Doublet Group distance statistics: 52027

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 3, 3, 3, 3, 5, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.001, 0.012, 0.022, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.001, 0.012, 0.022, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.010 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C5	B	0, 0.160, 0.338, 0.516, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.338 std_dev=0.178
N7	B	0, 0.165, 0.358, 0.552, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.358 std_dev=0.193
C6	B	0, 0.260, 0.465, 0.670, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.465 std_dev=0.205
C4	B	0, 0.263, 0.476, 0.689, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.476 std_dev=0.213
C8	B	0, 0.238, 0.479, 0.721, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.479 std_dev=0.241
N9	B	0, 0.294, 0.548, 0.801, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.548 std_dev=0.253
O6	B	0, 0.287, 0.553, 0.819, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.553 std_dev=0.266
N1	B	0, 0.345, 0.627, 0.910, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.627 std_dev=0.283
N3	B	0, 0.361, 0.650, 0.938, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.650 std_dev=0.289
C2	B	0, 0.381, 0.698, 1.016, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.698 std_dev=0.318
C1'	B	0, 0.418, 0.795, 1.173, 1.997 max_d=1.997 avg_d=0.795 std_dev=0.378
C2'	B	0, 0.173, 0.573, 0.972, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.573 std_dev=0.400
N2	B	0, 0.479, 0.914, 1.350, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.914 std_dev=0.435
O4'	A	0, 0.032, 0.470, 0.909, 2.072 max_d=2.072 avg_d=0.470 std_dev=0.438
C2'	A	0, 0.055, 0.525, 0.994, 2.240 max_d=2.240 avg_d=0.525 std_dev=0.469
O4'	B	0, 0.721, 1.240, 1.760, 2.766 max_d=2.766 avg_d=1.240 std_dev=0.519
O2'	A	0, 0.101, 0.711, 1.321, 2.603 max_d=2.603 avg_d=0.711 std_dev=0.610
C4'	A	0, 0.056, 0.709, 1.363, 3.067 max_d=3.067 avg_d=0.709 std_dev=0.653
C4'	B	0, 0.886, 1.557, 2.228, 3.331 max_d=3.331 avg_d=1.557 std_dev=0.671
C3'	B	0, 0.900, 1.572, 2.244, 2.881 max_d=2.881 avg_d=1.572 std_dev=0.672
O2'	B	0, 1.409, 2.090, 2.771, 3.457 max_d=3.457 avg_d=2.090 std_dev=0.681
O5'	B	0, 0.822, 1.509, 2.196, 3.489 max_d=3.489 avg_d=1.509 std_dev=0.687
C3'	A	0, 0.118, 0.812, 1.505, 3.481 max_d=3.481 avg_d=0.812 std_dev=0.693
C5'	B	0, 0.958, 1.686, 2.414, 3.822 max_d=3.822 avg_d=1.686 std_dev=0.728
OP2	B	0, 1.037, 1.805, 2.574, 3.881 max_d=3.881 avg_d=1.805 std_dev=0.769
P	B	0, 0.819, 1.655, 2.492, 4.405 max_d=4.405 avg_d=1.655 std_dev=0.836
O5'	A	0, 1.108, 1.995, 2.883, 5.197 max_d=5.197 avg_d=1.995 std_dev=0.888
O3'	B	0, 1.914, 2.851, 3.788, 4.433 max_d=4.433 avg_d=2.851 std_dev=0.937
O3'	A	0, 0.178, 1.159, 2.140, 5.183 max_d=5.183 avg_d=1.159 std_dev=0.981
C5'	A	0, 0.169, 1.245, 2.321, 5.346 max_d=5.346 avg_d=1.245 std_dev=1.076
OP1	B	0, 1.040, 2.292, 3.543, 6.912 max_d=6.912 avg_d=2.292 std_dev=1.252
P	A	0, 2.312, 3.585, 4.857, 7.735 max_d=7.735 avg_d=3.585 std_dev=1.273
OP1	A	0, 2.034, 3.596, 5.159, 6.984 max_d=6.984 avg_d=3.596 std_dev=1.563
OP2	A	0, 4.066, 5.660, 7.254, 9.330 max_d=9.330 avg_d=5.660 std_dev=1.594

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.14	0.31	0.20	0.14
C2	0.03	0.00	0.28	0.21	0.01	0.11	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.29	0.25	0.21	0.41	0.71	0.54	0.47
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.15	0.02	0.07	0.10	0.13	0.15	0.22	0.28	0.09	0.08	0.02	0.00	0.04	0.01	0.19	0.23	0.33	0.22
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.16	0.00	0.19	0.02	0.21	0.20	0.21	0.18	0.22	0.21	0.13	0.02	0.01	0.02	0.20	0.25	0.15	0.16
