Doublet Group distance statistics: 52036

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.015, 0.031, 0.046, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.031 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.020, 0.036, 0.053, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.036 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.020, 0.036, 0.053, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.036 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.017, 0.035, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.035 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.022, 0.043, 0.065, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.043 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.014, 0.036, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.036 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.027, 0.055, 0.082, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.055 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.025, 0.052, 0.080, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.052 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.037, 0.070, 0.102, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.070 std_dev=0.032
C4	B	0, 0.281, 0.570, 0.859, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.570 std_dev=0.289
N3	B	0, 0.346, 0.637, 0.928, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.637 std_dev=0.291
C5	B	0, 0.414, 0.765, 1.116, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.765 std_dev=0.351
C2	B	0, 0.491, 0.914, 1.337, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.914 std_dev=0.423
N9	B	0, 0.235, 0.660, 1.084, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.660 std_dev=0.425
O4'	A	0, 0.131, 0.583, 1.036, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.583 std_dev=0.452
C2'	A	0, 0.010, 0.465, 0.921, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.465 std_dev=0.455
C6	B	0, 0.454, 0.913, 1.371, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.913 std_dev=0.459
N7	B	0, 0.550, 1.013, 1.476, 1.352 max_d=1.352 avg_d=1.013 std_dev=0.463
N1	B	0, 0.531, 1.006, 1.481, 1.443 max_d=1.443 avg_d=1.006 std_dev=0.475
C8	B	0, 0.479, 0.991, 1.503, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.991 std_dev=0.512
C3'	A	0, 0.158, 0.700, 1.241, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.700 std_dev=0.541
C1'	B	0, 0.098, 0.649, 1.199, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.649 std_dev=0.550
O3'	A	0, 0.282, 0.848, 1.414, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.848 std_dev=0.566
N2	B	0, 0.673, 1.252, 1.831, 1.734 max_d=1.734 avg_d=1.252 std_dev=0.579
O4'	B	0, 0.231, 0.816, 1.401, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.816 std_dev=0.585
C2'	B	0, 0.242, 0.833, 1.424, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.833 std_dev=0.591
O6	B	0, 0.521, 1.120, 1.719, 1.749 max_d=1.749 avg_d=1.120 std_dev=0.599
OP2	B	0, 0.384, 1.008, 1.633, 2.087 max_d=2.087 avg_d=1.008 std_dev=0.625
O5'	B	0, 0.375, 1.029, 1.682, 2.191 max_d=2.191 avg_d=1.029 std_dev=0.653
C4'	A	0, 0.084, 0.747, 1.410, 2.082 max_d=2.082 avg_d=0.747 std_dev=0.663
O2'	B	0, 0.217, 0.880, 1.543, 2.160 max_d=2.160 avg_d=0.880 std_dev=0.663
P	B	0, 0.310, 0.976, 1.641, 2.221 max_d=2.221 avg_d=0.976 std_dev=0.666
C3'	B	0, 0.390, 1.070, 1.750, 2.294 max_d=2.294 avg_d=1.070 std_dev=0.680
C4'	B	0, 0.321, 1.020, 1.719, 2.322 max_d=2.322 avg_d=1.020 std_dev=0.699
C5'	B	0, 0.368, 1.092, 1.817, 2.424 max_d=2.424 avg_d=1.092 std_dev=0.724
O3'	B	0, 0.518, 1.293, 2.068, 2.612 max_d=2.612 avg_d=1.293 std_dev=0.775
OP1	B	0, 0.335, 1.151, 1.967, 2.735 max_d=2.735 avg_d=1.151 std_dev=0.816
O2'	A	0, -0.181, 0.673, 1.528, 2.547 max_d=2.547 avg_d=0.673 std_dev=0.855
C5'	A	0, 0.369, 1.373, 2.376, 3.191 max_d=3.191 avg_d=1.373 std_dev=1.003
