Doublet Group distance statistics: 51964

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.023, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.006, 0.022, 0.039, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.004, 0.029, 0.053, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.029 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.005, 0.031, 0.058, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.031 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.006, 0.036, 0.066, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.036 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.010, 0.051, 0.092, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.051 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.021, 0.101, 0.181, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.101 std_dev=0.080
C4'	A	0, 0.082, 0.207, 0.333, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.207 std_dev=0.126
C2'	A	0, 0.049, 0.175, 0.301, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.175 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.102, 0.243, 0.383, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.243 std_dev=0.140
C5'	A	0, 0.125, 0.317, 0.509, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.317 std_dev=0.192
O2'	A	0, 0.134, 0.358, 0.582, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.358 std_dev=0.224
C2	B	0, 0.167, 0.417, 0.667, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.417 std_dev=0.250
N1	B	0, 0.161, 0.417, 0.673, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.417 std_dev=0.256
O3'	A	0, 0.202, 0.480, 0.759, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.480 std_dev=0.278
C6	B	0, 0.093, 0.400, 0.708, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.400 std_dev=0.307
N3	B	0, 0.215, 0.527, 0.839, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.527 std_dev=0.312
C5	B	0, 0.159, 0.490, 0.821, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.490 std_dev=0.331
O4'	B	0, 0.225, 0.563, 0.902, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.563 std_dev=0.339
C4	B	0, 0.233, 0.581, 0.928, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.581 std_dev=0.348
O2	B	0, 0.113, 0.468, 0.823, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.468 std_dev=0.355
C5'	B	0, 0.259, 0.615, 0.970, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.615 std_dev=0.356
C1'	B	0, 0.247, 0.631, 1.015, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.631 std_dev=0.384
O5'	B	0, 0.280, 0.678, 1.075, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.678 std_dev=0.398
C4'	B	0, 0.282, 0.694, 1.106, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.694 std_dev=0.412
P	B	0, 0.300, 0.721, 1.142, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.721 std_dev=0.421
N4	B	0, 0.332, 0.813, 1.295, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.813 std_dev=0.482
OP1	B	0, 0.375, 0.889, 1.403, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.889 std_dev=0.514
OP2	B	0, 0.323, 0.839, 1.356, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.839 std_dev=0.516
C3'	B	0, 0.358, 0.900, 1.441, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.900 std_dev=0.542
C2'	B	0, 0.364, 0.919, 1.473, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.919 std_dev=0.555
O3'	B	0, 0.439, 1.076, 1.714, 1.658 max_d=1.658 avg_d=1.076 std_dev=0.638
O2'	B	0, 0.466, 1.142, 1.818, 1.763 max_d=1.763 avg_d=1.142 std_dev=0.676
