Doublet Group distance statistics: 52024

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 3, 1, 7, 8, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.013, 0.028, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.018, 0.036, 0.054, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.036 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.012, 0.033, 0.053, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.019, 0.045, 0.072, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.045 std_dev=0.027
N3	A	0, 0.001, 0.031, 0.061, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.031 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.010, 0.042, 0.075, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.042 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.025, 0.058, 0.091, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.058 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.095, 0.196, 0.297, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.196 std_dev=0.101
C2'	A	0, 0.185, 0.310, 0.435, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.310 std_dev=0.125
O2'	A	0, 0.404, 0.599, 0.793, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.599 std_dev=0.195
C4	B	0, 0.285, 0.483, 0.681, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.483 std_dev=0.198
C4'	A	0, 0.449, 0.650, 0.850, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.650 std_dev=0.201
C5	B	0, 0.313, 0.514, 0.715, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.514 std_dev=0.201
C3'	A	0, 0.372, 0.578, 0.783, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.578 std_dev=0.206
N9	B	0, 0.329, 0.555, 0.780, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.555 std_dev=0.225
C6	B	0, 0.301, 0.531, 0.760, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.531 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.230, 0.460, 0.689, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.460 std_dev=0.230
N7	B	0, 0.355, 0.598, 0.841, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.598 std_dev=0.243
N1	B	0, 0.239, 0.493, 0.746, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.493 std_dev=0.254
C8	B	0, 0.359, 0.615, 0.870, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.615 std_dev=0.255
C2	B	0, 0.199, 0.460, 0.720, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.460 std_dev=0.260
O6	B	0, 0.358, 0.629, 0.900, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.629 std_dev=0.271
O5'	A	0, 0.592, 0.865, 1.137, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.865 std_dev=0.273
O4'	B	0, 0.418, 0.699, 0.981, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.699 std_dev=0.282
C1'	B	0, 0.335, 0.617, 0.899, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.617 std_dev=0.282
N2	B	0, 0.195, 0.521, 0.848, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.521 std_dev=0.327
O3'	A	0, 0.570, 0.911, 1.252, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.911 std_dev=0.341
C4'	B	0, 0.458, 0.801, 1.144, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.801 std_dev=0.343
C2'	B	0, 0.370, 0.732, 1.095, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.732 std_dev=0.362
