Doublet Group distance statistics: 52035

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.012, 0.021, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.013, 0.024, 0.034, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.013, 0.025, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.020, 0.034, 0.049, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.034 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.026, 0.046, 0.065, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.046 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.026, 0.047, 0.068, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.047 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.033, 0.057, 0.081, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.057 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.151, 0.380, 0.610, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.380 std_dev=0.229
O4'	A	0, 0.142, 0.397, 0.653, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.397 std_dev=0.256
C4	B	0, 0.344, 0.618, 0.892, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.618 std_dev=0.274
C1'	B	0, 0.322, 0.608, 0.895, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.608 std_dev=0.287
N9	B	0, 0.202, 0.489, 0.776, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.489 std_dev=0.287
C5	B	0, 0.348, 0.654, 0.961, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.654 std_dev=0.307
C8	B	0, 0.088, 0.435, 0.782, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.435 std_dev=0.347
N3	B	0, 0.430, 0.791, 1.151, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.791 std_dev=0.360
N7	B	0, 0.041, 0.425, 0.808, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.425 std_dev=0.383
C6	B	0, 0.543, 0.962, 1.381, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.962 std_dev=0.419
O6	B	0, 0.626, 1.116, 1.607, 1.594 max_d=1.594 avg_d=1.116 std_dev=0.490
C2	B	0, 0.513, 1.030, 1.546, 1.482 max_d=1.482 avg_d=1.030 std_dev=0.517
N1	B	0, 0.590, 1.132, 1.675, 1.617 max_d=1.617 avg_d=1.132 std_dev=0.542
O2'	A	0, 0.447, 1.005, 1.562, 1.449 max_d=1.449 avg_d=1.005 std_dev=0.557
C5'	A	0, 0.366, 0.946, 1.526, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.946 std_dev=0.580
C4'	A	0, 0.373, 0.960, 1.548, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.960 std_dev=0.588
N2	B	0, 0.518, 1.222, 1.926, 1.879 max_d=1.879 avg_d=1.222 std_dev=0.704
O4'	B	0, 0.630, 1.383, 2.135, 2.016 max_d=2.016 avg_d=1.383 std_dev=0.752
C3'	A	0, 0.536, 1.351, 2.166, 1.886 max_d=1.886 avg_d=1.351 std_dev=0.815
C2'	B	0, 0.931, 1.995, 3.059, 2.912 max_d=2.912 avg_d=1.995 std_dev=1.064
O5'	A	0, 0.759, 1.934, 3.109, 2.866 max_d=2.866 avg_d=1.934 std_dev=1.175
P	A	0, 0.868, 2.170, 3.471, 3.348 max_d=3.348 avg_d=2.170 std_dev=1.301
O2'	B	0, 0.995, 2.313, 3.630, 3.646 max_d=3.646 avg_d=2.313 std_dev=1.317
OP2	A	0, 0.944, 2.278, 3.613, 3.448 max_d=3.448 avg_d=2.278 std_dev=1.335
C4'	B	0, 1.043, 2.382, 3.721, 3.415 max_d=3.415 avg_d=2.382 std_dev=1.339
