Doublet Group distance statistics: 51961

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.013, 0.029, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.001, 0.017, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.006, 0.023, 0.039, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.014, 0.032, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.003, 0.025, 0.046, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.025 std_dev=0.022
C2	A	0, -0.002, 0.027, 0.056, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.027 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.026, 0.059, 0.091, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.059 std_dev=0.033
N3	A	0, -0.005, 0.028, 0.061, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.028 std_dev=0.033
C1'	A	0, 0.008, 0.045, 0.083, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.045 std_dev=0.037
O2'	A	0, 0.084, 0.234, 0.384, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.234 std_dev=0.150
O4'	A	0, 0.047, 0.207, 0.367, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.207 std_dev=0.160
C6	B	0, 0.248, 0.436, 0.623, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.436 std_dev=0.188
C2'	A	0, 0.012, 0.206, 0.400, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.206 std_dev=0.194
N1	B	0, 0.258, 0.454, 0.649, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.454 std_dev=0.196
C4'	A	0, 0.207, 0.438, 0.669, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.438 std_dev=0.231
C3'	A	0, 0.185, 0.440, 0.696, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.440 std_dev=0.255
C5	B	0, 0.400, 0.697, 0.993, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.697 std_dev=0.296
O5'	A	0, 0.443, 0.756, 1.069, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.756 std_dev=0.313
O4'	B	0, 0.353, 0.686, 1.019, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.686 std_dev=0.333
C2	B	0, 0.298, 0.635, 0.971, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.635 std_dev=0.337
C4	B	0, 0.448, 0.787, 1.127, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.787 std_dev=0.339
C1'	B	0, 0.343, 0.693, 1.044, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.693 std_dev=0.350
C5'	A	0, 0.348, 0.700, 1.053, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.700 std_dev=0.352
N3	B	0, 0.367, 0.732, 1.098, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.732 std_dev=0.365
O3'	A	0, 0.255, 0.655, 1.055, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.655 std_dev=0.400
O5'	B	0, 0.402, 0.840, 1.278, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.840 std_dev=0.438
N4	B	0, 0.641, 1.124, 1.606, 1.494 max_d=1.494 avg_d=1.124 std_dev=0.482
C4'	B	0, 0.535, 1.027, 1.518, 1.772 max_d=1.772 avg_d=1.027 std_dev=0.491
C5'	B	0, 0.537, 1.035, 1.534, 1.813 max_d=1.813 avg_d=1.035 std_dev=0.499
P	B	0, 0.303, 0.808, 1.313, 1.826 max_d=1.826 avg_d=0.808 std_dev=0.505
P	A	0, 0.604, 1.114, 1.624, 1.796 max_d=1.796 avg_d=1.114 std_dev=0.510
C2'	B	0, 0.554, 1.072, 1.591, 1.891 max_d=1.891 avg_d=1.072 std_dev=0.519
OP1	A	0, 0.689, 1.216, 1.744, 1.623 max_d=1.623 avg_d=1.216 std_dev=0.527
O2	B	0, 0.331, 0.878, 1.425, 1.948 max_d=1.948 avg_d=0.878 std_dev=0.547
OP2	B	0, 0.221, 0.783, 1.345, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.783 std_dev=0.562
C3'	B	0, 0.619, 1.187, 1.755, 2.038 max_d=2.038 avg_d=1.187 std_dev=0.568
OP1	B	0, 0.360, 1.040, 1.720, 2.472 max_d=2.472 avg_d=1.040 std_dev=0.680
O2'	B	0, 0.581, 1.265, 1.949, 2.542 max_d=2.542 avg_d=1.265 std_dev=0.684
