Doublet Group distance statistics: 52008

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.000, 0.031, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O3'	B	0, 0.000, 0.099, 0.198, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.099 std_dev=0.099
C5	B	0, 0.000, 0.351, 0.703, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.351 std_dev=0.351
N3	B	0, 0.000, 0.365, 0.730, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.365 std_dev=0.365
C4	B	0, 0.000, 0.372, 0.745, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.372 std_dev=0.372
C4'	B	0, 0.000, 0.381, 0.762, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.381 std_dev=0.381
C6	B	0, 0.000, 0.394, 0.789, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.394 std_dev=0.394
O4'	B	0, 0.000, 0.402, 0.804, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.402 std_dev=0.402
N7	B	0, 0.000, 0.413, 0.826, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.413 std_dev=0.413
C2	B	0, 0.000, 0.419, 0.839, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.419 std_dev=0.419
O5'	B	0, 0.000, 0.436, 0.872, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.436 std_dev=0.436
C5'	B	0, 0.000, 0.439, 0.878, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.439 std_dev=0.439
N6	B	0, 0.000, 0.453, 0.906, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.453 std_dev=0.453
N1	B	0, 0.000, 0.462, 0.923, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.462 std_dev=0.462
C3'	B	0, 0.000, 0.462, 0.925, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.462 std_dev=0.462
N9	B	0, 0.000, 0.487, 0.973, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.487 std_dev=0.487
C8	B	0, 0.000, 0.522, 1.044, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.522 std_dev=0.522
C1'	B	0, 0.000, 0.656, 1.313, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.656 std_dev=0.656
C2'	A	0, 0.000, 0.731, 1.461, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.731 std_dev=0.731
O4'	A	0, 0.000, 0.752, 1.504, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.752 std_dev=0.752
C4'	A	0, 0.000, 0.880, 1.759, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.880 std_dev=0.880
C2'	B	0, 0.000, 0.942, 1.883, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.942 std_dev=0.942
P	B	0, 0.000, 0.949, 1.898, 1.898 max_d=1.898 avg_d=0.949 std_dev=0.949
OP2	B	0, 0.000, 1.187, 2.373, 2.373 max_d=2.373 avg_d=1.187 std_dev=1.187
C3'	A	0, 0.000, 1.227, 2.454, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.227 std_dev=1.227
O2'	A	0, 0.000, 1.246, 2.491, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.246 std_dev=1.246
O2'	B	0, 0.000, 1.509, 3.019, 3.019 max_d=3.019 avg_d=1.509 std_dev=1.509
OP1	B	0, 0.000, 1.512, 3.024, 3.024 max_d=3.024 avg_d=1.512 std_dev=1.512
C5'	A	0, 0.000, 1.746, 3.492, 3.492 max_d=3.492 avg_d=1.746 std_dev=1.746
O3'	A	0, 0.000, 1.786, 3.572, 3.572 max_d=3.572 avg_d=1.786 std_dev=1.786
O5'	A	0, 0.000, 2.719, 5.438, 5.438 max_d=5.438 avg_d=2.719 std_dev=2.719
P	A	0, 0.000, 3.908, 7.817, 7.817 max_d=7.817 avg_d=3.908 std_dev=3.908
OP1	A	0, 0.000, 4.113, 8.225, 8.225 max_d=8.225 avg_d=4.113 std_dev=4.113
OP2	A	0, 0.000, 4.568, 9.136, 9.136 max_d=9.136 avg_d=4.568 std_dev=4.568

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.01	0.02	0.32	0.07	0.11
C2	0.01	0.00	0.24	0.00	0.01	0.19	0.01	0.44	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.60	0.30	0.29	0.69	0.96	0.61	0.88
C2'	0.00	0.24	0.00	0.01	0.12	0.02	0.06	0.02	0.11	0.13	0.19	0.24	0.08	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.05	0.26	0.12
C3'	0.02	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.21	0.02	0.18	0.34	0.09	0.02	0.24	0.33	0.18	0.02	0.00	0.01	0.14	0.06	0.09	0.12