C3'	B	0, 1.164, 2.551, 3.938, 3.559 max_d=3.559 avg_d=2.551 std_dev=1.387
O3'	A	0, 0.950, 2.375, 3.800, 3.351 max_d=3.351 avg_d=2.375 std_dev=1.425
O3'	B	0, 1.257, 2.774, 4.291, 4.186 max_d=4.186 avg_d=2.774 std_dev=1.517
OP1	A	0, 0.821, 2.360, 3.898, 3.877 max_d=3.877 avg_d=2.360 std_dev=1.538
C5'	B	0, 1.429, 3.436, 5.442, 4.939 max_d=4.939 avg_d=3.436 std_dev=2.007
O5'	B	0, 1.857, 4.490, 7.122, 6.359 max_d=6.359 avg_d=4.490 std_dev=2.632
P	B	0, 2.588, 6.424, 10.259, 9.150 max_d=9.150 avg_d=6.424 std_dev=3.835
OP1	B	0, 2.802, 7.115, 11.428, 10.162 max_d=10.162 avg_d=7.115 std_dev=4.313
OP2	B	0, 3.132, 7.727, 12.322, 10.858 max_d=10.858 avg_d=7.727 std_dev=4.595

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.31	0.00	0.13	0.07	0.15	0.12
C2	0.02	0.00	0.14	0.05	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.54	0.13	0.22	0.15	0.45	0.24
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.18	0.08	0.04	0.12	0.13	0.07	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.09	0.11	0.16	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.11	0.00	0.23	0.01	0.19	0.36	0.09	0.06	0.26	0.35	0.18	0.01	0.01	0.03	0.29	0.17	0.27	0.24
C4	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.30	0.07	0.29	0.24	0.45	0.32
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.05	0.21	0.05	0.11	0.09	0.18	0.07	0.23	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04
C5	0.01	0.00	0.06	0.23	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.14	0.03	0.43	0.44	0.65	0.51
C5'	0.06	0.12	0.18	0.01	0.11	0.00	0.17	0.00	0.17	0.23	0.13	0.12	0.21	0.25	0.11	0.05	0.19	0.01	0.00	0.03	0.13	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.19	0.00	0.05	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.22	0.06	0.41	0.43	0.69	0.51
C8	0.01	0.00	0.04	0.36	0.00	0.21	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.14	0.08	0.57	0.51	0.61	0.59
N1	0.01	0.00	0.12	0.09	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.40	0.10	0.31	0.29	0.58	0.38
N3	0.02	0.00	0.13	0.06	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.54	0.13	0.19	0.09	0.36	0.18
N6	0.01	0.00	0.07	0.26	0.00	0.09	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.12	0.04	0.49	0.56	0.81	0.62
N7	0.00	0.00	0.02	0.35	0.00	0.18	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.10	0.05	0.59	0.60	0.77	0.67
N9	0.00	0.00	0.02	0.18	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.15	0.00	0.33	0.25	0.38	0.33
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.17	0.23	0.26	0.05	0.25	0.28	0.19	0.11	0.29	0.31	0.17	0.00	0.04	0.16	0.19	0.07	0.10	0.13
O3'	0.31	0.54	0.03	0.01	0.30	0.01	0.14	0.19	0.22	0.14	0.40	0.54	0.12	0.10	0.15	0.04	0.00	0.18	0.32	0.38	0.37	0.34
O4'	0.00	0.13	0.02	0.03	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.08	0.10	0.13	0.04	0.05	0.00	0.16	0.18	0.00	0.02	0.16	0.07	0.11
