Doublet Group distance statistics: 51989

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 0, 1, 1, 5, 1, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.014, 0.027, 0.039, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.027 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.012, 0.029, 0.047, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.029 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.034, 0.056, 0.078, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.056 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.030, 0.053, 0.076, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.053 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.025, 0.055, 0.085, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.055 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.025, 0.168, 0.311, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.168 std_dev=0.143
C2'	A	0, 0.051, 0.201, 0.351, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.201 std_dev=0.150
C4'	A	0, 0.128, 0.313, 0.498, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.313 std_dev=0.185
O2'	A	0, 0.299, 0.491, 0.683, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.491 std_dev=0.192
C3'	A	0, 0.113, 0.319, 0.525, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.319 std_dev=0.206
C4	B	0, 0.227, 0.471, 0.716, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.471 std_dev=0.245
N3	B	0, 0.306, 0.564, 0.821, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.564 std_dev=0.257
C5	B	0, 0.331, 0.589, 0.847, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.589 std_dev=0.258
N7	B	0, 0.359, 0.650, 0.942, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.650 std_dev=0.292
N9	B	0, 0.207, 0.501, 0.794, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.501 std_dev=0.293
O3'	A	0, 0.174, 0.492, 0.810, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.492 std_dev=0.318
C8	B	0, 0.312, 0.640, 0.967, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.640 std_dev=0.327
C1'	B	0, 0.276, 0.605, 0.935, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.605 std_dev=0.329
C5'	A	0, 0.201, 0.538, 0.875, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.538 std_dev=0.337
C6	B	0, 0.434, 0.787, 1.141, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.787 std_dev=0.354
C2'	B	0, 0.244, 0.613, 0.983, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.613 std_dev=0.369
O5'	A	0, 0.197, 0.570, 0.943, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.570 std_dev=0.373
C2	B	0, 0.404, 0.779, 1.153, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.779 std_dev=0.374
O2'	B	0, 0.335, 0.738, 1.140, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.738 std_dev=0.403
O5'	B	0, 0.226, 0.630, 1.033, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.630 std_dev=0.404
C4'	B	0, 0.249, 0.653, 1.057, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.653 std_dev=0.404
P	B	0, 0.217, 0.622, 1.027, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.622 std_dev=0.405
O4'	B	0, 0.335, 0.743, 1.152, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.743 std_dev=0.408
C3'	B	0, 0.178, 0.594, 1.010, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.594 std_dev=0.416
N1	B	0, 0.468, 0.898, 1.328, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.898 std_dev=0.430
C5'	B	0, 0.228, 0.661, 1.094, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.661 std_dev=0.433
OP2	B	0, 0.275, 0.709, 1.142, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.709 std_dev=0.433
N6	B	0, 0.497, 0.954, 1.411, 1.711 max_d=1.711 avg_d=0.954 std_dev=0.457
O3'	B	0, 0.152, 0.659, 1.167, 2.205 max_d=2.205 avg_d=0.659 std_dev=0.507
P	A	0, 0.246, 0.784, 1.321, 2.007 max_d=2.007 avg_d=0.784 std_dev=0.537
OP1	B	0, 0.222, 0.782, 1.342, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.782 std_dev=0.560
