Doublet Group distance statistics: 51980

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 4, 5, 3, 6, 1, 6, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.013, 0.027, 0.040, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.015, 0.031, 0.046, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.031 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.017, 0.034, 0.050, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.034, 0.058, 0.083, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.058 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.028, 0.054, 0.079, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.054 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.032, 0.060, 0.089, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.060 std_dev=0.029
C2'	A	0, -0.001, 0.217, 0.435, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.217 std_dev=0.218
O4'	A	0, -0.021, 0.200, 0.421, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.200 std_dev=0.221
N9	B	0, 0.229, 0.460, 0.692, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.460 std_dev=0.232
C1'	B	0, 0.253, 0.486, 0.718, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.486 std_dev=0.232
O4'	B	0, 0.263, 0.500, 0.737, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.500 std_dev=0.237
C8	B	0, 0.250, 0.514, 0.778, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.514 std_dev=0.264
C4	B	0, 0.227, 0.503, 0.778, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.503 std_dev=0.276
N3	B	0, 0.322, 0.602, 0.882, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.602 std_dev=0.280
C2'	B	0, 0.287, 0.594, 0.901, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.594 std_dev=0.307
N7	B	0, 0.247, 0.568, 0.889, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.568 std_dev=0.321
C5	B	0, 0.228, 0.550, 0.872, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.550 std_dev=0.322
C4'	B	0, 0.290, 0.617, 0.943, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.617 std_dev=0.327
C2	B	0, 0.362, 0.701, 1.039, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.701 std_dev=0.339
C3'	A	0, 0.029, 0.386, 0.742, 2.131 max_d=2.131 avg_d=0.386 std_dev=0.356
C3'	B	0, 0.299, 0.656, 1.013, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.656 std_dev=0.357
O2'	B	0, 0.365, 0.732, 1.098, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.732 std_dev=0.367
O2'	A	0, -0.006, 0.367, 0.740, 2.171 max_d=2.171 avg_d=0.367 std_dev=0.373
C6	B	0, 0.296, 0.672, 1.048, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.672 std_dev=0.376
C5'	B	0, 0.314, 0.695, 1.076, 1.784 max_d=1.784 avg_d=0.695 std_dev=0.381
N1	B	0, 0.348, 0.731, 1.115, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.731 std_dev=0.383
O5'	B	0, 0.229, 0.628, 1.028, 2.394 max_d=2.394 avg_d=0.628 std_dev=0.400
C4'	A	0, 0.076, 0.480, 0.884, 2.394 max_d=2.394 avg_d=0.480 std_dev=0.404
N6	B	0, 0.362, 0.802, 1.242, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.802 std_dev=0.440
O3'	A	0, 0.041, 0.521, 1.001, 2.775 max_d=2.775 avg_d=0.521 std_dev=0.480
O3'	B	0, 0.375, 0.856, 1.336, 2.039 max_d=2.039 avg_d=0.856 std_dev=0.481
P	B	0, 0.109, 0.673, 1.237, 3.495 max_d=3.495 avg_d=0.673 std_dev=0.564
C5'	A	0, 0.236, 0.898, 1.561, 3.528 max_d=3.528 avg_d=0.898 std_dev=0.662
OP2	B	0, 0.099, 0.778, 1.457, 4.179 max_d=4.179 avg_d=0.778 std_dev=0.679
OP1	B	0, 0.084, 0.856, 1.628, 4.699 max_d=4.699 avg_d=0.856 std_dev=0.772
O5'	A	0, 0.431, 1.225, 2.019, 3.611 max_d=3.611 avg_d=1.225 std_dev=0.794
P	A	0, 0.677, 1.818, 2.958, 4.792 max_d=4.792 avg_d=1.818 std_dev=1.140
OP1	A	0, 0.732, 2.000, 3.268, 5.640 max_d=5.640 avg_d=2.000 std_dev=1.268
OP2	A	0, 1.029, 2.483, 3.937, 5.689 max_d=5.689 avg_d=2.483 std_dev=1.454

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.19	0.29	0.31	0.19
C2	0.04	0.00	0.18	0.17	0.01	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.18	0.10	0.40	0.58	0.76	0.49