O5'	0.13	0.22	0.09	0.29	0.29	0.01	0.43	0.00	0.41	0.57	0.31	0.19	0.49	0.59	0.33	0.19	0.32	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.15	0.11	0.17	0.24	0.05	0.44	0.03	0.43	0.51	0.29	0.09	0.56	0.60	0.25	0.07	0.38	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.45	0.16	0.27	0.45	0.05	0.65	0.13	0.69	0.61	0.58	0.36	0.81	0.77	0.38	0.10	0.37	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.24	0.03	0.24	0.32	0.04	0.51	0.01	0.51	0.59	0.38	0.18	0.62	0.67	0.33	0.13	0.34	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.30	0.49	0.58	0.17	0.70	0.28	1.08	0.39	0.07	0.39	0.31	0.19	0.20	0.03	0.29	0.63	0.41	0.66	0.46	1.26	0.80	0.96
C2	0.16	0.25	0.20	0.56	0.19	0.90	0.20	1.26	0.24	0.15	0.26	0.26	0.22	0.16	0.16	0.55	0.79	0.61	1.06	0.24	2.36	1.32	1.63
C2'	0.24	0.28	0.52	0.50	0.19	0.59	0.32	0.78	0.41	0.11	0.37	0.27	0.19	0.30	0.09	0.46	0.56	0.46	0.55	0.49	0.88	0.87	0.84
C3'	0.38	0.61	0.56	0.65	0.50	0.75	0.67	1.02	0.81	0.43	0.76	0.60	0.48	0.63	0.39	0.54	0.71	0.58	0.86	0.94	1.30	1.27	1.26
C4	0.07	0.32	0.16	0.43	0.19	0.74	0.23	1.10	0.32	0.08	0.36	0.33	0.24	0.15	0.07	0.19	0.59	0.55	0.65	0.34	1.59	0.70	1.03
C4'	0.28	0.49	0.53	0.64	0.33	0.75	0.48	1.10	0.65	0.25	0.63	0.49	0.34	0.40	0.23	0.45	0.71	0.50	0.86	0.78	1.49	1.30	1.31
C5	0.09	0.36	0.09	0.25	0.17	0.63	0.17	0.91	0.28	0.08	0.36	0.39	0.26	0.08	0.06	0.29	0.47	0.56	0.44	0.28	1.42	0.55	0.81
C5'	0.26	0.58	0.52	0.63	0.33	0.76	0.47	1.11	0.70	0.22	0.72	0.62	0.38	0.32	0.19	0.46	0.71	0.50	0.94	0.85	1.66	1.65	1.49
C6	0.12	0.32	0.26	0.26	0.16	0.66	0.13	0.92	0.19	0.08	0.28	0.38	0.26	0.08	0.10	0.55	0.53	0.60	0.51	0.18	1.68	0.60	0.97
C8	0.16	0.37	0.21	0.30	0.14	0.55	0.21	0.81	0.39	0.16	0.44	0.39	0.23	0.08	0.08	0.13	0.41	0.47	0.49	0.42	1.01	0.96	0.78
N1	0.17	0.25	0.29	0.42	0.17	0.80	0.15	1.08	0.18	0.11	0.23	0.29	0.23	0.11	0.14	0.68	0.70	0.63	0.82	0.18	2.13	1.04	1.37
N3	0.10	0.28	0.20	0.59	0.20	0.89	0.24	1.31	0.29	0.14	0.31	0.28	0.22	0.19	0.14	0.31	0.75	0.56	1.02	0.31	2.10	1.14	1.48
N6	0.13	0.32	0.39	0.19	0.12	0.56	0.08	0.78	0.12	0.09	0.23	0.44	0.26	0.08	0.09	0.64	0.46	0.56	0.35	0.11	1.52	0.44	0.79
N7	0.13	0.40	0.06	0.18	0.13	0.51	0.16	0.76	0.33	0.16	0.43	0.44	0.25	0.09	0.09	0.12	0.34	0.50	0.39	0.33	1.03	0.79	0.66
N9	0.12	0.33	0.30	0.43	0.18	0.66	0.25	1.00	0.37	0.07	0.40	0.35	0.22	0.15	0.02	0.12	0.54	0.47	0.54	0.41	1.25	0.73	0.86
O2'	0.53	0.43	1.11	0.91	0.49	0.73	0.54	0.87	0.54	0.60	0.48	0.40	0.44	0.59	0.54	0.96	0.91	0.42	0.43	0.58	0.82	0.50	0.63
O3'	0.39	0.39	0.83	0.90	0.33	0.94	0.60	1.25	0.75	0.41	0.61	0.32	0.24	0.67	0.26	0.81	0.98	0.58	0.98	0.96	1.54	1.13	1.37
O4'	0.20	0.35	0.49	0.61	0.17	0.75	0.27	1.15	0.43	0.11	0.45	0.37	0.21	0.16	0.10	0.31	0.67	0.46	0.81	0.52	1.49	1.13	1.22
O5'	0.48	1.03	0.25	0.50	0.79	0.60	0.94	0.92	1.17	0.63	1.19	1.06	0.84	0.81	0.61	0.25	0.55	0.49	0.94	1.31	1.53	1.80	1.46
OP1	0.38	1.17	0.10	0.33	0.81	0.48	0.99	0.79	1.33	0.50	1.37	1.24	0.90	0.76	0.53	0.12	0.39	0.39	0.78	1.55	1.43	1.74	1.33
OP2	0.55	1.37	0.31	0.47	0.96	0.40	1.06	0.67	1.40	0.60	1.52	1.47	1.10	0.79	0.67	0.31	0.45	0.36	0.91	1.55	1.34	1.96	1.38
