Doublet Group distance statistics: 52026

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 5, 4, 4, 5, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.023, 0.043, 0.062, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.043 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.027, 0.050, 0.072, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.050 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.031, 0.057, 0.083, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.057 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.129, 0.243, 0.358, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.243 std_dev=0.114
O4'	A	0, 0.091, 0.207, 0.323, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.207 std_dev=0.116
O2'	A	0, 0.212, 0.347, 0.481, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.347 std_dev=0.134
C8	B	0, 0.270, 0.456, 0.641, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.456 std_dev=0.186
C3'	A	0, 0.208, 0.400, 0.592, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.400 std_dev=0.192
C4	B	0, 0.245, 0.442, 0.639, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.442 std_dev=0.197
N7	B	0, 0.297, 0.494, 0.691, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.494 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.143, 0.344, 0.544, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.344 std_dev=0.200
C5	B	0, 0.238, 0.442, 0.647, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.442 std_dev=0.205
N9	B	0, 0.217, 0.430, 0.643, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.430 std_dev=0.213
O4'	B	0, 0.311, 0.528, 0.744, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.528 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.346, 0.578, 0.810, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.578 std_dev=0.232
C2	B	0, 0.394, 0.643, 0.893, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.643 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.314, 0.565, 0.816, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.565 std_dev=0.251
C6	B	0, 0.271, 0.535, 0.798, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.535 std_dev=0.263
C4'	B	0, 0.369, 0.640, 0.911, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.640 std_dev=0.271
N1	B	0, 0.327, 0.599, 0.870, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.599 std_dev=0.271
O3'	A	0, 0.315, 0.598, 0.880, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.598 std_dev=0.282
C5'	B	0, 0.398, 0.694, 0.989, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.694 std_dev=0.295
N2	B	0, 0.500, 0.827, 1.153, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.827 std_dev=0.326
O6	B	0, 0.328, 0.656, 0.984, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.656 std_dev=0.328
C2'	B	0, 0.387, 0.738, 1.088, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.738 std_dev=0.350
C3'	B	0, 0.379, 0.729, 1.080, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.729 std_dev=0.351
C5'	A	0, 0.262, 0.633, 1.003, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.633 std_dev=0.371
O2'	B	0, 0.467, 0.904, 1.341, 1.940 max_d=1.940 avg_d=0.904 std_dev=0.437
O3'	B	0, 0.438, 0.901, 1.364, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.901 std_dev=0.463
O5'	A	0, 0.195, 0.917, 1.639, 2.704 max_d=2.704 avg_d=0.917 std_dev=0.722
P	A	0, 0.428, 1.197, 1.966, 2.946 max_d=2.946 avg_d=1.197 std_dev=0.769
OP2	A	0, 0.603, 1.494, 2.386, 3.226 max_d=3.226 avg_d=1.494 std_dev=0.891
O5'	B	0, 0.094, 1.013, 1.932, 3.400 max_d=3.400 avg_d=1.013 std_dev=0.919
OP1	A	0, 0.643, 1.609, 2.576, 3.955 max_d=3.955 avg_d=1.609 std_dev=0.967
P	B	0, -0.290, 1.284, 2.858, 5.494 max_d=5.494 avg_d=1.284 std_dev=1.574
OP1	B	0, -0.230, 1.424, 3.078, 5.790 max_d=5.790 avg_d=1.424 std_dev=1.654
OP2	B	0, -0.429, 1.473, 3.374, 6.615 max_d=6.615 avg_d=1.473 std_dev=1.902

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.18	0.27	0.22	0.19