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.02	0.06	0.06	0.09	0.09	0.15	0.18	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.22	0.36	0.21
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.14	0.00	0.17	0.02	0.18	0.19	0.18	0.15	0.20	0.20	0.12	0.02	0.01	0.02	0.22	0.24	0.31	0.16
C4	0.02	0.01	0.10	0.14	0.00	0.06	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.09	0.05	0.39	0.57	0.70	0.46
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.10	0.17	0.07	0.07	0.13	0.17	0.08	0.14	0.02	0.00	0.02	0.13	0.31	0.10
C5	0.02	0.01	0.06	0.17	0.00	0.11	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.11	0.03	0.47	0.75	0.91	0.61
C5'	0.05	0.17	0.06	0.02	0.20	0.01	0.28	0.00	0.29	0.32	0.23	0.14	0.34	0.36	0.19	0.09	0.08	0.02	0.01	0.19	0.28	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.18	0.01	0.10	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.12	0.05	0.49	0.80	1.00	0.66
C8	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.17	0.01	0.32	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.16	0.17	0.08	0.44	0.70	0.78	0.54
N1	0.04	0.00	0.15	0.18	0.01	0.07	0.01	0.23	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.17	0.14	0.07	0.45	0.72	0.91	0.59
N3	0.04	0.01	0.18	0.15	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.17	0.10	0.35	0.49	0.64	0.40
N6	0.02	0.01	0.07	0.20	0.01	0.13	0.01	0.34	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.17	0.14	0.04	0.53	0.92	1.12	0.75
N7	0.01	0.02	0.06	0.20	0.01	0.17	0.00	0.36	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.17	0.17	0.06	0.50	0.84	0.99	0.67
N9	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.08	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.07	0.02	0.34	0.50	0.57	0.38
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.12	0.14	0.14	0.09	0.15	0.16	0.17	0.18	0.17	0.17	0.09	0.00	0.06	0.11	0.13	0.22	0.39	0.17
O3'	0.11	0.18	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.08	0.12	0.17	0.14	0.17	0.14	0.17	0.07	0.06	0.00	0.07	0.22	0.42	0.50	0.24
O4'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.07	0.10	0.04	0.06	0.02	0.11	0.07	0.00	0.16	0.29	0.25	0.17
O5'	0.19	0.40	0.24	0.22	0.39	0.02	0.47	0.01	0.49	0.44	0.45	0.35	0.53	0.50	0.34	0.13	0.22	0.16	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.29	0.58	0.22	0.24	0.57	0.13	0.75	0.19	0.80	0.70	0.72	0.49	0.92	0.84	0.50	0.22	0.42	0.29	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.76	0.36	0.31	0.70	0.31	0.91	0.28	1.00	0.78	0.91	0.64	1.12	0.99	0.57	0.39	0.50	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.49	0.21	0.16	0.46	0.10	0.61	0.02	0.66	0.54	0.59	0.40	0.75	0.67	0.38	0.17	0.24	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.32	0.15	0.19	0.23	0.22	0.26	0.29	0.31	0.21	0.33	0.27	0.33	0.25	0.18	0.16	0.21	0.18	0.25	0.13	0.11	0.11
C2	0.26	0.29	0.26	0.24	0.16	0.27	0.14	0.27	0.17	0.25	0.25	0.25	0.20	0.23	0.21	0.31	0.24	0.27	0.26	0.19	0.27	0.18
C2'	0.24	0.32	0.17	0.18	0.27	0.26	0.27	0.33	0.30	0.21	0.32	0.30	0.31	0.25	0.23	0.24	0.21	0.25	0.27	0.12	0.16	0.13
C3'	0.24	0.32	0.18	0.13	0.30	0.16	0.32	0.18	0.34	0.29	0.34	0.30	0.36	0.32	0.27	0.22	0.14	0.22	0.10	0.03	0.08	0.02
C4	0.16	0.32	0.14	0.14	0.18	0.21	0.17	0.26	0.26	0.17	0.32	0.26	0.27	0.17	0.12	0.18	0.15	0.20	0.23	0.12	0.25	0.14
C4'	0.16	0.30	0.12	0.10	0.25	0.14	0.30	0.18	0.34	0.24	0.33	0.25	0.38	0.30	0.20	0.17	0.13	0.15	0.08	0.11	0.20	0.08
C5	0.15	0.35	0.13	0.15	0.18	0.19	0.17	0.25	0.28	0.17	0.36	0.27	0.30	0.17	0.12	0.17	0.15	0.19	0.25	0.19	0.37	0.22
C5'	0.22	0.38	0.19	0.16	0.34	0.16	0.43	0.18	0.48	0.36	0.45	0.33	0.55	0.45	0.29	0.20	0.17	0.19	0.15	0.22	0.40	0.21
C6	0.19	0.35	0.17	0.17	0.15	0.20	0.10	0.24	0.19	0.21	0.33	0.27	0.21	0.21	0.15	0.22	0.16	0.21	0.25	0.20	0.40	0.23
C8	0.14	0.35	0.13	0.18	0.23	0.21	0.27	0.29	0.36	0.18	0.39	0.28	0.40	0.24	0.15	0.14	0.20	0.18	0.26	0.22	0.36	0.24
