Doublet Group distance statistics: 51953

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 4, 5, 1, 4, 1, 3, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.014, 0.031, 0.048, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.031 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.021, 0.041, 0.061, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.041 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.014, 0.040, 0.067, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.040 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.017, 0.048, 0.080, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.048 std_dev=0.031
N3	B	0, 0.250, 0.431, 0.612, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.431 std_dev=0.181
O4'	A	0, 0.069, 0.263, 0.457, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.263 std_dev=0.194
C4	B	0, 0.262, 0.467, 0.673, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.467 std_dev=0.205
C2	B	0, 0.245, 0.483, 0.721, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.483 std_dev=0.238
C2'	A	0, 0.074, 0.315, 0.557, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.315 std_dev=0.241
N4	B	0, 0.395, 0.651, 0.907, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.651 std_dev=0.256
C4'	A	0, 0.195, 0.455, 0.716, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.455 std_dev=0.261
C5	B	0, 0.259, 0.525, 0.791, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.525 std_dev=0.266
O2'	A	0, 0.175, 0.489, 0.803, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.489 std_dev=0.314
O2	B	0, 0.339, 0.659, 0.979, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.659 std_dev=0.320
C6	B	0, 0.180, 0.511, 0.843, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.511 std_dev=0.332
N1	B	0, 0.161, 0.501, 0.841, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.501 std_dev=0.340
C3'	A	0, 0.123, 0.487, 0.851, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.487 std_dev=0.364
C5'	A	0, 0.379, 0.843, 1.307, 2.046 max_d=2.046 avg_d=0.843 std_dev=0.464
C1'	B	0, 0.198, 0.704, 1.210, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.704 std_dev=0.506
O4'	B	0, 0.313, 0.844, 1.375, 1.925 max_d=1.925 avg_d=0.844 std_dev=0.531
O3'	A	0, 0.181, 0.727, 1.272, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.727 std_dev=0.545
O5'	A	0, 0.558, 1.108, 1.659, 2.072 max_d=2.072 avg_d=1.108 std_dev=0.550
P	A	0, 0.580, 1.198, 1.816, 2.328 max_d=2.328 avg_d=1.198 std_dev=0.618
O5'	B	0, 0.366, 1.021, 1.676, 2.293 max_d=2.293 avg_d=1.021 std_dev=0.655
C2'	B	0, 0.179, 0.835, 1.492, 2.327 max_d=2.327 avg_d=0.835 std_dev=0.656
C5'	B	0, 0.439, 1.135, 1.832, 2.449 max_d=2.449 avg_d=1.135 std_dev=0.697
C4'	B	0, 0.269, 0.987, 1.705, 2.472 max_d=2.472 avg_d=0.987 std_dev=0.718
P	B	0, 0.211, 0.954, 1.697, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.954 std_dev=0.743
OP1	A	0, 0.691, 1.435, 2.179, 3.274 max_d=3.274 avg_d=1.435 std_dev=0.744
OP2	B	0, 0.273, 1.047, 1.821, 2.572 max_d=2.572 avg_d=1.047 std_dev=0.774
O2'	B	0, 0.320, 1.094, 1.868, 2.726 max_d=2.726 avg_d=1.094 std_dev=0.774
C3'	B	0, 0.162, 0.949, 1.735, 2.665 max_d=2.665 avg_d=0.949 std_dev=0.787
OP2	A	0, 0.806, 1.691, 2.577, 3.311 max_d=3.311 avg_d=1.691 std_dev=0.885
OP1	B	0, 0.315, 1.264, 2.214, 3.063 max_d=3.063 avg_d=1.264 std_dev=0.949
O3'	B	0, 0.282, 1.272, 2.263, 3.387 max_d=3.387 avg_d=1.272 std_dev=0.990

