Doublet Group distance statistics: 51993

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.015, 0.027, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.012, 0.027, 0.043, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.015, 0.031, 0.048, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.031 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.018, 0.039, 0.061, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.039 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.018, 0.042, 0.065, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.018, 0.044, 0.070, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.044 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.023, 0.055, 0.088, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.055 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.079, 0.252, 0.425, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.252 std_dev=0.173
C2'	A	0, 0.096, 0.298, 0.500, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.298 std_dev=0.202
C4'	A	0, 0.184, 0.453, 0.723, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.453 std_dev=0.269
C5	B	0, 0.096, 0.390, 0.685, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.390 std_dev=0.295
C6	B	0, 0.194, 0.501, 0.808, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.501 std_dev=0.307
C4	B	0, 0.207, 0.515, 0.822, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.515 std_dev=0.307
C3'	A	0, 0.155, 0.472, 0.789, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.472 std_dev=0.317
O2'	A	0, 0.215, 0.543, 0.872, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.543 std_dev=0.329
N7	B	0, 0.288, 0.626, 0.964, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.626 std_dev=0.338
N3	B	0, 0.418, 0.780, 1.141, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.780 std_dev=0.362
N6	B	0, 0.265, 0.629, 0.993, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.629 std_dev=0.364
N9	B	0, 0.182, 0.609, 1.036, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.609 std_dev=0.427
C2	B	0, 0.428, 0.872, 1.316, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.872 std_dev=0.444
C5'	A	0, 0.295, 0.740, 1.185, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.740 std_dev=0.445
C8	B	0, 0.265, 0.712, 1.160, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.712 std_dev=0.447
N1	B	0, 0.279, 0.736, 1.192, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.736 std_dev=0.457
O3'	A	0, 0.276, 0.768, 1.259, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.768 std_dev=0.492
C2'	B	0, 0.243, 0.769, 1.295, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.769 std_dev=0.526
C1'	B	0, 0.319, 0.848, 1.377, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.848 std_dev=0.529
O2'	B	0, 0.441, 1.036, 1.631, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.036 std_dev=0.595
O5'	B	0, 0.444, 1.099, 1.754, 2.196 max_d=2.196 avg_d=1.099 std_dev=0.655
O4'	B	0, 0.446, 1.129, 1.812, 2.071 max_d=2.071 avg_d=1.129 std_dev=0.683
C3'	B	0, 0.253, 0.939, 1.626, 2.201 max_d=2.201 avg_d=0.939 std_dev=0.687
P	B	0, 0.432, 1.138, 1.844, 2.448 max_d=2.448 avg_d=1.138 std_dev=0.706
OP2	B	0, 0.476, 1.214, 1.953, 2.643 max_d=2.643 avg_d=1.214 std_dev=0.738
C4'	B	0, 0.450, 1.214, 1.977, 2.217 max_d=2.217 avg_d=1.214 std_dev=0.764
O3'	B	0, 0.227, 1.052, 1.877, 2.713 max_d=2.713 avg_d=1.052 std_dev=0.825
O5'	A	0, 1.031, 1.986, 2.941, 2.827 max_d=2.827 avg_d=1.986 std_dev=0.955
C5'	B	0, 0.548, 1.508, 2.468, 2.938 max_d=2.938 avg_d=1.508 std_dev=0.960
OP1	B	0, 0.802, 1.803, 2.804, 3.240 max_d=3.240 avg_d=1.803 std_dev=1.001
OP1	A	0, 1.386, 2.460, 3.535, 3.467 max_d=3.467 avg_d=2.460 std_dev=1.074
P	A	0, 1.521, 2.695, 3.869, 3.477 max_d=3.477 avg_d=2.695 std_dev=1.174
OP2	A	0, 2.566, 4.528, 6.489, 5.865 max_d=5.865 avg_d=4.528 std_dev=1.962

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.27	0.25	0.10
