Doublet Group distance statistics: 51959

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 0, 0, 4, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, -0.001, 0.013, 0.028, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.013 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.010, 0.025, 0.041, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.036 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.020
C2'	A	0, 0.177, 0.348, 0.520, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.348 std_dev=0.171
O4'	A	0, 0.153, 0.325, 0.496, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.325 std_dev=0.171
C4	B	0, 0.303, 0.504, 0.705, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.504 std_dev=0.201
O2'	A	0, 0.197, 0.402, 0.608, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.402 std_dev=0.206
C5	B	0, 0.210, 0.429, 0.648, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.429 std_dev=0.219
C6	B	0, 0.269, 0.492, 0.714, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.492 std_dev=0.222
N4	B	0, 0.342, 0.575, 0.809, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.575 std_dev=0.234
N1	B	0, 0.295, 0.530, 0.765, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.530 std_dev=0.235
C4'	A	0, 0.231, 0.468, 0.705, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.468 std_dev=0.237
O4'	B	0, 0.399, 0.642, 0.885, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.642 std_dev=0.243
C1'	B	0, 0.394, 0.656, 0.919, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.656 std_dev=0.262
C3'	A	0, 0.271, 0.536, 0.801, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.536 std_dev=0.265
N3	B	0, 0.366, 0.639, 0.913, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.639 std_dev=0.274
O5'	B	0, 0.563, 0.848, 1.134, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.848 std_dev=0.286
C4'	B	0, 0.535, 0.824, 1.114, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.824 std_dev=0.290
C2	B	0, 0.327, 0.620, 0.913, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.620 std_dev=0.293
P	B	0, 0.455, 0.751, 1.048, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.751 std_dev=0.297
C5'	B	0, 0.575, 0.872, 1.170, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.872 std_dev=0.298
OP2	B	0, 0.388, 0.703, 1.018, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.703 std_dev=0.315
OP1	B	0, 0.469, 0.841, 1.213, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.841 std_dev=0.372
O3'	A	0, 0.369, 0.746, 1.123, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.746 std_dev=0.377
C3'	B	0, 0.521, 0.899, 1.278, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.899 std_dev=0.379
C2'	B	0, 0.446, 0.833, 1.220, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.833 std_dev=0.387
C5'	A	0, 0.439, 0.865, 1.291, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.865 std_dev=0.426
O2	B	0, 0.330, 0.757, 1.184, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.757 std_dev=0.427
O2'	B	0, 0.536, 0.999, 1.462, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.999 std_dev=0.463
O5'	A	0, 0.557, 1.034, 1.511, 1.708 max_d=1.708 avg_d=1.034 std_dev=0.477
O3'	B	0, 0.612, 1.143, 1.673, 1.805 max_d=1.805 avg_d=1.143 std_dev=0.531
P	A	0, 0.700, 1.387, 2.074, 2.397 max_d=2.397 avg_d=1.387 std_dev=0.687
OP2	A	0, 0.642, 1.401, 2.161, 2.702 max_d=2.702 avg_d=1.401 std_dev=0.760
OP1	A	0, 0.842, 1.631, 2.419, 2.823 max_d=2.823 avg_d=1.631 std_dev=0.788

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.12	0.07