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.15	0.38	0.16
C2	0.03	0.00	0.18	0.22	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.29	0.04	0.19	0.36	0.45	0.26
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.02	0.06	0.11	0.13	0.19	0.05	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.21	0.31	0.10
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.11	0.00	0.08	0.02	0.10	0.18	0.17	0.22	0.10	0.15	0.05	0.02	0.01	0.01	0.17	0.31	0.27	0.12
C4	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.02	0.20	0.31	0.41	0.23
C4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.10	0.08	0.09	0.07	0.09	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.17	0.30	0.08
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.26	0.40	0.42	0.25
C5'	0.03	0.14	0.02	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.13	0.16	0.13	0.12	0.14	0.15	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.22	0.23	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.02	0.25	0.44	0.44	0.28
C8	0.02	0.01	0.11	0.18	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.20	0.04	0.30	0.32	0.40	0.20
N1	0.03	0.00	0.13	0.17	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.22	0.03	0.22	0.42	0.45	0.28
N3	0.03	0.00	0.19	0.22	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.27	0.04	0.17	0.30	0.43	0.24
N6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.28	0.51	0.44	0.30
N7	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.31	0.42	0.42	0.25
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.19	0.24	0.39	0.18
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.05	0.04	0.05	0.07	0.06	0.13	0.16	0.06	0.05	0.02	0.00	0.03	0.04	0.06	0.21	0.31	0.10
O3'	0.02	0.29	0.02	0.01	0.12	0.02	0.09	0.03	0.13	0.20	0.22	0.27	0.12	0.17	0.05	0.03	0.00	0.02	0.17	0.47	0.30	0.19
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.20	0.44	0.22
O5'	0.09	0.19	0.13	0.17	0.20	0.01	0.26	0.01	0.25	0.30	0.22	0.17	0.28	0.31	0.19	0.06	0.17	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.36	0.21	0.31	0.31	0.17	0.40	0.22	0.44	0.32	0.42	0.30	0.51	0.42	0.24	0.21	0.47	0.20	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.38	0.45	0.31	0.27	0.41	0.30	0.42	0.23	0.44	0.40	0.45	0.43	0.44	0.42	0.39	0.31	0.30	0.44	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.26	0.10	0.12	0.23	0.08	0.25	0.02	0.28	0.20	0.28	0.24	0.30	0.25	0.18	0.10	0.19	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.24	0.22	0.20	0.23	0.25	0.25	0.37	0.20	0.21	0.22	0.26	0.28	0.31	0.21	0.24	0.21	0.05	0.12	0.05
C2	0.45	0.28	0.52	0.43	0.22	0.40	0.28	0.36	0.31	0.32	0.22	0.25	0.38	0.67	0.49	0.39	0.28	0.29	0.34	0.26
C2'	0.23	0.20	0.20	0.25	0.16	0.27	0.18	0.43	0.17	0.19	0.17	0.17	0.23	0.25	0.27	0.23	0.26	0.08	0.16	0.11
C3'	0.24	0.26	0.14	0.16	0.28	0.10	0.29	0.25	0.27	0.25	0.27	0.28	0.26	0.19	0.19	0.20	0.10	0.04	0.07	0.01
C4	0.30	0.26	0.31	0.19	0.17	0.21	0.24	0.25	0.23	0.24	0.19	0.17	0.34	0.42	0.21	0.22	0.20	0.11	0.20	0.08
C4'	0.26	0.33	0.17	0.17	0.42	0.12	0.43	0.26	0.35	0.31	0.38	0.46	0.32	0.21	0.19	0.20	0.06	0.17	0.22	0.12
C5	0.26	0.25	0.27	0.15	0.15	0.15	0.23	0.22	0.18	0.20	0.18	0.19	0.35	0.39	0.16	0.17	0.27	0.11	0.22	0.11
C5'	0.37	0.49	0.32	0.31	0.59	0.24	0.58	0.29	0.49	0.45	0.55	0.64	0.47	0.32	0.33	0.30	0.20	0.28	0.39	0.24
C6	0.30	0.24	0.36	0.24	0.24	0.21	0.28	0.21	0.22	0.21	0.17	0.32	0.37	0.49	0.27	0.22	0.26	0.12	0.22	0.10