OP1	A	0, 0.477, 1.478, 2.478, 2.467 max_d=2.467 avg_d=1.478 std_dev=1.000
O5'	A	0, 0.217, 1.533, 2.848, 2.860 max_d=2.860 avg_d=1.533 std_dev=1.316
P	A	0, 0.428, 2.221, 4.014, 3.990 max_d=3.990 avg_d=2.221 std_dev=1.793
OP2	A	0, 0.522, 3.666, 6.809, 6.802 max_d=6.802 avg_d=3.666 std_dev=3.143

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.06	0.50	0.31
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.14	0.01	0.56	0.19	1.21	0.70
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.02	0.08	0.02	0.09	0.05	0.09	0.05	0.10	0.08	0.04	0.00	0.01	0.01	0.33	0.15	0.53	0.29
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.00	0.16	0.02	0.16	0.13	0.14	0.07	0.18	0.17	0.09	0.01	0.01	0.01	0.41	0.21	0.53	0.30
C4	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.01	0.59	0.18	1.20	0.71
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.02	0.06	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00
C5	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.21	0.03	0.75	0.25	1.58	0.93
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.06	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00
C6	0.01	0.01	0.09	0.16	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.23	0.03	0.77	0.28	1.69	0.98
C8	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.16	0.03	0.76	0.22	1.43	0.89
N1	0.02	0.01	0.09	0.14	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.20	0.02	0.68	0.24	1.50	0.86
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.48	0.15	1.01	0.59
N6	0.01	0.01	0.10	0.18	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.27	0.03	0.85	0.33	1.94	1.11
N7	0.00	0.00	0.08	0.17	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.23	0.03	0.84	0.28	1.76	1.05
N9	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.55	0.14	1.03	0.63
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.06	0.06	0.06	0.07	0.03	0.08	0.06	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.07	0.08	0.03
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.13	0.02	0.21	0.03	0.23	0.16	0.20	0.09	0.27	0.23	0.10	0.04	0.00	0.01	0.28	0.24	0.33	0.14
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.11	0.18	0.13
O5'	0.28	0.56	0.33	0.41	0.59	0.01	0.75	0.01	0.77	0.76	0.68	0.48	0.85	0.84	0.55	0.05	0.28	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.19	0.15	0.21	0.18	0.04	0.25	0.05	0.28	0.22	0.24	0.15	0.33	0.28	0.14	0.07	0.24	0.11	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.50	1.21	0.53	0.53	1.20	0.04	1.58	0.02	1.69	1.43	1.50	1.01	1.94	1.76	1.03	0.08	0.33	0.18	0.02	0.03	0.00	0.01
P	0.31	0.70	0.29	0.30	0.71	0.00	0.93	0.00	0.98	0.89	0.86	0.59	1.11	1.05	0.63	0.03	0.14	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.22	0.12	0.09	0.18	0.11	0.10	0.11	0.08	0.14	0.24	0.18	0.25	0.17	0.11	0.11	0.08	0.03	0.07	0.04
C2	0.20	0.19	0.23	0.24	0.20	0.25	0.17	0.23	0.18	0.15	0.24	0.22	0.23	0.25	0.23	0.24	0.23	0.18	0.35	0.23
C2'	0.14	0.15	0.13	0.12	0.11	0.14	0.09	0.13	0.10	0.12	0.15	0.11	0.18	0.18	0.14	0.14	0.11	0.05	0.07	0.06
C3'	0.07	0.11	0.05	0.04	0.13	0.06	0.14	0.04	0.11	0.09	0.13	0.14	0.12	0.11	0.04	0.08	0.08	0.02	0.03	0.01
C4	0.09	0.19	0.10	0.11	0.14	0.14	0.06	0.17	0.08	0.07	0.22	0.16	0.24	0.12	0.11	0.12	0.16	0.17	0.31	0.21
C4'	0.10	0.19	0.08	0.04	0.21	0.06	0.18	0.06	0.14	0.14	0.22	0.23	0.20	0.12	0.05	0.09	0.08	0.03	0.08	0.03
C5	0.15	0.13	0.15	0.18	0.09	0.19	0.09	0.24	0.15	0.07	0.18	0.14	0.20	0.16	0.17	0.19	0.26	0.29	0.45	0.32