C2	0.02	0.00	0.11	0.12	0.02	0.04	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.10	0.14	0.04	0.18	0.19	0.28	0.19
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.08	0.11	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.10	0.06
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.10	0.11	0.09	0.09	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.13	0.09	0.07
C4	0.01	0.02	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.18	0.18	0.24	0.18
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.03	0.08	0.08	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.08	0.04	0.01
C5	0.01	0.02	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.22	0.24	0.29	0.24
C5'	0.03	0.09	0.01	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.15	0.15	0.12	0.07	0.18	0.17	0.09	0.06	0.04	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.03	0.23	0.26	0.33	0.26
C8	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.04	0.12	0.05	0.20	0.20	0.23	0.20
N1	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.11	0.03	0.21	0.24	0.31	0.23
N3	0.02	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.10	0.13	0.03	0.15	0.16	0.23	0.16
N6	0.02	0.02	0.04	0.09	0.01	0.08	0.02	0.18	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.11	0.04	0.26	0.31	0.37	0.31
N7	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.11	0.04	0.23	0.25	0.30	0.25
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.15	0.15	0.19	0.14
O2'	0.01	0.10	0.00	0.03	0.04	0.06	0.03	0.06	0.04	0.04	0.07	0.10	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.09	0.07	0.03
O3'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.04	0.09	0.12	0.11	0.13	0.11	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01	0.07	0.19	0.15	0.11
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.07	0.08	0.13	0.09
O5'	0.08	0.18	0.06	0.04	0.18	0.01	0.22	0.01	0.23	0.20	0.21	0.15	0.26	0.23	0.15	0.02	0.07	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.19	0.11	0.13	0.18	0.08	0.24	0.08	0.26	0.20	0.24	0.16	0.31	0.25	0.15	0.09	0.19	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.28	0.10	0.09	0.24	0.04	0.29	0.02	0.33	0.23	0.31	0.23	0.37	0.30	0.19	0.07	0.15	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.19	0.06	0.07	0.18	0.01	0.24	0.01	0.26	0.20	0.23	0.16	0.31	0.25	0.14	0.03	0.11	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.28	0.20	0.15	0.22	0.16	0.20	0.13	0.19	0.21	0.28	0.25	0.35	0.22	0.14	0.23	0.22	0.06	0.11	0.07
C2	0.24	0.28	0.24	0.23	0.21	0.23	0.23	0.25	0.25	0.21	0.32	0.27	0.38	0.26	0.22	0.23	0.30	0.18	0.13	0.16
C2'	0.21	0.21	0.17	0.14	0.20	0.16	0.22	0.12	0.19	0.18	0.21	0.23	0.26	0.19	0.13	0.22	0.25	0.10	0.12	0.11
C3'	0.16	0.16	0.10	0.09	0.21	0.15	0.23	0.11	0.17	0.13	0.18	0.25	0.18	0.14	0.10	0.21	0.10	0.03	0.07	0.01
C4	0.17	0.27	0.15	0.13	0.21	0.12	0.18	0.14	0.18	0.17	0.30	0.25	0.34	0.18	0.13	0.16	0.21	0.08	0.15	0.09
C4'	0.19	0.19	0.13	0.09	0.19	0.15	0.21	0.11	0.16	0.14	0.20	0.24	0.25	0.17	0.09	0.22	0.10	0.07	0.15	0.05
C5	0.17	0.26	0.16	0.15	0.20	0.14	0.13	0.14	0.15	0.17	0.29	0.25	0.31	0.17	0.15	0.16	0.19	0.12	0.22	0.13
C5'	0.18	0.17	0.12	0.12	0.20	0.16	0.22	0.14	0.16	0.13	0.18	0.25	0.22	0.15	0.14	0.22	0.10	0.17	0.29	0.15
C6	0.19	0.27	0.19	0.19	0.17	0.17	0.14	0.17	0.17	0.18	0.30	0.23	0.34	0.20	0.19	0.18	0.21	0.13	0.21	0.13
C8	0.20	0.25	0.18	0.16	0.22	0.17	0.14	0.14	0.14	0.18	0.27	0.27	0.29	0.19	0.15	0.21	0.17	0.20	0.29	0.18
N1	0.23	0.27	0.22	0.22	0.17	0.21	0.18	0.22	0.21	0.20	0.29	0.25	0.36	0.24	0.21	0.22	0.26	0.14	0.16	0.14
