Doublet Group distance statistics: 51991

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.013, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.013, 0.030, 0.046, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.017, 0.039, 0.061, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.039 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.009, 0.037, 0.064, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.037 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.015, 0.046, 0.076, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.046 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.040, 0.151, 0.262, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.151 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.095, 0.222, 0.349, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.222 std_dev=0.127
C4'	A	0, 0.087, 0.284, 0.481, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.284 std_dev=0.197
C3'	A	0, 0.164, 0.375, 0.585, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.375 std_dev=0.211
O2'	A	0, 0.167, 0.386, 0.605, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.386 std_dev=0.219
N3	B	0, 0.300, 0.548, 0.796, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.548 std_dev=0.248
C2	B	0, 0.321, 0.570, 0.818, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.570 std_dev=0.248
C4	B	0, 0.124, 0.403, 0.682, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.403 std_dev=0.279
N9	B	0, 0.206, 0.488, 0.769, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.488 std_dev=0.281
C1'	B	0, 0.366, 0.650, 0.934, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.650 std_dev=0.284
N1	B	0, 0.214, 0.507, 0.800, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.507 std_dev=0.293
C8	B	0, 0.272, 0.568, 0.863, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.568 std_dev=0.295
O4'	B	0, 0.516, 0.825, 1.135, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.825 std_dev=0.310
N7	B	0, 0.228, 0.548, 0.868, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.548 std_dev=0.320
C5	B	0, 0.036, 0.372, 0.708, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.372 std_dev=0.336
C3'	B	0, 0.539, 0.879, 1.219, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.879 std_dev=0.340
O3'	A	0, 0.301, 0.650, 0.998, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.650 std_dev=0.348
C6	B	0, 0.075, 0.426, 0.778, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.426 std_dev=0.351
O5'	B	0, 0.439, 0.797, 1.154, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.797 std_dev=0.358
C2'	B	0, 0.279, 0.663, 1.048, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.663 std_dev=0.384
C5'	A	0, 0.115, 0.504, 0.893, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.504 std_dev=0.389
C4'	B	0, 0.553, 0.955, 1.356, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.955 std_dev=0.401
P	B	0, 0.496, 0.916, 1.335, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.916 std_dev=0.420
N6	B	0, 0.148, 0.581, 1.015, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.581 std_dev=0.434
O5'	A	0, 0.414, 0.871, 1.329, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.871 std_dev=0.458
C5'	B	0, 0.602, 1.136, 1.671, 1.756 max_d=1.756 avg_d=1.136 std_dev=0.534
P	A	0, 0.755, 1.311, 1.867, 1.994 max_d=1.994 avg_d=1.311 std_dev=0.556
O3'	B	0, 0.691, 1.266, 1.841, 2.174 max_d=2.174 avg_d=1.266 std_dev=0.575
OP2	A	0, 0.824, 1.408, 1.992, 2.261 max_d=2.261 avg_d=1.408 std_dev=0.584
O2'	B	0, 0.445, 1.041, 1.637, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.041 std_dev=0.596
OP2	B	0, 0.557, 1.160, 1.763, 2.436 max_d=2.436 avg_d=1.160 std_dev=0.603
OP1	B	0, 0.587, 1.233, 1.878, 2.256 max_d=2.256 avg_d=1.233 std_dev=0.646
OP1	A	0, 0.855, 1.624, 2.393, 2.427 max_d=2.427 avg_d=1.624 std_dev=0.769

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.25	0.23	0.20