O5'	A	0, 0.505, 1.517, 2.529, 3.181 max_d=3.181 avg_d=1.517 std_dev=1.012
P	A	0, 0.781, 2.084, 3.387, 4.032 max_d=4.032 avg_d=2.084 std_dev=1.303
OP2	A	0, 0.800, 2.276, 3.751, 4.576 max_d=4.576 avg_d=2.276 std_dev=1.476
OP1	A	0, 0.906, 2.613, 4.319, 5.320 max_d=5.320 avg_d=2.613 std_dev=1.707

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.24	0.00	0.09	0.09	0.14	0.10
C2	0.02	0.00	0.21	0.14	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.25	0.17	0.27	0.26	0.58	0.34
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.03	0.16	0.07	0.15	0.15	0.22	0.03	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.32	0.26	0.45	0.36
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.18	0.01	0.24	0.02	0.23	0.26	0.19	0.12	0.26	0.28	0.18	0.01	0.00	0.03	0.12	0.09	0.15	0.12
C4	0.01	0.00	0.11	0.18	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.13	0.08	0.32	0.31	0.54	0.36
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.05	0.20	0.03	0.09	0.09	0.18	0.07	0.26	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.24	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.28	0.04	0.02	0.45	0.48	0.75	0.53
C5'	0.06	0.12	0.16	0.02	0.09	0.00	0.15	0.00	0.14	0.23	0.10	0.12	0.18	0.24	0.09	0.09	0.17	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.23	0.01	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.07	0.06	0.46	0.49	0.82	0.55
C8	0.01	0.00	0.15	0.26	0.00	0.20	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.39	0.12	0.14	0.49	0.50	0.63	0.52
N1	0.02	0.00	0.15	0.19	0.01	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.12	0.37	0.39	0.73	0.46
N3	0.02	0.00	0.22	0.12	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.27	0.17	0.22	0.19	0.46	0.27
N6	0.01	0.01	0.03	0.26	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.05	0.03	0.53	0.60	0.96	0.65
N7	0.01	0.01	0.10	0.28	0.01	0.18	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.42	0.12	0.09	0.55	0.60	0.84	0.63
N9	0.00	0.00	0.01	0.18	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.06	0.02	0.30	0.28	0.42	0.31
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.13	0.26	0.28	0.09	0.25	0.39	0.12	0.10	0.33	0.42	0.18	0.00	0.04	0.18	0.25	0.14	0.54	0.31
O3'	0.24	0.25	0.02	0.00	0.13	0.01	0.04	0.17	0.07	0.12	0.16	0.27	0.05	0.12	0.06	0.04	0.00	0.15	0.05	0.18	0.05	0.07
O4'	0.00	0.17	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.01	0.06	0.14	0.12	0.17	0.03	0.09	0.02	0.18	0.15	0.00	0.18	0.15	0.22	0.19
O5'	0.09	0.27	0.32	0.12	0.32	0.01	0.45	0.01	0.46	0.49	0.37	0.22	0.53	0.55	0.30	0.25	0.05	0.18	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.09	0.26	0.26	0.09	0.31	0.03	0.48	0.06	0.49	0.50	0.39	0.19	0.60	0.60	0.28	0.14	0.18	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.58	0.45	0.15	0.54	0.01	0.75	0.01	0.82	0.63	0.73	0.46	0.96	0.84	0.42	0.54	0.05	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.34	0.36	0.12	0.36	0.01	0.53	0.01	0.55	0.52	0.46	0.27	0.65	0.63	0.31	0.31	0.07	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.24	0.16	0.24	0.34	0.19	0.17	0.13	0.36	0.19	0.11	0.18	0.13	0.17	0.28	0.22	0.26	0.22
C2	0.24	0.15	0.24	0.22	0.15	0.23	0.13	0.21	0.09	0.23	0.11	0.22	0.16	0.20	0.22	0.27	0.22	0.23	0.14	0.14	0.18	0.16	0.17
C2'	0.43	0.29	0.37	0.33	0.24	0.45	0.12	0.37	0.16	0.08	0.19	0.35	0.34	0.19	0.25	0.47	0.31	0.52	0.24	0.24	0.07	0.35	0.09
C3'	0.22	0.30	0.22	0.21	0.27	0.21	0.27	0.19	0.28	0.22	0.30	0.31	0.29	0.25	0.23	0.23	0.19	0.22	0.18	0.29	0.09	0.06	0.01
C4	0.11	0.18	0.11	0.10	0.10	0.11	0.12	0.11	0.13	0.19	0.17	0.22	0.14	0.19	0.12	0.11	0.10	0.11	0.11	0.14	0.07	0.10	0.07
C4'	0.06	0.19	0.07	0.08	0.15	0.06	0.21	0.10	0.24	0.18	0.22	0.19	0.15	0.23	0.12	0.05	0.08	0.05	0.08	0.27	0.07	0.11	0.05
C5	0.09	0.20	0.09	0.14	0.09	0.13	0.05	0.15	0.10	0.15	0.20	0.25	0.15	0.14	0.09	0.08	0.14	0.12	0.21	0.09	0.12	0.22	0.14
C5'	0.10	0.27	0.14	0.19	0.25	0.11	0.32	0.17	0.37	0.26	0.33	0.26	0.23	0.35	0.19	0.09	0.19	0.06	0.24	0.42	0.16	0.35	0.24
