Doublet Group distance statistics: 51984

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 5, 2, 5, 0, 1, 2, 1, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.039, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.006, 0.036, 0.065, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.036 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.007, 0.041, 0.076, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.041 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.007, 0.042, 0.076, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.042 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.081, 0.178, 0.274, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.178 std_dev=0.097
C2'	A	0, 0.103, 0.203, 0.303, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.203 std_dev=0.100
O2'	A	0, 0.114, 0.294, 0.475, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.294 std_dev=0.180
C4'	A	0, 0.184, 0.366, 0.548, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.366 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.146, 0.337, 0.528, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.337 std_dev=0.191
C1'	B	0, 0.318, 0.566, 0.813, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.566 std_dev=0.248
O4'	B	0, 0.315, 0.583, 0.851, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.583 std_dev=0.268
N9	B	0, 0.267, 0.548, 0.828, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.548 std_dev=0.280
C2'	B	0, 0.305, 0.596, 0.886, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.596 std_dev=0.291
O3'	A	0, 0.183, 0.475, 0.767, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.475 std_dev=0.292
C5'	B	0, 0.373, 0.667, 0.961, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.667 std_dev=0.294
O5'	B	0, 0.317, 0.615, 0.913, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.615 std_dev=0.298
C4'	B	0, 0.325, 0.628, 0.931, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.628 std_dev=0.303
C4	B	0, 0.233, 0.555, 0.877, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.555 std_dev=0.322
N3	B	0, 0.267, 0.590, 0.912, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.590 std_dev=0.322
C8	B	0, 0.316, 0.640, 0.964, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.640 std_dev=0.324
C3'	B	0, 0.285, 0.613, 0.941, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.613 std_dev=0.328
O2'	B	0, 0.394, 0.737, 1.080, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.737 std_dev=0.343
C5'	A	0, 0.336, 0.680, 1.024, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.680 std_dev=0.344
P	B	0, 0.247, 0.598, 0.949, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.598 std_dev=0.351
N7	B	0, 0.343, 0.716, 1.090, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.716 std_dev=0.373
C2	B	0, 0.270, 0.646, 1.022, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.646 std_dev=0.376
C5	B	0, 0.257, 0.634, 1.010, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.634 std_dev=0.377
OP2	B	0, 0.265, 0.670, 1.075, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.670 std_dev=0.405
C6	B	0, 0.264, 0.691, 1.117, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.691 std_dev=0.426
N1	B	0, 0.245, 0.677, 1.108, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.677 std_dev=0.432
O3'	B	0, 0.293, 0.762, 1.231, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.762 std_dev=0.469
N6	B	0, 0.348, 0.827, 1.305, 1.935 max_d=1.935 avg_d=0.827 std_dev=0.479
OP1	B	0, 0.219, 0.705, 1.192, 2.489 max_d=2.489 avg_d=0.705 std_dev=0.486
O5'	A	0, 0.402, 0.934, 1.466, 2.159 max_d=2.159 avg_d=0.934 std_dev=0.532
P	A	0, 0.693, 1.929, 3.165, 4.043 max_d=4.043 avg_d=1.929 std_dev=1.236
OP1	A	0, 0.791, 2.202, 3.614, 4.482 max_d=4.482 avg_d=2.202 std_dev=1.411
OP2	A	0, 0.934, 2.794, 4.655, 5.740 max_d=5.740 avg_d=2.794 std_dev=1.861

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.38	0.55	0.23