C2	0.02	0.00	0.12	0.08	0.00	0.03	0.01	0.20	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.13	0.04	0.35	0.30	0.24	0.27
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.08	0.06	0.11	0.12	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.24	0.28	0.16	0.16
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.03	0.09	0.15	0.08	0.07	0.12	0.14	0.07	0.02	0.01	0.01	0.26	0.33	0.13	0.17
C4	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.07	0.00	0.23	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.06	0.03	0.36	0.31	0.24	0.27
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.15	0.07	0.02	0.13	0.16	0.08	0.03	0.03	0.00	0.02	0.14	0.27	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.11	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.02	0.42	0.34	0.27	0.32
C5'	0.07	0.20	0.03	0.03	0.23	0.01	0.31	0.00	0.31	0.32	0.26	0.17	0.35	0.36	0.21	0.03	0.06	0.02	0.02	0.25	0.39	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.11	0.00	0.31	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.10	0.03	0.42	0.34	0.28	0.32
C8	0.01	0.02	0.06	0.15	0.02	0.15	0.01	0.32	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.16	0.02	0.43	0.35	0.27	0.32
N1	0.02	0.00	0.11	0.08	0.00	0.07	0.00	0.26	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.10	0.04	0.39	0.32	0.27	0.30
N3	0.01	0.00	0.12	0.07	0.00	0.02	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.12	0.04	0.33	0.29	0.23	0.25
N6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.13	0.01	0.35	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.13	0.02	0.44	0.35	0.31	0.35
N7	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.16	0.01	0.36	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.01	0.45	0.36	0.30	0.35
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.35	0.30	0.24	0.26
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.12	0.03	0.09	0.03	0.13	0.04	0.19	0.21	0.12	0.03	0.03	0.00	0.02	0.08	0.07	0.15	0.16	0.04
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.06	0.03	0.10	0.06	0.10	0.16	0.10	0.12	0.13	0.16	0.06	0.02	0.00	0.02	0.19	0.34	0.18	0.17
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.00	0.20	0.24	0.30	0.22
O5'	0.24	0.35	0.24	0.26	0.36	0.02	0.42	0.02	0.42	0.43	0.39	0.33	0.44	0.45	0.35	0.07	0.19	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.25	0.30	0.28	0.33	0.31	0.14	0.34	0.25	0.34	0.35	0.32	0.29	0.35	0.36	0.30	0.15	0.34	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.24	0.16	0.13	0.24	0.27	0.27	0.39	0.28	0.27	0.27	0.23	0.31	0.30	0.24	0.16	0.18	0.30	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.27	0.16	0.17	0.27	0.05	0.32	0.02	0.32	0.32	0.30	0.25	0.35	0.35	0.26	0.04	0.17	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.26	0.30	0.13	0.16	0.19	0.28	0.30	0.35	0.24	0.34	0.17	0.43	0.32	0.12	0.59	0.24	0.18	0.26	0.21	0.22	0.08
C2	0.28	0.25	0.39	0.24	0.10	0.24	0.13	0.26	0.18	0.25	0.25	0.15	0.20	0.20	0.21	0.56	0.33	0.24	0.22	0.15	0.39	0.10
C2'	0.24	0.28	0.28	0.10	0.24	0.14	0.35	0.35	0.39	0.34	0.35	0.23	0.46	0.42	0.19	0.58	0.23	0.12	0.30	0.26	0.19	0.15
C3'	0.33	0.28	0.32	0.21	0.24	0.28	0.37	0.18	0.42	0.32	0.36	0.24	0.51	0.44	0.20	0.58	0.29	0.26	0.12	0.06	0.18	0.02
C4	0.34	0.27	0.36	0.22	0.09	0.26	0.19	0.23	0.30	0.26	0.34	0.15	0.36	0.22	0.19	0.57	0.28	0.27	0.24	0.16	0.38	0.12
C4'	0.31	0.24	0.31	0.18	0.18	0.23	0.31	0.21	0.38	0.26	0.33	0.18	0.48	0.36	0.15	0.59	0.28	0.21	0.12	0.08	0.28	0.10
C5	0.38	0.28	0.36	0.25	0.09	0.31	0.15	0.21	0.30	0.36	0.37	0.14	0.38	0.25	0.28	0.52	0.28	0.34	0.24	0.17	0.46	0.18
C5'	0.37	0.27	0.32	0.22	0.21	0.33	0.33	0.19	0.42	0.27	0.37	0.20	0.54	0.38	0.20	0.59	0.31	0.34	0.25	0.25	0.48	0.25
C6	0.37	0.28	0.38	0.28	0.15	0.30	0.16	0.21	0.22	0.42	0.34	0.14	0.27	0.34	0.33	0.50	0.31	0.32	0.23	0.17	0.50	0.19
C8	0.37	0.28	0.31	0.20	0.09	0.31	0.23	0.20	0.38	0.25	0.38	0.14	0.48	0.24	0.19	0.51	0.22	0.36	0.28	0.21	0.41	0.19
N1	0.32	0.25	0.39	0.28	0.15	0.26	0.17	0.21	0.15	0.35	0.26	0.14	0.19	0.29	0.29	0.51	0.33	0.26	0.21	0.14	0.46	0.15
