Doublet Group distance statistics: 51965

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, -0.002, 0.011, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.003, 0.018, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C1'	A	0, -0.001, 0.016, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.047, 0.162, 0.276, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.162 std_dev=0.114
O4'	A	0, 0.051, 0.184, 0.318, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.184 std_dev=0.133
O2'	A	0, 0.057, 0.197, 0.338, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.197 std_dev=0.140
C1'	B	0, 0.054, 0.252, 0.451, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.252 std_dev=0.199
C3'	A	0, 0.081, 0.281, 0.482, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.281 std_dev=0.200
O3'	A	0, 0.092, 0.326, 0.559, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.326 std_dev=0.234
C4'	A	0, 0.076, 0.326, 0.575, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.326 std_dev=0.250
N1	B	0, 0.055, 0.310, 0.564, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.310 std_dev=0.254
C2'	B	0, 0.026, 0.292, 0.557, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.292 std_dev=0.265
O2'	B	0, 0.032, 0.330, 0.628, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.330 std_dev=0.298
C6	B	0, 0.044, 0.347, 0.651, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.347 std_dev=0.303
C2	B	0, 0.064, 0.406, 0.748, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.406 std_dev=0.342
C5	B	0, 0.042, 0.416, 0.790, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.416 std_dev=0.374
O2	B	0, 0.077, 0.452, 0.827, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.452 std_dev=0.375
C4	B	0, 0.045, 0.479, 0.914, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.479 std_dev=0.434
N3	B	0, 0.055, 0.496, 0.938, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.496 std_dev=0.441
C5'	A	0, 0.117, 0.596, 1.075, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.596 std_dev=0.479
N4	B	0, 0.040, 0.570, 1.099, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.570 std_dev=0.530
O4'	B	0, -0.047, 0.508, 1.063, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.508 std_dev=0.555
O5'	A	0, 0.138, 0.694, 1.250, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.694 std_dev=0.556
C3'	B	0, -0.101, 0.526, 1.153, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.526 std_dev=0.627
C4'	B	0, -0.127, 0.596, 1.319, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.596 std_dev=0.723
P	A	0, 0.056, 0.803, 1.551, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.803 std_dev=0.747
O3'	B	0, -0.191, 0.719, 1.629, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.719 std_dev=0.910
OP2	A	0, -0.027, 0.896, 1.819, 2.167 max_d=2.167 avg_d=0.896 std_dev=0.923
OP1	A	0, 0.000, 1.038, 2.076, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.038 std_dev=1.038
C5'	B	0, -0.241, 0.967, 2.175, 2.671 max_d=2.671 avg_d=0.967 std_dev=1.208
O5'	B	0, -0.483, 1.321, 3.126, 3.873 max_d=3.873 avg_d=1.321 std_dev=1.804
P	B	0, -0.660, 1.982, 4.624, 5.716 max_d=5.716 avg_d=1.982 std_dev=2.642
OP1	B	0, -0.761, 2.587, 5.935, 7.315 max_d=7.315 avg_d=2.587 std_dev=3.348
OP2	B	0, -0.816, 2.700, 6.217, 7.667 max_d=7.667 avg_d=2.700 std_dev=3.516

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.14	0.12
C2	0.03	0.00	0.10	0.12	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.09	0.17	0.23	0.54	0.36
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.07	0.10	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.22	0.10	0.04
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.12	0.10	0.10	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.28	0.21	0.12
C4	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.05	0.19	0.23	0.47	0.35
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.06	0.12	0.03	0.02	0.09	0.12	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.20	0.07	0.03
C5	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.27	0.40	0.64	0.48
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.00	0.19	0.00	0.18	0.25	0.12	0.04	0.22	0.27	0.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.06	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.28	0.45	0.71	0.51
C8	0.00	0.01	0.07	0.01	0.00	0.12	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.28	0.34	0.47	0.43
N1	0.03	0.00	0.07	0.12	0.01	0.03	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.07	0.23	0.36	0.65	0.45
N3	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.10	0.09	0.13	0.14	0.44	0.29
N6	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.32	0.57	0.80	0.59
N7	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.12	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.32	0.49	0.68	0.55
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.16	0.16	0.35	0.29
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.05	0.05	0.06	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.29	0.13	0.07
