Doublet Group distance statistics: 51998

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.005, 0.028, 0.051, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.028 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.013, 0.039, 0.065, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.039 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.007, 0.035, 0.062, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.035 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.006, 0.038, 0.069, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.038 std_dev=0.031
OP2	B	0, 0.109, 0.261, 0.414, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.261 std_dev=0.152
C2	B	0, 0.073, 0.244, 0.415, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.244 std_dev=0.171
N1	B	0, 0.055, 0.230, 0.405, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.230 std_dev=0.175
N3	B	0, 0.080, 0.264, 0.448, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.264 std_dev=0.184
C5	B	0, 0.071, 0.256, 0.440, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.256 std_dev=0.184
C4	B	0, 0.074, 0.260, 0.445, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.260 std_dev=0.185
C6	B	0, 0.050, 0.236, 0.423, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.236 std_dev=0.186
P	B	0, 0.065, 0.253, 0.441, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.253 std_dev=0.188
OP1	B	0, 0.029, 0.232, 0.435, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.232 std_dev=0.203
N7	B	0, 0.100, 0.303, 0.507, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.303 std_dev=0.203
C8	B	0, 0.118, 0.322, 0.525, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.322 std_dev=0.204
N9	B	0, 0.096, 0.303, 0.509, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.303 std_dev=0.207
N6	B	0, 0.041, 0.251, 0.461, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.251 std_dev=0.210
C2'	B	0, 0.089, 0.305, 0.521, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.305 std_dev=0.216
O2'	B	0, 0.021, 0.248, 0.475, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.248 std_dev=0.227
C1'	B	0, 0.107, 0.356, 0.605, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.356 std_dev=0.249
C4'	B	0, 0.127, 0.402, 0.677, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.402 std_dev=0.275
C2'	A	0, -0.006, 0.271, 0.548, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.271 std_dev=0.277
O5'	B	0, 0.135, 0.424, 0.713, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.424 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.098, 0.395, 0.692, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.395 std_dev=0.297
O4'	A	0, -0.036, 0.262, 0.560, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.262 std_dev=0.298
O4'	B	0, 0.127, 0.504, 0.882, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.504 std_dev=0.378
C5'	A	0, 0.074, 0.474, 0.875, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.474 std_dev=0.401
O3'	B	0, 0.125, 0.545, 0.966, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.545 std_dev=0.420
C4'	A	0, -0.010, 0.456, 0.921, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.456 std_dev=0.466
O2'	A	0, -0.081, 0.409, 0.899, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.409 std_dev=0.490
C5'	B	0, 0.044, 0.625, 1.205, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.625 std_dev=0.581
C3'	A	0, -0.078, 0.591, 1.260, 1.720 max_d=1.720 avg_d=0.591 std_dev=0.669
OP1	A	0, 0.031, 1.157, 2.282, 2.925 max_d=2.925 avg_d=1.157 std_dev=1.126
O5'	A	0, -0.178, 1.021, 2.219, 2.997 max_d=2.997 avg_d=1.021 std_dev=1.198
O3'	A	0, -0.248, 1.002, 2.251, 3.140 max_d=3.140 avg_d=1.002 std_dev=1.249
P	A	0, -0.262, 1.347, 2.956, 4.046 max_d=4.046 avg_d=1.347 std_dev=1.609
OP2	A	0, -0.503, 2.022, 4.547, 6.324 max_d=6.324 avg_d=2.022 std_dev=2.525

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.31	0.01	0.20	0.18	0.25	0.18
C2	0.02	0.00	0.22	0.28	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.18	0.12	0.05	0.09	0.18	0.15	0.19
