Doublet Group distance statistics: 52040

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.001, 0.014, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C5	B	0, 0.259, 0.634, 1.009, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.634 std_dev=0.375
C8	B	0, 0.236, 0.616, 0.995, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.616 std_dev=0.380
C4	B	0, 0.260, 0.643, 1.026, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.643 std_dev=0.383
N9	B	0, 0.243, 0.628, 1.014, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.628 std_dev=0.385
N7	B	0, 0.284, 0.687, 1.089, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.687 std_dev=0.403
N1	B	0, 0.241, 0.651, 1.061, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.651 std_dev=0.410
C6	B	0, 0.257, 0.671, 1.085, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.671 std_dev=0.414
C1'	B	0, 0.287, 0.727, 1.167, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.727 std_dev=0.440
C2	B	0, 0.295, 0.742, 1.189, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.742 std_dev=0.447
N3	B	0, 0.309, 0.763, 1.217, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.763 std_dev=0.454
O6	B	0, 0.301, 0.812, 1.322, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.812 std_dev=0.511
N2	B	0, 0.360, 0.901, 1.443, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.901 std_dev=0.542
O4'	B	0, 0.284, 0.897, 1.511, 1.720 max_d=1.720 avg_d=0.897 std_dev=0.613
C3'	B	0, 0.422, 1.106, 1.789, 1.801 max_d=1.801 avg_d=1.106 std_dev=0.684
O3'	B	0, 0.481, 1.203, 1.926, 1.836 max_d=1.836 avg_d=1.203 std_dev=0.723
C2'	B	0, 0.409, 1.144, 1.879, 1.989 max_d=1.989 avg_d=1.144 std_dev=0.735
C4'	B	0, 0.307, 1.130, 1.953, 2.311 max_d=2.311 avg_d=1.130 std_dev=0.823
O4'	A	0, -0.136, 0.729, 1.594, 2.206 max_d=2.206 avg_d=0.729 std_dev=0.865
C2'	A	0, -0.156, 0.749, 1.653, 2.295 max_d=2.295 avg_d=0.749 std_dev=0.904
C3'	A	0, -0.146, 1.053, 2.252, 3.091 max_d=3.091 avg_d=1.053 std_dev=1.199
C4'	A	0, -0.199, 1.058, 2.314, 3.203 max_d=3.203 avg_d=1.058 std_dev=1.256
O3'	A	0, -0.069, 1.209, 2.486, 3.358 max_d=3.358 avg_d=1.209 std_dev=1.277
O2'	A	0, -0.308, 0.974, 2.257, 3.180 max_d=3.180 avg_d=0.974 std_dev=1.282
O2'	B	0, 0.300, 1.587, 2.873, 3.557 max_d=3.557 avg_d=1.587 std_dev=1.286
O5'	B	0, 0.018, 1.522, 3.026, 4.019 max_d=4.019 avg_d=1.522 std_dev=1.504
C5'	B	0, 0.009, 1.537, 3.066, 4.078 max_d=4.078 avg_d=1.537 std_dev=1.528
O5'	A	0, 0.109, 1.790, 3.471, 4.543 max_d=4.543 avg_d=1.790 std_dev=1.681
C5'	A	0, -0.166, 1.742, 3.651, 4.969 max_d=4.969 avg_d=1.742 std_dev=1.908
P	B	0, -0.189, 1.733, 3.655, 4.989 max_d=4.989 avg_d=1.733 std_dev=1.922
OP1	B	0, -0.171, 1.875, 3.920, 5.333 max_d=5.333 avg_d=1.875 std_dev=2.045
OP2	B	0, -0.223, 1.859, 3.942, 5.390 max_d=5.390 avg_d=1.859 std_dev=2.083