C2	0.04	0.00	0.20	0.22	0.01	0.11	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.29	0.05	0.35	0.45	0.43	0.30
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.02	0.11	0.07	0.17	0.19	0.10	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.21	0.21	0.17	0.15
C3'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.11	0.01	0.09	0.03	0.13	0.12	0.19	0.20	0.12	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.29	0.30	0.13	0.20
C4	0.02	0.01	0.10	0.11	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.14	0.03	0.34	0.44	0.45	0.28
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.06	0.10	0.11	0.06	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.12	0.26	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.41	0.51	0.63	0.37
C5'	0.02	0.11	0.02	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.08	0.08	0.10	0.10	0.08	0.07	0.04	0.05	0.05	0.01	0.01	0.21	0.38	0.02
C6	0.03	0.01	0.11	0.13	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.18	0.02	0.43	0.53	0.67	0.39
C8	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.13	0.03	0.38	0.49	0.59	0.32
N1	0.04	0.00	0.17	0.19	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.16	0.26	0.04	0.40	0.50	0.57	0.36
N3	0.04	0.01	0.19	0.20	0.01	0.11	0.00	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.25	0.05	0.31	0.41	0.35	0.25
N6	0.03	0.01	0.10	0.12	0.02	0.06	0.02	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.16	0.02	0.46	0.56	0.78	0.44
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.43	0.54	0.74	0.40
N9	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.29	0.41	0.40	0.23
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.08	0.05	0.06	0.05	0.11	0.05	0.16	0.17	0.09	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.09	0.16	0.14	0.07
O3'	0.01	0.29	0.02	0.01	0.14	0.02	0.11	0.05	0.18	0.13	0.26	0.25	0.16	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.25	0.43	0.19	0.20
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.26	0.29	0.10
O5'	0.12	0.35	0.21	0.29	0.34	0.02	0.41	0.01	0.43	0.38	0.40	0.31	0.46	0.43	0.29	0.09	0.25	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.27	0.45	0.21	0.30	0.44	0.12	0.51	0.21	0.53	0.49	0.50	0.41	0.56	0.54	0.41	0.16	0.43	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.43	0.17	0.13	0.45	0.26	0.63	0.38	0.67	0.59	0.57	0.35	0.78	0.74	0.40	0.14	0.19	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.30	0.15	0.20	0.28	0.02	0.37	0.02	0.39	0.32	0.36	0.25	0.44	0.40	0.23	0.07	0.20	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.36	0.35	0.33	0.26	0.26	0.27	0.12	0.38	0.12	0.13	0.22	0.40	0.19	0.23	0.22	0.51	0.25	0.30	0.26	0.02	0.15	0.06
C2	0.24	0.48	0.33	0.24	0.20	0.28	0.11	0.38	0.13	0.36	0.31	0.49	0.17	0.37	0.13	0.49	0.26	0.30	0.38	0.30	0.31	0.27
C2'	0.25	0.22	0.25	0.25	0.17	0.25	0.16	0.45	0.15	0.20	0.14	0.27	0.23	0.28	0.15	0.42	0.23	0.24	0.29	0.10	0.16	0.13
C3'	0.20	0.07	0.14	0.15	0.06	0.14	0.16	0.24	0.19	0.16	0.11	0.11	0.29	0.27	0.06	0.30	0.16	0.20	0.10	0.05	0.10	0.01
C4	0.33	0.43	0.34	0.21	0.27	0.19	0.11	0.25	0.13	0.20	0.27	0.47	0.19	0.30	0.19	0.50	0.22	0.21	0.30	0.13	0.23	0.13
C4'	0.23	0.13	0.16	0.15	0.09	0.14	0.10	0.26	0.13	0.11	0.07	0.18	0.25	0.22	0.11	0.33	0.15	0.21	0.05	0.19	0.22	0.11
C5	0.32	0.44	0.33	0.22	0.30	0.16	0.14	0.13	0.16	0.18	0.29	0.47	0.21	0.29	0.23	0.45	0.22	0.19	0.34	0.13	0.21	0.13
C5'	0.31	0.12	0.25	0.24	0.15	0.26	0.14	0.25	0.17	0.18	0.11	0.17	0.28	0.21	0.20	0.35	0.25	0.32	0.14	0.36	0.39	0.26
C6	0.22	0.49	0.29	0.17	0.25	0.12	0.11	0.14	0.16	0.23	0.34	0.48	0.21	0.32	0.12	0.39	0.20	0.12	0.37	0.20	0.23	0.18
C8	0.43	0.36	0.38	0.31	0.33	0.30	0.17	0.23	0.15	0.20	0.23	0.43	0.21	0.23	0.33	0.50	0.31	0.36	0.34	0.15	0.22	0.17
N1	0.20	0.52	0.30	0.20	0.20	0.21	0.09	0.28	0.13	0.33	0.34	0.50	0.18	0.36	0.10	0.42	0.23	0.23	0.39	0.28	0.28	0.25
N3	0.27	0.45	0.33	0.22	0.23	0.25	0.11	0.38	0.12	0.30	0.28	0.47	0.18	0.34	0.13	0.52	0.24	0.26	0.33	0.25	0.29	0.23
