Doublet Group distance statistics: 51995

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.011, 0.025, 0.038, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.016, 0.034, 0.053, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.034 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.015, 0.034, 0.053, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.034 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.024, 0.051, 0.078, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.051 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.019, 0.046, 0.073, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.046 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.028, 0.057, 0.086, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.057 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.027, 0.062, 0.096, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.062 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.123, 0.264, 0.405, 0.387 max_d=0.387 avg_d=0.264 std_dev=0.141
C4'	A	0, 0.181, 0.371, 0.560, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.371 std_dev=0.190
C2'	A	0, 0.169, 0.364, 0.559, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.364 std_dev=0.195
O2'	B	0, 0.267, 0.538, 0.808, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.538 std_dev=0.270
C1'	B	0, 0.130, 0.420, 0.710, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.420 std_dev=0.290
C2'	B	0, 0.175, 0.468, 0.761, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.468 std_dev=0.293
N9	B	0, 0.087, 0.397, 0.706, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.397 std_dev=0.310
C3'	A	0, 0.273, 0.583, 0.893, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.583 std_dev=0.310
C5	B	0, 0.045, 0.371, 0.697, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.371 std_dev=0.326
O2'	A	0, 0.306, 0.637, 0.967, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.637 std_dev=0.330
C4	B	0, 0.003, 0.335, 0.667, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.335 std_dev=0.332
N7	B	0, 0.142, 0.479, 0.817, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.479 std_dev=0.338
O4'	B	0, 0.096, 0.448, 0.799, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.448 std_dev=0.352
N3	B	0, 0.134, 0.489, 0.844, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.489 std_dev=0.355
C8	B	0, 0.165, 0.530, 0.895, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.530 std_dev=0.365
C6	B	0, 0.112, 0.478, 0.843, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.478 std_dev=0.365
C5'	A	0, 0.331, 0.703, 1.074, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.703 std_dev=0.371
N6	B	0, 0.145, 0.521, 0.898, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.521 std_dev=0.377
N1	B	0, 0.176, 0.625, 1.073, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.625 std_dev=0.449
C2	B	0, 0.169, 0.621, 1.073, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.621 std_dev=0.452
O3'	A	0, 0.415, 0.915, 1.415, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.915 std_dev=0.500
C4'	B	0, 0.125, 0.673, 1.221, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.673 std_dev=0.548
O5'	A	0, 0.481, 1.043, 1.606, 1.499 max_d=1.499 avg_d=1.043 std_dev=0.562
C3'	B	0, 0.194, 0.766, 1.338, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.766 std_dev=0.572
O5'	B	0, 0.404, 1.025, 1.647, 1.959 max_d=1.959 avg_d=1.025 std_dev=0.622
C5'	B	0, 0.269, 0.894, 1.519, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.894 std_dev=0.625
P	A	0, 0.477, 1.111, 1.745, 1.743 max_d=1.743 avg_d=1.111 std_dev=0.634
OP2	A	0, 0.558, 1.198, 1.838, 1.861 max_d=1.861 avg_d=1.198 std_dev=0.640
P	B	0, 0.386, 1.042, 1.699, 2.059 max_d=2.059 avg_d=1.042 std_dev=0.656
