Doublet Group distance statistics: 52021

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 12, 9, 13, 5, 4, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.022, 0.034, 0.046, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.034 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.021, 0.036, 0.051, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.036 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.014, 0.031, 0.047, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.031 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.023, 0.043, 0.063, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.043 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.017, 0.037, 0.057, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.037 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.032, 0.052, 0.072, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.052 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.031, 0.057, 0.083, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.057 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.031, 0.063, 0.096, 0.202 max_d=0.202 avg_d=0.063 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.048, 0.085, 0.122, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.085 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.038, 0.115, 0.191, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.115 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.181, 0.310, 0.438, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.310 std_dev=0.129
N9	B	0, 0.231, 0.367, 0.502, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.367 std_dev=0.135
C4'	A	0, 0.294, 0.442, 0.590, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.442 std_dev=0.148
C4	B	0, 0.324, 0.491, 0.659, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.491 std_dev=0.167
C3'	A	0, 0.401, 0.574, 0.747, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.574 std_dev=0.173
C1'	B	0, 0.247, 0.420, 0.594, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.420 std_dev=0.174
O2'	A	0, 0.399, 0.588, 0.778, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.588 std_dev=0.189
C8	B	0, 0.371, 0.567, 0.763, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.567 std_dev=0.196
C5	B	0, 0.418, 0.626, 0.834, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.626 std_dev=0.208
C2'	B	0, 0.283, 0.499, 0.715, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.499 std_dev=0.216
O4'	B	0, 0.338, 0.555, 0.771, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.555 std_dev=0.216
C3'	B	0, 0.285, 0.509, 0.733, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.509 std_dev=0.224
C4'	B	0, 0.401, 0.630, 0.859, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.630 std_dev=0.229
N7	B	0, 0.475, 0.705, 0.934, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.705 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.447, 0.699, 0.952, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.699 std_dev=0.252
C5'	A	0, 0.435, 0.695, 0.956, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.695 std_dev=0.261
O3'	A	0, 0.716, 0.990, 1.264, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.990 std_dev=0.274
C5'	B	0, 0.564, 0.843, 1.121, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.843 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.573, 0.857, 1.141, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.857 std_dev=0.284
O2'	B	0, 0.433, 0.729, 1.025, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.729 std_dev=0.296
O3'	B	0, 0.373, 0.677, 0.980, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.677 std_dev=0.303
C2	B	0, 0.603, 0.930, 1.257, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.930 std_dev=0.327
O5'	B	0, 0.583, 0.915, 1.247, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.915 std_dev=0.332
N1	B	0, 0.633, 0.968, 1.303, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.968 std_dev=0.335
O6	B	0, 0.716, 1.060, 1.404, 1.922 max_d=1.922 avg_d=1.060 std_dev=0.344
P	B	0, 0.874, 1.256, 1.638, 2.866 max_d=2.866 avg_d=1.256 std_dev=0.382
O5'	A	0, 0.744, 1.128, 1.512, 2.098 max_d=2.098 avg_d=1.128 std_dev=0.384
N2	B	0, 0.805, 1.235, 1.665, 2.093 max_d=2.093 avg_d=1.235 std_dev=0.430