O3'	B	0, 0.847, 1.642, 2.438, 2.866 max_d=2.866 avg_d=1.642 std_dev=0.795
OP2	A	0, 0.560, 1.629, 2.697, 3.823 max_d=3.823 avg_d=1.629 std_dev=1.068

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.16	0.05	0.27	0.20
C2	0.06	0.00	0.18	0.16	0.02	0.10	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.21	0.25	0.06	0.29	0.26	0.67	0.40
C2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.02	0.07	0.03	0.11	0.05	0.15	0.17	0.08	0.04	0.02	0.00	0.04	0.01	0.12	0.13	0.07	0.12
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.05	0.07	0.12	0.11	0.15	0.05	0.09	0.04	0.02	0.01	0.02	0.10	0.19	0.13	0.06
C4	0.03	0.02	0.10	0.06	0.00	0.04	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.11	0.10	0.03	0.32	0.25	0.72	0.43
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.06	0.10	0.07	0.10	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.01
C5	0.03	0.02	0.07	0.05	0.01	0.05	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.06	0.04	0.41	0.38	1.01	0.58
C5'	0.04	0.11	0.03	0.05	0.13	0.01	0.21	0.00	0.20	0.27	0.15	0.10	0.26	0.29	0.15	0.06	0.04	0.02	0.01	0.06	0.24	0.02
C6	0.04	0.02	0.11	0.07	0.02	0.05	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.13	0.11	0.05	0.41	0.41	1.06	0.61
C8	0.02	0.02	0.05	0.12	0.01	0.12	0.01	0.27	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.03	0.12	0.04	0.45	0.34	0.97	0.59
N1	0.05	0.01	0.15	0.11	0.02	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.18	0.19	0.05	0.35	0.35	0.89	0.51
N3	0.06	0.01	0.17	0.15	0.02	0.10	0.02	0.10	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.19	0.22	0.06	0.25	0.20	0.54	0.33
N6	0.04	0.02	0.08	0.05	0.02	0.07	0.02	0.26	0.00	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.12	0.07	0.06	0.47	0.51	1.25	0.71
N7	0.02	0.02	0.04	0.09	0.01	0.10	0.01	0.29	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.04	0.09	0.04	0.48	0.44	1.19	0.69
N9	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.15	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.31	0.20	0.64	0.40
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.11	0.05	0.09	0.06	0.13	0.03	0.18	0.19	0.12	0.04	0.03	0.00	0.08	0.03	0.04	0.02	0.15	0.03
O3'	0.03	0.25	0.04	0.01	0.10	0.01	0.06	0.04	0.11	0.12	0.19	0.22	0.07	0.09	0.03	0.08	0.00	0.01	0.09	0.26	0.36	0.06
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.05	0.06	0.06	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.10	0.09	0.14	0.12
O5'	0.16	0.29	0.12	0.10	0.32	0.01	0.41	0.01	0.41	0.45	0.35	0.25	0.47	0.48	0.31	0.04	0.09	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.05	0.26	0.13	0.19	0.25	0.05	0.38	0.06	0.41	0.34	0.35	0.20	0.51	0.44	0.20	0.02	0.26	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.67	0.07	0.13	0.72	0.16	1.01	0.24	1.06	0.97	0.89	0.54	1.25	1.19	0.64	0.15	0.36	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.40	0.12	0.06	0.43	0.01	0.58	0.02	0.61	0.59	0.51	0.33	0.71	0.69	0.40	0.03	0.06	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.32	0.23	0.15	0.32	0.23	0.38	0.20	0.27	0.22	0.31	0.36	0.42	0.33	0.18	0.25	0.15	0.09	0.11	0.05
C2	0.43	0.30	0.60	0.60	0.35	0.62	0.33	0.51	0.19	0.22	0.31	0.43	0.44	0.80	0.75	0.44	0.37	0.40	0.21	0.30
C2'	0.26	0.30	0.22	0.15	0.27	0.20	0.30	0.20	0.25	0.24	0.29	0.28	0.36	0.28	0.16	0.24	0.17	0.14	0.05	0.10
C3'	0.22	0.26	0.16	0.08	0.24	0.11	0.27	0.06	0.24	0.22	0.25	0.24	0.29	0.19	0.05	0.22	0.06	0.02	0.08	0.02
C4	0.37	0.33	0.41	0.35	0.38	0.42	0.42	0.33	0.25	0.21	0.32	0.45	0.48	0.55	0.42	0.38	0.22	0.20	0.09	0.13
C4'	0.24	0.30	0.17	0.09	0.31	0.13	0.34	0.06	0.27	0.24	0.31	0.33	0.35	0.22	0.06	0.23	0.04	0.08	0.22	0.08