N3	0.21	0.29	0.20	0.18	0.22	0.19	0.23	0.22	0.25	0.20	0.32	0.27	0.38	0.23	0.18	0.20	0.29	0.16	0.11	0.14
N6	0.21	0.28	0.21	0.21	0.18	0.18	0.15	0.18	0.18	0.20	0.30	0.21	0.34	0.21	0.22	0.19	0.21	0.17	0.26	0.17
N7	0.18	0.25	0.17	0.17	0.22	0.16	0.13	0.15	0.15	0.18	0.28	0.28	0.29	0.18	0.17	0.19	0.18	0.21	0.30	0.19
N9	0.18	0.26	0.16	0.12	0.22	0.12	0.17	0.10	0.15	0.17	0.28	0.26	0.32	0.18	0.11	0.18	0.18	0.08	0.17	0.09
O2'	0.32	0.29	0.29	0.26	0.22	0.27	0.24	0.23	0.25	0.26	0.26	0.23	0.34	0.31	0.26	0.32	0.35	0.19	0.14	0.18
O3'	0.16	0.16	0.09	0.08	0.23	0.16	0.26	0.14	0.19	0.14	0.19	0.27	0.16	0.13	0.09	0.21	0.02	0.02	0.01	0.00
O4'	0.22	0.26	0.17	0.12	0.21	0.16	0.20	0.11	0.17	0.18	0.26	0.26	0.33	0.21	0.11	0.23	0.16	0.04	0.13	0.02
O5'	0.22	0.21	0.20	0.21	0.24	0.21	0.25	0.20	0.22	0.19	0.22	0.28	0.24	0.21	0.23	0.26	0.18	0.22	0.32	0.19
OP1	0.34	0.33	0.40	0.44	0.38	0.35	0.40	0.32	0.37	0.33	0.34	0.42	0.32	0.39	0.48	0.34	0.38	0.35	0.54	0.36
OP2	0.41	0.40	0.45	0.47	0.44	0.40	0.45	0.35	0.42	0.40	0.42	0.47	0.40	0.44	0.49	0.41	0.38	0.37	0.46	0.33
P	0.29	0.29	0.33	0.35	0.32	0.29	0.34	0.27	0.31	0.28	0.30	0.36	0.29	0.32	0.38	0.31	0.29	0.28	0.43	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.07	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.17	0.08
C2	0.04	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.06	0.19	0.18	0.21	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.11	0.02	0.06	0.05	0.17	0.00	0.01	0.01	0.05	0.21	0.24	0.12
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.13	0.01	0.15	0.02	0.15	0.07	0.12	0.14	0.15	0.02	0.00	0.01	0.06	0.23	0.22	0.13
C4	0.03	0.01	0.04	0.13	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.05	0.27	0.28	0.31	0.27
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.11	0.06	0.07	0.10	0.08	0.04	0.01	0.01	0.02	0.14	0.12	0.05
C5	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.12	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.06	0.29	0.30	0.32	0.29
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.18	0.01	0.20	0.00	0.18	0.10	0.14	0.19	0.09	0.04	0.03	0.02	0.01	0.11	0.05	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.15	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.16	0.07	0.25	0.24	0.24	0.22
N1	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.17	0.18	0.20	0.15
N3	0.03	0.00	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.06	0.23	0.22	0.26	0.21
N4	0.03	0.01	0.05	0.14	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.17	0.05	0.29	0.32	0.36	0.31
O2	0.07	0.00	0.17	0.15	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.16	0.17	0.10	0.17	0.18	0.21	0.14
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.04	0.07	0.04	0.08	0.03	0.06	0.06	0.16	0.00	0.05	0.03	0.05	0.22	0.22	0.11
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.14	0.01	0.18	0.03	0.16	0.06	0.12	0.17	0.17	0.05	0.00	0.01	0.11	0.29	0.26	0.16
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.06	0.05	0.10	0.03	0.01	0.00	0.09	0.09	0.12	0.05
O5'	0.09	0.19	0.05	0.06	0.27	0.02	0.29	0.01	0.25	0.17	0.23	0.29	0.17	0.05	0.11	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.13	0.18	0.21	0.23	0.28	0.14	0.30	0.11	0.24	0.18	0.22	0.32	0.18	0.22	0.29	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.21	0.24	0.22	0.31	0.12	0.32	0.05	0.24	0.20	0.26	0.36	0.21	0.22	0.26	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.12	0.13	0.27	0.05	0.29	0.02	0.22	0.15	0.21	0.31	0.14	0.11	0.16	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00