C4	0.01	0.01	0.15	0.16	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.13	0.11	0.39	0.67	0.46	0.40
C4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.13	0.10	0.10	0.10	0.12	0.06	0.16	0.03	0.00	0.02	0.15	0.19	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.13	0.05	0.49	0.85	0.61	0.51
C5'	0.05	0.24	0.10	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.20	0.22	0.23	0.21	0.21	0.22	0.12	0.08	0.11	0.02	0.01	0.23	0.29	0.02
C6	0.01	0.01	0.13	0.21	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.15	0.09	0.51	0.91	0.67	0.56
C8	0.02	0.01	0.15	0.20	0.01	0.13	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.22	0.20	0.13	0.50	0.77	0.51	0.48
N1	0.02	0.00	0.22	0.21	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.20	0.16	0.48	0.84	0.63	0.53
N3	0.03	0.00	0.28	0.18	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.24	0.21	0.35	0.61	0.44	0.39
N6	0.02	0.01	0.09	0.22	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.19	0.17	0.06	0.56	1.01	0.76	0.62
N7	0.01	0.01	0.08	0.21	0.00	0.12	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.21	0.19	0.08	0.55	0.93	0.66	0.57
N9	0.01	0.02	0.02	0.13	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.08	0.01	0.34	0.57	0.35	0.32
O2'	0.02	0.29	0.00	0.02	0.15	0.16	0.16	0.08	0.18	0.22	0.24	0.28	0.19	0.21	0.10	0.00	0.08	0.12	0.14	0.19	0.37	0.19
O3'	0.14	0.25	0.04	0.01	0.13	0.03	0.13	0.11	0.15	0.20	0.20	0.24	0.17	0.19	0.08	0.08	0.00	0.10	0.21	0.44	0.20	0.22
O4'	0.00	0.21	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.02	0.09	0.13	0.16	0.21	0.06	0.08	0.01	0.12	0.10	0.00	0.15	0.29	0.22	0.16
O5'	0.14	0.41	0.19	0.20	0.39	0.02	0.49	0.01	0.51	0.50	0.48	0.35	0.56	0.55	0.34	0.14	0.21	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.31	0.71	0.23	0.25	0.67	0.15	0.85	0.23	0.91	0.77	0.84	0.61	1.01	0.93	0.57	0.19	0.44	0.29	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.54	0.33	0.15	0.46	0.19	0.61	0.29	0.67	0.51	0.63	0.44	0.76	0.66	0.35	0.37	0.20	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.47	0.22	0.16	0.40	0.03	0.51	0.02	0.56	0.48	0.53	0.39	0.62	0.57	0.32	0.19	0.22	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.18	0.33	0.29	0.13	0.34	0.15	0.27	0.19	0.20	0.18	0.23	0.19	0.22	0.16	0.47	0.35	0.32	0.25	0.25	0.16	0.20	0.20
C2	0.27	0.23	0.30	0.25	0.10	0.27	0.12	0.26	0.19	0.22	0.23	0.29	0.19	0.19	0.18	0.38	0.29	0.26	0.26	0.23	0.29	0.23	0.18
C2'	0.25	0.30	0.21	0.17	0.28	0.19	0.31	0.18	0.32	0.30	0.31	0.31	0.29	0.34	0.26	0.26	0.16	0.25	0.27	0.35	0.21	0.24	0.25
C3'	0.31	0.41	0.31	0.35	0.42	0.26	0.50	0.33	0.50	0.50	0.46	0.39	0.39	0.55	0.40	0.24	0.30	0.30	0.52	0.54	0.59	0.33	0.63
C4	0.29	0.20	0.28	0.24	0.12	0.27	0.13	0.25	0.19	0.20	0.19	0.24	0.19	0.20	0.17	0.37	0.26	0.28	0.23	0.24	0.29	0.23	0.13
C4'	0.19	0.23	0.17	0.16	0.22	0.14	0.33	0.23	0.36	0.33	0.28	0.24	0.21	0.43	0.20	0.33	0.17	0.18	0.40	0.44	0.64	0.38	0.63
C5	0.29	0.20	0.26	0.24	0.14	0.28	0.11	0.29	0.19	0.22	0.21	0.24	0.19	0.19	0.20	0.33	0.25	0.30	0.30	0.25	0.51	0.35	0.27
C5'	0.23	0.32	0.22	0.26	0.31	0.19	0.44	0.32	0.48	0.43	0.39	0.32	0.28	0.55	0.28	0.33	0.25	0.21	0.52	0.59	0.81	0.65	0.80
C6	0.26	0.23	0.25	0.22	0.15	0.25	0.13	0.27	0.19	0.22	0.23	0.28	0.21	0.20	0.21	0.30	0.23	0.26	0.30	0.26	0.56	0.36	0.29
C8	0.33	0.18	0.30	0.31	0.13	0.38	0.12	0.38	0.19	0.20	0.19	0.21	0.17	0.17	0.20	0.38	0.34	0.39	0.34	0.27	0.48	0.40	0.30
N1	0.26	0.23	0.27	0.23	0.13	0.25	0.11	0.24	0.19	0.20	0.23	0.29	0.21	0.18	0.19	0.34	0.25	0.25	0.25	0.26	0.43	0.29	0.21
N3	0.27	0.22	0.30	0.24	0.11	0.25	0.14	0.25	0.19	0.23	0.21	0.27	0.20	0.21	0.16	0.40	0.28	0.25	0.26	0.23	0.23	0.19	0.18
N6	0.26	0.27	0.23	0.23	0.19	0.26	0.17	0.29	0.21	0.24	0.26	0.33	0.24	0.23	0.22	0.28	0.23	0.27	0.36	0.29	0.72	0.44	0.39