OP2	B	0, 0.988, 1.473, 1.958, 3.759 max_d=3.759 avg_d=1.473 std_dev=0.485
P	A	0, 1.755, 2.260, 2.765, 3.910 max_d=3.910 avg_d=2.260 std_dev=0.505
OP1	B	0, 1.245, 1.809, 2.373, 4.299 max_d=4.299 avg_d=1.809 std_dev=0.564
OP2	A	0, 1.273, 1.939, 2.605, 4.499 max_d=4.499 avg_d=1.939 std_dev=0.666
OP1	A	0, 3.125, 3.856, 4.588, 5.500 max_d=5.500 avg_d=3.856 std_dev=0.732

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.10	0.10	0.22	0.15
C2	0.04	0.00	0.11	0.10	0.02	0.05	0.01	0.07	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.15	0.14	0.03	0.21	0.26	0.30	0.29
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.08	0.06	0.10	0.10	0.08	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.13	0.17	0.33	0.17
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.09	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.18	0.24	0.38	0.19
C4	0.01	0.02	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.09	0.02	0.22	0.26	0.27	0.28
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.07	0.08	0.04	0.09	0.03	0.01	0.02	0.11	0.27	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.10	0.03	0.27	0.35	0.32	0.35
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.10	0.06	0.16	0.16	0.09	0.10	0.04	0.02	0.01	0.14	0.27	0.02
C6	0.02	0.02	0.08	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.28	0.38	0.36	0.37
C8	0.02	0.03	0.06	0.10	0.01	0.08	0.02	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.11	0.03	0.27	0.33	0.26	0.32
N1	0.03	0.01	0.10	0.10	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.13	0.02	0.25	0.34	0.34	0.34
N3	0.03	0.01	0.10	0.10	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.14	0.12	0.03	0.18	0.22	0.28	0.25
N6	0.02	0.02	0.08	0.10	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.11	0.13	0.03	0.31	0.45	0.40	0.42
N7	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.12	0.04	0.30	0.40	0.33	0.38
N9	0.00	0.02	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.02	0.20	0.22	0.23	0.25
O2'	0.04	0.15	0.01	0.03	0.09	0.09	0.09	0.10	0.11	0.05	0.13	0.14	0.11	0.06	0.05	0.00	0.06	0.06	0.07	0.15	0.33	0.11
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.09	0.03	0.10	0.04	0.12	0.11	0.13	0.12	0.13	0.12	0.06	0.06	0.00	0.03	0.18	0.32	0.46	0.20
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.06	0.03	0.00	0.12	0.10	0.21	0.14
O5'	0.10	0.21	0.13	0.18	0.22	0.02	0.27	0.01	0.28	0.27	0.25	0.18	0.31	0.30	0.20	0.07	0.18	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.26	0.17	0.24	0.26	0.11	0.35	0.14	0.38	0.33	0.34	0.22	0.45	0.40	0.22	0.15	0.32	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.30	0.33	0.38	0.27	0.27	0.32	0.27	0.36	0.26	0.34	0.28	0.40	0.33	0.23	0.33	0.46	0.21	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.29	0.17	0.19	0.28	0.05	0.35	0.02	0.37	0.32	0.34	0.25	0.42	0.38	0.25	0.11	0.20	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.23	0.18	0.17	0.17	0.20	0.19	0.24	0.23	0.19	0.24	0.26	0.20	0.21	0.15	0.26	0.18	0.20	0.18	0.26	0.08	0.15	0.06
C2	0.24	0.30	0.26	0.20	0.15	0.22	0.16	0.20	0.24	0.18	0.29	0.34	0.25	0.17	0.15	0.32	0.22	0.21	0.20	0.26	0.15	0.31	0.16
C2'	0.15	0.21	0.14	0.16	0.18	0.17	0.22	0.25	0.24	0.21	0.23	0.22	0.18	0.25	0.15	0.20	0.18	0.16	0.20	0.27	0.11	0.16	0.10
C3'	0.14	0.21	0.13	0.18	0.19	0.14	0.24	0.21	0.26	0.21	0.24	0.21	0.19	0.26	0.16	0.16	0.19	0.16	0.11	0.29	0.03	0.08	0.02
C4	0.23	0.26	0.21	0.16	0.16	0.19	0.17	0.17	0.23	0.19	0.26	0.29	0.22	0.18	0.15	0.27	0.16	0.21	0.17	0.27	0.10	0.28	0.12
C4'	0.15	0.22	0.12	0.17	0.18	0.15	0.22	0.24	0.25	0.20	0.24	0.23	0.19	0.24	0.15	0.17	0.19	0.15	0.09	0.29	0.08	0.11	0.05
C5	0.23	0.25	0.20	0.17	0.15	0.19	0.15	0.16	0.23	0.21	0.26	0.29	0.21	0.18	0.17	0.25	0.17	0.23	0.18	0.27	0.13	0.33	0.16
C5'	0.18	0.25	0.15	0.19	0.22	0.15	0.26	0.21	0.29	0.23	0.28	0.26	0.22	0.27	0.19	0.17	0.22	0.18	0.09	0.33	0.18	0.21	0.12
C6	0.23	0.27	0.22	0.18	0.15	0.19	0.13	0.16	0.22	0.22	0.28	0.31	0.22	0.19	0.18	0.26	0.19	0.22	0.20	0.27	0.16	0.36	0.18
C8	0.23	0.23	0.19	0.18	0.16	0.20	0.17	0.17	0.23	0.20	0.25	0.26	0.20	0.19	0.17	0.24	0.18	0.24	0.19	0.28	0.15	0.30	0.16
N1	0.24	0.30	0.25	0.20	0.15	0.20	0.15	0.17	0.24	0.20	0.30	0.34	0.24	0.18	0.18	0.30	0.21	0.21	0.20	0.27	0.15	0.35	0.18