N3	0.28	0.26	0.37	0.21	0.11	0.23	0.17	0.29	0.25	0.22	0.29	0.17	0.27	0.20	0.16	0.61	0.31	0.24	0.24	0.17	0.34	0.08
N6	0.38	0.28	0.39	0.31	0.22	0.32	0.25	0.24	0.20	0.50	0.34	0.16	0.27	0.45	0.37	0.47	0.33	0.35	0.23	0.20	0.55	0.23
N7	0.39	0.29	0.33	0.23	0.08	0.33	0.18	0.22	0.36	0.35	0.39	0.13	0.47	0.23	0.26	0.49	0.25	0.39	0.27	0.22	0.48	0.22
N9	0.34	0.27	0.33	0.19	0.11	0.26	0.24	0.23	0.35	0.23	0.35	0.15	0.43	0.26	0.15	0.56	0.25	0.28	0.27	0.18	0.33	0.13
O2'	0.22	0.33	0.29	0.12	0.30	0.16	0.38	0.56	0.39	0.40	0.37	0.30	0.44	0.44	0.27	0.61	0.22	0.28	0.36	0.39	0.11	0.20
O3'	0.36	0.33	0.39	0.32	0.32	0.33	0.42	0.26	0.45	0.42	0.38	0.32	0.54	0.51	0.29	0.61	0.41	0.28	0.02	0.02	0.01	0.01
O4'	0.30	0.25	0.30	0.13	0.13	0.20	0.27	0.22	0.36	0.22	0.34	0.15	0.45	0.31	0.11	0.60	0.24	0.18	0.17	0.13	0.27	0.03
O5'	0.51	0.60	0.53	0.52	0.54	0.50	0.65	0.41	0.74	0.53	0.71	0.52	0.85	0.65	0.48	0.61	0.53	0.50	0.49	0.16	0.56	0.32
OP1	0.52	0.59	0.59	0.65	0.54	0.58	0.66	0.55	0.75	0.56	0.71	0.51	0.89	0.67	0.50	0.61	0.69	0.53	0.61	0.47	0.77	0.53
OP2	0.40	0.50	0.42	0.44	0.40	0.42	0.55	0.33	0.69	0.42	0.66	0.38	0.86	0.55	0.35	0.47	0.45	0.46	0.32	0.29	0.47	0.22
P	0.45	0.52	0.47	0.50	0.45	0.47	0.58	0.40	0.69	0.46	0.65	0.42	0.84	0.59	0.40	0.55	0.52	0.47	0.45	0.24	0.57	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.23	0.23	0.15
C2	0.02	0.00	0.27	0.23	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.32	0.32	0.09	0.27	0.23	0.64	0.32
C2'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.13	0.01	0.07	0.02	0.11	0.17	0.19	0.28	0.09	0.13	0.04	0.00	0.01	0.01	0.21	0.22	0.28	0.15
C3'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.11	0.00	0.13	0.02	0.14	0.27	0.17	0.23	0.16	0.24	0.10	0.02	0.01	0.01	0.32	0.19	0.32	0.20
C4	0.01	0.01	0.13	0.11	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.13	0.05	0.31	0.25	0.65	0.36
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.06	0.13	0.04	0.06	0.09	0.13	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.29	0.07	0.18
C5	0.02	0.02	0.07	0.13	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03	0.42	0.42	0.89	0.55
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.09	0.00	0.16	0.00	0.16	0.22	0.11	0.05	0.20	0.23	0.11	0.05	0.02	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.14	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.05	0.43	0.44	0.95	0.57
C8	0.02	0.03	0.17	0.27	0.01	0.13	0.01	0.22	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.10	0.29	0.06	0.46	0.47	0.83	0.56
N1	0.02	0.00	0.19	0.17	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.25	0.24	0.07	0.36	0.31	0.83	0.46
N3	0.02	0.00	0.28	0.23	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.30	0.09	0.22	0.21	0.53	0.25
N6	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.20	0.04	0.50	0.58	1.11	0.70
N7	0.02	0.02	0.13	0.24	0.01	0.13	0.01	0.23	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.27	0.04	0.51	0.58	1.02	0.68
N9	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.29	0.23	0.56	0.32
O2'	0.01	0.32	0.00	0.02	0.16	0.05	0.11	0.05	0.16	0.10	0.25	0.31	0.13	0.08	0.04	0.00	0.02	0.06	0.10	0.42	0.16	0.27
O3'	0.01	0.32	0.01	0.01	0.13	0.02	0.15	0.02	0.17	0.29	0.24	0.30	0.20	0.27	0.10	0.02	0.00	0.01	0.30	0.29	0.22	0.19
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.07	0.09	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.11	0.24	0.11	0.16
O5'	0.10	0.27	0.21	0.32	0.31	0.01	0.42	0.01	0.43	0.46	0.36	0.22	0.50	0.51	0.29	0.10	0.30	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.23	0.23	0.22	0.19	0.25	0.29	0.42	0.08	0.44	0.47	0.31	0.21	0.58	0.58	0.23	0.42	0.29	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.64	0.28	0.32	0.65	0.07	0.89	0.13	0.95	0.83	0.83	0.53	1.11	1.02	0.56	0.16	0.22	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.32	0.15	0.20	0.36	0.18	0.55	0.01	0.57	0.56	0.46	0.25	0.70	0.68	0.32	0.27	0.19	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00