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.10	0.02	0.05	0.30	0.10	0.10	0.17	0.21	0.07	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.40	0.35	0.52	0.47
C3'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.26	0.01	0.31	0.01	0.34	0.23	0.33	0.24	0.37	0.30	0.19	0.01	0.00	0.02	0.30	0.06	0.41	0.26
C4	0.01	0.01	0.10	0.26	0.00	0.06	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.07	0.03	0.14	0.21	0.20	0.20
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.08	0.04	0.09	0.07	0.08	0.05	0.03	0.26	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02
C5	0.00	0.00	0.05	0.31	0.00	0.06	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.08	0.02	0.14	0.23	0.21	0.25
C5'	0.16	0.19	0.30	0.01	0.21	0.01	0.24	0.00	0.24	0.26	0.22	0.18	0.26	0.26	0.21	0.03	0.23	0.01	0.01	0.07	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.10	0.34	0.01	0.08	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.12	0.03	0.12	0.22	0.20	0.26
C8	0.01	0.01	0.10	0.23	0.00	0.04	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.07	0.03	0.21	0.26	0.26	0.25
N1	0.02	0.00	0.17	0.33	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.23	0.10	0.04	0.10	0.20	0.18	0.23
N3	0.02	0.00	0.21	0.24	0.00	0.07	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.16	0.05	0.10	0.18	0.16	0.17
N6	0.01	0.00	0.07	0.37	0.01	0.08	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.18	0.03	0.13	0.23	0.23	0.30
N7	0.01	0.00	0.06	0.30	0.01	0.05	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.13	0.01	0.18	0.27	0.25	0.27
N9	0.01	0.02	0.00	0.19	0.00	0.03	0.01	0.21	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.08	0.00	0.18	0.22	0.23	0.20
O2'	0.02	0.18	0.01	0.01	0.20	0.26	0.25	0.03	0.26	0.20	0.23	0.14	0.28	0.26	0.16	0.00	0.01	0.20	0.13	0.12	0.28	0.25
O3'	0.31	0.12	0.02	0.00	0.07	0.02	0.08	0.23	0.12	0.07	0.10	0.16	0.18	0.13	0.08	0.01	0.00	0.30	0.45	0.28	0.64	0.46
O4'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.20	0.30	0.00	0.36	0.24	0.43	0.29
O5'	0.20	0.09	0.40	0.30	0.14	0.02	0.14	0.01	0.12	0.21	0.10	0.10	0.13	0.18	0.18	0.13	0.45	0.36	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.18	0.35	0.06	0.21	0.04	0.23	0.07	0.22	0.26	0.20	0.18	0.23	0.27	0.22	0.12	0.28	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.15	0.52	0.41	0.20	0.03	0.21	0.01	0.20	0.26	0.18	0.16	0.23	0.25	0.23	0.28	0.64	0.43	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.19	0.47	0.26	0.20	0.02	0.25	0.02	0.26	0.25	0.23	0.17	0.30	0.27	0.20	0.25	0.46	0.29	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.06	0.10	0.16	0.08	0.14	0.11	0.38	0.08	0.16	0.06	0.03	0.09	0.15	0.12	0.22	0.46	0.37	0.24	0.20	0.22	0.26
C2	0.13	0.08	0.15	0.16	0.16	0.22	0.20	0.57	0.17	0.22	0.11	0.11	0.18	0.23	0.17	0.20	0.37	0.24	0.19	0.16	0.19	0.21
C2'	0.22	0.09	0.28	0.36	0.15	0.25	0.14	0.37	0.12	0.21	0.13	0.10	0.14	0.17	0.20	0.37	0.62	0.42	0.09	0.06	0.09	0.11
C3'	0.61	0.58	0.43	0.24	0.63	0.46	0.63	0.54	0.61	0.64	0.58	0.61	0.60	0.65	0.64	0.35	0.22	0.85	0.37	0.36	0.46	0.48
C4	0.12	0.08	0.14	0.17	0.11	0.20	0.14	0.54	0.09	0.19	0.06	0.07	0.11	0.19	0.14	0.23	0.40	0.25	0.21	0.17	0.21	0.23
C4'	0.28	0.33	0.23	0.21	0.31	0.19	0.31	0.22	0.31	0.29	0.32	0.33	0.30	0.30	0.29	0.23	0.42	0.48	0.23	0.17	0.19	0.22
C5	0.16	0.11	0.17	0.20	0.11	0.23	0.13	0.59	0.08	0.20	0.08	0.11	0.12	0.20	0.16	0.23	0.37	0.16	0.18	0.15	0.20	0.21
C5'	0.33	0.38	0.36	0.39	0.33	0.23	0.30	0.14	0.32	0.25	0.35	0.38	0.30	0.26	0.29	0.37	0.55	0.26	0.27	0.13	0.13	0.13
C6	0.17	0.07	0.18	0.21	0.14	0.24	0.18	0.61	0.13	0.23	0.05	0.10	0.16	0.24	0.18	0.22	0.33	0.15	0.16	0.13	0.17	0.18
C8	0.15	0.17	0.16	0.20	0.06	0.19	0.07	0.50	0.08	0.14	0.12	0.16	0.10	0.13	0.09	0.25	0.42	0.19	0.23	0.18	0.23	0.25
N1	0.15	0.06	0.17	0.18	0.16	0.23	0.21	0.61	0.18	0.24	0.10	0.10	0.20	0.25	0.18	0.21	0.34	0.18	0.17	0.14	0.18	0.19
N3	0.12	0.05	0.13	0.15	0.15	0.20	0.17	0.54	0.13	0.20	0.07	0.09	0.14	0.20	0.16	0.21	0.40	0.29	0.21	0.17	0.21	0.23
N6	0.20	0.07	0.20	0.24	0.14	0.26	0.17	0.63	0.11	0.25	0.05	0.11	0.17	0.26	0.19	0.21	0.30	0.16	0.13	0.10	0.14	0.14