C5'	0.15	0.25	0.14	0.12	0.29	0.09	0.26	0.04	0.20	0.20	0.29	0.31	0.25	0.16	0.09	0.13	0.12	0.07	0.13	0.05
C6	0.26	0.02	0.26	0.28	0.14	0.28	0.19	0.30	0.23	0.17	0.12	0.19	0.12	0.27	0.25	0.28	0.33	0.34	0.50	0.37
C8	0.08	0.24	0.08	0.06	0.21	0.05	0.10	0.13	0.08	0.14	0.28	0.21	0.27	0.09	0.05	0.02	0.12	0.23	0.34	0.24
N1	0.27	0.12	0.28	0.30	0.20	0.30	0.21	0.29	0.23	0.18	0.20	0.24	0.12	0.30	0.28	0.30	0.31	0.28	0.45	0.33
N3	0.15	0.22	0.16	0.17	0.17	0.17	0.11	0.17	0.12	0.13	0.24	0.19	0.27	0.19	0.17	0.16	0.15	0.10	0.26	0.16
N6	0.32	0.12	0.33	0.33	0.17	0.31	0.26	0.33	0.29	0.25	0.07	0.23	0.18	0.35	0.31	0.31	0.38	0.42	0.58	0.43
N7	0.13	0.21	0.14	0.15	0.15	0.15	0.09	0.22	0.13	0.12	0.25	0.16	0.26	0.14	0.14	0.13	0.24	0.33	0.47	0.34
N9	0.08	0.22	0.06	0.04	0.17	0.07	0.06	0.11	0.04	0.12	0.25	0.18	0.26	0.11	0.05	0.05	0.08	0.13	0.24	0.15
O2'	0.24	0.20	0.26	0.26	0.13	0.27	0.12	0.24	0.15	0.18	0.18	0.12	0.24	0.31	0.29	0.23	0.18	0.11	0.06	0.09
O3'	0.03	0.12	0.04	0.05	0.22	0.02	0.24	0.04	0.19	0.12	0.17	0.25	0.08	0.05	0.08	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.12	0.25	0.10	0.06	0.25	0.08	0.18	0.08	0.13	0.17	0.28	0.26	0.27	0.15	0.06	0.10	0.07	0.03	0.05	0.00
O5'	0.97	1.18	0.96	0.87	1.26	0.74	1.21	0.57	1.12	1.11	1.26	1.27	1.16	0.92	0.76	0.86	0.77	0.28	0.74	0.52
OP1	0.62	0.73	0.70	0.70	0.80	0.56	0.78	0.46	0.71	0.69	0.78	0.83	0.71	0.66	0.67	0.56	0.61	0.33	0.67	0.46
OP2	1.75	2.26	1.75	1.53	2.56	1.25	2.38	0.90	2.08	2.05	2.49	2.71	2.20	1.67	1.36	1.47	1.15	0.35	1.06	0.72
P	1.03	1.34	1.02	0.88	1.49	0.72	1.38	0.49	1.22	1.21	1.46	1.57	1.31	0.97	0.75	0.87	0.68	0.10	0.65	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.09	0.09	0.21	0.11
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.21	0.29	0.41	0.27
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.08	0.05	0.11	0.00	0.03	0.00	0.09	0.10	0.18	0.10
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.03	0.05	0.05	0.11	0.09	0.11	0.03	0.00	0.00	0.07	0.08	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01	0.26	0.43	0.53	0.38
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.05	0.06	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.25	0.41	0.51	0.37
C5'	0.03	0.10	0.02	0.03	0.15	0.00	0.16	0.00	0.13	0.09	0.13	0.17	0.07	0.07	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02
C6	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.21	0.31	0.41	0.30
N1	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.18	0.24	0.35	0.23
N3	0.02	0.00	0.08	0.11	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.24	0.37	0.49	0.33
N4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.01	0.27	0.49	0.57	0.41
O2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.10	0.02	0.18	0.23	0.37	0.23
O2'	0.01	0.09	0.00	0.03	0.06	0.07	0.02	0.07	0.02	0.03	0.09	0.07	0.13	0.00	0.09	0.04	0.02	0.03	0.12	0.02
O3'	0.02	0.09	0.03	0.00	0.10	0.01	0.08	0.04	0.05	0.04	0.11	0.11	0.10	0.09	0.00	0.01	0.08	0.08	0.08	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.11	0.04
O5'	0.09	0.21	0.09	0.07	0.26	0.01	0.25	0.01	0.21	0.18	0.24	0.27	0.18	0.02	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.09	0.29	0.10	0.08	0.43	0.03	0.41	0.06	0.31	0.24	0.37	0.49	0.23	0.03	0.08	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.41	0.18	0.10	0.53	0.04	0.51	0.01	0.41	0.35	0.49	0.57	0.37	0.12	0.08	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.27	0.10	0.07	0.38	0.01	0.37	0.02	0.30	0.23	0.33	0.41	0.23	0.02	0.07	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00