C2	0.02	0.00	0.16	0.18	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.21	0.04	0.42	0.47	0.57	0.44
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.02	0.07	0.09	0.12	0.17	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.27	0.34	0.26	0.27
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.02	0.13	0.16	0.16	0.17	0.13	0.14	0.07	0.01	0.01	0.01	0.37	0.47	0.28	0.34
C4	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.11	0.02	0.45	0.48	0.53	0.44
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.10	0.11	0.09	0.07	0.11	0.12	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.22	0.26	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.02	0.58	0.62	0.72	0.58
C5'	0.03	0.16	0.02	0.02	0.16	0.00	0.22	0.00	0.23	0.22	0.20	0.13	0.26	0.25	0.14	0.05	0.03	0.01	0.01	0.27	0.38	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.13	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.59	0.65	0.79	0.61
C8	0.01	0.01	0.09	0.16	0.00	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.05	0.60	0.59	0.60	0.55
N1	0.02	0.00	0.12	0.16	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.17	0.03	0.52	0.57	0.71	0.54
N3	0.02	0.00	0.17	0.17	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.20	0.04	0.35	0.40	0.47	0.37
N6	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.11	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.66	0.75	0.91	0.70
N7	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.12	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.04	0.67	0.70	0.80	0.66
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.42	0.43	0.43	0.38
O2'	0.02	0.17	0.00	0.01	0.09	0.05	0.06	0.05	0.09	0.05	0.13	0.16	0.08	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.10	0.29	0.22	0.15
O3'	0.02	0.21	0.01	0.01	0.11	0.02	0.11	0.03	0.13	0.18	0.17	0.20	0.14	0.17	0.07	0.04	0.00	0.02	0.31	0.60	0.36	0.36
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.26	0.27	0.15
O5'	0.18	0.42	0.27	0.37	0.45	0.01	0.58	0.01	0.59	0.60	0.52	0.35	0.66	0.67	0.42	0.10	0.31	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.27	0.47	0.34	0.47	0.48	0.22	0.62	0.27	0.65	0.59	0.57	0.40	0.75	0.70	0.43	0.29	0.60	0.26	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.57	0.26	0.28	0.53	0.26	0.72	0.38	0.79	0.60	0.71	0.47	0.91	0.80	0.43	0.22	0.36	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.44	0.27	0.34	0.44	0.07	0.58	0.01	0.61	0.55	0.54	0.37	0.70	0.66	0.38	0.15	0.36	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.26	0.21	0.17	0.19	0.22	0.23	0.19	0.27	0.22	0.27	0.30	0.24	0.27	0.18	0.28	0.19	0.23	0.55	0.33	0.71	0.22	0.62
C2	0.27	0.32	0.29	0.26	0.21	0.27	0.21	0.28	0.23	0.27	0.27	0.40	0.28	0.25	0.23	0.35	0.30	0.26	0.16	0.24	0.15	0.37	0.19
C2'	0.24	0.22	0.22	0.19	0.19	0.23	0.21	0.21	0.23	0.25	0.22	0.25	0.22	0.26	0.19	0.27	0.21	0.25	0.52	0.27	0.67	0.09	0.55
C3'	0.27	0.24	0.23	0.17	0.22	0.22	0.22	0.17	0.24	0.22	0.23	0.26	0.25	0.25	0.22	0.25	0.17	0.30	0.67	0.28	1.02	0.57	0.99
C4	0.19	0.30	0.19	0.14	0.19	0.13	0.21	0.14	0.25	0.24	0.28	0.35	0.26	0.25	0.17	0.24	0.14	0.14	0.42	0.28	0.42	0.19	0.36
C4'	0.27	0.31	0.24	0.19	0.28	0.22	0.32	0.18	0.35	0.28	0.34	0.33	0.29	0.34	0.26	0.25	0.18	0.29	0.68	0.41	1.12	0.70	1.05
C5	0.14	0.30	0.15	0.13	0.15	0.11	0.18	0.15	0.25	0.21	0.29	0.36	0.24	0.22	0.12	0.19	0.11	0.12	0.52	0.27	0.52	0.43	0.50
C5'	0.41	0.49	0.40	0.33	0.47	0.31	0.52	0.23	0.55	0.47	0.52	0.49	0.47	0.54	0.44	0.36	0.30	0.39	0.79	0.60	1.31	1.13	1.28
C6	0.17	0.32	0.19	0.17	0.14	0.15	0.17	0.17	0.23	0.22	0.29	0.40	0.24	0.22	0.15	0.22	0.15	0.16	0.40	0.25	0.33	0.30	0.32
C8	0.18	0.27	0.16	0.18	0.15	0.19	0.19	0.23	0.28	0.19	0.29	0.31	0.21	0.21	0.13	0.19	0.18	0.20	0.78	0.33	0.91	0.81	0.91
N1	0.24	0.32	0.26	0.23	0.18	0.23	0.18	0.24	0.22	0.25	0.28	0.41	0.26	0.22	0.20	0.31	0.25	0.23	0.22	0.23	0.13	0.21	0.13
N3	0.25	0.31	0.26	0.22	0.22	0.23	0.22	0.24	0.24	0.28	0.28	0.37	0.28	0.27	0.22	0.32	0.25	0.22	0.21	0.26	0.18	0.32	0.13