N1	0.24	0.31	0.24	0.21	0.16	0.23	0.14	0.25	0.14	0.25	0.25	0.26	0.21	0.25	0.20	0.29	0.21	0.25	0.25	0.18	0.34	0.20
N3	0.21	0.29	0.21	0.20	0.15	0.26	0.13	0.28	0.20	0.21	0.27	0.25	0.20	0.17	0.16	0.25	0.21	0.26	0.25	0.18	0.20	0.15
N6	0.18	0.37	0.18	0.18	0.17	0.19	0.13	0.25	0.20	0.22	0.36	0.28	0.22	0.22	0.16	0.22	0.19	0.20	0.28	0.26	0.47	0.29
N7	0.14	0.37	0.12	0.17	0.21	0.20	0.24	0.28	0.35	0.17	0.40	0.28	0.39	0.20	0.13	0.14	0.19	0.18	0.28	0.26	0.44	0.28
N9	0.13	0.33	0.13	0.15	0.21	0.20	0.24	0.27	0.31	0.17	0.35	0.27	0.33	0.22	0.14	0.15	0.17	0.18	0.23	0.11	0.22	0.13
O2'	0.26	0.36	0.26	0.30	0.34	0.30	0.38	0.40	0.39	0.39	0.38	0.34	0.42	0.42	0.32	0.25	0.31	0.28	0.38	0.22	0.31	0.23
O3'	0.23	0.24	0.16	0.12	0.24	0.15	0.25	0.13	0.26	0.24	0.26	0.23	0.28	0.26	0.23	0.21	0.14	0.23	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.14	0.32	0.12	0.13	0.24	0.16	0.28	0.22	0.33	0.21	0.34	0.27	0.37	0.27	0.17	0.14	0.15	0.14	0.15	0.10	0.15	0.05
O5'	0.43	0.55	0.41	0.38	0.54	0.33	0.61	0.31	0.64	0.57	0.61	0.51	0.69	0.64	0.51	0.39	0.36	0.37	0.36	0.27	0.49	0.33
OP1	0.43	0.70	0.45	0.45	0.62	0.38	0.74	0.43	0.84	0.62	0.80	0.61	0.96	0.75	0.54	0.41	0.49	0.36	0.46	0.62	0.67	0.52
OP2	0.66	0.92	0.68	0.65	0.85	0.56	0.96	0.56	1.05	0.81	1.02	0.84	1.15	0.95	0.76	0.63	0.63	0.57	0.61	0.69	0.73	0.61
P	0.47	0.67	0.48	0.42	0.64	0.34	0.74	0.31	0.80	0.65	0.75	0.61	0.89	0.76	0.58	0.43	0.40	0.39	0.38	0.33	0.54	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.08	0.08	0.15	0.10
C2	0.04	0.00	0.13	0.16	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.19	0.07	0.17	0.16	0.34	0.20
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.02	0.06	0.08	0.10	0.13	0.06	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.10	0.15	0.08
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.13	0.00	0.14	0.03	0.15	0.13	0.16	0.15	0.16	0.15	0.09	0.02	0.01	0.01	0.08	0.14	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.04	0.17	0.16	0.31	0.20
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.11	0.06	0.05	0.09	0.11	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.06	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.16	0.03	0.22	0.24	0.40	0.26
C5'	0.03	0.08	0.02	0.03	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.17	0.11	0.07	0.18	0.18	0.09	0.06	0.04	0.02	0.01	0.07	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.18	0.04	0.23	0.26	0.43	0.28
C8	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.11	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.15	0.05	0.22	0.22	0.33	0.24
N1	0.03	0.00	0.10	0.16	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.19	0.05	0.20	0.21	0.40	0.25
N3	0.04	0.00	0.13	0.15	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.17	0.06	0.14	0.12	0.28	0.17
N6	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.09	0.02	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.20	0.04	0.26	0.32	0.49	0.33
N7	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.11	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.17	0.04	0.25	0.28	0.42	0.30
N9	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.15	0.13	0.25	0.17
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.06	0.11	0.13	0.07	0.06	0.03	0.00	0.07	0.05	0.07	0.07	0.12	0.07
O3'	0.03	0.19	0.03	0.01	0.13	0.02	0.16	0.04	0.18	0.15	0.19	0.17	0.20	0.17	0.08	0.07	0.00	0.02	0.11	0.19	0.14	0.12
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.07	0.12	0.12	0.11
O5'	0.08	0.17	0.08	0.08	0.17	0.02	0.22	0.01	0.23	0.22	0.20	0.14	0.26	0.25	0.15	0.07	0.11	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.16	0.10	0.14	0.16	0.06	0.24	0.07	0.26	0.22	0.21	0.12	0.32	0.28	0.13	0.07	0.19	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.34	0.15	0.12	0.31	0.05	0.40	0.03	0.43	0.33	0.40	0.28	0.49	0.42	0.25	0.12	0.14	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.20	0.08	0.09	0.20	0.04	0.26	0.02	0.28	0.24	0.25	0.17	0.33	0.30	0.17	0.07	0.12	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00