Doublet Group distance statistics: 51977

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 7, 5, 7, 11, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.027 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.020, 0.039, 0.058, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.039 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.004, 0.024, 0.043, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.024 std_dev=0.020
C2	A	0, -0.004, 0.016, 0.036, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.016 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.008, 0.032, 0.055, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.032 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.018, 0.043, 0.068, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.043 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.023, 0.048, 0.072, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.048 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.023, 0.138, 0.253, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.138 std_dev=0.115
C2'	A	0, 0.057, 0.186, 0.316, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.186 std_dev=0.130
C5	B	0, 0.223, 0.367, 0.511, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.367 std_dev=0.144
C4'	A	0, 0.085, 0.232, 0.379, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.232 std_dev=0.147
C4	B	0, 0.185, 0.335, 0.485, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.335 std_dev=0.150
C6	B	0, 0.255, 0.409, 0.562, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.409 std_dev=0.153
N9	B	0, 0.195, 0.358, 0.521, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.358 std_dev=0.163
O2'	A	0, 0.127, 0.293, 0.460, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.293 std_dev=0.167
N6	B	0, 0.332, 0.512, 0.691, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.512 std_dev=0.180
C3'	A	0, 0.102, 0.291, 0.479, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.291 std_dev=0.189
N3	B	0, 0.219, 0.410, 0.601, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.410 std_dev=0.191
C8	B	0, 0.248, 0.439, 0.630, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.439 std_dev=0.191
C1'	B	0, 0.206, 0.397, 0.589, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.397 std_dev=0.192
N1	B	0, 0.254, 0.446, 0.638, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.446 std_dev=0.192
N7	B	0, 0.256, 0.453, 0.650, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.453 std_dev=0.197
O4'	B	0, 0.226, 0.425, 0.624, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.425 std_dev=0.199
C4'	B	0, 0.300, 0.505, 0.711, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.505 std_dev=0.205
C2	B	0, 0.242, 0.460, 0.678, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.460 std_dev=0.218
C2'	B	0, 0.208, 0.436, 0.665, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.436 std_dev=0.228
C3'	B	0, 0.263, 0.494, 0.725, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.494 std_dev=0.231
O3'	A	0, 0.214, 0.483, 0.753, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.483 std_dev=0.270
C5'	A	0, 0.174, 0.465, 0.757, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.465 std_dev=0.292
P	B	0, 0.277, 0.569, 0.861, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.569 std_dev=0.292
OP2	B	0, 0.331, 0.628, 0.924, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.628 std_dev=0.297
C5'	B	0, 0.331, 0.634, 0.936, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.634 std_dev=0.303
O5'	B	0, 0.322, 0.627, 0.933, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.627 std_dev=0.306
OP1	B	0, 0.357, 0.731, 1.105, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.731 std_dev=0.374
O2'	B	0, 0.131, 0.525, 0.920, 2.467 max_d=2.467 avg_d=0.525 std_dev=0.394
O3'	B	0, 0.229, 0.638, 1.047, 2.506 max_d=2.506 avg_d=0.638 std_dev=0.409
O5'	A	0, 0.263, 0.879, 1.494, 2.262 max_d=2.262 avg_d=0.879 std_dev=0.616
P	A	0, 0.384, 1.284, 2.183, 3.105 max_d=3.105 avg_d=1.284 std_dev=0.900