O5'	B	0, 0.442, 0.810, 1.178, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.810 std_dev=0.368
C5'	A	0, 0.918, 1.290, 1.661, 1.962 max_d=1.962 avg_d=1.290 std_dev=0.372
C5'	B	0, 0.520, 0.910, 1.300, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.910 std_dev=0.390
P	B	0, 0.483, 0.874, 1.265, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.874 std_dev=0.391
OP2	B	0, 0.546, 0.937, 1.328, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.937 std_dev=0.391
P	A	0, 0.483, 0.878, 1.273, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.878 std_dev=0.395
C3'	B	0, 0.447, 0.846, 1.246, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.846 std_dev=0.400
OP1	B	0, 0.506, 0.966, 1.427, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.966 std_dev=0.460
OP2	A	0, 0.401, 0.887, 1.374, 1.922 max_d=1.922 avg_d=0.887 std_dev=0.486
OP1	A	0, 0.760, 1.270, 1.779, 2.161 max_d=2.161 avg_d=1.270 std_dev=0.509
O3'	B	0, 0.562, 1.086, 1.610, 2.069 max_d=2.069 avg_d=1.086 std_dev=0.524
O2'	B	0, 0.273, 0.898, 1.523, 2.770 max_d=2.770 avg_d=0.898 std_dev=0.625

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.17	0.22	0.19	0.14
C2	0.03	0.00	0.05	0.06	0.02	0.04	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.13	0.07	0.05	0.24	0.28	0.39	0.26
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.06	0.05	0.07	0.03	0.01	0.02	0.02	0.10	0.21	0.17	0.11
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.04	0.09	0.12	0.08	0.06	0.12	0.12	0.07	0.04	0.01	0.02	0.08	0.21	0.14	0.09
C4	0.02	0.02	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.24	0.27	0.34	0.24
C4'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.09	0.13	0.07	0.03	0.12	0.13	0.07	0.11	0.04	0.01	0.02	0.18	0.08	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.10	0.00	0.22	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.10	0.04	0.27	0.31	0.42	0.30
C5'	0.05	0.14	0.04	0.04	0.16	0.00	0.22	0.00	0.23	0.25	0.19	0.12	0.26	0.27	0.16	0.11	0.08	0.02	0.01	0.22	0.13	0.04
C6	0.02	0.02	0.04	0.09	0.02	0.09	0.01	0.23	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.08	0.10	0.04	0.28	0.33	0.45	0.32
C8	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.13	0.03	0.25	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.13	0.06	0.27	0.28	0.32	0.26
N1	0.03	0.01	0.04	0.08	0.02	0.07	0.02	0.19	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.02	0.11	0.08	0.05	0.26	0.31	0.43	0.30
N3	0.03	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.03	0.12	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.02	0.01	0.13	0.06	0.04	0.22	0.26	0.33	0.22
N6	0.03	0.04	0.05	0.12	0.03	0.12	0.02	0.26	0.01	0.03	0.03	0.06	0.00	0.04	0.03	0.08	0.13	0.05	0.30	0.37	0.49	0.36
N7	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.13	0.01	0.27	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.14	0.06	0.29	0.33	0.42	0.32
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.06	0.03	0.22	0.24	0.28	0.20
O2'	0.03	0.13	0.01	0.04	0.07	0.11	0.06	0.11	0.08	0.04	0.11	0.13	0.08	0.05	0.03	0.00	0.04	0.10	0.08	0.25	0.12	0.10