OP2	A	0, 0.265, 0.939, 1.612, 2.746 max_d=2.746 avg_d=0.939 std_dev=0.673
OP1	A	0, 0.081, 1.124, 2.168, 4.628 max_d=4.628 avg_d=1.124 std_dev=1.044

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.14	0.37	0.16	0.13
C2	0.04	0.00	0.12	0.14	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.11	0.17	0.04	0.21	0.51	0.38	0.24
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.11	0.07	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.17	0.20	0.09
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.03	0.12	0.09	0.13	0.13	0.12	0.09	0.05	0.03	0.02	0.02	0.12	0.15	0.21	0.13
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.10	0.04	0.22	0.51	0.35	0.24
C4'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.06	0.06	0.09	0.10	0.05	0.05	0.03	0.01	0.03	0.15	0.13	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.11	0.06	0.25	0.57	0.44	0.29
C5'	0.03	0.09	0.02	0.03	0.10	0.01	0.13	0.00	0.13	0.14	0.11	0.08	0.16	0.16	0.09	0.05	0.03	0.02	0.02	0.17	0.19	0.02
C6	0.02	0.02	0.07	0.12	0.02	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.05	0.25	0.59	0.48	0.30
C8	0.04	0.02	0.06	0.09	0.01	0.10	0.01	0.14	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.09	0.09	0.28	0.55	0.38	0.28
N1	0.04	0.01	0.10	0.13	0.02	0.06	0.01	0.11	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.17	0.03	0.23	0.56	0.44	0.28
N3	0.04	0.01	0.11	0.13	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.10	0.15	0.03	0.20	0.48	0.32	0.22
N6	0.02	0.02	0.07	0.12	0.02	0.09	0.02	0.16	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.06	0.15	0.06	0.26	0.62	0.53	0.34
N7	0.04	0.01	0.06	0.09	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.10	0.09	0.28	0.60	0.48	0.32
N9	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.05	0.04	0.22	0.48	0.29	0.22
O2'	0.03	0.11	0.01	0.03	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.07	0.10	0.10	0.06	0.07	0.04	0.00	0.05	0.04	0.06	0.18	0.16	0.08
O3'	0.03	0.17	0.03	0.02	0.10	0.03	0.11	0.03	0.14	0.09	0.17	0.15	0.15	0.10	0.05	0.05	0.00	0.03	0.22	0.33	0.29	0.21
O4'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.05	0.09	0.03	0.03	0.06	0.09	0.04	0.04	0.03	0.00	0.17	0.39	0.15	0.14
O5'	0.14	0.21	0.05	0.12	0.22	0.03	0.25	0.02	0.25	0.28	0.23	0.20	0.26	0.28	0.22	0.06	0.22	0.17	0.00	0.03	0.04	0.01
OP1	0.37	0.51	0.17	0.15	0.51	0.15	0.57	0.17	0.59	0.55	0.56	0.48	0.62	0.60	0.48	0.18	0.33	0.39	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.38	0.20	0.21	0.35	0.13	0.44	0.19	0.48	0.38	0.44	0.32	0.53	0.48	0.29	0.16	0.29	0.15	0.04	0.02	0.00	0.02
P	0.13	0.24	0.09	0.13	0.24	0.04	0.29	0.02	0.30	0.28	0.28	0.22	0.34	0.32	0.22	0.08	0.21	0.14	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.26	0.23	0.15	0.18	0.18	0.20	0.17	0.24	0.24	0.24	0.25	0.30	0.27	0.18	0.33	0.15	0.24	0.18	0.16	0.16	0.05
C2	0.28	0.33	0.34	0.31	0.19	0.33	0.25	0.36	0.30	0.34	0.33	0.26	0.34	0.33	0.23	0.45	0.34	0.31	0.37	0.33	0.30	0.27
C2'	0.23	0.21	0.19	0.14	0.18	0.17	0.23	0.17	0.25	0.25	0.22	0.21	0.31	0.30	0.17	0.27	0.14	0.24	0.20	0.20	0.08	0.10
C3'	0.19	0.18	0.13	0.12	0.16	0.15	0.23	0.14	0.26	0.21	0.22	0.16	0.34	0.29	0.15	0.19	0.13	0.24	0.10	0.05	0.14	0.03
C4	0.26	0.30	0.26	0.19	0.15	0.21	0.19	0.22	0.26	0.26	0.29	0.26	0.32	0.28	0.15	0.38	0.21	0.22	0.25	0.19	0.25	0.15
C4'	0.21	0.18	0.15	0.12	0.15	0.15	0.19	0.16	0.23	0.19	0.20	0.18	0.31	0.25	0.15	0.22	0.13	0.24	0.09	0.06	0.22	0.07
C5	0.27	0.31	0.27	0.19	0.15	0.21	0.19	0.20	0.28	0.23	0.32	0.27	0.35	0.26	0.17	0.38	0.21	0.23	0.22	0.15	0.30	0.15
C5'	0.25	0.23	0.17	0.15	0.20	0.18	0.21	0.17	0.24	0.18	0.24	0.23	0.32	0.22	0.20	0.23	0.15	0.28	0.10	0.19	0.35	0.17
C6	0.26	0.34	0.30	0.24	0.15	0.25	0.23	0.25	0.33	0.27	0.37	0.25	0.39	0.29	0.18	0.40	0.27	0.24	0.28	0.21	0.32	0.20
C8	0.31	0.29	0.26	0.18	0.22	0.21	0.20	0.16	0.25	0.22	0.28	0.28	0.32	0.23	0.23	0.35	0.18	0.29	0.15	0.08	0.30	0.10
