Doublet Group distance statistics: 52043

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N6	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.000, 0.039, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.000, 0.043, 0.087, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N9	A	0, 0.000, 0.045, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.045
O6	B	0, 0.000, 0.294, 0.587, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.294 std_dev=0.294
C6	B	0, 0.000, 0.318, 0.635, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.318 std_dev=0.318
O3'	A	0, 0.000, 0.346, 0.692, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.346 std_dev=0.346
N1	B	0, 0.000, 0.352, 0.703, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.352 std_dev=0.352
C5	B	0, 0.000, 0.353, 0.706, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.353 std_dev=0.353
N7	B	0, 0.000, 0.385, 0.771, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.385 std_dev=0.385
C2	B	0, 0.000, 0.397, 0.795, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.397 std_dev=0.397
C4	B	0, 0.000, 0.407, 0.814, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.407 std_dev=0.407
N3	B	0, 0.000, 0.425, 0.849, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.425 std_dev=0.425
N2	B	0, 0.000, 0.447, 0.894, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.447 std_dev=0.447
C8	B	0, 0.000, 0.465, 0.931, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.465 std_dev=0.465
N9	B	0, 0.000, 0.480, 0.960, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.480 std_dev=0.480
C1'	B	0, 0.000, 0.586, 1.172, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.586 std_dev=0.586
O4'	B	0, 0.000, 0.672, 1.344, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.672 std_dev=0.672
C2'	A	0, 0.000, 0.680, 1.359, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.680 std_dev=0.680
C2'	B	0, 0.000, 0.697, 1.394, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.697 std_dev=0.697
O4'	A	0, 0.000, 0.730, 1.459, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.730 std_dev=0.730
C3'	A	0, 0.000, 0.762, 1.525, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.762 std_dev=0.762
C3'	B	0, 0.000, 0.809, 1.618, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.809 std_dev=0.809
O2'	B	0, 0.000, 0.813, 1.625, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.813 std_dev=0.813
C4'	B	0, 0.000, 0.851, 1.702, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.851 std_dev=0.851
O3'	B	0, 0.000, 0.962, 1.924, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.962 std_dev=0.962
C4'	A	0, 0.000, 0.970, 1.939, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.970 std_dev=0.970
C5'	B	0, 0.000, 0.981, 1.962, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.981 std_dev=0.981
O2'	A	0, 0.000, 1.094, 2.187, 2.187 max_d=2.187 avg_d=1.094 std_dev=1.094
O5'	B	0, 0.000, 1.120, 2.240, 2.240 max_d=2.240 avg_d=1.120 std_dev=1.120
P	B	0, 0.000, 1.368, 2.736, 2.736 max_d=2.736 avg_d=1.368 std_dev=1.368
C5'	A	0, 0.000, 1.529, 3.057, 3.057 max_d=3.057 avg_d=1.529 std_dev=1.529
O5'	A	0, 0.000, 1.612, 3.223, 3.223 max_d=3.223 avg_d=1.612 std_dev=1.612
OP1	B	0, 0.000, 1.647, 3.294, 3.294 max_d=3.294 avg_d=1.647 std_dev=1.647
OP2	B	0, 0.000, 1.715, 3.430, 3.430 max_d=3.430 avg_d=1.715 std_dev=1.715
OP2	A	0, 0.000, 2.017, 4.034, 4.034 max_d=4.034 avg_d=2.017 std_dev=2.017
P	A	0, 0.000, 2.140, 4.280, 4.280 max_d=4.280 avg_d=2.140 std_dev=2.140
OP1	A	0, 0.000, 2.310, 4.620, 4.620 max_d=4.620 avg_d=2.310 std_dev=2.310

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.12	0.17	0.24	0.10
C2	0.04	0.00	0.12	0.08	0.01	0.34	0.01	0.48	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.39	0.07	0.38	0.53	0.18	0.76	0.61
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.07	0.07	0.05	0.10	0.11	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.26	0.05
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06
C4	0.03	0.01	0.07	0.04	0.00	0.19	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.05	0.21	0.39	0.07	0.64	0.42
C4'	0.00	0.34	0.01	0.00	0.19	0.00	0.12	0.00	0.20	0.10	0.29	0.32	0.16	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.17	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.12	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.04	0.11	0.35	0.22	0.72	0.40
C5'	0.05	0.48	0.07	0.01	0.30	0.00	0.24	0.00	0.33	0.05	0.44	0.44	0.29	0.05	0.12	0.07	0.03	0.00	0.01	0.20	0.26	0.01
