Doublet Group distance statistics: 51981

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 4, 10, 6, 4, 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.024, 0.035, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.027 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.018, 0.036, 0.054, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.036 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.018, 0.038, 0.058, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.038 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.013, 0.034, 0.055, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.034 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.018, 0.044, 0.070, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.044 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.036, 0.069, 0.103, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.069 std_dev=0.033
N6	A	0, 0.029, 0.066, 0.103, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.066 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.023, 0.067, 0.110, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.067 std_dev=0.044
C8	A	0, 0.034, 0.087, 0.141, 0.216 max_d=0.216 avg_d=0.087 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.135, 0.277, 0.418, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.277 std_dev=0.141
C4'	A	0, 0.197, 0.366, 0.534, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.366 std_dev=0.169
C2'	A	0, 0.235, 0.406, 0.577, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.406 std_dev=0.171
O2'	A	0, 0.373, 0.616, 0.858, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.616 std_dev=0.242
C3'	A	0, 0.298, 0.552, 0.806, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.552 std_dev=0.254
N3	B	0, 0.554, 0.810, 1.066, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.810 std_dev=0.256
C6	B	0, 0.431, 0.688, 0.946, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.688 std_dev=0.257
C5	B	0, 0.402, 0.660, 0.919, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.660 std_dev=0.258
C2	B	0, 0.643, 0.907, 1.170, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.907 std_dev=0.264
C4	B	0, 0.365, 0.635, 0.906, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.635 std_dev=0.271
N1	B	0, 0.527, 0.801, 1.076, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.801 std_dev=0.275
P	B	0, 0.761, 1.054, 1.347, 1.580 max_d=1.580 avg_d=1.054 std_dev=0.293
N7	B	0, 0.532, 0.833, 1.134, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.833 std_dev=0.301
O5'	B	0, 0.785, 1.101, 1.416, 1.849 max_d=1.849 avg_d=1.101 std_dev=0.315
N9	B	0, 0.321, 0.643, 0.965, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.643 std_dev=0.322
C8	B	0, 0.477, 0.808, 1.139, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.808 std_dev=0.331
C4'	B	0, 0.433, 0.765, 1.097, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.765 std_dev=0.332
C5'	B	0, 0.665, 1.014, 1.363, 1.980 max_d=1.980 avg_d=1.014 std_dev=0.349
N6	B	0, 0.400, 0.749, 1.098, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.749 std_dev=0.349
O3'	A	0, 0.554, 0.905, 1.257, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.905 std_dev=0.351
C5'	A	0, 0.401, 0.754, 1.108, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.754 std_dev=0.353
OP2	B	0, 0.820, 1.178, 1.535, 1.687 max_d=1.687 avg_d=1.178 std_dev=0.358
OP1	B	0, 0.955, 1.327, 1.699, 1.993 max_d=1.993 avg_d=1.327 std_dev=0.372
C3'	B	0, 0.543, 0.921, 1.299, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.921 std_dev=0.378
C1'	B	0, 0.255, 0.637, 1.019, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.637 std_dev=0.382
O4'	B	0, 0.263, 0.651, 1.038, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.651 std_dev=0.387
C2'	B	0, 0.331, 0.723, 1.115, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.723 std_dev=0.392
O2'	B	0, 0.466, 0.902, 1.338, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.902 std_dev=0.436
O5'	A	0, 0.670, 1.248, 1.826, 2.573 max_d=2.573 avg_d=1.248 std_dev=0.578