C8	0.22	0.27	0.17	0.17	0.21	0.19	0.18	0.32	0.15	0.20	0.27	0.24	0.33	0.27	0.17	0.18	0.39	0.23	0.32	0.27
N1	0.40	0.27	0.48	0.37	0.26	0.34	0.29	0.29	0.28	0.29	0.23	0.32	0.38	0.63	0.44	0.33	0.24	0.21	0.27	0.17
N3	0.40	0.27	0.43	0.35	0.19	0.35	0.27	0.34	0.30	0.30	0.19	0.19	0.35	0.56	0.40	0.35	0.26	0.27	0.32	0.24
N6	0.26	0.20	0.33	0.22	0.30	0.18	0.32	0.20	0.21	0.18	0.16	0.43	0.35	0.46	0.26	0.19	0.32	0.15	0.25	0.15
N7	0.21	0.27	0.19	0.14	0.15	0.15	0.20	0.27	0.14	0.18	0.24	0.17	0.34	0.29	0.13	0.14	0.40	0.23	0.33	0.26
N9	0.25	0.26	0.21	0.14	0.20	0.18	0.23	0.30	0.19	0.21	0.23	0.22	0.31	0.32	0.14	0.19	0.24	0.07	0.17	0.08
O2'	0.31	0.22	0.34	0.41	0.15	0.45	0.17	0.58	0.17	0.22	0.17	0.16	0.28	0.39	0.45	0.35	0.35	0.12	0.15	0.15
O3'	0.21	0.20	0.12	0.20	0.22	0.12	0.23	0.25	0.21	0.20	0.21	0.24	0.21	0.18	0.26	0.22	0.01	0.02	0.01	0.00
O4'	0.25	0.30	0.18	0.14	0.39	0.15	0.41	0.29	0.31	0.27	0.34	0.44	0.31	0.26	0.14	0.18	0.10	0.13	0.18	0.07
O5'	0.35	0.49	0.33	0.34	0.58	0.22	0.54	0.26	0.43	0.43	0.55	0.63	0.48	0.32	0.37	0.26	0.35	0.21	0.34	0.24
OP1	0.59	0.75	0.54	0.48	0.88	0.46	0.77	0.42	0.65	0.66	0.85	0.99	0.75	0.54	0.48	0.53	0.47	0.62	0.55	0.51
OP2	0.78	0.95	0.77	0.67	1.04	0.60	0.95	0.50	0.84	0.86	1.01	1.08	0.94	0.76	0.67	0.67	0.37	0.48	0.49	0.41
P	0.54	0.72	0.50	0.41	0.84	0.34	0.75	0.24	0.62	0.63	0.81	0.92	0.71	0.50	0.40	0.43	0.28	0.30	0.31	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.11	0.06	0.47	0.16
C2	0.01	0.00	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.14	0.02	0.24	0.10	0.42	0.15
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.08	0.08	0.14	0.00	0.02	0.01	0.21	0.20	0.31	0.05
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.13	0.00	0.13	0.02	0.13	0.07	0.13	0.14	0.17	0.02	0.01	0.01	0.30	0.33	0.21	0.15
C4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.16	0.04	0.35	0.16	0.34	0.16
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.08	0.09	0.07	0.06	0.02	0.00	0.01	0.12	0.38	0.08
C5	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.06	0.36	0.16	0.35	0.16
C5'	0.02	0.11	0.02	0.02	0.14	0.01	0.13	0.00	0.10	0.07	0.13	0.15	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.15	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.06	0.32	0.12	0.42	0.15
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.23	0.09	0.44	0.15
N3	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.30	0.13	0.38	0.15
N4	0.03	0.02	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.18	0.05	0.37	0.18	0.30	0.18
O2	0.02	0.01	0.14	0.17	0.02	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.20	0.03	0.19	0.08	0.43	0.15
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.05	0.04	0.02	0.05	0.05	0.10	0.00	0.03	0.05	0.10	0.19	0.34	0.07
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.16	0.02	0.16	0.03	0.14	0.07	0.16	0.18	0.20	0.03	0.00	0.01	0.28	0.47	0.16	0.25
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.01	0.00	0.09	0.10	0.53	0.24
O5'	0.11	0.24	0.21	0.30	0.35	0.01	0.36	0.01	0.32	0.23	0.30	0.37	0.19	0.10	0.28	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.10	0.20	0.33	0.16	0.12	0.16	0.15	0.12	0.09	0.13	0.18	0.08	0.19	0.47	0.10	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.47	0.42	0.31	0.21	0.34	0.38	0.35	0.34	0.42	0.44	0.38	0.30	0.43	0.34	0.16	0.53	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.16	0.15	0.05	0.15	0.16	0.08	0.16	0.02	0.15	0.15	0.15	0.18	0.15	0.07	0.25	0.24	0.01	0.00	0.00	0.00