Doublet Group distance statistics: 52032

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.017
O4'	A	0, 0.053, 0.242, 0.432, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.242 std_dev=0.190
C2'	A	0, 0.082, 0.276, 0.470, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.276 std_dev=0.194
N9	B	0, 0.124, 0.349, 0.575, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.349 std_dev=0.225
C8	B	0, 0.141, 0.369, 0.597, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.369 std_dev=0.228
C4'	A	0, 0.132, 0.365, 0.598, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.365 std_dev=0.233
C1'	B	0, 0.250, 0.487, 0.724, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.487 std_dev=0.237
O2'	A	0, 0.175, 0.422, 0.668, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.422 std_dev=0.247
C3'	A	0, 0.137, 0.417, 0.697, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.417 std_dev=0.280
C4	B	0, 0.091, 0.372, 0.654, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.372 std_dev=0.282
O4'	B	0, 0.236, 0.523, 0.810, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.523 std_dev=0.287
N7	B	0, 0.148, 0.447, 0.746, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.447 std_dev=0.299
N3	B	0, 0.155, 0.459, 0.763, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.459 std_dev=0.304
C5	B	0, 0.105, 0.429, 0.754, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.429 std_dev=0.324
O3'	A	0, 0.251, 0.609, 0.966, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.609 std_dev=0.358
C2	B	0, 0.161, 0.529, 0.897, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.529 std_dev=0.368
P	B	0, 0.299, 0.702, 1.104, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.702 std_dev=0.402
C6	B	0, 0.125, 0.541, 0.958, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.541 std_dev=0.417
OP1	B	0, 0.306, 0.724, 1.142, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.724 std_dev=0.418
C5'	A	0, 0.225, 0.648, 1.072, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.648 std_dev=0.424
N2	B	0, 0.210, 0.637, 1.063, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.637 std_dev=0.427
N1	B	0, 0.121, 0.553, 0.985, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.553 std_dev=0.432
OP2	B	0, 0.397, 0.842, 1.288, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.842 std_dev=0.445
O5'	B	0, 0.267, 0.726, 1.185, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.726 std_dev=0.459
C2'	B	0, 0.263, 0.730, 1.197, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.730 std_dev=0.467
C5'	B	0, 0.243, 0.739, 1.234, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.739 std_dev=0.495
O6	B	0, 0.167, 0.664, 1.162, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.664 std_dev=0.498
C4'	B	0, 0.192, 0.715, 1.239, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.715 std_dev=0.524
O5'	A	0, 0.205, 0.757, 1.309, 1.898 max_d=1.898 avg_d=0.757 std_dev=0.552
C3'	B	0, 0.408, 1.069, 1.731, 2.045 max_d=2.045 avg_d=1.069 std_dev=0.662
OP1	A	0, 0.632, 1.299, 1.966, 2.030 max_d=2.030 avg_d=1.299 std_dev=0.667
P	A	0, 0.425, 1.166, 1.908, 2.612 max_d=2.612 avg_d=1.166 std_dev=0.742
O2'	B	0, 0.796, 1.687, 2.578, 3.079 max_d=3.079 avg_d=1.687 std_dev=0.891
O3'	B	0, 0.732, 1.887, 3.041, 3.342 max_d=3.342 avg_d=1.887 std_dev=1.154
OP2	A	0, 0.679, 1.928, 3.176, 3.798 max_d=3.798 avg_d=1.928 std_dev=1.248

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.54	0.19	0.16
C2	0.03	0.00	0.16	0.15	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.19	0.06	0.19	0.86	0.53	0.27
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.05	0.03	0.08	0.08	0.13	0.16	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.21	0.13	0.08