O3'	B	0, 0.659, 1.276, 1.893, 2.391 max_d=2.391 avg_d=1.276 std_dev=0.617
P	A	0, 0.935, 1.816, 2.697, 4.348 max_d=4.348 avg_d=1.816 std_dev=0.881
OP1	A	0, 1.150, 2.208, 3.267, 4.658 max_d=4.658 avg_d=2.208 std_dev=1.059
OP2	A	0, 1.203, 2.660, 4.117, 7.068 max_d=7.068 avg_d=2.660 std_dev=1.457

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.26	0.59	0.47	0.27
C2	0.04	0.00	0.13	0.08	0.01	0.04	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.13	0.06	0.46	0.97	0.83	0.55
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.09	0.10	0.13	0.07	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.21	0.37	0.36	0.20
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.02	0.08	0.15	0.07	0.09	0.11	0.14	0.06	0.03	0.01	0.02	0.23	0.25	0.35	0.19
C4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.06	0.03	0.48	0.92	0.82	0.55
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.13	0.06	0.04	0.11	0.13	0.06	0.05	0.03	0.01	0.02	0.32	0.29	0.10
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.58	1.08	1.03	0.71
C5'	0.04	0.16	0.02	0.02	0.17	0.01	0.23	0.00	0.24	0.24	0.20	0.13	0.27	0.27	0.15	0.05	0.05	0.02	0.01	0.32	0.38	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.04	0.59	1.14	1.09	0.74
C8	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.13	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.16	0.06	0.59	0.98	0.97	0.69
N1	0.02	0.01	0.10	0.07	0.01	0.06	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.10	0.05	0.54	1.08	0.98	0.66
N3	0.04	0.01	0.13	0.09	0.01	0.04	0.01	0.13	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.18	0.12	0.06	0.40	0.87	0.72	0.47
N6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.02	0.11	0.02	0.27	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.13	0.05	0.64	1.24	1.22	0.84
N7	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.13	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.16	0.05	0.64	1.14	1.15	0.80
N9	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.45	0.81	0.73	0.49
O2'	0.02	0.19	0.00	0.03	0.10	0.05	0.07	0.05	0.10	0.06	0.15	0.18	0.09	0.05	0.03	0.00	0.06	0.06	0.09	0.43	0.35	0.21
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.06	0.03	0.10	0.05	0.10	0.16	0.10	0.12	0.13	0.16	0.06	0.06	0.00	0.03	0.27	0.44	0.47	0.27
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.05	0.02	0.06	0.03	0.00	0.21	0.59	0.46	0.22
O5'	0.26	0.46	0.21	0.23	0.48	0.02	0.58	0.01	0.59	0.59	0.54	0.40	0.64	0.64	0.45	0.09	0.27	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.59	0.97	0.37	0.25	0.92	0.32	1.08	0.32	1.14	0.98	1.08	0.87	1.24	1.14	0.81	0.43	0.44	0.59	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.47	0.83	0.36	0.35	0.82	0.29	1.03	0.38	1.09	0.97	0.98	0.72	1.22	1.15	0.73	0.35	0.47	0.46	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.27	0.55	0.20	0.19	0.55	0.10	0.71	0.02	0.74	0.69	0.66	0.47	0.84	0.80	0.49	0.21	0.27	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.22	0.18	0.17	0.18	0.18	0.26	0.25	0.26	0.35	0.24	0.17	0.32	0.37	0.23	0.21	0.17	0.16	0.23	0.05	0.12	0.07
C2	0.28	0.19	0.30	0.25	0.20	0.25	0.19	0.27	0.18	0.26	0.20	0.18	0.22	0.24	0.25	0.34	0.25	0.25	0.28	0.13	0.27	0.16
C2'	0.18	0.23	0.15	0.16	0.19	0.15	0.27	0.26	0.26	0.37	0.24	0.19	0.30	0.37	0.23	0.18	0.16	0.12	0.26	0.10	0.17	0.13
C3'	0.20	0.25	0.15	0.16	0.23	0.12	0.31	0.17	0.32	0.37	0.28	0.22	0.37	0.41	0.24	0.18	0.16	0.18	0.09	0.05	0.07	0.02
C4	0.20	0.20	0.20	0.17	0.18	0.17	0.24	0.21	0.24	0.29	0.24	0.14	0.28	0.30	0.22	0.23	0.16	0.17	0.24	0.10	0.23	0.12
C4'	0.18	0.24	0.14	0.14	0.21	0.10	0.31	0.18	0.32	0.37	0.28	0.19	0.39	0.41	0.23	0.17	0.15	0.14	0.07	0.15	0.19	0.09
C5	0.19	0.19	0.21	0.18	0.18	0.17	0.24	0.19	0.24	0.28	0.23	0.14	0.29	0.30	0.21	0.22	0.18	0.18	0.25	0.18	0.28	0.18
C5'	0.21	0.30	0.20	0.21	0.27	0.16	0.35	0.19	0.39	0.37	0.35	0.25	0.46	0.43	0.25	0.19	0.22	0.19	0.13	0.29	0.37	0.21
C6	0.20	0.17	0.23	0.19	0.17	0.17	0.21	0.19	0.21	0.25	0.19	0.15	0.27	0.27	0.20	0.24	0.19	0.18	0.26	0.18	0.31	0.18
