Doublet Group distance statistics: 51960

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.014, 0.026, 0.039, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.018
O2'	A	0, 0.087, 0.230, 0.374, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.230 std_dev=0.143
C2'	A	0, 0.021, 0.200, 0.380, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.200 std_dev=0.180
O4'	A	0, 0.031, 0.214, 0.397, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.214 std_dev=0.183
C5	B	0, 0.131, 0.335, 0.539, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.335 std_dev=0.204
C6	B	0, 0.152, 0.356, 0.560, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.356 std_dev=0.204
C4	B	0, 0.144, 0.352, 0.560, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.352 std_dev=0.208
N1	B	0, 0.136, 0.353, 0.570, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.353 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.148, 0.390, 0.632, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.390 std_dev=0.242
C2	B	0, 0.119, 0.374, 0.629, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.374 std_dev=0.255
N4	B	0, 0.147, 0.410, 0.673, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.410 std_dev=0.263
O4'	B	0, 0.115, 0.386, 0.658, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.386 std_dev=0.272
C4'	A	0, 0.104, 0.379, 0.654, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.379 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.123, 0.402, 0.680, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.402 std_dev=0.278
C3'	A	0, 0.035, 0.336, 0.638, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.336 std_dev=0.301
P	B	0, 0.143, 0.447, 0.751, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.447 std_dev=0.304
C4'	B	0, 0.119, 0.453, 0.786, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.453 std_dev=0.333
O2	B	0, 0.081, 0.435, 0.790, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.435 std_dev=0.354
C2'	B	0, 0.134, 0.496, 0.857, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.496 std_dev=0.361
O3'	A	0, 0.028, 0.405, 0.783, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.405 std_dev=0.378
O2'	B	0, 0.167, 0.571, 0.976, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.571 std_dev=0.404
OP2	B	0, 0.130, 0.545, 0.961, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.545 std_dev=0.416
OP1	B	0, 0.115, 0.533, 0.952, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.533 std_dev=0.418
C3'	B	0, 0.058, 0.483, 0.909, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.483 std_dev=0.425
P	A	0, 0.177, 0.629, 1.081, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.629 std_dev=0.452
O5'	B	0, 0.248, 0.701, 1.154, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.701 std_dev=0.453
O3'	B	0, 0.094, 0.561, 1.028, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.561 std_dev=0.467
OP2	A	0, 0.299, 0.778, 1.258, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.778 std_dev=0.479
O5'	A	0, 0.229, 0.716, 1.203, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.716 std_dev=0.487
OP1	A	0, 0.205, 0.709, 1.213, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.709 std_dev=0.504
C5'	B	0, 0.260, 0.775, 1.290, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.775 std_dev=0.515
C5'	A	0, 0.247, 0.778, 1.309, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.778 std_dev=0.531

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.17	0.11