N1	0.29	0.36	0.34	0.30	0.19	0.31	0.27	0.33	0.33	0.32	0.37	0.26	0.38	0.32	0.24	0.45	0.34	0.30	0.34	0.29	0.33	0.25
N3	0.24	0.30	0.28	0.24	0.16	0.26	0.22	0.31	0.26	0.32	0.29	0.25	0.32	0.31	0.18	0.41	0.27	0.23	0.33	0.30	0.26	0.23
N6	0.26	0.35	0.29	0.24	0.17	0.24	0.24	0.24	0.36	0.25	0.41	0.24	0.44	0.28	0.20	0.38	0.27	0.24	0.27	0.21	0.35	0.21
N7	0.29	0.30	0.26	0.18	0.21	0.20	0.19	0.16	0.27	0.21	0.30	0.28	0.35	0.22	0.22	0.35	0.19	0.26	0.16	0.09	0.32	0.12
N9	0.29	0.28	0.25	0.16	0.19	0.19	0.19	0.16	0.24	0.23	0.27	0.27	0.31	0.25	0.19	0.36	0.17	0.25	0.18	0.11	0.23	0.06
O2'	0.23	0.23	0.20	0.16	0.20	0.18	0.24	0.21	0.25	0.27	0.23	0.22	0.31	0.30	0.19	0.28	0.17	0.23	0.21	0.32	0.07	0.17
O3'	0.16	0.19	0.14	0.17	0.18	0.16	0.26	0.18	0.28	0.22	0.24	0.16	0.35	0.30	0.16	0.15	0.19	0.22	0.03	0.02	0.05	0.01
O4'	0.26	0.22	0.21	0.13	0.17	0.17	0.19	0.15	0.22	0.23	0.21	0.22	0.30	0.26	0.19	0.30	0.13	0.26	0.14	0.07	0.23	0.04
O5'	0.28	0.28	0.21	0.19	0.24	0.23	0.25	0.19	0.30	0.22	0.30	0.27	0.37	0.23	0.24	0.26	0.20	0.32	0.22	0.17	0.22	0.17
OP1	0.35	0.36	0.30	0.34	0.33	0.33	0.31	0.36	0.33	0.34	0.36	0.35	0.35	0.31	0.34	0.32	0.40	0.39	0.40	0.60	0.67	0.51
OP2	0.63	0.70	0.60	0.54	0.68	0.52	0.70	0.42	0.72	0.67	0.72	0.68	0.76	0.70	0.66	0.60	0.53	0.60	0.44	0.26	0.31	0.28
P	0.39	0.33	0.31	0.28	0.33	0.31	0.30	0.25	0.31	0.35	0.32	0.34	0.34	0.31	0.36	0.35	0.28	0.41	0.29	0.23	0.32	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.09	0.13	0.06
C2	0.04	0.00	0.14	0.18	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.24	0.05	0.21	0.24	0.41	0.25
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.08	0.08	0.12	0.14	0.08	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.17	0.19	0.12
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.12	0.01	0.14	0.01	0.17	0.14	0.18	0.16	0.18	0.15	0.08	0.05	0.01	0.01	0.15	0.21	0.22	0.17
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.03	0.19	0.21	0.35	0.23
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.02	0.09	0.11	0.08	0.06	0.12	0.12	0.05	0.06	0.02	0.01	0.03	0.14	0.07	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.17	0.05	0.25	0.30	0.46	0.31
C5'	0.03	0.11	0.03	0.01	0.10	0.02	0.15	0.00	0.16	0.16	0.14	0.09	0.20	0.18	0.09	0.07	0.03	0.02	0.01	0.12	0.09	0.04
C6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.21	0.05	0.27	0.34	0.52	0.35
C8	0.04	0.01	0.08	0.14	0.01	0.11	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.15	0.07	0.21	0.23	0.34	0.25
N1	0.03	0.00	0.12	0.18	0.02	0.08	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.12	0.24	0.05	0.25	0.31	0.49	0.32
N3	0.04	0.01	0.14	0.16	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.05	0.17	0.19	0.34	0.20
N6	0.03	0.02	0.08	0.18	0.01	0.12	0.02	0.20	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.06	0.23	0.07	0.31	0.42	0.59	0.42
N7	0.04	0.01	0.06	0.15	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.05	0.16	0.07	0.26	0.32	0.47	0.34
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.05	0.02	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.08	0.03	0.15	0.15	0.27	0.17
O2'	0.02	0.14	0.01	0.05	0.06	0.06	0.04	0.07	0.07	0.06	0.12	0.13	0.06	0.05	0.02	0.00	0.07	0.05	0.09	0.20	0.16	0.10
O3'	0.02	0.24	0.02	0.01	0.14	0.02	0.17	0.03	0.21	0.15	0.24	0.20	0.23	0.16	0.08	0.07	0.00	0.02	0.18	0.28	0.29	0.22
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.07	0.05	0.05	0.07	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.11	0.13	0.11	0.11
O5'	0.06	0.21	0.11	0.15	0.19	0.03	0.25	0.01	0.27	0.21	0.25	0.17	0.31	0.26	0.15	0.09	0.18	0.11	0.00	0.03	0.03	0.02
OP1	0.09	0.24	0.17	0.21	0.21	0.14	0.30	0.12	0.34	0.23	0.31	0.19	0.42	0.32	0.15	0.20	0.28	0.13	0.03	0.00	0.03	0.01
OP2	0.13	0.41	0.19	0.22	0.35	0.07	0.46	0.09	0.52	0.34	0.49	0.34	0.59	0.47	0.27	0.16	0.29	0.11	0.03	0.03	0.00	0.02
P	0.06	0.25	0.12	0.17	0.23	0.05	0.31	0.04	0.35	0.25	0.32	0.20	0.42	0.34	0.17	0.10	0.22	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00