O3'	0.01	0.12	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.11	0.10	0.09	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.42	0.36	0.22
O4'	0.00	0.09	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.07	0.09	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.09	0.09	0.07
O5'	0.04	0.17	0.04	0.03	0.19	0.00	0.27	0.00	0.28	0.28	0.23	0.13	0.32	0.32	0.16	0.02	0.03	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.23	0.22	0.28	0.23	0.20	0.40	0.14	0.45	0.34	0.36	0.14	0.57	0.49	0.16	0.29	0.42	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.54	0.10	0.21	0.47	0.07	0.64	0.03	0.71	0.47	0.65	0.44	0.80	0.68	0.35	0.13	0.36	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.36	0.04	0.12	0.35	0.03	0.48	0.01	0.51	0.43	0.45	0.29	0.59	0.55	0.29	0.07	0.22	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.27	0.09	0.38	0.26	0.51	0.06	0.81	0.11	0.08	0.36	0.33	0.32	0.05	0.40	0.34	0.14	1.26	0.78	0.10
C2	0.13	0.15	0.08	0.12	0.06	0.38	0.26	0.54	0.27	0.11	0.18	0.07	0.33	0.15	0.05	0.44	0.08	1.10	0.51	0.07
C2'	0.19	0.41	0.07	0.23	0.40	0.27	0.21	0.56	0.14	0.26	0.47	0.43	0.44	0.15	0.28	0.05	0.20	0.70	1.34	0.38
C3'	0.26	0.52	0.15	0.14	0.60	0.19	0.42	0.45	0.29	0.37	0.63	0.69	0.54	0.20	0.21	0.04	0.32	0.47	1.63	0.58
C4	0.08	0.24	0.05	0.21	0.12	0.41	0.18	0.63	0.21	0.05	0.32	0.17	0.35	0.11	0.18	0.38	0.12	1.04	0.89	0.10
C4'	0.06	0.38	0.04	0.35	0.50	0.46	0.27	0.76	0.12	0.19	0.52	0.63	0.40	0.02	0.43	0.23	0.13	1.09	0.99	0.05
C5	0.10	0.18	0.07	0.15	0.04	0.36	0.24	0.55	0.24	0.07	0.25	0.08	0.31	0.13	0.10	0.37	0.26	0.83	1.11	0.27
C5'	0.11	0.49	0.04	0.26	0.63	0.41	0.38	0.70	0.20	0.27	0.65	0.81	0.50	0.06	0.34	0.19	0.06	0.99	1.12	0.11
C6	0.13	0.10	0.10	0.07	0.10	0.32	0.30	0.47	0.28	0.12	0.14	0.10	0.27	0.15	0.02	0.39	0.31	0.78	1.02	0.27
C8	0.08	0.24	0.05	0.24	0.18	0.40	0.13	0.63	0.16	0.07	0.33	0.27	0.33	0.09	0.23	0.33	0.20	0.83	1.27	0.31
N1	0.15	0.07	0.11	0.06	0.14	0.32	0.31	0.46	0.29	0.14	0.09	0.14	0.27	0.16	0.04	0.41	0.23	0.90	0.74	0.12
N3	0.09	0.24	0.05	0.21	0.09	0.44	0.18	0.65	0.22	0.04	0.30	0.13	0.36	0.12	0.17	0.43	0.00	1.22	0.54	0.11
N6	0.14	0.05	0.11	0.03	0.16	0.28	0.31	0.41	0.28	0.14	0.05	0.18	0.21	0.16	0.07	0.37	0.41	0.64	1.16	0.38
N7	0.09	0.19	0.06	0.17	0.09	0.36	0.20	0.56	0.21	0.07	0.27	0.15	0.30	0.11	0.14	0.34	0.30	0.73	1.33	0.38
N9	0.07	0.26	0.05	0.27	0.21	0.44	0.11	0.69	0.15	0.07	0.36	0.29	0.34	0.08	0.27	0.35	0.07	1.04	1.01	0.13
O2'	0.08	0.26	0.12	0.44	0.25	0.43	0.10	0.76	0.04	0.14	0.31	0.28	0.29	0.03	0.51	0.12	0.17	1.01	0.89	0.04
O3'	0.31	0.53	0.17	0.13	0.61	0.11	0.49	0.34	0.38	0.41	0.61	0.68	0.53	0.20	0.23	0.16	0.42	0.13	1.88	0.80
O4'	0.08	0.27	0.12	0.41	0.32	0.56	0.09	0.86	0.07	0.08	0.39	0.43	0.31	0.08	0.46	0.37	0.24	1.40	0.68	0.22
O5'	0.25	0.63	0.24	0.05	0.75	0.21	0.48	0.48	0.32	0.41	0.80	0.94	0.66	0.25	0.10	0.06	0.30	0.65	1.52	0.45
OP1	0.14	0.59	0.10	0.23	0.71	0.41	0.38	0.71	0.20	0.31	0.78	0.95	0.64	0.12	0.32	0.21	0.06	0.74	1.40	0.27
OP2	0.39	0.78	0.41	0.10	0.77	0.11	0.41	0.41	0.32	0.50	0.93	0.94	0.89	0.47	0.06	0.09	0.45	0.46	1.75	0.62
P	0.30	0.70	0.28	0.02	0.77	0.21	0.45	0.51	0.30	0.44	0.86	0.96	0.77	0.32	0.08	0.05	0.28	0.64	1.54	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.41	0.33	0.48	0.29
C2	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.77	0.07	1.29	0.78
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.25	0.19	0.21	0.15
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.09	0.01	0.07	0.02	0.13	0.01	0.01	0.00	0.20	0.02	0.15	0.13
C4	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	1.01	0.42	2.09	1.24
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.00	0.41	0.19	0.12
C5	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	1.00	0.44	2.17	1.28
C5'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.22	0.04	0.01
C6	0.00	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.01	0.88	0.22	1.69	1.03
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.73	0.05	1.19	0.73
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.92	0.26	1.72	1.03
N4	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	1.07	0.56	2.34	1.37
O2	0.02	0.00	0.12	0.13	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.16	0.04	0.64	0.09	0.94	0.58
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.06	0.52	0.41	0.25
O3'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.03	0.09	0.01	0.08	0.02	0.16	0.01	0.00	0.02	0.14	0.04	0.41	0.18
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.30	0.50	0.27	0.15
O5'	0.41	0.77	0.25	0.20	1.01	0.00	1.00	0.00	0.88	0.73	0.92	1.07	0.64	0.06	0.14	0.30	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.33	0.07	0.19	0.02	0.42	0.41	0.44	0.22	0.22	0.05	0.26	0.56	0.09	0.52	0.04	0.50	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.48	1.29	0.21	0.15	2.09	0.19	2.17	0.04	1.69	1.19	1.72	2.34	0.94	0.41	0.41	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.29	0.78	0.15	0.13	1.24	0.12	1.28	0.01	1.03	0.73	1.03	1.37	0.58	0.25	0.18	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00