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.10	0.13	0.13	0.14	0.09	0.11	0.06	0.03	0.01	0.02	0.08	0.17	0.13	0.08
C4	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.09	0.03	0.19	0.84	0.51	0.27
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.03	0.04	0.07	0.09	0.04	0.07	0.03	0.00	0.02	0.10	0.22	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.02	0.24	0.98	0.67	0.34
C5'	0.03	0.06	0.03	0.03	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.18	0.10	0.04	0.17	0.19	0.10	0.07	0.05	0.02	0.01	0.15	0.40	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.03	0.25	1.03	0.72	0.36
C8	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.14	0.07	0.25	0.92	0.59	0.33
N1	0.02	0.01	0.13	0.13	0.01	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.16	0.04	0.22	0.96	0.65	0.32
N3	0.03	0.00	0.16	0.14	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.17	0.06	0.16	0.77	0.44	0.23
N6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.11	0.03	0.28	1.10	0.83	0.41
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.13	0.05	0.27	1.04	0.75	0.38
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.03	0.17	0.76	0.42	0.24
O2'	0.01	0.19	0.00	0.03	0.10	0.07	0.07	0.07	0.11	0.05	0.16	0.18	0.09	0.05	0.03	0.00	0.07	0.05	0.06	0.15	0.09	0.06
O3'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.09	0.03	0.09	0.05	0.11	0.14	0.16	0.17	0.11	0.13	0.05	0.07	0.00	0.02	0.12	0.47	0.31	0.16
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.07	0.04	0.06	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.09	0.54	0.14	0.17
O5'	0.10	0.19	0.06	0.08	0.19	0.02	0.24	0.01	0.25	0.25	0.22	0.16	0.28	0.27	0.17	0.06	0.12	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.54	0.86	0.21	0.17	0.84	0.10	0.98	0.15	1.03	0.92	0.96	0.77	1.10	1.04	0.76	0.15	0.47	0.54	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.53	0.13	0.13	0.51	0.22	0.67	0.40	0.72	0.59	0.65	0.44	0.83	0.75	0.42	0.09	0.31	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.27	0.08	0.08	0.27	0.04	0.34	0.02	0.36	0.33	0.32	0.23	0.41	0.38	0.24	0.06	0.16	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.30	0.17	0.23	0.21	0.21	0.18	0.35	0.21	0.15	0.26	0.35	0.29	0.19	0.17	0.28	0.22	0.17	0.25	0.21	0.05	0.09	0.07
C2	0.29	0.31	0.36	0.26	0.25	0.26	0.32	0.29	0.36	0.28	0.31	0.38	0.30	0.35	0.24	0.53	0.48	0.25	0.19	0.42	0.16	0.24	0.16
C2'	0.24	0.29	0.19	0.22	0.22	0.18	0.17	0.35	0.18	0.15	0.24	0.33	0.30	0.16	0.19	0.27	0.23	0.17	0.29	0.16	0.10	0.11	0.13
C3'	0.32	0.32	0.26	0.09	0.29	0.12	0.25	0.13	0.24	0.24	0.28	0.35	0.33	0.22	0.28	0.27	0.13	0.29	0.08	0.21	0.06	0.07	0.02
C4	0.22	0.32	0.22	0.18	0.20	0.18	0.23	0.29	0.25	0.23	0.26	0.39	0.30	0.30	0.16	0.35	0.22	0.17	0.22	0.30	0.11	0.20	0.12
C4'	0.28	0.35	0.23	0.11	0.31	0.11	0.30	0.18	0.31	0.27	0.33	0.37	0.34	0.29	0.28	0.24	0.15	0.23	0.06	0.30	0.13	0.24	0.10
C5	0.18	0.34	0.19	0.18	0.17	0.15	0.23	0.27	0.26	0.23	0.27	0.44	0.30	0.33	0.13	0.31	0.17	0.14	0.24	0.35	0.15	0.26	0.17
C5'	0.36	0.44	0.33	0.12	0.42	0.16	0.45	0.10	0.46	0.41	0.45	0.45	0.42	0.45	0.39	0.32	0.15	0.31	0.14	0.47	0.23	0.40	0.20
C6	0.20	0.33	0.25	0.18	0.19	0.15	0.29	0.24	0.35	0.26	0.29	0.47	0.29	0.37	0.17	0.38	0.27	0.16	0.22	0.47	0.15	0.28	0.17
C8	0.17	0.35	0.09	0.26	0.20	0.18	0.16	0.32	0.22	0.15	0.30	0.41	0.30	0.21	0.12	0.19	0.19	0.13	0.31	0.22	0.19	0.26	0.21
N1	0.25	0.32	0.34	0.23	0.24	0.21	0.33	0.25	0.40	0.28	0.33	0.44	0.30	0.37	0.22	0.49	0.42	0.21	0.19	0.48	0.15	0.26	0.16
N3	0.28	0.29	0.31	0.23	0.22	0.26	0.27	0.31	0.29	0.26	0.27	0.35	0.29	0.32	0.22	0.47	0.39	0.24	0.20	0.34	0.14	0.21	0.14
N6	0.18	0.32	0.24	0.21	0.17	0.14	0.28	0.23	0.36	0.26	0.27	0.50	0.26	0.37	0.16	0.36	0.24	0.15	0.24	0.53	0.19	0.32	0.21
N7	0.15	0.36	0.11	0.24	0.18	0.16	0.16	0.29	0.21	0.19	0.31	0.45	0.30	0.27	0.11	0.22	0.14	0.12	0.29	0.27	0.21	0.30	0.22
