Doublet Group distance statistics: 52019

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 2, 10, 18, 14, 17, 11, 15, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.021, 0.028, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.028 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.018, 0.026, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.018, 0.027, 0.037, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.027 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.014, 0.024, 0.035, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.024, 0.037, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.048, 0.062, 0.076, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.062 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.030, 0.044, 0.058, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.044 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.033, 0.050, 0.068, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.050 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.028, 0.049, 0.070, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.049 std_dev=0.021
O4'	A	0, 0.074, 0.180, 0.285, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.180 std_dev=0.106
C2'	A	0, 0.114, 0.223, 0.332, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.223 std_dev=0.109
O2'	A	0, 0.105, 0.244, 0.383, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.244 std_dev=0.139
C3'	A	0, 0.192, 0.377, 0.562, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.377 std_dev=0.185
C4'	A	0, 0.155, 0.345, 0.535, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.345 std_dev=0.190
C4	B	0, 0.339, 0.547, 0.755, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.547 std_dev=0.208
N3	B	0, 0.384, 0.603, 0.822, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.603 std_dev=0.219
N9	B	0, 0.336, 0.556, 0.775, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.556 std_dev=0.220
C8	B	0, 0.352, 0.588, 0.825, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.588 std_dev=0.237
C5	B	0, 0.304, 0.543, 0.783, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.543 std_dev=0.240
C2	B	0, 0.395, 0.635, 0.876, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.635 std_dev=0.241
N7	B	0, 0.336, 0.584, 0.833, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.584 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.339, 0.594, 0.849, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.594 std_dev=0.255
O3'	A	0, 0.295, 0.551, 0.808, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.551 std_dev=0.256
N1	B	0, 0.350, 0.614, 0.878, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.614 std_dev=0.264
O4'	B	0, 0.301, 0.569, 0.836, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.569 std_dev=0.267
C6	B	0, 0.312, 0.583, 0.853, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.583 std_dev=0.270
O5'	B	0, 0.366, 0.646, 0.926, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.646 std_dev=0.280
N2	B	0, 0.449, 0.745, 1.040, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.745 std_dev=0.295
P	B	0, 0.328, 0.637, 0.947, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.637 std_dev=0.310
O6	B	0, 0.325, 0.644, 0.963, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.644 std_dev=0.319
C4'	B	0, 0.384, 0.707, 1.030, 2.028 max_d=2.028 avg_d=0.707 std_dev=0.323
C5'	A	0, 0.212, 0.545, 0.878, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.545 std_dev=0.333
C2'	B	0, 0.397, 0.740, 1.083, 2.084 max_d=2.084 avg_d=0.740 std_dev=0.343
C3'	B	0, 0.435, 0.797, 1.160, 2.080 max_d=2.080 avg_d=0.797 std_dev=0.363
OP2	B	0, 0.328, 0.695, 1.062, 2.200 max_d=2.200 avg_d=0.695 std_dev=0.367
O5'	A	0, 0.295, 0.708, 1.122, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.708 std_dev=0.414
OP1	B	0, 0.374, 0.790, 1.207, 2.413 max_d=2.413 avg_d=0.790 std_dev=0.416
C5'	B	0, 0.337, 0.756, 1.176, 3.156 max_d=3.156 avg_d=0.756 std_dev=0.420