OP1	A	0, 0.689, 2.870, 5.052, 6.109 max_d=6.109 avg_d=2.870 std_dev=2.181
P	A	0, 0.348, 2.586, 4.824, 6.151 max_d=6.151 avg_d=2.586 std_dev=2.238
OP2	A	0, 0.734, 3.319, 5.904, 7.236 max_d=7.236 avg_d=3.319 std_dev=2.585

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.23	0.00	0.07	0.22	0.27	0.15
C2	0.01	0.00	0.52	0.51	0.00	0.05	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.30	0.31	0.14	0.19	0.55	0.24
C2'	0.00	0.52	0.00	0.00	0.25	0.01	0.09	0.24	0.20	0.30	0.39	0.53	0.12	0.18	0.02	0.00	0.01	0.00	0.34	0.35	0.50	0.32
C3'	0.01	0.51	0.00	0.00	0.35	0.00	0.32	0.01	0.40	0.06	0.48	0.46	0.37	0.17	0.17	0.01	0.00	0.01	0.34	0.42	0.20	0.25
C4	0.01	0.00	0.25	0.35	0.00	0.03	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.17	0.13	0.22	0.52	0.22
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.29	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.32	0.00	0.03	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.15	0.08	0.16	0.27	0.63	0.27
C5'	0.14	0.22	0.24	0.01	0.22	0.00	0.24	0.00	0.25	0.23	0.24	0.20	0.27	0.25	0.21	0.05	0.23	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.20	0.40	0.00	0.04	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.24	0.15	0.18	0.27	0.68	0.29
C8	0.01	0.01	0.30	0.06	0.00	0.02	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.43	0.07	0.17	0.14	0.30	0.55	0.25
N1	0.01	0.00	0.39	0.48	0.00	0.05	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.30	0.25	0.16	0.23	0.63	0.27
N3	0.01	0.00	0.53	0.46	0.00	0.05	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.22	0.30	0.11	0.17	0.48	0.21
N6	0.01	0.01	0.12	0.37	0.01	0.04	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.24	0.11	0.20	0.30	0.74	0.32
N7	0.01	0.01	0.18	0.17	0.00	0.02	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.39	0.06	0.08	0.17	0.31	0.65	0.28
N9	0.00	0.01	0.02	0.17	0.00	0.01	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.03	0.01	0.11	0.24	0.45	0.20
O2'	0.03	0.31	0.00	0.01	0.04	0.29	0.16	0.05	0.06	0.43	0.14	0.34	0.17	0.39	0.15	0.00	0.01	0.20	0.04	0.10	0.23	0.06
O3'	0.23	0.30	0.01	0.00	0.13	0.00	0.15	0.23	0.24	0.07	0.30	0.22	0.24	0.06	0.03	0.01	0.00	0.22	0.15	0.31	0.22	0.07
O4'	0.00	0.31	0.00	0.01	0.17	0.00	0.08	0.00	0.15	0.17	0.25	0.30	0.11	0.08	0.01	0.20	0.22	0.00	0.31	0.49	0.17	0.35
O5'	0.07	0.14	0.34	0.34	0.13	0.00	0.16	0.00	0.18	0.14	0.16	0.11	0.20	0.17	0.11	0.04	0.15	0.31	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.22	0.19	0.35	0.42	0.22	0.03	0.27	0.01	0.27	0.30	0.23	0.17	0.30	0.31	0.24	0.10	0.31	0.49	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.27	0.55	0.50	0.20	0.52	0.07	0.63	0.06	0.68	0.55	0.63	0.48	0.74	0.65	0.45	0.23	0.22	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.24	0.32	0.25	0.22	0.02	0.27	0.01	0.29	0.25	0.27	0.21	0.32	0.28	0.20	0.06	0.07	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.09	0.48	0.12	0.06	0.15	0.14	0.05	0.20	0.09	0.15	0.08	0.05	0.16	0.08	0.47	0.11	0.39	0.35	0.26	0.10	0.67	0.16