N7	0.31	0.19	0.27	0.30	0.14	0.35	0.12	0.38	0.20	0.24	0.21	0.23	0.18	0.18	0.22	0.33	0.31	0.36	0.38	0.27	0.64	0.46	0.39
N9	0.32	0.18	0.31	0.28	0.12	0.33	0.13	0.29	0.19	0.19	0.18	0.22	0.18	0.20	0.18	0.41	0.31	0.34	0.23	0.25	0.24	0.23	0.12
O2'	0.26	0.32	0.26	0.28	0.32	0.24	0.40	0.27	0.40	0.43	0.36	0.31	0.29	0.47	0.31	0.29	0.30	0.23	0.36	0.45	0.32	0.54	0.32
O3'	0.42	0.45	0.47	0.57	0.49	0.47	0.55	0.60	0.54	0.58	0.50	0.42	0.44	0.61	0.49	0.34	0.54	0.42	0.78	0.58	0.95	0.45	0.92
O4'	0.33	0.22	0.34	0.23	0.14	0.27	0.15	0.15	0.19	0.16	0.17	0.28	0.24	0.24	0.15	0.54	0.30	0.30	0.21	0.29	0.33	0.19	0.37
O5'	0.41	0.65	0.43	0.47	0.62	0.33	0.76	0.39	0.82	0.67	0.75	0.64	0.59	0.83	0.55	0.41	0.45	0.34	0.57	0.93	0.69	0.72	0.76
OP1	0.58	1.02	0.61	0.66	0.91	0.47	1.09	0.56	1.22	0.88	1.16	1.02	0.89	1.10	0.77	0.53	0.67	0.45	0.80	1.37	1.05	0.99	1.02
OP2	0.43	0.75	0.48	0.51	0.67	0.33	0.82	0.36	0.92	0.66	0.85	0.74	0.65	0.85	0.56	0.42	0.51	0.33	0.56	1.06	0.61	0.75	0.70
P	0.43	0.72	0.45	0.49	0.66	0.33	0.82	0.40	0.91	0.69	0.83	0.72	0.64	0.88	0.57	0.42	0.49	0.34	0.61	1.04	0.74	0.81	0.81

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.12	0.02	0.20	0.16	0.13
C2	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.04	0.26	0.01	0.51	0.37	0.29
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.07	0.06	0.10	0.14	0.11	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.07	0.20	0.16	0.14
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.12	0.12	0.13	0.16	0.12	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.19	0.12	0.23	0.13	0.16
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.02	0.27	0.02	0.49	0.34	0.29
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.12	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.02	0.34	0.02	0.63	0.44	0.37
C5'	0.03	0.08	0.03	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.14	0.16	0.11	0.07	0.07	0.17	0.09	0.05	0.04	0.01	0.01	0.16	0.21	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.35	0.01	0.69	0.49	0.40
C8	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.04	0.33	0.03	0.54	0.36	0.34
N1	0.02	0.01	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.03	0.31	0.01	0.62	0.44	0.36
N2	0.04	0.00	0.14	0.16	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.20	0.05	0.24	0.02	0.48	0.35	0.27
N3	0.03	0.01	0.11	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.23	0.01	0.43	0.31	0.25
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.37	0.03	0.68	0.47	0.41
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.24	0.02	0.40	0.27	0.24
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.05	0.11	0.14	0.11	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.07	0.09	0.10	0.15	0.08
O3'	0.04	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.04	0.14	0.13	0.16	0.20	0.14	0.14	0.06	0.05	0.00	0.03	0.19	0.15	0.30	0.17	0.17
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.05	0.03	0.00	0.09	0.04	0.13	0.19	0.11
O5'	0.12	0.26	0.15	0.19	0.27	0.02	0.34	0.01	0.35	0.33	0.31	0.24	0.23	0.37	0.24	0.07	0.19	0.09	0.00	0.38	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.02	0.07	0.02	0.16	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.15	0.04	0.38	0.00	0.76	0.55	0.45
OP1	0.20	0.51	0.20	0.23	0.49	0.12	0.63	0.21	0.69	0.54	0.62	0.48	0.43	0.68	0.40	0.10	0.30	0.13	0.02	0.76	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.37	0.16	0.13	0.34	0.17	0.44	0.25	0.49	0.36	0.44	0.35	0.31	0.47	0.27	0.15	0.17	0.19	0.02	0.55	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.29	0.14	0.16	0.29	0.03	0.37	0.02	0.40	0.34	0.36	0.27	0.25	0.41	0.24	0.08	0.17	0.11	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00