N9	0.20	0.32	0.14	0.21	0.20	0.18	0.18	0.32	0.21	0.17	0.27	0.38	0.30	0.23	0.14	0.26	0.16	0.14	0.26	0.23	0.10	0.17	0.12
O2'	0.31	0.31	0.31	0.37	0.25	0.36	0.20	0.51	0.20	0.20	0.25	0.35	0.32	0.19	0.24	0.42	0.39	0.29	0.39	0.18	0.16	0.13	0.20
O3'	0.33	0.30	0.30	0.10	0.27	0.17	0.22	0.09	0.21	0.22	0.25	0.32	0.31	0.19	0.27	0.26	0.17	0.35	0.01	0.17	0.05	0.02	0.01
O4'	0.25	0.35	0.19	0.16	0.28	0.14	0.27	0.26	0.29	0.21	0.33	0.39	0.33	0.25	0.23	0.25	0.17	0.18	0.13	0.29	0.09	0.19	0.05
O5'	0.41	0.54	0.39	0.18	0.51	0.18	0.54	0.13	0.57	0.48	0.56	0.54	0.51	0.54	0.46	0.42	0.18	0.33	0.14	0.57	0.22	0.31	0.17
OP1	0.49	1.02	0.34	0.32	0.79	0.22	0.87	0.37	1.05	0.53	1.10	1.09	0.87	0.71	0.59	0.41	0.44	0.35	0.39	1.12	0.66	0.49	0.50
OP2	0.33	0.60	0.46	0.39	0.48	0.29	0.55	0.35	0.68	0.39	0.68	0.62	0.50	0.49	0.38	0.48	0.46	0.27	0.36	0.77	0.71	0.57	0.51
P	0.45	0.66	0.46	0.26	0.59	0.21	0.65	0.18	0.71	0.54	0.71	0.67	0.60	0.63	0.52	0.51	0.29	0.35	0.22	0.75	0.30	0.36	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.21	0.01	0.09	0.01	0.11	0.20	0.17
C2	0.03	0.00	0.17	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.27	0.09	0.05	0.01	0.11	0.20	0.15
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.13	0.07	0.11	0.12	0.20	0.17	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.28	0.05	0.28	0.38	0.30
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.13	0.01	0.19	0.05	0.19	0.23	0.15	0.11	0.10	0.23	0.14	0.03	0.01	0.02	0.17	0.21	0.25	0.24	0.18
C4	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.14	0.04	0.05	0.01	0.10	0.20	0.14
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.12	0.03	0.07	0.04	0.11	0.05	0.20	0.02	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.19	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.08	0.01	0.08	0.01	0.10	0.20	0.13
C5'	0.04	0.05	0.13	0.05	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.10	0.04	0.07	0.05	0.10	0.04	0.09	0.15	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.19	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.10	0.03	0.08	0.01	0.11	0.20	0.13
C8	0.01	0.01	0.11	0.23	0.01	0.12	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.15	0.08	0.09	0.01	0.10	0.19	0.13
N1	0.02	0.01	0.12	0.15	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.18	0.06	0.06	0.01	0.10	0.20	0.14
N2	0.04	0.00	0.20	0.11	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.34	0.12	0.06	0.01	0.11	0.20	0.16
N3	0.03	0.00	0.17	0.10	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.27	0.09	0.05	0.02	0.11	0.20	0.16
N7	0.01	0.01	0.08	0.23	0.00	0.11	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.28	0.15	0.06	0.11	0.01	0.11	0.20	0.13
N9	0.00	0.01	0.03	0.14	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.19	0.14
O2'	0.02	0.15	0.00	0.03	0.15	0.20	0.23	0.09	0.23	0.24	0.18	0.16	0.13	0.28	0.14	0.00	0.08	0.14	0.21	0.26	0.20	0.39	0.23
O3'	0.21	0.27	0.03	0.01	0.14	0.02	0.08	0.15	0.10	0.15	0.18	0.34	0.27	0.15	0.09	0.08	0.00	0.15	0.27	0.10	0.49	0.40	0.35
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.06	0.12	0.09	0.06	0.01	0.14	0.15	0.00	0.09	0.02	0.17	0.19	0.20
O5'	0.09	0.05	0.28	0.17	0.05	0.02	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06	0.06	0.05	0.11	0.04	0.21	0.27	0.09	0.00	0.11	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.21	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.26	0.10	0.02	0.11	0.00	0.12	0.20	0.13
OP1	0.11	0.11	0.28	0.25	0.10	0.05	0.10	0.05	0.11	0.10	0.10	0.11	0.11	0.11	0.09	0.20	0.49	0.17	0.02	0.12	0.00	0.03	0.01
OP2	0.20	0.20	0.38	0.24	0.20	0.03	0.20	0.02	0.20	0.19	0.20	0.20	0.20	0.20	0.19	0.39	0.40	0.19	0.02	0.20	0.03	0.00	0.00
P	0.17	0.15	0.30	0.18	0.14	0.05	0.13	0.01	0.13	0.13	0.14	0.16	0.16	0.13	0.14	0.23	0.35	0.20	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00