N6	0.19	0.47	0.26	0.17	0.23	0.10	0.13	0.08	0.19	0.19	0.36	0.43	0.24	0.28	0.13	0.33	0.19	0.10	0.40	0.20	0.22	0.19
N7	0.39	0.38	0.36	0.29	0.33	0.25	0.20	0.17	0.17	0.22	0.25	0.43	0.23	0.26	0.32	0.46	0.28	0.29	0.35	0.13	0.22	0.16
N9	0.40	0.39	0.36	0.27	0.30	0.26	0.13	0.26	0.13	0.13	0.24	0.44	0.20	0.24	0.27	0.52	0.26	0.31	0.28	0.05	0.18	0.08
O2'	0.25	0.25	0.28	0.33	0.19	0.35	0.18	0.64	0.16	0.24	0.17	0.29	0.23	0.29	0.18	0.44	0.31	0.28	0.34	0.15	0.15	0.16
O3'	0.14	0.13	0.14	0.23	0.13	0.13	0.25	0.30	0.27	0.23	0.21	0.09	0.35	0.32	0.11	0.21	0.23	0.16	0.03	0.02	0.04	0.01
O4'	0.31	0.28	0.25	0.17	0.20	0.19	0.07	0.29	0.08	0.10	0.15	0.33	0.20	0.20	0.19	0.44	0.16	0.26	0.14	0.13	0.19	0.06
O5'	0.34	0.54	0.38	0.46	0.51	0.31	0.60	0.37	0.65	0.51	0.61	0.49	0.73	0.63	0.44	0.30	0.44	0.31	0.49	0.23	0.49	0.34
OP1	0.32	0.46	0.35	0.40	0.39	0.35	0.48	0.36	0.58	0.36	0.55	0.39	0.71	0.47	0.34	0.34	0.43	0.34	0.44	0.55	0.52	0.46
OP2	0.57	0.74	0.46	0.43	0.69	0.38	0.73	0.31	0.77	0.63	0.77	0.70	0.80	0.69	0.63	0.49	0.42	0.52	0.48	0.50	0.51	0.40
P	0.31	0.50	0.33	0.38	0.43	0.25	0.51	0.24	0.58	0.38	0.56	0.44	0.67	0.49	0.36	0.28	0.38	0.29	0.43	0.30	0.48	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.21	0.15	0.35	0.07
C2	0.06	0.00	0.17	0.18	0.03	0.10	0.02	0.17	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.14	0.21	0.05	0.42	0.33	0.30	0.25
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.07	0.01	0.02	0.02	0.05	0.09	0.12	0.18	0.03	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.26	0.33	0.20	0.12
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.08	0.17	0.13	0.18	0.08	0.14	0.06	0.01	0.01	0.01	0.32	0.45	0.11	0.22
C4	0.02	0.03	0.07	0.08	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.08	0.02	0.44	0.30	0.26	0.22
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.09	0.10	0.05	0.04	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.15	0.39	0.08
C5	0.02	0.02	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.05	0.55	0.37	0.27	0.32
C5'	0.04	0.17	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.16	0.11	0.18	0.15	0.15	0.12	0.10	0.05	0.01	0.02	0.02	0.23	0.42	0.03
C6	0.03	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.04	0.56	0.40	0.31	0.35
C8	0.04	0.03	0.09	0.17	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.18	0.08	0.56	0.33	0.26	0.28
N1	0.05	0.00	0.12	0.13	0.03	0.09	0.02	0.18	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.10	0.15	0.05	0.50	0.38	0.31	0.31
N3	0.06	0.01	0.18	0.18	0.01	0.10	0.00	0.15	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.21	0.05	0.36	0.28	0.29	0.19
N6	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.10	0.05	0.63	0.45	0.35	0.42
N7	0.02	0.02	0.07	0.14	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.17	0.08	0.62	0.40	0.28	0.36
N9	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.10	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.41	0.26	0.27	0.16
O2'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.06	0.05	0.02	0.05	0.04	0.05	0.10	0.14	0.03	0.04	0.01	0.00	0.04	0.05	0.05	0.20	0.30	0.06
O3'	0.02	0.21	0.01	0.01	0.08	0.02	0.07	0.01	0.08	0.18	0.15	0.21	0.10	0.17	0.05	0.04	0.00	0.02	0.21	0.51	0.09	0.21
O4'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.04	0.08	0.05	0.05	0.05	0.08	0.02	0.05	0.02	0.00	0.10	0.05	0.46	0.16
O5'	0.21	0.42	0.26	0.32	0.44	0.02	0.55	0.02	0.56	0.56	0.50	0.36	0.63	0.62	0.41	0.05	0.21	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.33	0.33	0.45	0.30	0.15	0.37	0.23	0.40	0.33	0.38	0.28	0.45	0.40	0.26	0.20	0.51	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.35	0.30	0.20	0.11	0.26	0.39	0.27	0.42	0.31	0.26	0.31	0.29	0.35	0.28	0.27	0.30	0.09	0.46	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.25	0.12	0.22	0.22	0.08	0.32	0.03	0.35	0.28	0.31	0.19	0.42	0.36	0.16	0.06	0.21	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00