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.06	0.04	0.10	0.08	0.10	0.13	0.08	0.06	0.13	0.14	0.06	0.04	0.00	0.03	0.12	0.23	0.18	0.12
O4'	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.05	0.04	0.05	0.06	0.03	0.10	0.03	0.00	0.17	0.22	0.14	0.13
O5'	0.17	0.24	0.10	0.08	0.24	0.02	0.27	0.01	0.28	0.27	0.26	0.22	0.30	0.29	0.22	0.08	0.12	0.17	0.00	0.03	0.03	0.00
OP1	0.22	0.28	0.21	0.21	0.27	0.18	0.31	0.22	0.33	0.28	0.31	0.26	0.37	0.33	0.24	0.25	0.23	0.22	0.03	0.00	0.04	0.00
OP2	0.19	0.39	0.17	0.14	0.34	0.08	0.42	0.13	0.45	0.32	0.43	0.33	0.49	0.42	0.28	0.12	0.18	0.14	0.03	0.04	0.00	0.01
P	0.14	0.26	0.11	0.09	0.24	0.02	0.30	0.04	0.32	0.26	0.30	0.22	0.36	0.32	0.20	0.10	0.12	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.26	0.20	0.19	0.23	0.20	0.28	0.27	0.31	0.27	0.29	0.26	0.23	0.30	0.23	0.28	0.19	0.22	0.10	0.35	0.04	0.13	0.04
C2	0.21	0.30	0.24	0.16	0.18	0.20	0.16	0.22	0.23	0.15	0.27	0.34	0.27	0.17	0.15	0.31	0.23	0.20	0.14	0.25	0.09	0.21	0.07
C2'	0.22	0.24	0.18	0.20	0.25	0.18	0.31	0.28	0.32	0.33	0.28	0.22	0.21	0.36	0.25	0.24	0.19	0.21	0.12	0.37	0.06	0.17	0.08
C3'	0.17	0.24	0.21	0.19	0.24	0.14	0.32	0.21	0.35	0.30	0.30	0.22	0.20	0.37	0.21	0.17	0.19	0.19	0.07	0.42	0.03	0.07	0.02
C4	0.22	0.28	0.19	0.16	0.19	0.19	0.21	0.21	0.28	0.17	0.30	0.31	0.24	0.19	0.17	0.25	0.17	0.21	0.14	0.31	0.07	0.19	0.07
C4'	0.20	0.24	0.20	0.19	0.23	0.15	0.30	0.24	0.34	0.28	0.30	0.23	0.21	0.34	0.21	0.19	0.19	0.20	0.07	0.42	0.08	0.08	0.05
C5	0.22	0.28	0.20	0.20	0.16	0.22	0.13	0.22	0.24	0.20	0.29	0.31	0.22	0.15	0.17	0.24	0.20	0.25	0.20	0.29	0.13	0.24	0.14
C5'	0.20	0.30	0.25	0.19	0.27	0.14	0.35	0.19	0.41	0.28	0.37	0.29	0.25	0.37	0.22	0.20	0.19	0.20	0.12	0.50	0.15	0.20	0.12
C6	0.22	0.29	0.21	0.21	0.17	0.23	0.14	0.23	0.20	0.25	0.29	0.35	0.24	0.23	0.20	0.25	0.23	0.26	0.20	0.24	0.14	0.26	0.14
C8	0.22	0.26	0.22	0.20	0.17	0.21	0.20	0.21	0.29	0.16	0.30	0.28	0.21	0.16	0.16	0.24	0.20	0.25	0.20	0.36	0.16	0.23	0.17
N1	0.21	0.30	0.21	0.18	0.16	0.21	0.14	0.22	0.20	0.20	0.28	0.37	0.25	0.21	0.17	0.26	0.23	0.23	0.17	0.25	0.11	0.23	0.10
N3	0.24	0.29	0.23	0.17	0.22	0.20	0.23	0.25	0.27	0.19	0.29	0.31	0.27	0.22	0.20	0.32	0.21	0.20	0.13	0.29	0.08	0.18	0.06
N6	0.25	0.29	0.24	0.26	0.22	0.27	0.22	0.27	0.22	0.32	0.29	0.36	0.24	0.33	0.25	0.30	0.27	0.29	0.24	0.25	0.19	0.29	0.19
N7	0.23	0.26	0.23	0.23	0.15	0.25	0.14	0.24	0.25	0.21	0.29	0.30	0.20	0.12	0.18	0.27	0.23	0.28	0.24	0.32	0.19	0.28	0.19
N9	0.23	0.27	0.19	0.17	0.20	0.19	0.24	0.21	0.30	0.19	0.30	0.28	0.23	0.23	0.18	0.24	0.17	0.22	0.13	0.35	0.08	0.17	0.08
O2'	0.34	0.29	0.28	0.30	0.31	0.30	0.35	0.42	0.34	0.39	0.31	0.28	0.29	0.39	0.34	0.42	0.29	0.33	0.22	0.37	0.10	0.16	0.11
O3'	0.16	0.22	0.23	0.22	0.23	0.13	0.32	0.22	0.34	0.32	0.28	0.20	0.19	0.38	0.22	0.16	0.24	0.18	0.02	0.41	0.03	0.02	0.01
O4'	0.23	0.26	0.19	0.18	0.22	0.17	0.27	0.25	0.32	0.24	0.30	0.26	0.22	0.29	0.21	0.24	0.18	0.21	0.09	0.38	0.06	0.10	0.03
O5'	0.24	0.40	0.35	0.25	0.33	0.21	0.42	0.24	0.50	0.30	0.47	0.39	0.33	0.40	0.27	0.32	0.26	0.25	0.20	0.59	0.24	0.27	0.20
OP1	0.35	0.53	0.53	0.37	0.47	0.29	0.56	0.30	0.65	0.43	0.61	0.53	0.46	0.54	0.40	0.51	0.36	0.30	0.32	0.74	0.31	0.41	0.29
OP2	0.38	0.60	0.52	0.37	0.50	0.30	0.58	0.29	0.68	0.42	0.67	0.61	0.52	0.53	0.42	0.55	0.38	0.34	0.30	0.76	0.30	0.32	0.25