C2	0.10	0.10	0.15	0.31	0.11	0.60	0.10	1.00	0.10	0.08	0.10	0.10	0.11	0.09	0.10	0.18	0.47	0.42	1.01	0.10	0.83	0.81	0.78
C2'	0.87	0.35	0.23	0.74	0.45	1.14	0.17	1.06	0.04	0.41	0.14	0.39	0.51	0.11	0.62	0.17	0.76	1.34	0.63	0.23	0.69	0.07	0.68
C3'	1.15	0.74	0.53	1.09	0.88	1.43	0.74	1.42	0.57	1.01	0.61	0.72	0.87	0.78	1.04	0.39	1.17	1.58	1.14	0.41	1.17	0.51	1.21
C4	0.14	0.07	0.25	0.09	0.04	0.17	0.09	0.45	0.14	0.06	0.12	0.07	0.04	0.08	0.08	0.17	0.20	0.04	0.57	0.19	0.33	0.50	0.33
C4'	0.69	0.29	0.12	0.62	0.47	0.85	0.42	0.81	0.28	0.70	0.23	0.23	0.40	0.55	0.63	0.08	0.73	1.01	0.59	0.20	0.94	0.29	0.81
C5	0.12	0.09	0.13	0.04	0.04	0.18	0.07	0.42	0.13	0.10	0.14	0.10	0.03	0.07	0.09	0.12	0.15	0.08	0.41	0.18	0.17	0.20	0.13
C5'	0.74	0.23	0.29	0.86	0.49	0.98	0.46	1.00	0.28	0.82	0.19	0.15	0.37	0.67	0.68	0.18	0.99	1.02	0.92	0.21	1.48	1.01	1.30
C6	0.07	0.08	0.02	0.03	0.01	0.36	0.02	0.64	0.07	0.07	0.10	0.11	0.03	0.04	0.05	0.07	0.25	0.30	0.55	0.08	0.35	0.26	0.28
C8	0.17	0.10	0.26	0.14	0.08	0.12	0.12	0.08	0.19	0.15	0.17	0.11	0.05	0.14	0.12	0.35	0.09	0.23	0.12	0.26	0.21	0.05	0.22
N1	0.06	0.09	0.05	0.18	0.07	0.56	0.06	0.90	0.07	0.05	0.09	0.10	0.08	0.05	0.06	0.20	0.40	0.47	0.80	0.06	0.65	0.53	0.57
N3	0.14	0.08	0.28	0.28	0.08	0.38	0.10	0.78	0.12	0.07	0.10	0.07	0.08	0.11	0.09	0.09	0.37	0.12	0.94	0.15	0.72	0.88	0.73
N6	0.06	0.10	0.07	0.04	0.03	0.37	0.04	0.61	0.05	0.08	0.10	0.15	0.05	0.08	0.05	0.10	0.21	0.35	0.45	0.06	0.26	0.09	0.17
N7	0.15	0.11	0.16	0.15	0.08	0.06	0.11	0.19	0.18	0.15	0.17	0.13	0.06	0.13	0.12	0.24	0.08	0.09	0.17	0.24	0.13	0.09	0.16
N9	0.16	0.08	0.34	0.06	0.05	0.06	0.12	0.16	0.18	0.09	0.15	0.08	0.04	0.12	0.09	0.34	0.10	0.24	0.33	0.24	0.06	0.36	0.08
O2'	0.35	0.17	0.36	0.25	0.17	0.86	0.50	0.92	0.61	0.38	0.41	0.08	0.05	0.68	0.08	0.44	0.30	1.00	0.33	0.83	0.50	0.43	0.42
O3'	1.05	0.65	0.43	1.05	0.77	1.49	0.64	1.61	0.50	0.87	0.54	0.65	0.76	0.66	0.92	0.31	1.22	1.56	1.26	0.37	1.32	0.34	1.32
O4'	0.16	0.08	0.43	0.07	0.06	0.11	0.08	0.06	0.03	0.24	0.07	0.13	0.04	0.20	0.15	0.42	0.04	0.35	0.26	0.04	0.09	0.44	0.04
O5'	0.67	0.29	0.15	0.73	0.47	0.93	0.44	0.96	0.31	0.70	0.25	0.23	0.39	0.59	0.62	0.05	0.87	0.99	0.82	0.26	1.38	0.82	1.16
OP1	0.71	0.43	0.18	0.75	0.58	0.94	0.58	0.96	0.49	0.75	0.43	0.38	0.50	0.69	0.68	0.08	0.88	1.01	0.84	0.47	1.40	0.88	1.16
OP2	0.76	0.46	0.47	1.08	0.56	1.09	0.57	1.18	0.50	0.85	0.49	0.47	0.47	0.75	0.71	0.32	1.24	1.00	1.19	0.51	1.99	1.55	1.66
P	0.78	0.45	0.33	0.89	0.64	0.99	0.66	1.01	0.54	0.89	0.45	0.39	0.53	0.82	0.77	0.19	1.03	1.03	0.95	0.52	1.55	1.11	1.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.32	0.00	0.10	0.01	0.33	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.43	0.25	0.00	0.28	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.10	0.47	0.19	0.01	0.21	0.13	0.03