C8	0.23	0.22	0.24	0.23	0.21	0.22	0.28	0.24	0.30	0.34	0.27	0.18	0.37	0.37	0.25	0.23	0.23	0.24	0.27	0.22	0.26	0.21
N1	0.23	0.16	0.27	0.22	0.18	0.20	0.19	0.21	0.19	0.23	0.17	0.17	0.25	0.23	0.21	0.30	0.22	0.21	0.27	0.14	0.29	0.16
N3	0.26	0.21	0.27	0.23	0.20	0.24	0.22	0.28	0.21	0.30	0.23	0.16	0.23	0.28	0.25	0.31	0.23	0.24	0.28	0.12	0.23	0.14
N6	0.20	0.19	0.24	0.22	0.19	0.18	0.24	0.20	0.23	0.27	0.19	0.18	0.32	0.30	0.22	0.24	0.23	0.19	0.28	0.24	0.35	0.23
N7	0.22	0.21	0.24	0.24	0.21	0.22	0.28	0.23	0.29	0.32	0.27	0.17	0.36	0.35	0.24	0.24	0.24	0.23	0.28	0.26	0.31	0.23
N9	0.20	0.21	0.20	0.17	0.19	0.17	0.27	0.21	0.27	0.33	0.25	0.16	0.32	0.35	0.23	0.21	0.17	0.18	0.23	0.11	0.19	0.11
O2'	0.23	0.24	0.22	0.25	0.19	0.26	0.25	0.38	0.24	0.39	0.23	0.20	0.27	0.36	0.26	0.25	0.26	0.21	0.37	0.18	0.18	0.19
O3'	0.24	0.26	0.19	0.18	0.25	0.18	0.32	0.19	0.31	0.39	0.28	0.24	0.37	0.42	0.27	0.23	0.19	0.25	0.02	0.03	0.03	0.01
O4'	0.18	0.21	0.15	0.14	0.19	0.13	0.29	0.21	0.30	0.36	0.25	0.17	0.37	0.40	0.22	0.18	0.14	0.14	0.14	0.10	0.16	0.05
O5'	0.42	0.54	0.45	0.44	0.55	0.33	0.67	0.32	0.69	0.65	0.62	0.49	0.78	0.75	0.52	0.40	0.44	0.36	0.40	0.42	0.62	0.39
OP1	0.59	0.93	0.59	0.53	0.84	0.42	0.98	0.45	1.09	0.81	1.04	0.83	1.22	0.99	0.73	0.54	0.52	0.48	0.52	0.76	0.76	0.57
OP2	0.66	0.99	0.73	0.74	0.91	0.59	1.10	0.59	1.22	0.98	1.15	0.86	1.40	1.15	0.82	0.68	0.77	0.55	0.69	0.87	0.94	0.71
P	0.46	0.67	0.49	0.46	0.65	0.32	0.81	0.29	0.87	0.74	0.79	0.59	1.00	0.88	0.60	0.44	0.44	0.37	0.37	0.51	0.65	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.10	0.09	0.31	0.12
C2	0.03	0.00	0.14	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.15	0.15	0.24	0.19	0.38	0.21
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.08	0.12	0.14	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.12	0.27	0.07
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.02	0.16	0.15	0.14	0.11	0.17	0.16	0.09	0.03	0.01	0.02	0.21	0.19	0.24	0.12
C4	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.11	0.07	0.26	0.21	0.38	0.23
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.16	0.05	0.08	0.10	0.15	0.06	0.06	0.02	0.01	0.02	0.10	0.26	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.03	0.35	0.34	0.47	0.34
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.12	0.01	0.19	0.00	0.18	0.28	0.14	0.11	0.23	0.29	0.13	0.06	0.04	0.01	0.01	0.12	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.06	0.35	0.35	0.49	0.35
C8	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.16	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.16	0.10	0.39	0.38	0.46	0.38
N1	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.12	0.29	0.27	0.44	0.29
N3	0.03	0.00	0.14	0.11	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.12	0.14	0.20	0.14	0.34	0.17
N6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.10	0.01	0.23	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.20	0.05	0.40	0.44	0.55	0.42
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.15	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.18	0.07	0.42	0.45	0.53	0.44
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.24	0.21	0.36	0.22
O2'	0.02	0.14	0.00	0.03	0.08	0.06	0.06	0.06	0.08	0.08	0.12	0.14	0.08	0.07	0.04	0.00	0.06	0.07	0.09	0.12	0.27	0.08
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.11	0.02	0.15	0.04	0.17	0.16	0.16	0.12	0.20	0.18	0.08	0.06	0.00	0.02	0.21	0.27	0.24	0.16
O4'	0.01	0.15	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.10	0.12	0.14	0.05	0.07	0.01	0.07	0.02	0.00	0.08	0.13	0.34	0.17
O5'	0.10	0.24	0.15	0.21	0.26	0.02	0.35	0.01	0.35	0.39	0.29	0.20	0.40	0.42	0.24	0.09	0.21	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.09	0.19	0.12	0.19	0.21	0.10	0.34	0.12	0.35	0.38	0.27	0.14	0.44	0.45	0.21	0.12	0.27	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.31	0.38	0.27	0.24	0.38	0.26	0.47	0.21	0.49	0.46	0.44	0.34	0.55	0.53	0.36	0.27	0.24	0.34	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.21	0.07	0.12	0.23	0.06	0.34	0.02	0.35	0.38	0.29	0.17	0.42	0.44	0.22	0.08	0.16	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00