N7	0.21	0.17	0.18	0.23	0.09	0.23	0.07	0.58	0.07	0.17	0.13	0.18	0.11	0.15	0.14	0.25	0.37	0.12	0.19	0.15	0.21	0.22
N9	0.09	0.11	0.13	0.17	0.07	0.18	0.10	0.48	0.08	0.16	0.09	0.08	0.10	0.15	0.11	0.23	0.43	0.29	0.23	0.19	0.22	0.26
O2'	0.33	0.45	0.42	0.40	0.42	0.20	0.42	0.30	0.43	0.39	0.43	0.44	0.42	0.40	0.39	0.59	0.62	0.37	0.13	0.02	0.07	0.10
O3'	0.89	0.62	0.83	0.64	0.76	0.69	0.73	0.69	0.66	0.82	0.60	0.72	0.63	0.78	0.83	0.86	0.54	1.01	0.49	0.50	0.54	0.57
O4'	0.18	0.18	0.14	0.13	0.18	0.22	0.18	0.36	0.17	0.21	0.17	0.18	0.16	0.21	0.19	0.13	0.36	0.44	0.32	0.30	0.29	0.34
O5'	0.64	0.55	0.83	0.86	0.52	0.39	0.45	0.21	0.45	0.42	0.49	0.59	0.40	0.41	0.51	1.00	1.19	0.23	0.13	0.11	0.11	0.20
OP1	0.56	0.38	0.75	0.83	0.37	0.49	0.30	0.41	0.28	0.30	0.32	0.43	0.23	0.26	0.40	0.80	0.89	0.27	0.14	0.18	0.23	0.30
OP2	1.12	0.88	1.52	1.51	0.93	0.80	0.86	0.65	0.83	0.89	0.84	0.95	0.78	0.84	0.97	1.81	1.77	0.55	0.24	0.21	0.17	0.25
P	0.98	0.78	1.25	1.29	0.81	0.73	0.75	0.59	0.72	0.76	0.74	0.83	0.68	0.72	0.84	1.39	1.53	0.51	0.25	0.10	0.12	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.12	0.22	0.21	0.11
C2	0.03	0.00	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.36	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.42	0.16	0.29	0.23	0.23	0.24
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.05	0.08	0.03	0.07	0.03	0.00	0.03	0.03	0.20	0.08	0.06	0.08
C3'	0.04	0.13	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.16	0.08	0.14	0.05	0.13	0.04	0.01	0.01	0.01	0.37	0.12	0.20	0.27
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.09	0.01	0.39	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.25	0.09	0.21	0.18	0.16	0.17
C4'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.12	0.17	0.09	0.04	0.15	0.17	0.10	0.03	0.02	0.01	0.03	0.12	0.08	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.14	0.00	0.48	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.18	0.04	0.21	0.16	0.16	0.19
C5'	0.12	0.36	0.07	0.02	0.39	0.01	0.48	0.00	0.49	0.46	0.43	0.31	0.53	0.52	0.36	0.06	0.04	0.03	0.01	0.34	0.12	0.02
C6	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.00	0.49	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.25	0.07	0.24	0.19	0.20	0.23
C8	0.01	0.01	0.10	0.16	0.00	0.17	0.01	0.46	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.03	0.07	0.18	0.10	0.07	0.11
N1	0.03	0.01	0.05	0.08	0.01	0.09	0.01	0.43	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.36	0.12	0.27	0.22	0.23	0.25
N3	0.03	0.01	0.08	0.14	0.00	0.04	0.01	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.39	0.17	0.26	0.22	0.21	0.21
N6	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.15	0.01	0.53	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.17	0.21	0.04	0.24	0.18	0.21	0.24
N7	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.17	0.00	0.52	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.11	0.06	0.04	0.21	0.13	0.12	0.17
N9	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.10	0.01	0.36	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.16	0.16	0.14	0.12
O2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.18	0.03	0.16	0.06	0.19	0.08	0.24	0.23	0.17	0.11	0.09	0.00	0.04	0.03	0.26	0.05	0.06	0.13
O3'	0.12	0.42	0.03	0.01	0.25	0.02	0.18	0.04	0.25	0.03	0.36	0.39	0.21	0.06	0.12	0.04	0.00	0.05	0.37	0.28	0.24	0.34
O4'	0.00	0.16	0.03	0.01	0.09	0.01	0.04	0.03	0.07	0.07	0.12	0.17	0.04	0.04	0.01	0.03	0.05	0.00	0.34	0.37	0.40	0.28
O5'	0.12	0.29	0.20	0.37	0.21	0.03	0.21	0.01	0.24	0.18	0.27	0.26	0.24	0.21	0.16	0.26	0.37	0.34	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.22	0.23	0.08	0.12	0.18	0.12	0.16	0.34	0.19	0.10	0.22	0.22	0.18	0.13	0.16	0.05	0.28	0.37	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.23	0.06	0.20	0.16	0.08	0.16	0.12	0.20	0.07	0.23	0.21	0.21	0.12	0.14	0.06	0.24	0.40	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.24	0.08	0.27	0.17	0.05	0.19	0.02	0.23	0.11	0.25	0.21	0.24	0.17	0.12	0.13	0.34	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00