P	0.28	0.47	0.43	0.29	0.39	0.23	0.48	0.24	0.58	0.34	0.55	0.47	0.40	0.46	0.32	0.42	0.30	0.26	0.24	0.68	0.24	0.30	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.15	0.01	0.10	0.04	0.12	0.22	0.09
C2	0.04	0.00	0.22	0.22	0.03	0.06	0.01	0.09	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.22	0.10	0.21	0.03	0.18	0.36	0.21
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.13	0.03	0.09	0.09	0.12	0.12	0.17	0.26	0.22	0.10	0.05	0.00	0.02	0.01	0.27	0.13	0.28	0.38	0.27
C3'	0.02	0.22	0.01	0.00	0.19	0.00	0.22	0.02	0.24	0.20	0.24	0.23	0.19	0.23	0.15	0.02	0.01	0.02	0.23	0.27	0.20	0.25	0.20
C4	0.02	0.03	0.13	0.19	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.12	0.06	0.22	0.01	0.18	0.33	0.21
C4'	0.01	0.06	0.03	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.14	0.06	0.08	0.06	0.13	0.06	0.19	0.03	0.00	0.04	0.12	0.14	0.16	0.05
C5	0.02	0.01	0.09	0.22	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.21	0.14	0.05	0.29	0.03	0.28	0.43	0.31
C5'	0.04	0.09	0.09	0.02	0.09	0.01	0.15	0.00	0.15	0.19	0.11	0.10	0.08	0.20	0.10	0.11	0.11	0.02	0.02	0.18	0.12	0.17	0.03
C6	0.02	0.03	0.12	0.24	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.22	0.17	0.06	0.31	0.01	0.31	0.47	0.34
C8	0.02	0.03	0.12	0.20	0.01	0.14	0.02	0.19	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.23	0.15	0.07	0.30	0.04	0.26	0.35	0.29
N1	0.03	0.01	0.17	0.24	0.03	0.06	0.01	0.11	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.16	0.19	0.08	0.26	0.01	0.25	0.42	0.28
N2	0.03	0.01	0.26	0.23	0.02	0.08	0.02	0.10	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.27	0.12	0.19	0.03	0.16	0.34	0.19
N3	0.04	0.01	0.22	0.19	0.01	0.06	0.03	0.08	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.12	0.20	0.11	0.18	0.04	0.15	0.31	0.17
N7	0.02	0.01	0.10	0.23	0.01	0.13	0.01	0.20	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.26	0.17	0.06	0.34	0.06	0.34	0.46	0.37
N9	0.01	0.03	0.05	0.15	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.13	0.05	0.03	0.20	0.03	0.16	0.28	0.17
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.14	0.19	0.21	0.11	0.22	0.23	0.16	0.16	0.12	0.26	0.13	0.00	0.06	0.13	0.16	0.26	0.23	0.35	0.19
O3'	0.15	0.22	0.02	0.01	0.12	0.03	0.14	0.11	0.17	0.15	0.19	0.27	0.20	0.17	0.05	0.06	0.00	0.10	0.27	0.21	0.28	0.31	0.26
O4'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.02	0.06	0.07	0.08	0.12	0.11	0.06	0.03	0.13	0.10	0.00	0.11	0.07	0.18	0.22	0.13
O5'	0.10	0.21	0.27	0.23	0.22	0.04	0.29	0.02	0.31	0.30	0.26	0.19	0.18	0.34	0.20	0.16	0.27	0.11	0.00	0.35	0.02	0.03	0.01
O6	0.04	0.03	0.13	0.27	0.01	0.12	0.03	0.18	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.06	0.03	0.26	0.21	0.07	0.35	0.00	0.38	0.54	0.41
OP1	0.12	0.18	0.28	0.20	0.18	0.14	0.28	0.12	0.31	0.26	0.25	0.16	0.15	0.34	0.16	0.23	0.28	0.18	0.02	0.38	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.36	0.38	0.25	0.33	0.16	0.43	0.17	0.47	0.35	0.42	0.34	0.31	0.46	0.28	0.35	0.31	0.22	0.03	0.54	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.21	0.27	0.20	0.21	0.05	0.31	0.03	0.34	0.29	0.28	0.19	0.17	0.37	0.17	0.19	0.26	0.13	0.01	0.41	0.01	0.01	0.00