Doublet Group distance statistics: 52033

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 4, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.011, 0.025, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.013, 0.027, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.018, 0.036, 0.054, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.036 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.125, 0.228, 0.330, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.228 std_dev=0.103
C2'	A	0, 0.088, 0.225, 0.361, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.225 std_dev=0.137
C5	B	0, 0.152, 0.297, 0.443, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.297 std_dev=0.145
N7	B	0, 0.117, 0.270, 0.423, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.270 std_dev=0.153
O2'	A	0, 0.129, 0.300, 0.471, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.300 std_dev=0.171
C8	B	0, 0.181, 0.354, 0.526, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.354 std_dev=0.173
C6	B	0, 0.210, 0.383, 0.556, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.383 std_dev=0.173
C3'	A	0, 0.263, 0.447, 0.631, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.447 std_dev=0.184
C4'	A	0, 0.263, 0.451, 0.638, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.451 std_dev=0.188
C4	B	0, 0.233, 0.435, 0.638, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.435 std_dev=0.203
O6	B	0, 0.307, 0.524, 0.740, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.524 std_dev=0.217
N9	B	0, 0.250, 0.484, 0.717, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.484 std_dev=0.233
N1	B	0, 0.211, 0.449, 0.688, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.449 std_dev=0.238
N3	B	0, 0.314, 0.590, 0.866, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.590 std_dev=0.276
C2	B	0, 0.259, 0.543, 0.827, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.543 std_dev=0.284
O5'	B	0, 0.375, 0.662, 0.949, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.662 std_dev=0.287
O3'	A	0, 0.375, 0.663, 0.952, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.663 std_dev=0.289
P	B	0, 0.404, 0.707, 1.009, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.707 std_dev=0.302
C1'	B	0, 0.419, 0.727, 1.035, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.727 std_dev=0.308
O4'	B	0, 0.526, 0.847, 1.168, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.847 std_dev=0.321
C5'	A	0, 0.440, 0.774, 1.108, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.774 std_dev=0.334
N2	B	0, 0.281, 0.679, 1.077, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.679 std_dev=0.398
C2'	B	0, 0.454, 0.860, 1.266, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.860 std_dev=0.406
C3'	B	0, 0.611, 1.048, 1.484, 1.474 max_d=1.474 avg_d=1.048 std_dev=0.436
C4'	B	0, 0.651, 1.095, 1.538, 1.612 max_d=1.612 avg_d=1.095 std_dev=0.443
OP2	B	0, 0.456, 0.909, 1.363, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.909 std_dev=0.454
O2'	B	0, 0.559, 1.016, 1.473, 1.575 max_d=1.575 avg_d=1.016 std_dev=0.457
O3'	B	0, 0.759, 1.293, 1.827, 1.814 max_d=1.814 avg_d=1.293 std_dev=0.534
OP1	B	0, 0.442, 0.994, 1.546, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.994 std_dev=0.552
P	A	0, 0.660, 1.242, 1.823, 1.980 max_d=1.980 avg_d=1.242 std_dev=0.582
OP2	A	0, 0.654, 1.313, 1.972, 2.235 max_d=2.235 avg_d=1.313 std_dev=0.659
O5'	A	0, 0.447, 1.113, 1.779, 2.421 max_d=2.421 avg_d=1.113 std_dev=0.666
C5'	B	0, 0.620, 1.300, 1.981, 2.217 max_d=2.217 avg_d=1.300 std_dev=0.681
OP1	A	0, 0.540, 1.417, 2.294, 3.151 max_d=3.151 avg_d=1.417 std_dev=0.877

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.08	0.44	0.19
C2	0.03	0.00	0.11	0.20	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.26	0.03	0.36	0.28	0.49	0.31
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.05	0.09	0.08	0.13	0.06	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01	0.21	0.23	0.29	0.06