OP2	B	0, 0.427, 1.123, 1.819, 2.190 max_d=2.190 avg_d=1.123 std_dev=0.696
O3'	B	0, 0.256, 1.037, 1.819, 2.086 max_d=2.086 avg_d=1.037 std_dev=0.781
OP1	B	0, 0.416, 1.272, 2.128, 2.681 max_d=2.681 avg_d=1.272 std_dev=0.856
OP1	A	0, 1.147, 2.326, 3.505, 3.181 max_d=3.181 avg_d=2.326 std_dev=1.179

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.30	0.26	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.06	0.03	0.07	0.60	0.62	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.06	0.05	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.12	0.16	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.05	0.10	0.04	0.04	0.07	0.10	0.05	0.01	0.00	0.01	0.04	0.19	0.10	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.07	0.55	0.57	0.14
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.11	0.18	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.09	0.65	0.72	0.16
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.18	0.33	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.09	0.71	0.78	0.17
C8	0.00	0.01	0.05	0.10	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.10	0.54	0.59	0.15
N1	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.04	0.02	0.08	0.68	0.72	0.16
N3	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.06	0.03	0.06	0.52	0.53	0.12
N6	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.09	0.02	0.10	0.77	0.86	0.18
N7	0.00	0.01	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.11	0.66	0.75	0.17
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.46	0.47	0.12
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.03	0.11	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.04	0.04	0.09	0.10	0.04
O3'	0.02	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.04	0.06	0.12	0.04	0.06	0.09	0.13	0.04	0.06	0.00	0.02	0.08	0.39	0.23	0.05
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.29	0.22	0.09
O5'	0.03	0.07	0.04	0.04	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.10	0.08	0.06	0.10	0.11	0.07	0.04	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.30	0.60	0.12	0.19	0.55	0.11	0.65	0.18	0.71	0.54	0.68	0.52	0.77	0.66	0.46	0.09	0.39	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.62	0.16	0.10	0.57	0.18	0.72	0.33	0.78	0.59	0.72	0.53	0.86	0.75	0.47	0.10	0.23	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.14	0.06	0.05	0.14	0.03	0.16	0.01	0.17	0.15	0.16	0.12	0.18	0.17	0.12	0.04	0.05	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.30	0.11	0.12	0.15	0.15	0.25	0.18	0.30	0.35	0.32	0.22	0.36	0.36	0.15	0.13	0.13	0.13	0.26	0.09	0.07	0.08
C2	0.20	0.36	0.20	0.20	0.15	0.23	0.25	0.23	0.32	0.31	0.37	0.23	0.37	0.32	0.20	0.22	0.21	0.22	0.29	0.15	0.13	0.11
C2'	0.08	0.28	0.08	0.11	0.17	0.12	0.24	0.17	0.28	0.34	0.29	0.22	0.32	0.34	0.14	0.12	0.12	0.09	0.31	0.16	0.09	0.16
C3'	0.18	0.26	0.15	0.12	0.17	0.15	0.16	0.09	0.19	0.23	0.24	0.25	0.22	0.22	0.15	0.21	0.12	0.20	0.07	0.01	0.07	0.01
C4	0.14	0.33	0.13	0.13	0.11	0.16	0.24	0.18	0.32	0.32	0.36	0.22	0.39	0.35	0.14	0.16	0.13	0.16	0.24	0.09	0.16	0.09
C4'	0.13	0.29	0.11	0.09	0.17	0.10	0.20	0.07	0.25	0.25	0.29	0.24	0.28	0.27	0.14	0.15	0.09	0.13	0.06	0.09	0.21	0.08
C5	0.17	0.31	0.15	0.15	0.04	0.18	0.16	0.18	0.27	0.26	0.33	0.21	0.37	0.30	0.12	0.18	0.15	0.19	0.23	0.14	0.25	0.15
C5'	0.20	0.32	0.21	0.20	0.23	0.18	0.23	0.15	0.27	0.26	0.31	0.28	0.29	0.27	0.21	0.23	0.21	0.20	0.10	0.25	0.39	0.23
C6	0.19	0.32	0.17	0.16	0.05	0.19	0.13	0.19	0.23	0.22	0.32	0.22	0.34	0.25	0.14	0.20	0.16	0.20	0.24	0.14	0.25	0.15
C8	0.18	0.27	0.16	0.17	0.11	0.19	0.18	0.19	0.25	0.29	0.28	0.21	0.33	0.33	0.15	0.19	0.17	0.21	0.21	0.18	0.29	0.19
N1	0.20	0.33	0.19	0.18	0.09	0.21	0.18	0.21	0.26	0.25	0.34	0.21	0.34	0.27	0.16	0.22	0.19	0.21	0.27	0.13	0.19	0.12
