Doublet Group distance statistics: 52025

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 3, 4, 9, 3, 6, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.016, 0.025, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.023, 0.032, 0.042, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.032 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.017, 0.029, 0.040, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.029 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.025, 0.039, 0.053, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.039 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.023, 0.037, 0.051, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.024, 0.043, 0.061, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.043 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.032, 0.050, 0.069, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.050 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.037, 0.056, 0.076, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.056 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.012, 0.032, 0.053, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.032 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.030, 0.052, 0.074, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.052 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.058, 0.091, 0.125, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.091 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.122, 0.213, 0.304, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.213 std_dev=0.091
C2'	A	0, 0.046, 0.204, 0.362, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.204 std_dev=0.158
N3	B	0, 0.298, 0.488, 0.677, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.488 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.196, 0.393, 0.590, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.393 std_dev=0.197
C8	B	0, 0.236, 0.452, 0.667, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.452 std_dev=0.216
C3'	A	0, 0.206, 0.422, 0.639, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.422 std_dev=0.217
C4'	A	0, 0.341, 0.559, 0.776, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.559 std_dev=0.217
N9	B	0, 0.231, 0.451, 0.671, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.451 std_dev=0.220
C5	B	0, 0.184, 0.406, 0.627, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.406 std_dev=0.221
N7	B	0, 0.221, 0.463, 0.705, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.463 std_dev=0.242
C2	B	0, 0.252, 0.506, 0.761, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.506 std_dev=0.255
O2'	A	0, 0.197, 0.466, 0.736, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.466 std_dev=0.270
C1'	B	0, 0.415, 0.688, 0.960, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.688 std_dev=0.273
O5'	B	0, 0.279, 0.569, 0.858, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.569 std_dev=0.289
C6	B	0, 0.208, 0.503, 0.798, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.503 std_dev=0.295
O4'	B	0, 0.475, 0.777, 1.079, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.777 std_dev=0.302
N1	B	0, 0.203, 0.506, 0.810, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.506 std_dev=0.303
N2	B	0, 0.302, 0.625, 0.949, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.625 std_dev=0.323
O3'	A	0, 0.215, 0.555, 0.895, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.555 std_dev=0.340
P	B	0, 0.305, 0.659, 1.013, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.659 std_dev=0.354
C4'	B	0, 0.573, 0.934, 1.295, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.934 std_dev=0.361
C2'	B	0, 0.576, 0.939, 1.302, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.939 std_dev=0.363
C5'	B	0, 0.556, 0.930, 1.304, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.930 std_dev=0.374
OP2	B	0, 0.425, 0.805, 1.184, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.805 std_dev=0.380
O5'	A	0, 0.872, 1.256, 1.641, 2.124 max_d=2.124 avg_d=1.256 std_dev=0.385
O6	B	0, 0.340, 0.726, 1.112, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.726 std_dev=0.386
C5'	A	0, 0.667, 1.072, 1.477, 2.268 max_d=2.268 avg_d=1.072 std_dev=0.405