C2	0.01	0.00	0.12	0.14	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.17	0.03	0.23	0.21	0.30	0.25
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.03	0.05	0.06	0.09	0.12	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.18	0.18	0.11	0.13
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.04	0.09	0.07	0.12	0.13	0.08	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.26	0.24	0.10	0.16
C4	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.24	0.22	0.27	0.24
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.06	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.22	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.31	0.29	0.35	0.31
C5'	0.03	0.10	0.03	0.04	0.10	0.01	0.13	0.00	0.14	0.13	0.12	0.08	0.15	0.15	0.08	0.02	0.06	0.01	0.01	0.12	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.10	0.02	0.32	0.31	0.38	0.33
C8	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.04	0.30	0.26	0.27	0.28
N1	0.02	0.00	0.09	0.12	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.15	0.02	0.29	0.27	0.35	0.30
N3	0.01	0.00	0.12	0.13	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.15	0.03	0.20	0.18	0.25	0.21
N6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.36	0.36	0.44	0.37
N7	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.34	0.32	0.36	0.34
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.21	0.19	0.22	0.21
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.12	0.13	0.05
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.08	0.02	0.06	0.06	0.10	0.08	0.15	0.15	0.09	0.06	0.02	0.05	0.00	0.02	0.22	0.27	0.14	0.16
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.07	0.21	0.10
O5'	0.09	0.23	0.18	0.26	0.24	0.02	0.31	0.01	0.32	0.30	0.29	0.20	0.36	0.34	0.21	0.07	0.22	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.10	0.21	0.18	0.24	0.22	0.08	0.29	0.12	0.31	0.26	0.27	0.18	0.36	0.32	0.19	0.12	0.27	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.30	0.11	0.10	0.27	0.22	0.35	0.32	0.38	0.27	0.35	0.25	0.44	0.36	0.22	0.13	0.14	0.21	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.25	0.13	0.16	0.24	0.02	0.31	0.01	0.33	0.28	0.30	0.21	0.37	0.34	0.21	0.05	0.16	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.26	0.30	0.27	0.26	0.23	0.31	0.22	0.34	0.31	0.24	0.23	0.26	0.32	0.26	0.27	0.23	0.07	0.10	0.07
C2	0.15	0.09	0.18	0.15	0.16	0.18	0.15	0.21	0.13	0.09	0.15	0.19	0.11	0.21	0.16	0.19	0.29	0.21	0.31	0.21
C2'	0.31	0.28	0.30	0.30	0.28	0.27	0.33	0.28	0.36	0.31	0.26	0.26	0.28	0.29	0.28	0.29	0.29	0.14	0.13	0.14
C3'	0.26	0.22	0.27	0.30	0.21	0.23	0.26	0.23	0.27	0.25	0.20	0.21	0.24	0.26	0.26	0.26	0.08	0.02	0.07	0.01
C4	0.15	0.18	0.15	0.10	0.21	0.07	0.25	0.12	0.24	0.19	0.19	0.21	0.17	0.18	0.10	0.08	0.20	0.10	0.22	0.11
C4'	0.26	0.22	0.27	0.29	0.20	0.24	0.25	0.27	0.27	0.25	0.19	0.19	0.24	0.27	0.27	0.25	0.07	0.11	0.25	0.11
C5	0.09	0.12	0.09	0.05	0.18	0.08	0.21	0.18	0.17	0.11	0.15	0.19	0.12	0.12	0.05	0.06	0.14	0.06	0.23	0.09
C5'	0.29	0.26	0.32	0.37	0.26	0.28	0.30	0.29	0.31	0.28	0.25	0.27	0.26	0.30	0.36	0.29	0.20	0.27	0.48	0.27
C6	0.13	0.08	0.11	0.11	0.11	0.16	0.12	0.24	0.09	0.07	0.08	0.16	0.13	0.14	0.10	0.16	0.16	0.11	0.27	0.13
C8	0.20	0.20	0.19	0.17	0.24	0.13	0.29	0.14	0.29	0.22	0.20	0.23	0.18	0.20	0.17	0.15	0.18	0.09	0.17	0.09
N1	0.19	0.07	0.18	0.18	0.11	0.21	0.11	0.26	0.10	0.11	0.08	0.16	0.13	0.21	0.17	0.23	0.24	0.18	0.31	0.19
N3	0.15	0.18	0.17	0.11	0.20	0.11	0.21	0.15	0.21	0.17	0.20	0.20	0.18	0.21	0.12	0.11	0.28	0.18	0.26	0.18