O2'	B	0, 0.409, 0.874, 1.339, 2.474 max_d=2.474 avg_d=0.874 std_dev=0.465
O3'	B	0, 0.531, 1.021, 1.511, 2.863 max_d=2.863 avg_d=1.021 std_dev=0.490
P	A	0, 0.319, 0.927, 1.535, 3.647 max_d=3.647 avg_d=0.927 std_dev=0.608
OP1	A	0, 0.292, 1.031, 1.771, 4.236 max_d=4.236 avg_d=1.031 std_dev=0.740
OP2	A	0, 0.391, 1.140, 1.890, 5.024 max_d=5.024 avg_d=1.140 std_dev=0.750

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.30	0.20	0.16
C2	0.03	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.03	0.27	0.50	0.37	0.33
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.05	0.07	0.09	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.31	0.28	0.18
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.11	0.11	0.11	0.10	0.13	0.12	0.06	0.02	0.01	0.01	0.19	0.33	0.33	0.22
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.02	0.27	0.47	0.32	0.30
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.07	0.05	0.10	0.11	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.17	0.24	0.08
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.02	0.34	0.55	0.39	0.38
C5'	0.04	0.13	0.02	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.20	0.21	0.17	0.11	0.23	0.23	0.13	0.05	0.04	0.02	0.01	0.18	0.24	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.03	0.35	0.59	0.44	0.41
C8	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.11	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.12	0.03	0.33	0.49	0.32	0.33
N1	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.32	0.56	0.42	0.38
N3	0.03	0.00	0.09	0.10	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.03	0.24	0.45	0.32	0.28
N6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.15	0.03	0.38	0.63	0.49	0.45
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.37	0.57	0.42	0.40
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.25	0.42	0.26	0.26
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.03	0.11	0.12	0.08	0.04	0.02	0.00	0.05	0.06	0.06	0.26	0.29	0.14
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.04	0.13	0.12	0.13	0.12	0.15	0.14	0.06	0.05	0.00	0.02	0.19	0.38	0.45	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.13	0.24	0.23	0.17
O5'	0.14	0.27	0.14	0.19	0.27	0.02	0.34	0.01	0.35	0.33	0.32	0.24	0.38	0.37	0.25	0.06	0.19	0.13	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.30	0.50	0.31	0.33	0.47	0.17	0.55	0.18	0.59	0.49	0.56	0.45	0.63	0.57	0.42	0.26	0.38	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.37	0.28	0.33	0.32	0.24	0.39	0.24	0.44	0.32	0.42	0.32	0.49	0.42	0.26	0.29	0.45	0.23	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.33	0.18	0.22	0.30	0.08	0.38	0.02	0.41	0.33	0.38	0.28	0.45	0.40	0.26	0.14	0.27	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.24	0.21	0.21	0.20	0.24	0.23	0.30	0.26	0.21	0.25	0.26	0.22	0.25	0.19	0.27	0.22	0.23	0.21	0.31	0.05	0.10	0.05
C2	0.30	0.28	0.30	0.26	0.18	0.28	0.14	0.27	0.21	0.21	0.24	0.33	0.28	0.20	0.22	0.36	0.27	0.29	0.25	0.28	0.16	0.26	0.15
C2'	0.19	0.20	0.17	0.19	0.18	0.20	0.22	0.31	0.25	0.22	0.22	0.20	0.18	0.26	0.17	0.23	0.21	0.19	0.23	0.29	0.09	0.10	0.09
C3'	0.20	0.22	0.17	0.13	0.20	0.13	0.24	0.18	0.26	0.21	0.24	0.22	0.21	0.26	0.19	0.20	0.17	0.20	0.10	0.30	0.04	0.06	0.02
C4	0.26	0.27	0.23	0.21	0.20	0.24	0.19	0.25	0.25	0.19	0.27	0.31	0.25	0.20	0.20	0.29	0.21	0.26	0.22	0.30	0.12	0.21	0.11
C4'	0.19	0.23	0.16	0.13	0.20	0.14	0.25	0.20	0.28	0.21	0.26	0.23	0.20	0.27	0.18	0.21	0.17	0.19	0.08	0.33	0.11	0.12	0.06
C5	0.28	0.29	0.25	0.24	0.22	0.24	0.18	0.23	0.24	0.22	0.28	0.33	0.27	0.19	0.23	0.29	0.23	0.27	0.23	0.29	0.19	0.27	0.17
C5'	0.23	0.31	0.20	0.16	0.28	0.14	0.33	0.15	0.37	0.27	0.35	0.31	0.28	0.33	0.24	0.22	0.19	0.21	0.09	0.43	0.22	0.22	0.14
C6	0.29	0.31	0.28	0.27	0.24	0.26	0.16	0.24	0.19	0.25	0.28	0.37	0.30	0.21	0.25	0.31	0.25	0.28	0.24	0.24	0.21	0.30	0.19
C8	0.25	0.28	0.22	0.22	0.22	0.23	0.23	0.24	0.28	0.21	0.29	0.30	0.25	0.22	0.21	0.26	0.22	0.26	0.22	0.34	0.20	0.23	0.17
N1	0.30	0.30	0.30	0.27	0.22	0.27	0.13	0.25	0.16	0.23	0.24	0.37	0.30	0.21	0.25	0.34	0.26	0.29	0.25	0.25	0.18	0.29	0.18