C4	0.01	0.01	0.12	0.11	0.00	0.14	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.37	0.09	0.15	0.37	0.55	0.17	0.43
C4'	0.02	0.19	0.02	0.00	0.14	0.00	0.14	0.00	0.18	0.03	0.20	0.16	0.18	0.09	0.07	0.20	0.01	0.01	0.03	0.29	0.13	0.12
C5	0.00	0.01	0.06	0.21	0.00	0.14	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.08	0.05	0.27	0.37	0.02	0.26
C5'	0.02	0.44	0.02	0.02	0.30	0.00	0.30	0.00	0.39	0.06	0.46	0.37	0.39	0.17	0.15	0.16	0.09	0.00	0.00	0.00	0.17	0.02
C6	0.01	0.00	0.11	0.18	0.00	0.18	0.00	0.39	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.42	0.01	0.13	0.44	0.55	0.18	0.47
C8	0.01	0.02	0.13	0.34	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.20	0.21	0.11	0.55	0.29
N1	0.01	0.00	0.19	0.09	0.00	0.20	0.00	0.46	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.54	0.16	0.23	0.63	0.83	0.49	0.76
N3	0.01	0.00	0.24	0.02	0.01	0.16	0.00	0.37	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.55	0.31	0.29	0.60	0.88	0.50	0.76
N6	0.00	0.00	0.08	0.24	0.01	0.18	0.00	0.39	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.38	0.10	0.08	0.37	0.42	0.06	0.35
N7	0.01	0.01	0.06	0.33	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.29	0.11	0.05	0.01	0.45	0.16
N9	0.00	0.01	0.00	0.18	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.05	0.01	0.09	0.27	0.13	0.10
O2'	0.01	0.60	0.00	0.02	0.37	0.20	0.31	0.16	0.42	0.00	0.54	0.55	0.38	0.12	0.15	0.00	0.03	0.15	0.03	0.42	0.00	0.17
O3'	0.12	0.30	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.09	0.01	0.32	0.16	0.31	0.10	0.29	0.05	0.03	0.00	0.07	0.03	0.09	0.14	0.03
O4'	0.01	0.29	0.01	0.01	0.15	0.01	0.05	0.00	0.13	0.20	0.23	0.29	0.08	0.11	0.01	0.15	0.07	0.00	0.10	0.43	0.06	0.21
O5'	0.02	0.69	0.19	0.14	0.37	0.03	0.27	0.00	0.44	0.21	0.63	0.60	0.37	0.05	0.09	0.03	0.03	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.32	0.96	0.05	0.06	0.55	0.29	0.37	0.00	0.55	0.11	0.83	0.88	0.42	0.01	0.27	0.42	0.09	0.43	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.61	0.26	0.09	0.17	0.13	0.02	0.17	0.18	0.55	0.49	0.50	0.06	0.45	0.13	0.00	0.14	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.88	0.12	0.12	0.43	0.12	0.26	0.02	0.47	0.29	0.76	0.76	0.35	0.16	0.10	0.17	0.03	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.42	0.00	0.49	0.30	0.21	0.19	0.20	0.11	0.09	0.36	0.01	0.10	0.08	0.28	0.33	0.65	0.01	0.20	0.14	0.21	0.63	0.50
C2	0.25	0.02	0.40	0.30	0.18	0.14	0.21	0.04	0.17	0.26	0.08	0.08	0.19	0.25	0.22	0.35	0.02	0.08	0.04	0.15	0.77	0.34
C2'	0.16	0.34	0.18	0.07	0.09	0.09	0.01	0.14	0.11	0.24	0.25	0.29	0.06	0.17	0.10	0.30	0.25	0.11	0.18	0.35	0.69	0.59
C3'	0.14	0.26	0.17	0.37	0.12	0.37	0.01	0.27	0.02	0.12	0.14	0.28	0.07	0.14	0.05	0.01	0.72	0.25	0.13	0.24	0.40	0.37
C4	0.31	0.06	0.40	0.30	0.19	0.14	0.21	0.05	0.12	0.33	0.02	0.05	0.13	0.29	0.27	0.40	0.03	0.12	0.07	0.03	0.77	0.42
C4'	0.03	0.12	0.01	0.28	0.08	0.37	0.05	0.43	0.06	0.01	0.09	0.12	0.04	0.02	0.05	0.28	0.56	0.27	0.34	0.06	0.04	0.08
C5	0.22	0.16	0.28	0.27	0.11	0.10	0.16	0.01	0.05	0.28	0.13	0.05	0.08	0.26	0.20	0.23	0.03	0.08	0.02	0.12	0.81	0.39
C5'	0.32	0.12	0.37	0.69	0.22	0.83	0.18	0.96	0.12	0.28	0.09	0.18	0.09	0.23	0.29	0.03	0.94	0.64	0.83	0.50	0.50	0.41
C6	0.18	0.16	0.25	0.26	0.08	0.08	0.13	0.02	0.06	0.22	0.13	0.06	0.11	0.22	0.15	0.15	0.03	0.05	0.01	0.23	0.82	0.33
C8	0.28	0.15	0.29	0.26	0.12	0.11	0.14	0.02	0.00	0.35	0.14	0.04	0.01	0.29	0.26	0.32	0.04	0.13	0.07	0.07	0.78	0.49
N1	0.19	0.07	0.31	0.28	0.12	0.10	0.17	0.01	0.13	0.22	0.01	0.00	0.17	0.22	0.17	0.21	0.03	0.05	0.00	0.23	0.80	0.32
N3	0.31	0.04	0.46	0.31	0.22	0.16	0.23	0.07	0.18	0.31	0.08	0.12	0.18	0.28	0.27	0.47	0.02	0.12	0.08	0.05	0.74	0.39
N6	0.12	0.21	0.17	0.23	0.02	0.05	0.07	0.06	0.02	0.17	0.20	0.11	0.04	0.17	0.10	0.03	0.04	0.02	0.06	0.31	0.83	0.29