N6	0.18	0.32	0.19	0.19	0.13	0.16	0.17	0.18	0.23	0.22	0.30	0.42	0.22	0.22	0.16	0.21	0.17	0.17	0.46	0.26	0.40	0.46	0.41
N7	0.15	0.28	0.14	0.18	0.14	0.16	0.18	0.21	0.27	0.20	0.30	0.33	0.21	0.21	0.12	0.16	0.16	0.16	0.73	0.31	0.80	0.79	0.81
N9	0.19	0.28	0.17	0.14	0.18	0.16	0.22	0.16	0.27	0.21	0.28	0.32	0.24	0.25	0.15	0.23	0.13	0.18	0.59	0.31	0.69	0.40	0.64
O2'	0.31	0.26	0.32	0.31	0.23	0.34	0.23	0.30	0.24	0.27	0.24	0.29	0.26	0.27	0.25	0.39	0.33	0.32	0.36	0.27	0.50	0.46	0.26
O3'	0.26	0.19	0.23	0.20	0.19	0.25	0.19	0.21	0.20	0.20	0.18	0.21	0.21	0.23	0.20	0.24	0.20	0.30	0.61	0.24	1.14	0.46	1.06
O4'	0.22	0.30	0.18	0.13	0.23	0.19	0.28	0.16	0.34	0.22	0.33	0.33	0.26	0.30	0.19	0.24	0.14	0.23	0.63	0.41	0.95	0.53	0.88
O5'	0.70	0.67	0.69	0.67	0.71	0.63	0.71	0.57	0.69	0.75	0.67	0.66	0.69	0.75	0.72	0.67	0.66	0.66	1.18	0.67	1.50	1.40	1.53
OP1	0.70	0.76	0.73	0.76	0.74	0.71	0.79	0.74	0.83	0.75	0.80	0.75	0.73	0.80	0.72	0.71	0.80	0.68	1.31	0.88	1.83	1.83	1.80
OP2	0.69	0.86	0.73	0.71	0.81	0.62	0.86	0.58	0.91	0.76	0.89	0.86	0.82	0.84	0.75	0.70	0.73	0.61	1.22	0.94	1.62	1.71	1.62
P	0.67	0.69	0.68	0.67	0.71	0.62	0.74	0.58	0.74	0.73	0.71	0.68	0.69	0.77	0.70	0.66	0.68	0.63	1.23	0.75	1.63	1.64	1.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.29	0.01	0.20	0.20	0.17
C2	0.02	0.00	0.12	0.17	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.19	0.06	0.48	0.01	0.43	0.66	0.47
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.08	0.04	0.11	0.14	0.12	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.08	0.09	0.16	0.06
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.14	0.00	0.17	0.01	0.19	0.13	0.19	0.17	0.14	0.17	0.10	0.02	0.01	0.01	0.10	0.20	0.15	0.12	0.06
C4	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.15	0.03	0.52	0.01	0.49	0.65	0.52
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.05	0.05	0.04	0.12	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.10	0.07	0.23	0.13
C5	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.20	0.03	0.64	0.01	0.69	0.91	0.73
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.15	0.17	0.10	0.05	0.05	0.19	0.09	0.06	0.04	0.01	0.01	0.18	0.26	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.23	0.04	0.65	0.00	0.73	1.00	0.77
C8	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.15	0.04	0.65	0.01	0.68	0.80	0.72
N1	0.02	0.00	0.11	0.19	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.22	0.05	0.57	0.01	0.59	0.86	0.64
N2	0.03	0.00	0.14	0.17	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.07	0.42	0.01	0.35	0.58	0.38
N3	0.02	0.00	0.12	0.14	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.05	0.42	0.01	0.36	0.53	0.38
N7	0.01	0.01	0.04	0.17	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.20	0.03	0.71	0.01	0.81	1.02	0.86
N9	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.49	0.01	0.46	0.53	0.46
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.07	0.04	0.09	0.13	0.10	0.04	0.03	0.00	0.04	0.06	0.09	0.07	0.26	0.22	0.30
O3'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.15	0.03	0.20	0.04	0.23	0.15	0.22	0.19	0.15	0.20	0.10	0.04	0.00	0.02	0.18	0.25	0.21	0.14	0.22
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.07	0.05	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.25	0.03	0.21	0.16	0.14
O5'	0.29	0.48	0.15	0.10	0.52	0.02	0.64	0.01	0.65	0.65	0.57	0.42	0.42	0.71	0.49	0.09	0.18	0.25	0.00	0.71	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.20	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.25	0.03	0.71	0.00	0.84	1.15	0.89
OP1	0.20	0.43	0.09	0.15	0.49	0.07	0.69	0.26	0.73	0.68	0.59	0.35	0.36	0.81	0.46	0.26	0.21	0.21	0.02	0.84	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.66	0.16	0.12	0.65	0.23	0.91	0.28	1.00	0.80	0.86	0.58	0.53	1.02	0.53	0.22	0.14	0.16	0.02	1.15	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.47	0.06	0.06	0.52	0.13	0.73	0.01	0.77	0.72	0.64	0.38	0.38	0.86	0.46	0.30	0.22	0.14	0.00	0.89	0.01	0.01	0.00