C2	0.04	0.00	0.12	0.19	0.01	0.11	0.01	0.26	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.20	0.20	0.03	0.34	0.30	1.16	0.57
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.03	0.06	0.03	0.08	0.07	0.10	0.12	0.08	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.24	0.46	0.57	0.12
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.13	0.01	0.14	0.04	0.16	0.14	0.18	0.17	0.17	0.15	0.09	0.03	0.01	0.02	0.37	0.44	0.58	0.20
C4	0.02	0.01	0.06	0.13	0.00	0.10	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.12	0.02	0.33	0.32	1.08	0.56
C4'	0.01	0.11	0.03	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.14	0.15	0.12	0.10	0.16	0.17	0.09	0.09	0.02	0.00	0.02	0.57	0.25	0.21
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.14	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.15	0.03	0.41	0.51	1.29	0.77
C5'	0.05	0.26	0.03	0.04	0.25	0.01	0.33	0.00	0.34	0.31	0.31	0.21	0.38	0.36	0.21	0.10	0.07	0.02	0.01	0.31	0.30	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.16	0.01	0.14	0.01	0.34	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.13	0.17	0.03	0.42	0.55	1.40	0.82
C8	0.02	0.02	0.07	0.14	0.01	0.15	0.01	0.31	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.04	0.16	0.06	0.38	0.49	1.08	0.70
N1	0.04	0.00	0.10	0.18	0.01	0.12	0.01	0.31	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.17	0.19	0.02	0.39	0.42	1.33	0.72
N3	0.04	0.01	0.12	0.17	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.18	0.03	0.30	0.28	1.01	0.46
N6	0.03	0.02	0.08	0.17	0.02	0.16	0.02	0.38	0.00	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.12	0.19	0.05	0.45	0.71	1.52	0.95
N7	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.17	0.01	0.36	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.17	0.06	0.44	0.66	1.32	0.88
N9	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.09	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.08	0.02	0.29	0.29	0.90	0.47
O2'	0.01	0.20	0.00	0.03	0.11	0.09	0.09	0.10	0.13	0.04	0.17	0.18	0.12	0.05	0.04	0.00	0.06	0.08	0.13	0.77	0.29	0.29
O3'	0.02	0.20	0.03	0.01	0.12	0.02	0.15	0.07	0.17	0.16	0.19	0.18	0.19	0.17	0.08	0.06	0.00	0.02	0.43	0.69	0.49	0.30
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.02	0.03	0.05	0.06	0.02	0.08	0.02	0.00	0.21	0.48	0.37	0.30
O5'	0.16	0.34	0.24	0.37	0.33	0.02	0.41	0.01	0.42	0.38	0.39	0.30	0.45	0.44	0.29	0.13	0.43	0.21	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.38	0.30	0.46	0.44	0.32	0.57	0.51	0.31	0.55	0.49	0.42	0.28	0.71	0.66	0.29	0.77	0.69	0.48	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.55	1.16	0.57	0.58	1.08	0.25	1.29	0.30	1.40	1.08	1.33	1.01	1.52	1.32	0.90	0.29	0.49	0.37	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.57	0.12	0.20	0.56	0.21	0.77	0.02	0.82	0.70	0.72	0.46	0.95	0.88	0.47	0.29	0.30	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.22	0.17	0.13	0.22	0.13	0.25	0.18	0.27	0.26	0.24	0.21	0.31	0.29	0.22	0.20	0.13	0.15	0.28	0.08	0.13	0.08
C2	0.21	0.17	0.23	0.18	0.12	0.22	0.15	0.22	0.16	0.18	0.15	0.18	0.20	0.20	0.13	0.32	0.22	0.21	0.24	0.18	0.28	0.19
C2'	0.18	0.21	0.15	0.15	0.22	0.13	0.27	0.21	0.28	0.28	0.24	0.20	0.32	0.31	0.22	0.16	0.16	0.15	0.32	0.16	0.13	0.15
C3'	0.21	0.27	0.18	0.18	0.27	0.16	0.34	0.17	0.36	0.32	0.32	0.24	0.41	0.38	0.25	0.17	0.18	0.21	0.10	0.03	0.09	0.02
C4	0.21	0.23	0.19	0.12	0.19	0.14	0.19	0.16	0.21	0.20	0.22	0.22	0.23	0.22	0.18	0.25	0.12	0.16	0.23	0.12	0.24	0.14
C4'	0.19	0.29	0.15	0.17	0.28	0.13	0.36	0.19	0.39	0.33	0.35	0.25	0.46	0.40	0.25	0.15	0.18	0.17	0.08	0.14	0.24	0.11
C5	0.22	0.28	0.21	0.14	0.21	0.15	0.20	0.16	0.22	0.21	0.26	0.26	0.23	0.23	0.20	0.26	0.14	0.18	0.23	0.17	0.31	0.19
C5'	0.34	0.52	0.31	0.29	0.49	0.23	0.59	0.22	0.64	0.50	0.60	0.46	0.72	0.61	0.43	0.26	0.28	0.28	0.17	0.32	0.44	0.26
C6	0.22	0.26	0.22	0.14	0.17	0.17	0.14	0.17	0.14	0.20	0.21	0.25	0.18	0.22	0.17	0.29	0.15	0.19	0.24	0.19	0.35	0.22
C8	0.24	0.31	0.21	0.18	0.27	0.16	0.29	0.18	0.32	0.28	0.33	0.28	0.36	0.31	0.25	0.23	0.17	0.19	0.26	0.17	0.27	0.18