N3	0.28	0.26	0.27	0.23	0.19	0.27	0.18	0.28	0.24	0.20	0.25	0.30	0.25	0.22	0.20	0.33	0.24	0.27	0.24	0.29	0.13	0.21	0.12
N6	0.30	0.34	0.29	0.29	0.27	0.27	0.22	0.25	0.21	0.28	0.31	0.40	0.32	0.26	0.28	0.32	0.28	0.29	0.26	0.22	0.26	0.34	0.23
N7	0.27	0.30	0.24	0.24	0.23	0.24	0.22	0.24	0.28	0.23	0.31	0.33	0.27	0.21	0.23	0.27	0.24	0.27	0.23	0.33	0.24	0.28	0.20
N9	0.25	0.26	0.22	0.20	0.21	0.23	0.22	0.25	0.27	0.19	0.27	0.29	0.24	0.23	0.20	0.27	0.21	0.25	0.21	0.32	0.11	0.17	0.09
O2'	0.21	0.21	0.21	0.26	0.21	0.28	0.25	0.42	0.26	0.27	0.24	0.22	0.20	0.29	0.21	0.27	0.29	0.22	0.27	0.29	0.17	0.11	0.14
O3'	0.20	0.20	0.17	0.12	0.19	0.12	0.22	0.14	0.23	0.20	0.21	0.20	0.19	0.24	0.18	0.20	0.18	0.22	0.02	0.26	0.02	0.02	0.01
O4'	0.21	0.24	0.18	0.17	0.20	0.19	0.23	0.26	0.28	0.20	0.26	0.26	0.22	0.25	0.18	0.25	0.19	0.21	0.14	0.33	0.08	0.12	0.03
O5'	0.34	0.45	0.33	0.30	0.41	0.27	0.46	0.25	0.51	0.39	0.49	0.45	0.41	0.46	0.37	0.33	0.31	0.31	0.27	0.55	0.30	0.34	0.26
OP1	0.53	0.69	0.54	0.51	0.64	0.45	0.70	0.44	0.75	0.61	0.74	0.70	0.65	0.68	0.59	0.52	0.53	0.48	0.48	0.80	0.51	0.59	0.48
OP2	0.55	0.66	0.59	0.58	0.62	0.52	0.66	0.52	0.70	0.60	0.70	0.67	0.63	0.65	0.59	0.57	0.60	0.52	0.55	0.74	0.56	0.60	0.54
P	0.43	0.57	0.43	0.40	0.53	0.35	0.58	0.33	0.63	0.50	0.61	0.57	0.52	0.57	0.48	0.42	0.41	0.39	0.37	0.68	0.36	0.45	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.12	0.02	0.11	0.27	0.14
C2	0.04	0.00	0.18	0.20	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.26	0.06	0.18	0.01	0.16	0.28	0.17
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.02	0.06	0.07	0.09	0.08	0.14	0.21	0.18	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.19	0.08	0.22	0.26	0.18
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.15	0.00	0.16	0.02	0.18	0.15	0.20	0.23	0.18	0.16	0.10	0.02	0.01	0.01	0.17	0.18	0.22	0.15	0.12
C4	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.03	0.19	0.01	0.15	0.27	0.16
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.07	0.09	0.07	0.09	0.04	0.11	0.03	0.00	0.02	0.08	0.09	0.20	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.14	0.03	0.24	0.01	0.19	0.28	0.19
C5'	0.04	0.11	0.07	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.13	0.13	0.12	0.12	0.10	0.14	0.08	0.07	0.09	0.02	0.01	0.15	0.12	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.18	0.04	0.25	0.00	0.21	0.29	0.21
C8	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.14	0.04	0.25	0.02	0.17	0.26	0.17
N1	0.03	0.00	0.14	0.20	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.22	0.05	0.22	0.01	0.19	0.29	0.19
N2	0.04	0.00	0.21	0.23	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.32	0.07	0.17	0.02	0.16	0.29	0.17
N3	0.04	0.01	0.18	0.18	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.23	0.06	0.16	0.01	0.15	0.28	0.16
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.15	0.04	0.27	0.02	0.21	0.27	0.21
N9	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.01	0.18	0.02	0.13	0.27	0.15
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.10	0.11	0.11	0.07	0.13	0.12	0.14	0.19	0.14	0.13	0.07	0.00	0.06	0.08	0.13	0.14	0.18	0.29	0.16
O3'	0.11	0.26	0.03	0.01	0.15	0.03	0.14	0.09	0.18	0.14	0.22	0.32	0.23	0.15	0.08	0.06	0.00	0.08	0.19	0.18	0.34	0.23	0.22
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.04	0.01	0.08	0.08	0.00	0.09	0.04	0.12	0.30	0.17
O5'	0.12	0.18	0.19	0.17	0.19	0.02	0.24	0.01	0.25	0.25	0.22	0.17	0.16	0.27	0.18	0.13	0.19	0.09	0.00	0.27	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.18	0.04	0.27	0.00	0.24	0.30	0.24
OP1	0.11	0.16	0.22	0.22	0.15	0.09	0.19	0.12	0.21	0.17	0.19	0.16	0.15	0.21	0.13	0.18	0.34	0.12	0.02	0.24	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.28	0.26	0.15	0.27	0.20	0.28	0.17	0.29	0.26	0.29	0.29	0.28	0.27	0.27	0.29	0.23	0.30	0.02	0.30	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.17	0.18	0.12	0.16	0.06	0.19	0.02	0.21	0.17	0.19	0.17	0.16	0.21	0.15	0.16	0.22	0.17	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00