N6	0.16	0.15	0.13	0.14	0.06	0.18	0.09	0.28	0.09	0.13	0.11	0.11	0.20	0.15	0.12	0.18	0.13	0.09	0.27	0.11
N7	0.11	0.14	0.11	0.09	0.20	0.07	0.24	0.18	0.20	0.14	0.16	0.21	0.13	0.12	0.09	0.05	0.14	0.05	0.19	0.06
N9	0.23	0.22	0.22	0.18	0.24	0.13	0.29	0.11	0.31	0.25	0.21	0.22	0.21	0.23	0.17	0.17	0.18	0.05	0.15	0.06
O2'	0.39	0.33	0.40	0.42	0.31	0.41	0.36	0.47	0.40	0.37	0.30	0.29	0.34	0.40	0.41	0.39	0.39	0.21	0.13	0.19
O3'	0.27	0.23	0.30	0.35	0.21	0.27	0.25	0.35	0.25	0.24	0.20	0.22	0.26	0.29	0.32	0.27	0.02	0.02	0.01	0.01
O4'	0.27	0.22	0.26	0.25	0.21	0.21	0.26	0.21	0.29	0.26	0.20	0.19	0.23	0.29	0.23	0.24	0.13	0.05	0.19	0.05
O5'	0.25	0.34	0.21	0.18	0.47	0.20	0.46	0.23	0.38	0.32	0.41	0.53	0.30	0.22	0.18	0.21	0.28	0.12	0.13	0.15
OP1	0.20	0.31	0.15	0.11	0.45	0.16	0.42	0.18	0.31	0.27	0.39	0.54	0.27	0.19	0.11	0.17	0.26	0.22	0.27	0.20
OP2	0.21	0.35	0.16	0.18	0.48	0.17	0.40	0.20	0.28	0.28	0.45	0.58	0.34	0.18	0.20	0.17	0.23	0.33	0.37	0.26
P	0.17	0.30	0.10	0.06	0.43	0.11	0.39	0.15	0.28	0.25	0.39	0.52	0.27	0.13	0.06	0.11	0.17	0.16	0.20	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.09	0.15	0.20	0.08
C2	0.03	0.00	0.07	0.09	0.01	0.06	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.08	0.03	0.16	0.15	0.27	0.12
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.03	0.07	0.03	0.06	0.03	0.07	0.07	0.11	0.00	0.03	0.01	0.13	0.15	0.20	0.10
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.05	0.04	0.04	0.08	0.05	0.13	0.02	0.01	0.03	0.24	0.18	0.21	0.17
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.10	0.00	0.35	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.04	0.03	0.21	0.19	0.36	0.19
C4'	0.02	0.06	0.03	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.11	0.06	0.08	0.11	0.06	0.07	0.03	0.00	0.02	0.13	0.24	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.03	0.00	0.13	0.00	0.39	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.04	0.24	0.20	0.36	0.22
C5'	0.05	0.20	0.03	0.05	0.35	0.01	0.39	0.00	0.33	0.21	0.27	0.38	0.12	0.09	0.04	0.02	0.01	0.15	0.35	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.11	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.04	0.22	0.17	0.31	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.16	0.15	0.26	0.12
N3	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.08	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.07	0.02	0.18	0.16	0.32	0.15
N4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.11	0.01	0.38	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.05	0.03	0.22	0.21	0.39	0.21
O2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.13	0.04	0.13	0.17	0.23	0.10
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.09	0.07	0.07	0.09	0.05	0.05	0.10	0.10	0.11	0.00	0.04	0.03	0.03	0.16	0.18	0.06
O3'	0.01	0.08	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.07	0.05	0.13	0.04	0.00	0.02	0.22	0.14	0.22	0.14
O4'	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.08	0.15	0.18	0.07
O5'	0.09	0.16	0.13	0.24	0.21	0.02	0.24	0.01	0.22	0.16	0.18	0.22	0.13	0.03	0.22	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.15	0.15	0.18	0.19	0.13	0.20	0.15	0.17	0.15	0.16	0.21	0.17	0.16	0.14	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.27	0.20	0.21	0.36	0.24	0.36	0.35	0.31	0.26	0.32	0.39	0.23	0.18	0.22	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.10	0.17	0.19	0.03	0.22	0.02	0.18	0.12	0.15	0.21	0.10	0.06	0.14	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00