0.30
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.18	0.18	0.32	0.16
O5'	0.21	0.40	0.20	0.25	0.42	0.02	0.50	0.01	0.52	0.51	0.47	0.36	0.56	0.56	0.39	0.10	0.26	0.18	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.34	0.29	0.31	0.34	0.24	0.48	0.15	0.51	0.45	0.43	0.28	0.62	0.56	0.29	0.41	0.40	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.73	0.22	0.21	0.71	0.19	0.91	0.24	0.97	0.81	0.88	0.62	1.09	0.99	0.61	0.21	0.35	0.32	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.45	0.14	0.19	0.46	0.10	0.61	0.02	0.65	0.58	0.57	0.37	0.74	0.70	0.40	0.18	0.30	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.25	0.18	0.17	0.19	0.19	0.19	0.26	0.17	0.18	0.25	0.21	0.32	0.22	0.18	0.18	0.24	0.06	0.12	0.07
C2	0.39	0.22	0.39	0.37	0.19	0.41	0.21	0.40	0.27	0.25	0.23	0.28	0.34	0.48	0.39	0.41	0.35	0.25	0.21	0.21
C2'	0.20	0.26	0.17	0.17	0.21	0.17	0.19	0.26	0.18	0.20	0.25	0.22	0.31	0.19	0.18	0.17	0.27	0.12	0.13	0.12
C3'	0.21	0.24	0.17	0.17	0.24	0.14	0.24	0.18	0.21	0.21	0.24	0.25	0.26	0.19	0.19	0.20	0.10	0.03	0.09	0.02
C4	0.24	0.22	0.23	0.22	0.16	0.26	0.20	0.29	0.23	0.18	0.22	0.21	0.30	0.28	0.22	0.27	0.28	0.13	0.18	0.12
C4'	0.20	0.25	0.16	0.17	0.29	0.14	0.30	0.19	0.24	0.21	0.27	0.33	0.28	0.19	0.18	0.18	0.08	0.12	0.20	0.09
C5	0.25	0.21	0.22	0.21	0.13	0.25	0.22	0.26	0.24	0.20	0.19	0.20	0.29	0.28	0.21	0.26	0.28	0.14	0.24	0.15
C5'	0.28	0.36	0.26	0.26	0.46	0.20	0.46	0.20	0.37	0.33	0.41	0.51	0.35	0.25	0.27	0.24	0.15	0.25	0.36	0.21
C6	0.33	0.24	0.30	0.27	0.15	0.31	0.24	0.30	0.26	0.26	0.16	0.26	0.33	0.37	0.27	0.33	0.30	0.17	0.25	0.17
C8	0.17	0.20	0.15	0.19	0.17	0.19	0.18	0.24	0.17	0.15	0.22	0.20	0.25	0.17	0.21	0.18	0.29	0.19	0.30	0.21
N1	0.39	0.22	0.38	0.34	0.18	0.38	0.23	0.36	0.27	0.27	0.18	0.30	0.34	0.47	0.36	0.39	0.33	0.22	0.23	0.19
N3	0.31	0.24	0.31	0.30	0.19	0.36	0.21	0.37	0.25	0.21	0.26	0.24	0.35	0.39	0.32	0.35	0.33	0.22	0.19	0.18
N6	0.34	0.28	0.31	0.27	0.18	0.30	0.26	0.28	0.26	0.28	0.19	0.29	0.37	0.38	0.27	0.32	0.30	0.18	0.28	0.19
N7	0.20	0.21	0.17	0.19	0.15	0.20	0.21	0.24	0.21	0.17	0.21	0.18	0.27	0.20	0.20	0.20	0.29	0.20	0.31	0.21
N9	0.18	0.22	0.17	0.17	0.17	0.20	0.19	0.25	0.18	0.15	0.23	0.20	0.29	0.21	0.18	0.19	0.26	0.09	0.18	0.11
O2'	0.31	0.34	0.29	0.26	0.24	0.26	0.21	0.32	0.22	0.29	0.31	0.23	0.42	0.32	0.26	0.28	0.32	0.18	0.13	0.16
O3'	0.23	0.23	0.19	0.20	0.23	0.18	0.23	0.19	0.21	0.21	0.22	0.24	0.25	0.22	0.22	0.24	0.01	0.02	0.02	0.00
O4'	0.18	0.24	0.15	0.15	0.24	0.15	0.25	0.21	0.19	0.17	0.25	0.28	0.30	0.19	0.16	0.16	0.15	0.07	0.17	0.05
O5'	0.38	0.51	0.38	0.37	0.63	0.29	0.61	0.28	0.51	0.46	0.58	0.70	0.49	0.35	0.37	0.32	0.33	0.28	0.35	0.27
OP1	0.40	0.60	0.43	0.43	0.81	0.34	0.73	0.36	0.56	0.51	0.73	0.96	0.56	0.39	0.46	0.35	0.39	0.44	0.53	0.39
OP2	0.63	0.92	0.62	0.54	1.12	0.42	0.98	0.36	0.79	0.78	1.06	1.27	0.90	0.58	0.53	0.49	0.43	0.52	0.47	0.40
P	0.42	0.65	0.43	0.39	0.83	0.28	0.75	0.26	0.59	0.55	0.77	0.97	0.62	0.38	0.40	0.32	0.33	0.37	0.41	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.08	0.07	0.22	0.10
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.18	0.15	0.26	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.07	0.07	0.16	0.00	0.02	0.01	0.12	0.14	0.12	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.02	0.13	0.05	0.10	0.10	0.16	0.02	0.01	0.01	0.18	0.20	0.09	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.11	0.03	0.25	0.22	0.29	0.22
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.06	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.09	0.17	0.04
C5	0.02	0.02	0.08	0.13	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.15	0.04	0.26	0.22	0.28	0.22
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.13	0.01	0.13	0.00	0.12	0.08	0.11	0.14	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.10	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.15	0.04	0.22	0.17	0.25	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.17	0.12	0.24	0.14
N3	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.22	0.19	0.28	0.20
N4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.13	0.03	0.27	0.25	0.31	0.25
O2	0.04	0.01	0.16	0.16	0.02	0.07	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.20	0.06	0.15	0.14	0.26	0.15
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.04	0.06	0.05	0.06	0.03	0.07	0.07	0.13	0.00	0.05	0.05	0.06	0.12	0.15	0.06
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.11	0.02	0.15	0.04	0.15	0.05	0.11	0.13	0.20	0.05	0.00	0.02	0.20	0.28	0.14	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.06	0.05	0.02	0.00	0.09	0.09	0.27	0.14
O5'	0.08	0.18	0.12	0.18	0.25	0.01	0.26	0.01	0.22	0.17	0.22	0.27	0.15	0.06	0.20	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.15	0.14	0.20	0.22	0.09	0.22	0.10	0.17	0.12	0.19	0.25	0.14	0.12	0.28	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.26	0.12	0.09	0.29	0.17	0.28	0.17	0.25	0.24	0.28	0.31	0.26	0.15	0.14	0.27	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.16	0.07	0.12	0.22	0.04	0.22	0.02	0.17	0.14	0.20	0.25	0.15	0.06	0.18	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00