OP1	A	0, 0.375, 1.429, 2.484, 3.580 max_d=3.580 avg_d=1.429 std_dev=1.054
OP2	A	0, 0.445, 1.842, 3.238, 5.516 max_d=5.516 avg_d=1.842 std_dev=1.397

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.36	0.38	0.22
C2	0.05	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.13	0.05	0.41	0.54	0.75	0.45
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.09	0.10	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.23	0.23	0.42	0.19
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.09	0.08	0.09	0.09	0.09	0.04	0.02	0.01	0.02	0.28	0.30	0.44	0.24
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.07	0.02	0.42	0.53	0.73	0.45
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.04	0.05	0.08	0.10	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.23	0.33	0.08
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.07	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.03	0.50	0.65	0.92	0.58
C5'	0.05	0.13	0.02	0.02	0.15	0.01	0.21	0.00	0.21	0.23	0.17	0.11	0.24	0.25	0.15	0.06	0.06	0.02	0.01	0.30	0.34	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.06	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.10	0.03	0.51	0.68	0.97	0.60
C8	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.10	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.10	0.05	0.51	0.60	0.84	0.55
N1	0.04	0.00	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.12	0.04	0.46	0.63	0.88	0.54
N3	0.05	0.00	0.10	0.09	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.06	0.37	0.48	0.65	0.39
N6	0.03	0.01	0.07	0.09	0.02	0.08	0.02	0.24	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.12	0.04	0.54	0.76	1.08	0.67
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.10	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.11	0.05	0.55	0.71	1.01	0.64
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.05	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.40	0.48	0.63	0.40
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.11	0.12	0.08	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.09	0.28	0.39	0.13
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.07	0.02	0.08	0.06	0.10	0.10	0.12	0.11	0.12	0.11	0.04	0.03	0.00	0.02	0.30	0.52	0.52	0.31
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.23	0.43	0.28	0.24
O5'	0.24	0.41	0.23	0.28	0.42	0.02	0.50	0.01	0.51	0.51	0.46	0.37	0.54	0.55	0.40	0.09	0.30	0.23	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.36	0.54	0.23	0.30	0.53	0.23	0.65	0.30	0.68	0.60	0.63	0.48	0.76	0.71	0.48	0.28	0.52	0.43	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.38	0.75	0.42	0.44	0.73	0.33	0.92	0.34	0.97	0.84	0.88	0.65	1.08	1.01	0.63	0.39	0.52	0.28	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.22	0.45	0.19	0.24	0.45	0.08	0.58	0.02	0.60	0.55	0.54	0.39	0.67	0.64	0.40	0.13	0.31	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.26	0.15	0.14	0.14	0.16	0.15	0.23	0.23	0.19	0.27	0.20	0.26	0.15	0.14	0.18	0.15	0.16	0.22	0.04	0.11	0.05
C2	0.21	0.26	0.23	0.21	0.12	0.22	0.14	0.24	0.18	0.24	0.26	0.18	0.22	0.22	0.19	0.24	0.31	0.23	0.27	0.14	0.21	0.14
C2'	0.18	0.25	0.14	0.14	0.18	0.14	0.19	0.23	0.24	0.17	0.26	0.22	0.26	0.17	0.15	0.17	0.14	0.15	0.25	0.10	0.10	0.10
C3'	0.21	0.27	0.17	0.14	0.22	0.12	0.24	0.11	0.28	0.20	0.29	0.24	0.30	0.21	0.20	0.19	0.13	0.20	0.10	0.04	0.07	0.02
C4	0.18	0.26	0.18	0.17	0.09	0.17	0.10	0.21	0.19	0.24	0.27	0.18	0.23	0.19	0.16	0.19	0.21	0.17	0.25	0.10	0.18	0.11
C4'	0.18	0.27	0.15	0.12	0.20	0.11	0.23	0.14	0.29	0.20	0.30	0.22	0.33	0.22	0.17	0.18	0.12	0.17	0.07	0.13	0.18	0.08
C5	0.19	0.27	0.20	0.20	0.13	0.17	0.10	0.21	0.18	0.26	0.28	0.20	0.22	0.22	0.18	0.20	0.23	0.18	0.26	0.14	0.23	0.15
C5'	0.22	0.35	0.19	0.17	0.29	0.14	0.35	0.12	0.41	0.28	0.41	0.30	0.47	0.34	0.25	0.19	0.18	0.20	0.11	0.26	0.30	0.18
C6	0.20	0.28	0.22	0.22	0.15	0.19	0.13	0.21	0.15	0.25	0.27	0.21	0.20	0.24	0.20	0.23	0.28	0.20	0.28	0.16	0.25	0.17
C8	0.17	0.26	0.17	0.19	0.14	0.17	0.14	0.22	0.23	0.24	0.29	0.20	0.27	0.18	0.16	0.18	0.19	0.16	0.24	0.14	0.21	0.14
