Doublet Group distance statistics: 51952

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 4, 1, 8, 3, 0, 0, 5, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.012, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.018, 0.031, 0.045, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.031 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.018, 0.032, 0.046, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.032 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.017, 0.032, 0.046, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.024, 0.040, 0.056, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.040 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.017, 0.034, 0.050, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.034 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.020, 0.039, 0.059, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.039 std_dev=0.020
C2'	A	0, 0.085, 0.226, 0.366, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.226 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.141, 0.301, 0.461, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.301 std_dev=0.160
O4'	A	0, 0.053, 0.226, 0.399, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.226 std_dev=0.173
C3'	A	0, 0.140, 0.395, 0.649, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.395 std_dev=0.254
O4'	B	0, 0.319, 0.592, 0.864, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.592 std_dev=0.272
C6	B	0, 0.269, 0.553, 0.838, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.553 std_dev=0.285
C4'	A	0, 0.090, 0.381, 0.672, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.381 std_dev=0.291
C5	B	0, 0.310, 0.602, 0.894, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.602 std_dev=0.292
C5'	B	0, 0.347, 0.656, 0.964, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.656 std_dev=0.308
C4'	B	0, 0.331, 0.640, 0.949, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.640 std_dev=0.309
C1'	B	0, 0.295, 0.604, 0.914, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.604 std_dev=0.309
N1	B	0, 0.223, 0.534, 0.845, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.534 std_dev=0.311
O5'	B	0, 0.321, 0.632, 0.944, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.632 std_dev=0.312
O3'	A	0, 0.217, 0.529, 0.842, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.529 std_dev=0.312
C2'	B	0, 0.334, 0.685, 1.036, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.685 std_dev=0.351
P	B	0, 0.305, 0.659, 1.012, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.659 std_dev=0.353
C4	B	0, 0.237, 0.594, 0.950, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.594 std_dev=0.356
C2	B	0, 0.224, 0.582, 0.940, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.582 std_dev=0.358
C3'	B	0, 0.326, 0.688, 1.050, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.688 std_dev=0.362
N3	B	0, 0.201, 0.591, 0.980, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.591 std_dev=0.389
O2	B	0, 0.304, 0.699, 1.093, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.699 std_dev=0.394
OP2	B	0, 0.314, 0.709, 1.104, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.709 std_dev=0.395
N4	B	0, 0.285, 0.691, 1.097, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.691 std_dev=0.406
O2'	B	0, 0.394, 0.805, 1.217, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.805 std_dev=0.412
OP1	B	0, 0.368, 0.800, 1.232, 2.162 max_d=2.162 avg_d=0.800 std_dev=0.432
O3'	B	0, 0.382, 0.845, 1.308, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.845 std_dev=0.463
C5'	A	0, 0.193, 0.779, 1.365, 1.988 max_d=1.988 avg_d=0.779 std_dev=0.586
O5'	A	0, 0.361, 1.102, 1.842, 2.949 max_d=2.949 avg_d=1.102 std_dev=0.741