C6	0.10	0.21	0.10	0.12	0.09	0.11	0.09	0.13	0.08	0.16	0.18	0.28	0.16	0.19	0.10	0.11	0.12	0.10	0.19	0.11	0.11	0.23	0.13
C8	0.13	0.19	0.14	0.20	0.10	0.21	0.11	0.24	0.19	0.12	0.21	0.22	0.14	0.11	0.09	0.13	0.20	0.20	0.30	0.23	0.19	0.25	0.22
N1	0.16	0.18	0.16	0.13	0.10	0.14	0.10	0.13	0.10	0.16	0.12	0.27	0.16	0.18	0.13	0.20	0.13	0.15	0.12	0.19	0.09	0.17	0.10
N3	0.23	0.16	0.23	0.22	0.17	0.23	0.18	0.21	0.13	0.30	0.14	0.20	0.14	0.26	0.24	0.23	0.22	0.23	0.16	0.13	0.21	0.18	0.19
N6	0.10	0.22	0.11	0.18	0.11	0.14	0.15	0.18	0.15	0.20	0.20	0.30	0.16	0.25	0.12	0.09	0.19	0.12	0.26	0.21	0.18	0.32	0.21
N7	0.14	0.21	0.15	0.23	0.11	0.22	0.09	0.26	0.16	0.17	0.22	0.25	0.15	0.13	0.12	0.12	0.23	0.19	0.33	0.18	0.23	0.33	0.26
N9	0.08	0.18	0.09	0.10	0.10	0.12	0.15	0.12	0.18	0.18	0.19	0.20	0.13	0.21	0.09	0.08	0.10	0.12	0.14	0.22	0.04	0.07	0.05
O2'	0.24	0.22	0.13	0.08	0.26	0.34	0.58	0.26	0.61	0.61	0.41	0.18	0.15	0.84	0.19	0.36	0.09	0.43	0.22	0.79	0.16	0.86	0.35
O3'	0.17	0.24	0.16	0.16	0.25	0.11	0.29	0.11	0.30	0.29	0.27	0.23	0.23	0.32	0.24	0.13	0.14	0.14	0.02	0.32	0.01	0.01	0.00
O4'	0.22	0.22	0.21	0.19	0.22	0.20	0.24	0.17	0.25	0.28	0.24	0.22	0.20	0.27	0.23	0.22	0.19	0.22	0.09	0.26	0.15	0.07	0.10
O5'	0.26	0.50	0.29	0.29	0.44	0.19	0.51	0.18	0.57	0.40	0.56	0.49	0.44	0.50	0.36	0.24	0.27	0.18	0.21	0.62	0.11	0.26	0.14
OP1	0.30	0.57	0.37	0.39	0.52	0.24	0.64	0.25	0.72	0.51	0.67	0.55	0.49	0.64	0.43	0.28	0.38	0.21	0.34	0.81	0.18	0.50	0.31
OP2	0.45	0.83	0.49	0.44	0.72	0.30	0.82	0.22	0.94	0.60	0.92	0.84	0.73	0.76	0.58	0.44	0.41	0.32	0.26	1.03	0.11	0.25	0.13
P	0.30	0.60	0.35	0.34	0.52	0.22	0.62	0.20	0.71	0.47	0.68	0.59	0.52	0.60	0.42	0.28	0.32	0.21	0.25	0.79	0.10	0.32	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.10	0.02	0.10	0.00	0.12	0.26	0.17
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.11	0.09	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.04	0.03	0.13	0.09
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.09	0.07	0.10	0.07	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.11	0.08	0.06	0.12	0.10
C4	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.10	0.00	0.12	0.24	0.17
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.14	0.00	0.19	0.31	0.22
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.10	0.07	0.04	0.04	0.11	0.06	0.02	0.03	0.01	0.01	0.11	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.15	0.00	0.21	0.34	0.24
C8	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.14	0.00	0.17	0.26	0.21
N1	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.09	0.01	0.13	0.00	0.17	0.31	0.21
N2	0.02	0.00	0.11	0.10	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.13	0.02	0.09	0.00	0.10	0.25	0.15
N3	0.01	0.00	0.09	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.02	0.08	0.00	0.09	0.22	0.14
N7	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.16	0.00	0.23	0.33	0.25
N9	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.10	0.20	0.14
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.04	0.08	0.13	0.10	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.04	0.05	0.10	0.05
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.08	0.09	0.09	0.13	0.09	0.09	0.04	0.03	0.00	0.01	0.12	0.10	0.08	0.11	0.10
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.05
O5'	0.03	0.10	0.08	0.11	0.10	0.01	0.14	0.01	0.15	0.14	0.13	0.09	0.08	0.16	0.09	0.06	0.12	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.17	0.00	0.25	0.38	0.27
OP1	0.05	0.12	0.03	0.06	0.12	0.05	0.19	0.05	0.21	0.17	0.17	0.10	0.09	0.23	0.10	0.05	0.08	0.08	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.26	0.13	0.12	0.24	0.02	0.31	0.02	0.34	0.26	0.31	0.25	0.22	0.33	0.20	0.10	0.11	0.02	0.01	0.38	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.17	0.09	0.10	0.17	0.02	0.22	0.01	0.24	0.21	0.21	0.15	0.14	0.25	0.14	0.05	0.10	0.05	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00