N1	0.21	0.26	0.24	0.22	0.14	0.21	0.14	0.22	0.16	0.25	0.25	0.20	0.22	0.23	0.20	0.24	0.32	0.22	0.28	0.15	0.23	0.16
N3	0.19	0.26	0.20	0.18	0.09	0.20	0.12	0.24	0.19	0.24	0.26	0.18	0.22	0.20	0.17	0.22	0.25	0.20	0.26	0.12	0.18	0.12
N6	0.21	0.29	0.23	0.24	0.18	0.19	0.16	0.22	0.15	0.25	0.27	0.23	0.20	0.25	0.20	0.25	0.30	0.19	0.29	0.19	0.28	0.20
N7	0.18	0.27	0.19	0.21	0.16	0.18	0.14	0.22	0.22	0.25	0.29	0.21	0.26	0.22	0.18	0.21	0.22	0.17	0.26	0.17	0.25	0.17
N9	0.16	0.26	0.15	0.15	0.12	0.15	0.12	0.20	0.22	0.22	0.27	0.19	0.25	0.16	0.14	0.16	0.16	0.15	0.23	0.07	0.16	0.09
O2'	0.26	0.28	0.24	0.25	0.23	0.27	0.22	0.38	0.25	0.21	0.27	0.26	0.26	0.20	0.22	0.28	0.26	0.25	0.30	0.17	0.10	0.14
O3'	0.26	0.28	0.23	0.20	0.25	0.19	0.26	0.17	0.28	0.23	0.29	0.27	0.31	0.25	0.24	0.25	0.20	0.28	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.17	0.26	0.14	0.11	0.14	0.12	0.16	0.17	0.24	0.18	0.28	0.20	0.28	0.15	0.13	0.17	0.11	0.15	0.14	0.08	0.16	0.04
O5'	0.43	0.49	0.47	0.46	0.50	0.38	0.57	0.38	0.59	0.60	0.55	0.45	0.65	0.64	0.50	0.43	0.47	0.38	0.41	0.39	0.53	0.41
OP1	0.48	0.62	0.61	0.59	0.57	0.52	0.66	0.61	0.72	0.63	0.70	0.55	0.81	0.70	0.54	0.62	0.66	0.43	0.61	0.81	0.77	0.69
OP2	0.77	0.95	0.85	0.79	0.94	0.66	1.06	0.65	1.11	1.00	1.05	0.89	1.21	1.12	0.89	0.81	0.82	0.64	0.70	0.75	0.83	0.68
P	0.49	0.61	0.57	0.52	0.61	0.41	0.71	0.41	0.74	0.69	0.68	0.56	0.82	0.77	0.59	0.54	0.54	0.40	0.46	0.50	0.62	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.13	0.00	0.17	0.16	0.18	0.15
C2	0.04	0.00	0.20	0.20	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.28	0.08	0.26	0.23	0.28	0.23
C2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.09	0.11	0.09	0.16	0.20	0.09	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.24	0.29	0.26	0.23
C3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.14	0.01	0.16	0.03	0.18	0.18	0.20	0.18	0.19	0.18	0.10	0.02	0.01	0.01	0.20	0.25	0.12	0.15
C4	0.02	0.01	0.10	0.14	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.15	0.05	0.26	0.22	0.26	0.22
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.12	0.07	0.07	0.10	0.12	0.06	0.12	0.02	0.00	0.02	0.09	0.17	0.05
C5	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.13	0.13	0.04	0.31	0.27	0.31	0.27
C5'	0.05	0.12	0.09	0.03	0.12	0.01	0.16	0.00	0.16	0.18	0.14	0.10	0.19	0.20	0.11	0.06	0.10	0.01	0.02	0.16	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.18	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.18	0.05	0.31	0.29	0.34	0.29
C8	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.14	0.15	0.06	0.31	0.25	0.25	0.24
N1	0.03	0.00	0.16	0.20	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.24	0.07	0.29	0.26	0.32	0.27
N3	0.04	0.00	0.20	0.18	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.26	0.08	0.24	0.21	0.25	0.21
N6	0.03	0.01	0.09	0.19	0.02	0.10	0.02	0.19	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.17	0.18	0.06	0.34	0.33	0.38	0.33
N7	0.02	0.01	0.07	0.18	0.01	0.12	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.15	0.15	0.05	0.33	0.30	0.32	0.29
N9	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.25	0.21	0.22	0.20
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.11	0.12	0.13	0.06	0.15	0.14	0.17	0.16	0.17	0.15	0.08	0.00	0.06	0.09	0.14	0.22	0.27	0.18
O3'	0.13	0.28	0.03	0.01	0.15	0.02	0.13	0.10	0.18	0.15	0.24	0.26	0.18	0.15	0.07	0.06	0.00	0.09	0.19	0.28	0.20	0.18
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.07	0.08	0.06	0.05	0.01	0.09	0.09	0.00	0.09	0.12	0.18	0.13
O5'	0.17	0.26	0.24	0.20	0.26	0.02	0.31	0.02	0.31	0.31	0.29	0.24	0.34	0.33	0.25	0.14	0.19	0.09	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.16	0.23	0.29	0.25	0.22	0.09	0.27	0.16	0.29	0.25	0.26	0.21	0.33	0.30	0.21	0.22	0.28	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.28	0.26	0.12	0.26	0.17	0.31	0.25	0.34	0.25	0.32	0.25	0.38	0.32	0.22	0.27	0.20	0.18	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.23	0.23	0.15	0.22	0.05	0.27	0.02	0.29	0.24	0.27	0.21	0.33	0.29	0.20	0.18	0.18	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00