N1	0.21	0.19	0.23	0.16	0.12	0.20	0.15	0.20	0.15	0.19	0.14	0.21	0.21	0.23	0.14	0.32	0.19	0.21	0.24	0.19	0.33	0.21
N3	0.20	0.18	0.20	0.15	0.15	0.18	0.16	0.21	0.17	0.18	0.17	0.18	0.19	0.20	0.14	0.28	0.18	0.18	0.24	0.16	0.23	0.15
N6	0.22	0.31	0.23	0.16	0.19	0.17	0.17	0.17	0.15	0.23	0.24	0.28	0.19	0.26	0.19	0.30	0.16	0.20	0.25	0.24	0.40	0.26
N7	0.24	0.32	0.22	0.18	0.27	0.16	0.28	0.17	0.31	0.27	0.33	0.29	0.33	0.29	0.24	0.25	0.18	0.19	0.25	0.20	0.33	0.22
N9	0.22	0.25	0.18	0.13	0.23	0.13	0.25	0.16	0.27	0.25	0.26	0.24	0.30	0.28	0.22	0.22	0.12	0.16	0.25	0.10	0.20	0.11
O2'	0.26	0.26	0.24	0.26	0.27	0.25	0.29	0.33	0.29	0.31	0.27	0.27	0.31	0.32	0.28	0.24	0.26	0.25	0.41	0.25	0.15	0.22
O3'	0.21	0.26	0.22	0.27	0.27	0.22	0.34	0.26	0.36	0.33	0.31	0.24	0.43	0.39	0.26	0.20	0.29	0.22	0.01	0.02	0.02	0.01
O4'	0.19	0.24	0.13	0.10	0.23	0.10	0.28	0.16	0.31	0.27	0.28	0.22	0.37	0.32	0.22	0.17	0.11	0.14	0.17	0.08	0.20	0.05
O5'	0.44	0.47	0.45	0.48	0.47	0.43	0.50	0.45	0.52	0.49	0.50	0.45	0.57	0.52	0.46	0.43	0.50	0.41	0.52	0.44	0.48	0.46
OP1	0.43	0.55	0.42	0.44	0.52	0.48	0.62	0.56	0.70	0.53	0.65	0.49	0.82	0.64	0.47	0.43	0.48	0.44	0.48	0.79	0.48	0.58
OP2	1.27	1.52	1.30	1.21	1.49	1.02	1.57	0.86	1.61	1.47	1.58	1.47	1.66	1.59	1.41	1.21	1.16	1.11	0.95	0.63	1.02	0.76
P	0.57	0.82	0.57	0.51	0.78	0.38	0.88	0.33	0.94	0.78	0.90	0.75	1.03	0.90	0.71	0.49	0.48	0.46	0.41	0.39	0.53	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.11	0.19	0.11
C2	0.05	0.00	0.14	0.13	0.02	0.06	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.19	0.18	0.05	0.24	0.24	0.38	0.27
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.02	0.08	0.06	0.12	0.14	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.20	0.14	0.13
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.11	0.12	0.12	0.12	0.12	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.24	0.27	0.11	0.18
C4	0.02	0.02	0.08	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.27	0.26	0.36	0.28
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.04	0.07	0.07	0.08	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.12	0.18	0.03
C5	0.01	0.02	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03	0.36	0.38	0.48	0.39
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.08	0.00	0.12	0.00	0.13	0.15	0.09	0.06	0.16	0.16	0.08	0.07	0.03	0.01	0.01	0.13	0.25	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.03	0.37	0.40	0.53	0.42
C8	0.02	0.03	0.06	0.12	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.37	0.36	0.41	0.36
N1	0.03	0.01	0.12	0.12	0.01	0.04	0.02	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.16	0.04	0.31	0.33	0.47	0.36
N3	0.05	0.00	0.14	0.12	0.01	0.07	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.18	0.16	0.05	0.20	0.19	0.32	0.22
N6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.02	0.07	0.02	0.16	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.10	0.16	0.04	0.43	0.49	0.62	0.49
N7	0.02	0.03	0.05	0.11	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.14	0.04	0.42	0.44	0.53	0.45
N9	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.25	0.23	0.30	0.24
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.09	0.07	0.07	0.07	0.11	0.04	0.16	0.18	0.10	0.03	0.02	0.00	0.05	0.05	0.08	0.19	0.12	0.07
O3'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.03	0.14	0.14	0.16	0.16	0.16	0.14	0.06	0.05	0.00	0.02	0.24	0.32	0.16	0.20
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.10	0.22	0.11
O5'	0.11	0.24	0.16	0.24	0.27	0.01	0.36	0.01	0.37	0.37	0.31	0.20	0.43	0.42	0.25	0.08	0.24	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.24	0.20	0.27	0.26	0.12	0.38	0.13	0.40	0.36	0.33	0.19	0.49	0.44	0.23	0.19	0.32	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.38	0.14	0.11	0.36	0.18	0.48	0.25	0.53	0.41	0.47	0.32	0.62	0.53	0.30	0.12	0.16	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.27	0.13	0.18	0.28	0.03	0.39	0.01	0.42	0.36	0.36	0.22	0.49	0.45	0.24	0.07	0.20	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00