N7	0.21	0.21	0.22	0.24	0.07	0.08	0.10	0.03	0.04	0.29	0.20	0.09	0.02	0.25	0.19	0.19	0.04	0.08	0.01	0.07	0.82	0.42
N9	0.35	0.08	0.40	0.29	0.18	0.15	0.19	0.06	0.07	0.36	0.05	0.03	0.08	0.30	0.31	0.46	0.02	0.16	0.10	0.09	0.74	0.48
O2'	0.26	0.57	0.34	0.28	0.20	0.43	0.14	0.53	0.29	0.23	0.48	0.47	0.25	0.09	0.08	0.46	0.06	0.37	0.45	0.57	0.86	0.79
O3'	0.04	0.38	0.09	0.24	0.12	0.11	0.05	0.14	0.03	0.29	0.23	0.37	0.08	0.28	0.04	0.04	0.66	0.00	0.27	0.75	0.75	0.80
O4'	0.16	0.01	0.23	0.02	0.04	0.17	0.01	0.31	0.04	0.04	0.03	0.04	0.07	0.01	0.07	0.51	0.27	0.13	0.28	0.15	0.12	0.08
O5'	0.68	0.21	0.73	1.09	0.51	1.29	0.55	1.58	0.39	0.80	0.23	0.33	0.40	0.72	0.68	0.32	1.25	1.09	1.51	1.29	1.23	1.15
OP1	0.70	0.03	0.81	1.34	0.46	1.53	0.58	1.97	0.38	0.96	0.12	0.16	0.45	0.87	0.71	0.26	1.45	1.18	1.91	1.73	2.04	1.73
OP2	1.20	0.59	1.34	1.72	1.04	1.89	1.19	2.37	0.99	1.56	0.69	0.72	1.07	1.51	1.27	0.84	1.76	1.60	2.44	2.36	2.46	2.22
P	0.80	0.17	0.89	1.33	0.60	1.54	0.71	1.97	0.51	1.07	0.25	0.31	0.57	0.99	0.83	0.38	1.43	1.26	1.95	1.81	1.93	1.71

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.03	0.06	0.07	0.02	0.02	0.00	0.00	0.15	0.00	0.12	0.30	0.33	0.02
C2	0.07	0.00	0.28	0.28	0.00	0.07	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.11	0.06	0.10	0.47	0.59	0.07
C2'	0.00	0.28	0.00	0.01	0.13	0.02	0.04	0.12	0.10	0.17	0.21	0.28	0.05	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.61	0.02	0.33
C3'	0.02	0.28	0.01	0.00	0.22	0.00	0.22	0.00	0.25	0.10	0.29	0.26	0.24	0.15	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.09	0.11
C4	0.03	0.00	0.13	0.22	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.04	0.11	0.45	0.59	0.07
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.07	0.02	0.00	0.03	0.22	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03
C5	0.01	0.02	0.04	0.22	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.16	0.11	0.03	0.14	0.54	0.66	0.06
C5'	0.05	0.05	0.12	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.11	0.11	0.08	0.03	0.14	0.13	0.06	0.10	0.15	0.00	0.00	0.18	0.21	0.01
C6	0.03	0.01	0.10	0.25	0.01	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.04	0.15	0.58	0.67	0.05
C8	0.03	0.00	0.17	0.10	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.04	0.02	0.17	0.49	0.62	0.06
N1	0.06	0.00	0.21	0.29	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.15	0.05	0.12	0.54	0.65	0.07
N3	0.07	0.00	0.28	0.26	0.01	0.07	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.07	0.05	0.08	0.41	0.55	0.08
N6	0.02	0.01	0.05	0.24	0.01	0.02	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.17	0.04	0.17	0.64	0.69	0.03
N7	0.02	0.02	0.11	0.15	0.01	0.00	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.27	0.10	0.00	0.17	0.58	0.69	0.05
N9	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.12	0.39	0.53	0.07
O2'	0.00	0.10	0.00	0.02	0.06	0.22	0.16	0.10	0.12	0.27	0.00	0.12	0.17	0.27	0.13	0.00	0.00	0.13	0.17	0.58	0.04	0.27
O3'	0.15	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.11	0.15	0.15	0.04	0.15	0.07	0.17	0.10	0.00	0.00	0.00	0.11	0.20	0.10	0.14	0.04
O4'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.04	0.00	0.00	0.13	0.11	0.00	0.00	0.01	0.33	0.21
O5'	0.12	0.10	0.28	0.01	0.11	0.01	0.14	0.00	0.15	0.17	0.12	0.08	0.17	0.17	0.12	0.17	0.20	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.30	0.47	0.61	0.17	0.45	0.04	0.54	0.18	0.58	0.49	0.54	0.41	0.64	0.58	0.39	0.58	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.33	0.59	0.02	0.09	0.59	0.02	0.66	0.21	0.67	0.62	0.65	0.55	0.69	0.69	0.53	0.04	0.14	0.33	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.07	0.33	0.11	0.07	0.03	0.06	0.01	0.05	0.06	0.07	0.08	0.03	0.05	0.07	0.27	0.04	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00