C5	0.39	0.32	0.43	0.33	0.44	0.39	0.48	0.29	0.26	0.17	0.33	0.55	0.55	0.60	0.41	0.38	0.18	0.14	0.12	0.08
C5'	0.22	0.29	0.22	0.21	0.40	0.14	0.47	0.12	0.37	0.27	0.34	0.43	0.30	0.19	0.23	0.19	0.16	0.20	0.38	0.20
C6	0.43	0.28	0.54	0.45	0.45	0.48	0.44	0.35	0.23	0.15	0.32	0.58	0.54	0.75	0.56	0.40	0.22	0.20	0.09	0.12
C8	0.27	0.32	0.23	0.13	0.41	0.22	0.53	0.19	0.31	0.15	0.31	0.52	0.50	0.37	0.15	0.27	0.19	0.13	0.28	0.16
N1	0.44	0.26	0.62	0.58	0.39	0.58	0.36	0.46	0.19	0.17	0.31	0.50	0.46	0.86	0.73	0.42	0.31	0.33	0.14	0.23
N3	0.39	0.33	0.49	0.48	0.35	0.53	0.35	0.45	0.23	0.24	0.32	0.41	0.44	0.63	0.59	0.41	0.33	0.35	0.19	0.27
N6	0.39	0.21	0.52	0.42	0.50	0.44	0.47	0.31	0.24	0.10	0.32	0.67	0.54	0.76	0.54	0.36	0.19	0.16	0.12	0.09
N7	0.33	0.32	0.31	0.19	0.47	0.28	0.56	0.21	0.30	0.14	0.32	0.61	0.57	0.47	0.23	0.32	0.17	0.11	0.25	0.13
N9	0.29	0.32	0.27	0.19	0.37	0.28	0.44	0.23	0.28	0.19	0.32	0.43	0.46	0.40	0.23	0.30	0.17	0.09	0.14	0.06
O2'	0.28	0.30	0.24	0.17	0.26	0.21	0.27	0.21	0.25	0.25	0.28	0.27	0.36	0.30	0.20	0.25	0.17	0.21	0.08	0.14
O3'	0.21	0.22	0.15	0.10	0.21	0.14	0.22	0.08	0.22	0.21	0.21	0.21	0.23	0.17	0.10	0.23	0.03	0.01	0.02	0.01
O4'	0.29	0.37	0.23	0.13	0.33	0.19	0.36	0.13	0.25	0.26	0.36	0.37	0.46	0.31	0.12	0.27	0.09	0.04	0.19	0.05
O5'	0.21	0.28	0.25	0.28	0.43	0.16	0.50	0.18	0.39	0.27	0.35	0.46	0.26	0.20	0.30	0.13	0.20	0.15	0.28	0.17
OP1	0.42	0.44	0.58	0.67	0.61	0.46	0.71	0.48	0.62	0.48	0.49	0.64	0.36	0.50	0.75	0.33	0.56	0.57	0.78	0.56
OP2	0.47	0.75	0.51	0.38	0.94	0.21	0.76	0.06	0.58	0.60	0.89	1.10	0.73	0.48	0.37	0.26	0.05	0.40	0.28	0.27
P	0.27	0.37	0.35	0.35	0.52	0.20	0.54	0.17	0.42	0.35	0.44	0.59	0.32	0.30	0.38	0.18	0.19	0.14	0.27	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.07
C2	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.11	0.03	0.06	0.07	0.11	0.10
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.06	0.13	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.06	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.08	0.04	0.09	0.09	0.13	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.10	0.08
C4	0.03	0.02	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.10	0.04	0.09	0.13	0.17	0.15
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.04	0.08	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.04	0.10	0.14	0.19	0.16
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.04	0.07	0.10	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.09	0.05	0.08	0.10	0.14	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.05	0.09	0.09
N3	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.07	0.10	0.14	0.12
N4	0.03	0.02	0.06	0.09	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.04	0.11	0.05	0.11	0.17	0.21	0.17
O2	0.02	0.00	0.13	0.13	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.15	0.04	0.05	0.06	0.09	0.09
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.04	0.10	0.00	0.02	0.03	0.02	0.10	0.04	0.03
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.10	0.00	0.09	0.02	0.09	0.04	0.11	0.11	0.15	0.02	0.00	0.01	0.09	0.23	0.17	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.11	0.11
O5'	0.02	0.06	0.04	0.06	0.09	0.01	0.10	0.01	0.08	0.04	0.07	0.11	0.05	0.02	0.09	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.03	0.07	0.10	0.15	0.13	0.05	0.14	0.04	0.10	0.05	0.10	0.17	0.06	0.10	0.23	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.11	0.06	0.10	0.17	0.03	0.19	0.02	0.14	0.09	0.14	0.21	0.09	0.04	0.17	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.04	0.08	0.15	0.02	0.16	0.01	0.13	0.09	0.12	0.17	0.09	0.03	0.14	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00