P	A	0, 0.930, 2.238, 3.546, 4.982 max_d=4.982 avg_d=2.238 std_dev=1.308
OP1	A	0, 1.027, 2.668, 4.309, 5.621 max_d=5.621 avg_d=2.668 std_dev=1.641
OP2	A	0, 1.122, 2.869, 4.616, 6.237 max_d=6.237 avg_d=2.869 std_dev=1.747

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.20	0.36	0.42	0.21
C2	0.04	0.00	0.11	0.20	0.01	0.10	0.01	0.26	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.15	0.21	0.03	0.55	0.74	1.15	0.67
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.03	0.07	0.07	0.09	0.11	0.06	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.28	0.47	0.51	0.19
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.14	0.00	0.15	0.03	0.17	0.14	0.19	0.18	0.17	0.14	0.09	0.02	0.01	0.02	0.36	0.47	0.56	0.26
C4	0.02	0.01	0.06	0.14	0.00	0.10	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.13	0.01	0.51	0.63	1.02	0.60
C4'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.14	0.13	0.12	0.09	0.16	0.15	0.08	0.07	0.02	0.00	0.02	0.51	0.34	0.22
C5	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.13	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.15	0.02	0.61	0.84	1.30	0.82
C5'	0.06	0.26	0.03	0.03	0.25	0.01	0.33	0.00	0.36	0.30	0.32	0.21	0.40	0.36	0.21	0.07	0.05	0.02	0.01	0.33	0.32	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.14	0.01	0.36	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.02	0.65	0.96	1.45	0.91
C8	0.02	0.02	0.07	0.14	0.01	0.13	0.01	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.15	0.05	0.51	0.63	1.06	0.67
N1	0.03	0.00	0.09	0.19	0.01	0.12	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.20	0.02	0.63	0.89	1.36	0.83
N3	0.04	0.00	0.11	0.18	0.00	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.14	0.18	0.04	0.48	0.61	0.95	0.53
N6	0.02	0.02	0.06	0.17	0.01	0.16	0.01	0.40	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.19	0.03	0.70	1.11	1.62	1.04
N7	0.01	0.02	0.06	0.14	0.01	0.15	0.00	0.36	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.16	0.04	0.60	0.88	1.35	0.87
N9	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.08	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.41	0.46	0.81	0.46
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.09	0.07	0.08	0.07	0.11	0.04	0.14	0.14	0.10	0.05	0.04	0.00	0.05	0.06	0.12	0.66	0.42	0.28
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.13	0.02	0.15	0.05	0.18	0.15	0.20	0.18	0.19	0.16	0.08	0.05	0.00	0.03	0.33	0.60	0.62	0.29
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.01	0.06	0.03	0.00	0.15	0.41	0.33	0.32
O5'	0.20	0.55	0.28	0.36	0.51	0.02	0.61	0.01	0.65	0.51	0.63	0.48	0.70	0.60	0.41	0.12	0.33	0.15	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.36	0.74	0.47	0.47	0.63	0.51	0.84	0.33	0.96	0.63	0.89	0.61	1.11	0.88	0.46	0.66	0.60	0.41	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.42	1.15	0.51	0.56	1.02	0.34	1.30	0.32	1.45	1.06	1.36	0.95	1.62	1.35	0.81	0.42	0.62	0.33	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.21	0.67	0.19	0.26	0.60	0.22	0.82	0.02	0.91	0.67	0.83	0.53	1.04	0.87	0.46	0.28	0.29	0.32	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.18	0.19	0.19	0.24	0.22	0.25	0.24	0.18	0.15	0.20	0.32	0.22	0.22	0.21	0.23	0.22	0.05	0.11	0.08
C2	0.27	0.22	0.26	0.24	0.18	0.26	0.23	0.26	0.24	0.22	0.19	0.25	0.28	0.30	0.25	0.27	0.27	0.23	0.34	0.25
C2'	0.17	0.15	0.15	0.18	0.22	0.19	0.23	0.23	0.17	0.13	0.18	0.27	0.18	0.17	0.20	0.19	0.24	0.11	0.14	0.13
C3'	0.18	0.23	0.12	0.10	0.32	0.10	0.33	0.11	0.26	0.21	0.28	0.37	0.21	0.13	0.13	0.18	0.07	0.02	0.07	0.02
C4	0.20	0.17	0.17	0.17	0.20	0.21	0.20	0.23	0.17	0.14	0.19	0.28	0.22	0.21	0.18	0.22	0.23	0.15	0.27	0.18
C4'	0.15	0.20	0.10	0.09	0.36	0.13	0.36	0.13	0.24	0.17	0.28	0.45	0.18	0.13	0.12	0.18	0.07	0.10	0.18	0.07