C2'	0.00	0.43	0.00	0.00	0.23	0.01	0.12	0.18	0.20	0.21	0.34	0.52	0.42	0.10	0.02	0.00	0.03	0.01	0.40	0.15	0.86	0.62	0.57
C3'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.28	0.00	0.37	0.00	0.38	0.34	0.33	0.20	0.20	0.40	0.25	0.00	0.00	0.02	0.02	0.42	0.57	0.13	0.23
C4	0.00	0.00	0.23	0.28	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.24	0.03	0.01	0.07	0.21	0.14
C4'	0.00	0.28	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.02	0.33	0.16	0.39	0.27	0.27	0.10	0.29	0.02	0.00	0.00	0.05	0.20	0.03	0.05
C5	0.00	0.00	0.12	0.37	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.10	0.10	0.18	0.01	0.18	0.46	0.38
C5'	0.05	0.40	0.18	0.00	0.13	0.00	0.05	0.00	0.07	0.39	0.26	0.55	0.38	0.32	0.06	0.10	0.20	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.00
C6	0.00	0.00	0.20	0.38	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.11	0.20	0.13	0.00	0.18	0.48	0.35
C8	0.00	0.00	0.21	0.34	0.00	0.33	0.00	0.39	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.12	0.27	0.43	0.01	0.29	0.49	0.55
N1	0.00	0.00	0.34	0.33	0.00	0.16	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.02	0.36	0.06	0.00	0.03	0.31	0.16
N2	0.01	0.00	0.52	0.20	0.00	0.39	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.59	0.16	0.57	0.31	0.01	0.34	0.04	0.15
N3	0.00	0.00	0.42	0.20	0.00	0.27	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.16	0.47	0.21	0.01	0.27	0.06	0.07
N7	0.00	0.00	0.10	0.40	0.00	0.27	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.19	0.15	0.42	0.01	0.41	0.66	0.63
N9	0.00	0.00	0.02	0.25	0.00	0.10	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.06	0.01	0.09	0.01	0.05	0.18	0.19
O2'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.04	0.29	0.19	0.10	0.08	0.56	0.18	0.59	0.39	0.49	0.20	0.00	0.06	0.20	0.29	0.19	0.85	0.72	0.54
O3'	0.32	0.10	0.03	0.00	0.04	0.02	0.10	0.20	0.11	0.12	0.02	0.16	0.16	0.19	0.06	0.06	0.00	0.21	0.22	0.18	0.25	0.11	0.04
O4'	0.00	0.47	0.01	0.02	0.24	0.00	0.10	0.01	0.20	0.27	0.36	0.57	0.47	0.15	0.01	0.20	0.21	0.00	0.03	0.14	0.02	0.11	0.15
O5'	0.10	0.19	0.40	0.02	0.03	0.00	0.18	0.00	0.13	0.43	0.06	0.31	0.21	0.42	0.09	0.29	0.22	0.03	0.00	0.22	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.15	0.42	0.01	0.05	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.18	0.14	0.22	0.00	0.33	0.63	0.48
OP1	0.33	0.21	0.86	0.57	0.07	0.20	0.18	0.04	0.18	0.29	0.03	0.34	0.27	0.41	0.05	0.85	0.25	0.02	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.13	0.62	0.13	0.21	0.03	0.46	0.02	0.48	0.49	0.31	0.04	0.06	0.66	0.18	0.72	0.11	0.11	0.02	0.63	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.03	0.57	0.23	0.14	0.05	0.38	0.00	0.35	0.55	0.16	0.15	0.07	0.63	0.19	0.54	0.04	0.15	0.00	0.48	0.00	0.01	0.00