C3'	B	0, 0.551, 0.956, 1.362, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.956 std_dev=0.406
O2'	B	0, 0.763, 1.183, 1.602, 1.937 max_d=1.937 avg_d=1.183 std_dev=0.420
OP1	B	0, 0.319, 0.820, 1.320, 2.215 max_d=2.215 avg_d=0.820 std_dev=0.501
O3'	B	0, 0.687, 1.206, 1.726, 2.215 max_d=2.215 avg_d=1.206 std_dev=0.519
P	A	0, 1.225, 1.802, 2.379, 2.824 max_d=2.824 avg_d=1.802 std_dev=0.577
OP2	A	0, 1.063, 1.978, 2.893, 5.110 max_d=5.110 avg_d=1.978 std_dev=0.915
OP1	A	0, 1.079, 2.155, 3.231, 4.437 max_d=4.437 avg_d=2.155 std_dev=1.076

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.25	0.27	0.26	0.15
C2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.18	0.05	0.47	0.71	0.71	0.49
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.06	0.08	0.10	0.14	0.05	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.22	0.26	0.29	0.13
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.05	0.09	0.17	0.11	0.13	0.10	0.15	0.07	0.02	0.01	0.01	0.26	0.36	0.30	0.19
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.03	0.49	0.67	0.67	0.49
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.13	0.06	0.06	0.10	0.12	0.06	0.07	0.02	0.00	0.02	0.30	0.29	0.17
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.60	0.88	0.93	0.69
C5'	0.05	0.16	0.04	0.05	0.16	0.01	0.22	0.00	0.23	0.23	0.20	0.13	0.27	0.26	0.15	0.05	0.04	0.02	0.01	0.35	0.29	0.03
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.61	0.96	1.01	0.73
C8	0.01	0.01	0.08	0.17	0.01	0.13	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.18	0.03	0.61	0.77	0.80	0.65
N1	0.04	0.00	0.10	0.11	0.02	0.06	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.14	0.04	0.55	0.87	0.90	0.63
N3	0.04	0.01	0.14	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.17	0.05	0.42	0.58	0.57	0.39
N6	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.10	0.01	0.27	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.11	0.04	0.66	1.10	1.18	0.86
N7	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.12	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.16	0.03	0.66	0.96	1.03	0.80
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.46	0.55	0.55	0.42
O2'	0.02	0.18	0.01	0.02	0.09	0.07	0.06	0.05	0.09	0.05	0.14	0.17	0.08	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.10	0.27	0.34	0.22
O3'	0.02	0.18	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.10	0.18	0.14	0.17	0.11	0.16	0.06	0.05	0.00	0.03	0.24	0.44	0.32	0.18
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.05	0.03	0.00	0.19	0.24	0.28	0.16
O5'	0.25	0.47	0.22	0.26	0.49	0.02	0.60	0.01	0.61	0.61	0.55	0.42	0.66	0.66	0.46	0.10	0.24	0.19	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.27	0.71	0.26	0.36	0.67	0.30	0.88	0.35	0.96	0.77	0.87	0.58	1.10	0.96	0.55	0.27	0.44	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.71	0.29	0.30	0.67	0.29	0.93	0.29	1.01	0.80	0.90	0.57	1.18	1.03	0.55	0.34	0.32	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.49	0.13	0.19	0.49	0.17	0.69	0.03	0.73	0.65	0.63	0.39	0.86	0.80	0.42	0.22	0.18	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.32	0.19	0.18	0.25	0.21	0.27	0.25	0.31	0.23	0.31	0.35	0.30	0.30	0.20	0.24	0.20	0.21	0.14	0.35	0.06	0.12	0.05
C2	0.22	0.34	0.21	0.24	0.20	0.29	0.22	0.33	0.26	0.27	0.31	0.41	0.28	0.26	0.20	0.22	0.24	0.29	0.25	0.27	0.24	0.21	0.20
C2'	0.21	0.28	0.19	0.20	0.24	0.21	0.26	0.27	0.28	0.24	0.28	0.30	0.27	0.28	0.22	0.21	0.21	0.20	0.15	0.29	0.10	0.10	0.07
C3'	0.15	0.22	0.11	0.13	0.20	0.10	0.24	0.15	0.25	0.22	0.24	0.23	0.21	0.27	0.18	0.13	0.15	0.14	0.07	0.28	0.03	0.08	0.04
C4	0.12	0.33	0.11	0.12	0.22	0.16	0.26	0.21	0.30	0.22	0.33	0.38	0.29	0.28	0.14	0.15	0.12	0.14	0.16	0.33	0.11	0.18	0.10
C4'	0.16	0.25	0.11	0.12	0.21	0.13	0.26	0.16	0.29	0.23	0.27	0.27	0.23	0.30	0.18	0.16	0.14	0.16	0.06	0.34	0.07	0.14	0.07
C5	0.13	0.33	0.12	0.12	0.19	0.16	0.22	0.18	0.30	0.19	0.33	0.37	0.27	0.23	0.11	0.14	0.12	0.16	0.18	0.33	0.13	0.24	0.14
C5'	0.24	0.34	0.19	0.18	0.32	0.15	0.38	0.15	0.40	0.33	0.37	0.34	0.31	0.41	0.28	0.21	0.19	0.21	0.14	0.45	0.18	0.26	0.17
C6	0.17	0.33	0.17	0.17	0.16	0.20	0.18	0.21	0.26	0.23	0.32	0.39	0.25	0.23	0.15	0.18	0.17	0.21	0.19	0.29	0.15	0.24	0.14