C5	0.19	0.18	0.16	0.18	0.19	0.20	0.18	0.23	0.17	0.15	0.21	0.29	0.22	0.20	0.18	0.22	0.25	0.21	0.34	0.23
C5'	0.22	0.39	0.18	0.16	0.60	0.10	0.57	0.10	0.41	0.33	0.51	0.72	0.34	0.15	0.16	0.18	0.10	0.17	0.34	0.16
C6	0.21	0.20	0.19	0.19	0.15	0.21	0.20	0.24	0.20	0.18	0.19	0.23	0.25	0.22	0.19	0.23	0.27	0.25	0.38	0.26
C8	0.18	0.18	0.17	0.20	0.27	0.21	0.24	0.24	0.17	0.15	0.24	0.37	0.20	0.18	0.22	0.22	0.27	0.19	0.29	0.21
N1	0.25	0.21	0.23	0.22	0.16	0.24	0.23	0.25	0.23	0.21	0.19	0.25	0.28	0.27	0.22	0.25	0.27	0.25	0.38	0.27
N3	0.24	0.18	0.22	0.21	0.18	0.25	0.21	0.25	0.21	0.18	0.18	0.24	0.25	0.27	0.22	0.26	0.24	0.18	0.28	0.20
N6	0.21	0.22	0.19	0.21	0.17	0.21	0.21	0.24	0.21	0.19	0.22	0.24	0.27	0.22	0.21	0.22	0.28	0.29	0.42	0.29
N7	0.18	0.19	0.17	0.20	0.25	0.21	0.21	0.24	0.17	0.16	0.24	0.35	0.22	0.18	0.22	0.21	0.27	0.24	0.35	0.25
N9	0.18	0.17	0.16	0.17	0.24	0.20	0.24	0.22	0.17	0.14	0.21	0.33	0.20	0.19	0.19	0.21	0.22	0.11	0.21	0.14
O2'	0.32	0.30	0.31	0.32	0.27	0.33	0.26	0.33	0.25	0.28	0.28	0.29	0.34	0.32	0.33	0.33	0.30	0.17	0.14	0.15
O3'	0.19	0.21	0.12	0.09	0.28	0.12	0.29	0.10	0.24	0.20	0.24	0.32	0.20	0.14	0.12	0.21	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.17	0.16	0.14	0.14	0.28	0.18	0.28	0.18	0.18	0.13	0.22	0.38	0.19	0.18	0.16	0.20	0.14	0.06	0.11	0.02
O5'	0.54	0.80	0.58	0.58	1.03	0.40	0.98	0.37	0.79	0.71	0.94	1.15	0.74	0.50	0.57	0.41	0.54	0.39	0.66	0.49
OP1	0.84	1.18	0.95	0.94	1.51	0.75	1.39	0.73	1.11	1.04	1.39	1.73	1.11	0.86	0.97	0.70	0.82	0.76	1.09	0.79
OP2	1.08	1.55	1.17	1.12	1.90	0.83	1.73	0.77	1.41	1.35	1.79	2.14	1.49	1.04	1.12	0.82	0.96	0.80	1.13	0.86
P	0.61	1.02	0.70	0.69	1.37	0.41	1.25	0.38	0.96	0.87	1.24	1.58	0.94	0.57	0.69	0.40	0.59	0.47	0.89	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.08	0.10	0.12	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.16	0.19	0.25	0.18
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.05	0.06	0.12	0.01	0.02	0.01	0.06	0.14	0.11	0.07
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.02	0.12	0.06	0.08	0.10	0.12	0.02	0.01	0.01	0.07	0.17	0.14	0.10
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.21	0.27	0.33	0.26
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.08	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.10	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.14	0.04	0.22	0.27	0.31	0.27
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.13	0.08	0.11	0.15	0.06	0.05	0.03	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.13	0.04	0.20	0.22	0.24	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.15	0.16	0.20	0.16
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.03	0.19	0.23	0.30	0.23
N4	0.03	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.04	0.22	0.30	0.36	0.29
O2	0.03	0.01	0.12	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.15	0.05	0.14	0.16	0.23	0.16
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.02	0.06	0.06	0.11	0.00	0.04	0.05	0.06	0.16	0.10	0.07
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.11	0.02	0.14	0.03	0.13	0.06	0.10	0.13	0.15	0.04	0.00	0.02	0.12	0.25	0.23	0.17
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.09	0.09	0.13	0.11
O5'	0.08	0.16	0.06	0.07	0.21	0.01	0.22	0.01	0.20	0.15	0.19	0.22	0.14	0.06	0.12	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.10	0.19	0.14	0.17	0.27	0.10	0.27	0.08	0.22	0.16	0.23	0.30	0.16	0.16	0.25	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.25	0.11	0.14	0.33	0.03	0.31	0.02	0.24	0.20	0.30	0.36	0.23	0.10	0.23	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.07	0.10	0.26	0.02	0.27	0.01	0.21	0.16	0.23	0.29	0.16	0.07	0.17	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00