N3	0.18	0.36	0.17	0.18	0.17	0.20	0.28	0.22	0.34	0.34	0.38	0.24	0.39	0.36	0.20	0.18	0.19	0.20	0.29	0.14	0.10	0.10
N6	0.21	0.31	0.19	0.18	0.13	0.20	0.06	0.20	0.12	0.18	0.26	0.25	0.27	0.18	0.16	0.21	0.18	0.22	0.25	0.18	0.30	0.19
N7	0.21	0.27	0.18	0.19	0.12	0.21	0.14	0.21	0.22	0.26	0.27	0.22	0.33	0.29	0.16	0.20	0.19	0.23	0.23	0.21	0.32	0.22
N9	0.13	0.30	0.11	0.12	0.12	0.15	0.23	0.16	0.30	0.33	0.33	0.21	0.37	0.36	0.13	0.15	0.12	0.15	0.22	0.08	0.17	0.09
O2'	0.20	0.31	0.23	0.30	0.24	0.30	0.30	0.38	0.32	0.40	0.32	0.25	0.36	0.39	0.25	0.16	0.31	0.23	0.49	0.31	0.18	0.28
O3'	0.20	0.23	0.17	0.14	0.16	0.19	0.10	0.14	0.13	0.15	0.19	0.23	0.14	0.12	0.15	0.23	0.14	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00
O4'	0.09	0.30	0.08	0.07	0.15	0.10	0.23	0.11	0.29	0.30	0.32	0.23	0.35	0.33	0.13	0.12	0.08	0.10	0.15	0.04	0.18	0.02
O5'	0.29	0.35	0.31	0.31	0.29	0.27	0.28	0.22	0.29	0.32	0.33	0.33	0.29	0.32	0.29	0.31	0.32	0.28	0.19	0.32	0.47	0.29
OP1	0.35	0.71	0.35	0.24	0.55	0.22	0.60	0.27	0.72	0.41	0.76	0.61	0.77	0.51	0.43	0.34	0.22	0.26	0.26	0.51	0.38	0.37
OP2	0.31	0.70	0.22	0.22	0.50	0.23	0.50	0.24	0.64	0.25	0.73	0.60	0.67	0.34	0.35	0.26	0.27	0.28	0.25	0.53	0.47	0.38
P	0.30	0.42	0.33	0.32	0.35	0.25	0.33	0.19	0.35	0.33	0.40	0.39	0.35	0.34	0.32	0.33	0.32	0.28	0.19	0.26	0.39	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.10	0.04
C2	0.02	0.00	0.14	0.11	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.15	0.09	0.11	0.09	0.18	0.10
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.08	0.10	0.14	0.03	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.05	0.03
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.09	0.11	0.07	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.05	0.02
C4	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.05	0.10	0.07	0.15	0.06
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.09	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.13	0.11	0.17	0.08
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.06	0.10	0.06	0.05	0.08	0.10	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.09	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.05	0.14	0.12	0.18	0.10
C8	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.11	0.06	0.14	0.13	0.13	0.10
N1	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.08	0.12	0.10	0.18	0.10
N3	0.03	0.00	0.14	0.11	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.14	0.09	0.08	0.07	0.17	0.09
N6	0.02	0.00	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.09	0.04	0.16	0.15	0.19	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.10	0.03	0.16	0.16	0.17	0.12
N9	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.08	0.06	0.12	0.04
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.06	0.04	0.05	0.07	0.07	0.11	0.15	0.06	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.09	0.02	0.04
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.08	0.01	0.07	0.04	0.09	0.11	0.13	0.14	0.09	0.10	0.03	0.04	0.00	0.01	0.09	0.12	0.08	0.04
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.06	0.08	0.09	0.04	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.04	0.12	0.07
O5'	0.04	0.11	0.02	0.05	0.10	0.01	0.13	0.00	0.14	0.14	0.12	0.08	0.16	0.16	0.08	0.03	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.09	0.09	0.11	0.07	0.09	0.11	0.09	0.12	0.13	0.10	0.07	0.15	0.16	0.06	0.09	0.12	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.18	0.05	0.05	0.15	0.03	0.17	0.01	0.18	0.13	0.18	0.17	0.19	0.17	0.12	0.02	0.08	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.10	0.03	0.02	0.06	0.03	0.08	0.01	0.10	0.10	0.10	0.09	0.12	0.12	0.04	0.04	0.04	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00