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.12	0.01	0.11	0.03	0.14	0.11	0.17	0.19	0.14	0.11	0.06	0.03	0.01	0.01	0.31	0.38	0.23	0.14
C4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.14	0.01	0.33	0.24	0.46	0.28
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.09	0.08	0.07	0.10	0.10	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.14	0.39	0.09
C5	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.01	0.41	0.33	0.48	0.35
C5'	0.03	0.15	0.02	0.03	0.14	0.01	0.18	0.00	0.20	0.16	0.18	0.13	0.22	0.20	0.11	0.05	0.09	0.02	0.02	0.21	0.40	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.17	0.02	0.44	0.37	0.52	0.39
C8	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.03	0.36	0.25	0.42	0.28
N1	0.03	0.00	0.08	0.17	0.01	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.22	0.03	0.42	0.34	0.51	0.36
N3	0.03	0.00	0.13	0.19	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.24	0.03	0.30	0.22	0.46	0.27
N6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.02	0.47	0.44	0.55	0.43
N7	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.03	0.43	0.34	0.46	0.36
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.27	0.18	0.43	0.23
O2'	0.02	0.07	0.00	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.02	0.00	0.05	0.07	0.08	0.20	0.36	0.09
O3'	0.02	0.26	0.03	0.01	0.14	0.03	0.12	0.09	0.17	0.12	0.22	0.24	0.17	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.27	0.54	0.26	0.22
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.10	0.14	0.52	0.27
O5'	0.10	0.36	0.21	0.31	0.33	0.02	0.41	0.02	0.44	0.36	0.42	0.30	0.47	0.43	0.27	0.08	0.27	0.10	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.08	0.28	0.23	0.38	0.24	0.14	0.33	0.21	0.37	0.25	0.34	0.22	0.44	0.34	0.18	0.20	0.54	0.14	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.44	0.49	0.29	0.23	0.46	0.39	0.48	0.40	0.52	0.42	0.51	0.46	0.55	0.46	0.43	0.36	0.26	0.52	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.31	0.06	0.14	0.28	0.09	0.35	0.02	0.39	0.28	0.36	0.27	0.43	0.36	0.23	0.09	0.22	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.16	0.30	0.29	0.16	0.29	0.15	0.27	0.18	0.20	0.18	0.17	0.17	0.16	0.22	0.38	0.28	0.31	0.28	0.22	0.05	0.13	0.07
C2	0.22	0.16	0.24	0.21	0.12	0.21	0.09	0.23	0.12	0.14	0.15	0.20	0.16	0.11	0.15	0.29	0.22	0.19	0.21	0.14	0.19	0.27	0.16
C2'	0.25	0.13	0.27	0.29	0.15	0.29	0.17	0.32	0.18	0.23	0.16	0.13	0.13	0.21	0.20	0.32	0.28	0.27	0.35	0.21	0.12	0.18	0.16
C3'	0.10	0.19	0.15	0.21	0.16	0.19	0.22	0.24	0.26	0.16	0.24	0.19	0.15	0.24	0.10	0.22	0.19	0.15	0.10	0.31	0.04	0.09	0.02
C4	0.25	0.18	0.24	0.21	0.13	0.21	0.12	0.19	0.18	0.15	0.19	0.20	0.16	0.11	0.17	0.30	0.21	0.22	0.22	0.22	0.09	0.23	0.10
C4'	0.12	0.18	0.13	0.20	0.13	0.19	0.22	0.27	0.27	0.13	0.24	0.18	0.13	0.23	0.07	0.23	0.18	0.17	0.08	0.34	0.18	0.28	0.12
C5	0.21	0.22	0.20	0.17	0.14	0.18	0.14	0.21	0.22	0.15	0.25	0.24	0.18	0.09	0.16	0.24	0.17	0.20	0.27	0.26	0.14	0.28	0.15
C5'	0.13	0.30	0.19	0.28	0.25	0.26	0.35	0.34	0.41	0.24	0.37	0.29	0.23	0.35	0.18	0.23	0.28	0.17	0.15	0.49	0.32	0.48	0.26
C6	0.17	0.25	0.17	0.15	0.14	0.16	0.11	0.23	0.21	0.12	0.27	0.28	0.21	0.05	0.13	0.21	0.16	0.16	0.28	0.23	0.18	0.31	0.18
C8	0.26	0.20	0.23	0.21	0.16	0.23	0.17	0.21	0.24	0.20	0.24	0.21	0.17	0.16	0.20	0.27	0.20	0.27	0.29	0.29	0.12	0.21	0.15
N1	0.18	0.23	0.19	0.18	0.14	0.18	0.10	0.22	0.15	0.13	0.21	0.27	0.21	0.11	0.14	0.24	0.19	0.17	0.26	0.15	0.19	0.30	0.18
N3	0.25	0.14	0.26	0.22	0.11	0.22	0.09	0.23	0.13	0.13	0.15	0.17	0.14	0.11	0.15	0.33	0.23	0.21	0.17	0.16	0.15	0.24	0.12
N6	0.15	0.30	0.15	0.14	0.15	0.15	0.12	0.27	0.25	0.12	0.33	0.33	0.23	0.06	0.12	0.19	0.15	0.14	0.32	0.26	0.21	0.35	0.22
N7	0.22	0.22	0.20	0.17	0.15	0.19	0.17	0.23	0.25	0.18	0.27	0.24	0.18	0.13	0.18	0.23	0.17	0.23	0.30	0.31	0.16	0.28	0.18
N9	0.27	0.17	0.25	0.23	0.14	0.24	0.15	0.20	0.20	0.18	0.20	0.19	0.16	0.14	0.19	0.31	0.23	0.27	0.24	0.24	0.04	0.19	0.07