P	0.51	1.19	0.22	0.45	0.86	0.54	1.00	0.85	1.30	0.61	1.36	1.26	0.95	0.79	0.63	0.23	0.48	0.47	0.90	1.46	1.46	1.82	1.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.26	0.01	0.30	0.01	0.25	0.35	0.17
C2	0.02	0.00	0.37	0.27	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.12	0.29	0.48	0.00	0.34	0.84	0.33
C2'	0.00	0.37	0.00	0.00	0.21	0.00	0.11	0.16	0.18	0.16	0.30	0.44	0.37	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.14	0.25	0.12	0.05
C3'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.28	0.00	0.36	0.01	0.38	0.30	0.34	0.23	0.22	0.37	0.23	0.01	0.00	0.02	0.02	0.42	0.25	0.15	0.11
C4	0.01	0.00	0.21	0.28	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.15	0.65	0.01	0.05	1.04	0.57
C4'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.00	0.08	0.26	0.02	0.19	0.13	0.24	0.10	0.26	0.01	0.00	0.01	0.13	0.38	0.16	0.17
C5	0.01	0.00	0.11	0.36	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.11	0.05	0.92	0.01	0.36	1.55	0.96
C5'	0.05	0.12	0.16	0.01	0.02	0.00	0.14	0.00	0.11	0.30	0.02	0.21	0.14	0.30	0.08	0.08	0.16	0.01	0.00	0.18	0.06	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.18	0.38	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.12	0.11	0.91	0.00	0.32	1.63	0.96
C8	0.01	0.00	0.16	0.30	0.00	0.26	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.41	0.14	0.18	1.05	0.01	0.62	1.57	1.12
N1	0.01	0.00	0.30	0.34	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.21	0.70	0.00	0.06	1.26	0.65
N2	0.02	0.00	0.44	0.23	0.01	0.19	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.20	0.35	0.32	0.01	0.60	0.58	0.11
N3	0.02	0.00	0.37	0.22	0.00	0.13	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.16	0.29	0.40	0.01	0.40	0.66	0.24
N7	0.00	0.00	0.07	0.37	0.00	0.24	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.20	0.11	1.13	0.01	0.73	1.90	1.29
N9	0.00	0.01	0.03	0.23	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.04	0.00	0.68	0.01	0.12	0.98	0.62
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.05	0.26	0.22	0.08	0.16	0.41	0.04	0.32	0.21	0.40	0.17	0.00	0.03	0.19	0.08	0.24	0.20	0.07	0.05
O3'	0.26	0.12	0.02	0.00	0.04	0.01	0.11	0.16	0.12	0.14	0.05	0.20	0.16	0.20	0.04	0.03	0.00	0.17	0.04	0.18	0.34	0.28	0.18
O4'	0.01	0.29	0.01	0.02	0.15	0.00	0.05	0.01	0.11	0.18	0.21	0.35	0.29	0.11	0.00	0.19	0.17	0.00	0.30	0.06	0.34	0.25	0.14
O5'	0.30	0.48	0.03	0.02	0.65	0.01	0.92	0.00	0.91	1.05	0.70	0.32	0.40	1.13	0.68	0.08	0.04	0.30	0.00	1.04	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.14	0.42	0.01	0.13	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.18	0.06	1.04	0.00	0.53	1.92	1.18
OP1	0.25	0.34	0.25	0.25	0.05	0.38	0.36	0.06	0.32	0.62	0.06	0.60	0.40	0.73	0.12	0.20	0.34	0.34	0.01	0.53	0.00	0.00	0.00
OP2	0.35	0.84	0.12	0.15	1.04	0.16	1.55	0.01	1.63	1.57	1.26	0.58	0.66	1.90	0.98	0.07	0.28	0.25	0.01	1.92	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.33	0.05	0.11	0.57	0.17	0.96	0.00	0.96	1.12	0.65	0.11	0.24	1.29	0.62	0.05	0.18	0.14	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00