C8	0.18	0.31	0.16	0.17	0.22	0.19	0.25	0.21	0.32	0.17	0.33	0.35	0.27	0.24	0.16	0.19	0.17	0.20	0.23	0.38	0.21	0.31	0.22
N1	0.23	0.33	0.22	0.23	0.17	0.27	0.19	0.28	0.24	0.26	0.31	0.41	0.26	0.24	0.19	0.23	0.23	0.28	0.23	0.26	0.20	0.22	0.16
N3	0.15	0.34	0.15	0.18	0.23	0.23	0.25	0.30	0.28	0.27	0.31	0.40	0.30	0.29	0.18	0.17	0.19	0.21	0.22	0.30	0.21	0.19	0.17
N6	0.20	0.31	0.20	0.20	0.15	0.21	0.17	0.21	0.24	0.24	0.31	0.38	0.23	0.24	0.18	0.20	0.20	0.22	0.21	0.29	0.17	0.28	0.17
N7	0.15	0.31	0.14	0.15	0.19	0.17	0.22	0.19	0.31	0.17	0.33	0.35	0.26	0.21	0.14	0.16	0.15	0.18	0.23	0.37	0.21	0.33	0.22
N9	0.17	0.32	0.15	0.14	0.24	0.17	0.27	0.20	0.32	0.20	0.33	0.36	0.29	0.29	0.17	0.19	0.14	0.17	0.16	0.36	0.09	0.19	0.10
O2'	0.27	0.30	0.27	0.29	0.27	0.31	0.26	0.37	0.28	0.25	0.29	0.33	0.30	0.27	0.25	0.30	0.32	0.27	0.19	0.29	0.16	0.08	0.11
O3'	0.15	0.20	0.12	0.15	0.19	0.12	0.21	0.15	0.22	0.21	0.21	0.20	0.19	0.23	0.18	0.13	0.18	0.16	0.03	0.23	0.02	0.02	0.01
O4'	0.17	0.30	0.15	0.15	0.24	0.17	0.30	0.20	0.34	0.24	0.32	0.33	0.27	0.34	0.19	0.20	0.16	0.18	0.09	0.40	0.05	0.14	0.05
O5'	0.46	0.64	0.48	0.47	0.60	0.36	0.67	0.31	0.71	0.58	0.69	0.64	0.60	0.68	0.54	0.44	0.46	0.40	0.38	0.76	0.29	0.40	0.31
OP1	0.76	1.22	0.82	0.79	1.09	0.57	1.24	0.51	1.39	0.98	1.35	1.22	1.10	1.20	0.93	0.73	0.79	0.59	0.65	1.51	0.56	0.84	0.60
OP2	0.85	1.29	0.93	0.87	1.17	0.66	1.31	0.55	1.44	1.05	1.40	1.29	1.17	1.27	1.01	0.83	0.85	0.69	0.65	1.56	0.47	0.74	0.51
P	0.55	0.92	0.60	0.58	0.82	0.39	0.95	0.31	1.06	0.76	1.02	0.91	0.82	0.94	0.70	0.52	0.56	0.42	0.43	1.17	0.28	0.58	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.03	0.09	0.18	0.09
C2	0.04	0.00	0.11	0.14	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.04	0.16	0.01	0.13	0.23	0.14
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.06	0.10	0.13	0.11	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.13	0.13	0.07
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.11	0.09	0.13	0.16	0.12	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.16	0.11	0.18	0.14	0.12
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.16	0.02	0.12	0.22	0.14
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.05	0.03	0.06	0.02	0.01	0.02	0.05	0.10	0.14	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.02	0.18	0.02	0.14	0.24	0.17
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.09	0.01	0.11	0.00	0.11	0.10	0.11	0.11	0.09	0.11	0.07	0.06	0.03	0.02	0.01	0.12	0.11	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.15	0.03	0.18	0.01	0.15	0.25	0.17
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.19	0.03	0.15	0.22	0.16
N1	0.03	0.01	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.17	0.04	0.18	0.01	0.14	0.24	0.16
N2	0.05	0.01	0.13	0.16	0.02	0.07	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.21	0.05	0.16	0.02	0.13	0.23	0.14
N3	0.03	0.01	0.11	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.04	0.14	0.01	0.11	0.21	0.13
N7	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.05	0.00	0.11	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.20	0.03	0.16	0.25	0.18
N9	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.15	0.02	0.11	0.21	0.13
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.06	0.07	0.06	0.09	0.04	0.12	0.15	0.11	0.05	0.03	0.00	0.03	0.06	0.05	0.09	0.12	0.14	0.05
O3'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.10	0.02	0.12	0.03	0.15	0.11	0.17	0.21	0.15	0.12	0.05	0.03	0.00	0.02	0.18	0.16	0.25	0.19	0.18
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.03	0.11	0.21	0.12
O5'	0.09	0.16	0.11	0.16	0.16	0.02	0.18	0.01	0.18	0.19	0.18	0.16	0.14	0.20	0.15	0.05	0.18	0.11	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.08	0.11	0.02	0.05	0.02	0.12	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.16	0.03	0.19	0.00	0.17	0.26	0.19
OP1	0.09	0.13	0.13	0.18	0.12	0.10	0.14	0.11	0.15	0.15	0.14	0.13	0.11	0.16	0.11	0.12	0.25	0.11	0.02	0.17	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.23	0.13	0.14	0.22	0.14	0.24	0.16	0.25	0.22	0.24	0.23	0.21	0.25	0.21	0.14	0.19	0.21	0.02	0.26	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.07	0.12	0.14	0.02	0.17	0.02	0.17	0.16	0.16	0.14	0.13	0.18	0.13	0.05	0.18	0.12	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00