O2'	0.43	0.23	0.46	0.48	0.28	0.49	0.25	0.56	0.22	0.33	0.21	0.22	0.27	0.27	0.34	0.52	0.49	0.44	0.53	0.22	0.19	0.19	0.22
O3'	0.14	0.23	0.21	0.28	0.22	0.21	0.28	0.28	0.30	0.25	0.27	0.23	0.20	0.31	0.18	0.28	0.25	0.14	0.03	0.34	0.02	0.02	0.01
O4'	0.23	0.16	0.22	0.22	0.12	0.23	0.15	0.26	0.21	0.11	0.20	0.17	0.14	0.14	0.14	0.31	0.20	0.25	0.16	0.28	0.12	0.21	0.06
O5'	0.44	0.71	0.50	0.56	0.68	0.34	0.77	0.37	0.83	0.68	0.79	0.69	0.65	0.79	0.60	0.32	0.49	0.37	0.47	0.88	0.27	0.59	0.38
OP1	0.40	0.60	0.57	0.71	0.57	0.47	0.66	0.57	0.72	0.58	0.67	0.58	0.54	0.68	0.51	0.41	0.73	0.37	0.67	0.80	0.66	0.94	0.70
OP2	0.35	0.69	0.46	0.47	0.59	0.37	0.71	0.42	0.82	0.50	0.79	0.69	0.60	0.67	0.47	0.39	0.47	0.31	0.39	0.92	0.28	0.41	0.28
P	0.27	0.58	0.39	0.45	0.52	0.23	0.62	0.28	0.70	0.48	0.66	0.57	0.50	0.62	0.42	0.24	0.44	0.19	0.41	0.79	0.25	0.56	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.21	0.01	0.21	0.26	0.10
C2	0.04	0.00	0.13	0.16	0.00	0.05	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.18	0.04	0.35	0.01	0.32	0.37	0.26
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.03	0.08	0.08	0.11	0.14	0.13	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.21	0.08	0.29	0.17	0.14
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.05	0.12	0.12	0.14	0.18	0.15	0.12	0.07	0.02	0.00	0.03	0.28	0.13	0.38	0.11	0.20
C4	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.07	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.10	0.02	0.37	0.01	0.32	0.36	0.27
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.15	0.07	0.05	0.04	0.16	0.07	0.04	0.04	0.00	0.03	0.14	0.16	0.32	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.11	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.11	0.04	0.43	0.01	0.38	0.43	0.34
C5'	0.06	0.19	0.03	0.05	0.22	0.01	0.32	0.00	0.33	0.34	0.27	0.15	0.15	0.38	0.21	0.04	0.07	0.02	0.01	0.39	0.27	0.43	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.12	0.00	0.11	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.14	0.03	0.44	0.00	0.39	0.46	0.36
C8	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.15	0.01	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.07	0.44	0.02	0.37	0.38	0.33
N1	0.03	0.01	0.11	0.14	0.01	0.07	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.16	0.03	0.40	0.01	0.36	0.43	0.32
N2	0.04	0.00	0.14	0.18	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.21	0.06	0.32	0.02	0.30	0.36	0.24
N3	0.04	0.00	0.13	0.15	0.00	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.16	0.05	0.32	0.00	0.30	0.34	0.23
N7	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.16	0.00	0.38	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.14	0.07	0.47	0.02	0.41	0.45	0.38
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.02	0.35	0.01	0.30	0.32	0.24
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.12	0.04	0.11	0.04	0.15	0.06	0.19	0.22	0.19	0.07	0.05	0.00	0.04	0.06	0.06	0.14	0.16	0.22	0.09
O3'	0.02	0.18	0.03	0.00	0.10	0.04	0.11	0.07	0.14	0.13	0.16	0.21	0.16	0.14	0.06	0.04	0.00	0.03	0.17	0.15	0.33	0.10	0.15
O4'	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.02	0.03	0.07	0.03	0.06	0.05	0.07	0.02	0.06	0.03	0.00	0.17	0.05	0.16	0.30	0.07
O5'	0.21	0.35	0.21	0.28	0.37	0.03	0.43	0.01	0.44	0.44	0.40	0.32	0.32	0.47	0.35	0.06	0.17	0.17	0.00	0.46	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.14	0.01	0.39	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.15	0.05	0.46	0.00	0.43	0.50	0.40
OP1	0.21	0.32	0.29	0.38	0.32	0.16	0.38	0.27	0.39	0.37	0.36	0.30	0.30	0.41	0.30	0.16	0.33	0.16	0.02	0.43	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.37	0.17	0.11	0.36	0.32	0.43	0.43	0.46	0.38	0.43	0.36	0.34	0.45	0.32	0.22	0.10	0.30	0.01	0.50	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.26	0.14	0.20	0.27	0.05	0.34	0.01	0.36	0.33	0.32	0.24	0.23	0.38	0.24	0.09	0.15	0.07	0.01	0.40	0.01	0.01	0.00