N3	0.23	0.27	0.24	0.18	0.16	0.22	0.17	0.21	0.23	0.18	0.27	0.31	0.24	0.18	0.14	0.31	0.20	0.21	0.19	0.26	0.13	0.27	0.13
N6	0.23	0.26	0.22	0.20	0.17	0.19	0.15	0.18	0.21	0.24	0.27	0.31	0.21	0.22	0.20	0.25	0.21	0.22	0.21	0.28	0.19	0.39	0.21
N7	0.23	0.24	0.20	0.18	0.16	0.20	0.16	0.17	0.23	0.22	0.25	0.27	0.20	0.19	0.18	0.23	0.18	0.24	0.19	0.28	0.17	0.35	0.19
N9	0.22	0.24	0.19	0.16	0.16	0.19	0.18	0.18	0.23	0.19	0.25	0.27	0.21	0.19	0.16	0.26	0.16	0.22	0.17	0.27	0.08	0.24	0.10
O2'	0.20	0.25	0.20	0.22	0.22	0.23	0.25	0.34	0.26	0.25	0.26	0.26	0.23	0.27	0.21	0.24	0.24	0.19	0.29	0.28	0.21	0.16	0.16
O3'	0.15	0.23	0.16	0.23	0.22	0.15	0.27	0.24	0.28	0.25	0.26	0.22	0.20	0.29	0.20	0.13	0.25	0.14	0.03	0.31	0.02	0.02	0.01
O4'	0.18	0.23	0.15	0.15	0.16	0.17	0.20	0.24	0.24	0.18	0.25	0.26	0.20	0.22	0.14	0.23	0.17	0.18	0.13	0.28	0.07	0.13	0.03
O5'	0.30	0.35	0.28	0.30	0.33	0.25	0.36	0.23	0.39	0.32	0.38	0.36	0.32	0.36	0.30	0.28	0.32	0.30	0.28	0.42	0.28	0.37	0.27
OP1	0.35	0.43	0.36	0.41	0.40	0.35	0.45	0.35	0.49	0.39	0.47	0.43	0.39	0.45	0.37	0.35	0.46	0.35	0.39	0.53	0.47	0.46	0.39
OP2	0.52	0.49	0.52	0.54	0.49	0.53	0.50	0.52	0.50	0.51	0.50	0.49	0.49	0.51	0.50	0.52	0.57	0.54	0.52	0.52	0.55	0.56	0.52
P	0.39	0.45	0.37	0.37	0.43	0.33	0.46	0.29	0.49	0.43	0.47	0.45	0.42	0.47	0.41	0.36	0.39	0.38	0.31	0.52	0.30	0.36	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.11	0.02	0.11	0.26	0.10
C2	0.04	0.00	0.15	0.19	0.02	0.07	0.01	0.13	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.15	0.25	0.07	0.24	0.02	0.23	0.38	0.24
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.09	0.02	0.07	0.02	0.09	0.08	0.13	0.18	0.15	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.16	0.09	0.19	0.18	0.12
C3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.13	0.01	0.13	0.03	0.16	0.12	0.19	0.22	0.17	0.13	0.07	0.03	0.01	0.02	0.23	0.16	0.25	0.13	0.17
C4	0.01	0.02	0.09	0.13	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.04	0.25	0.01	0.23	0.36	0.24
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.08	0.08	0.08	0.06	0.09	0.05	0.08	0.03	0.01	0.03	0.10	0.11	0.22	0.04
C5	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.00	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.16	0.04	0.30	0.02	0.29	0.42	0.30
C5'	0.04	0.13	0.02	0.03	0.13	0.01	0.17	0.00	0.18	0.17	0.16	0.13	0.11	0.19	0.11	0.09	0.07	0.03	0.01	0.20	0.12	0.25	0.02
C6	0.02	0.02	0.09	0.16	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.21	0.04	0.31	0.00	0.32	0.45	0.32
C8	0.02	0.03	0.08	0.12	0.01	0.08	0.02	0.17	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.14	0.05	0.31	0.02	0.28	0.37	0.28
N1	0.03	0.01	0.13	0.19	0.03	0.08	0.01	0.16	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.12	0.24	0.06	0.28	0.01	0.28	0.42	0.29
N2	0.04	0.01	0.18	0.22	0.02	0.08	0.02	0.13	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.18	0.30	0.08	0.22	0.03	0.21	0.37	0.22
N3	0.04	0.01	0.15	0.17	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.14	0.22	0.07	0.21	0.02	0.19	0.34	0.20
N7	0.03	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.16	0.05	0.34	0.03	0.33	0.44	0.33
N9	0.01	0.03	0.03	0.07	0.01	0.05	0.02	0.11	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.08	0.03	0.22	0.02	0.20	0.32	0.20
O2'	0.03	0.15	0.01	0.03	0.08	0.08	0.07	0.09	0.09	0.05	0.12	0.18	0.14	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.08	0.08	0.19	0.17	0.07
O3'	0.03	0.25	0.03	0.01	0.15	0.03	0.16	0.07	0.21	0.14	0.24	0.30	0.22	0.16	0.08	0.06	0.00	0.02	0.21	0.22	0.31	0.16	0.20
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.10	0.04	0.10	0.29	0.12
O5'	0.11	0.24	0.16	0.23	0.25	0.03	0.30	0.01	0.31	0.31	0.28	0.22	0.21	0.34	0.22	0.08	0.21	0.10	0.00	0.34	0.03	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.09	0.16	0.01	0.10	0.02	0.20	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.08	0.22	0.04	0.34	0.00	0.36	0.49	0.36
OP1	0.11	0.23	0.19	0.25	0.23	0.11	0.29	0.12	0.32	0.28	0.28	0.21	0.19	0.33	0.20	0.19	0.31	0.10	0.03	0.36	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.38	0.18	0.13	0.36	0.22	0.42	0.25	0.45	0.37	0.42	0.37	0.34	0.44	0.32	0.17	0.16	0.29	0.03	0.49	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.12	0.17	0.24	0.04	0.30	0.02	0.32	0.28	0.29	0.22	0.20	0.33	0.20	0.07	0.20	0.12	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00