C6	0.03	0.00	0.07	0.04	0.01	0.20	0.00	0.33	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.05	0.19	0.42	0.10	0.81	0.51
C8	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.10	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.02	0.16	0.06	0.56	0.48	0.04
N1	0.04	0.00	0.10	0.06	0.00	0.29	0.01	0.44	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.33	0.06	0.30	0.50	0.09	0.82	0.61
N3	0.04	0.00	0.11	0.08	0.00	0.32	0.00	0.44	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.36	0.07	0.38	0.48	0.14	0.66	0.53
N6	0.02	0.00	0.06	0.02	0.01	0.16	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.04	0.14	0.38	0.19	0.85	0.48
N7	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.06	0.16	0.52	0.64	0.18
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.22	0.25	0.47	0.21
O2'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.21	0.00	0.13	0.07	0.22	0.15	0.33	0.36	0.17	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.08	0.37	0.07
O3'	0.04	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.06	0.07	0.04	0.03	0.03	0.02	0.00	0.06	0.05	0.04	0.10	0.05
O4'	0.00	0.38	0.01	0.01	0.21	0.00	0.11	0.00	0.19	0.16	0.30	0.38	0.14	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.14	0.03	0.02
O5'	0.12	0.53	0.05	0.06	0.39	0.01	0.35	0.01	0.42	0.06	0.50	0.48	0.38	0.16	0.22	0.06	0.05	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.17	0.18	0.07	0.03	0.07	0.07	0.22	0.20	0.10	0.56	0.09	0.14	0.19	0.52	0.25	0.08	0.04	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.24	0.76	0.26	0.05	0.64	0.17	0.72	0.26	0.81	0.48	0.82	0.66	0.85	0.64	0.47	0.37	0.10	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.61	0.05	0.06	0.42	0.02	0.40	0.01	0.51	0.04	0.61	0.53	0.48	0.18	0.21	0.07	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.16	0.28	0.30	0.20	0.33	0.14	0.37	0.08	0.20	0.11	0.16	0.20	0.13	0.25	0.28	0.31	0.31	0.54	0.01	0.74	0.93	0.66
C2	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.12	0.02	0.11	0.13	0.05	0.06	0.01	0.16	0.07	0.02	0.00	0.04	0.15	0.13	0.25	0.43	0.21
C2'	0.08	0.11	0.12	0.10	0.14	0.04	0.18	0.02	0.17	0.18	0.13	0.10	0.11	0.23	0.13	0.09	0.09	0.05	0.16	0.18	0.45	0.61	0.34
C3'	0.15	0.01	0.11	0.12	0.01	0.20	0.08	0.25	0.13	0.01	0.07	0.01	0.04	0.11	0.06	0.16	0.12	0.20	0.38	0.21	0.56	0.74	0.50
C4	0.09	0.07	0.09	0.10	0.05	0.10	0.02	0.13	0.04	0.01	0.02	0.08	0.09	0.06	0.06	0.09	0.10	0.09	0.29	0.09	0.50	0.64	0.41
C4'	0.43	0.16	0.38	0.38	0.21	0.49	0.05	0.51	0.06	0.19	0.02	0.18	0.25	0.02	0.29	0.46	0.39	0.49	0.64	0.21	0.72	0.89	0.69
C5	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.08	0.08	0.11	0.06	0.05	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.03	0.03	0.22	0.15	0.48	0.58	0.36
C5'	0.40	0.14	0.33	0.30	0.17	0.43	0.01	0.44	0.13	0.12	0.02	0.17	0.23	0.06	0.25	0.43	0.30	0.46	0.54	0.32	0.62	0.75	0.58
C6	0.07	0.09	0.08	0.06	0.12	0.06	0.16	0.02	0.17	0.13	0.14	0.04	0.08	0.16	0.10	0.09	0.06	0.06	0.13	0.18	0.35	0.46	0.25
C8	0.12	0.06	0.10	0.14	0.08	0.15	0.04	0.22	0.00	0.06	0.03	0.05	0.08	0.03	0.10	0.09	0.14	0.14	0.36	0.05	0.68	0.77	0.53
N1	0.10	0.08	0.09	0.09	0.14	0.10	0.17	0.07	0.16	0.16	0.12	0.02	0.09	0.18	0.13	0.09	0.08	0.10	0.09	0.17	0.24	0.39	0.18
N3	0.09	0.07	0.10	0.09	0.04	0.08	0.04	0.09	0.05	0.05	0.01	0.10	0.10	0.09	0.04	0.12	0.10	0.08	0.27	0.09	0.38	0.57	0.33
N6	0.12	0.17	0.14	0.12	0.16	0.11	0.18	0.06	0.21	0.15	0.20	0.14	0.15	0.17	0.14	0.16	0.13	0.10	0.08	0.21	0.33	0.41	0.22
N7	0.05	0.00	0.03	0.06	0.01	0.08	0.03	0.14	0.07	0.00	0.04	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.06	0.07	0.27	0.13	0.59	0.66	0.44
N9	0.17	0.11	0.16	0.18	0.12	0.19	0.07	0.24	0.03	0.09	0.07	0.11	0.13	0.05	0.14	0.15	0.19	0.18	0.40	0.02	0.65	0.79	0.54
O2'	0.41	0.22	0.40	0.38	0.32	0.38	0.26	0.29	0.13	0.42	0.15	0.21	0.30	0.33	0.39	0.40	0.37	0.41	0.17	0.02	0.28	0.43	0.11
O3'	0.30	0.14	0.29	0.32	0.18	0.38	0.10	0.44	0.05	0.18	0.09	0.15	0.19	0.09	0.23	0.33	0.34	0.35	0.59	0.01	0.72	0.96	0.70
O4'	0.58	0.27	0.54	0.56	0.35	0.63	0.19	0.65	0.05	0.35	0.13	0.28	0.38	0.17	0.45	0.60	0.56	0.63	0.80	0.11	0.88	1.05	0.84
O5'	0.31	0.11	0.22	0.18	0.12	0.30	0.07	0.30	0.17	0.04	0.05	0.16	0.19	0.13	0.18	0.32	0.16	0.35	0.38	0.38	0.52	0.60	0.44
OP1	0.01	0.48	0.13	0.12	0.35	0.08	0.55	0.14	0.77	0.29	0.69	0.46	0.32	0.51	0.20	0.02	0.14	0.11	0.24	1.01	0.40	0.51	0.35
OP2	0.49	0.48	0.41	0.34	0.40	0.41	0.26	0.38	0.23	0.24	0.36	0.54	0.50	0.15	0.39	0.50	0.31	0.47	0.44	0.07	0.60	0.64	0.49
P	0.29	0.07	0.18	0.13	0.08	0.27	0.12	0.26	0.25	0.01	0.11	0.13	0.16	0.19	0.14	0.30	0.10	0.33	0.33	0.49	0.46	0.51	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.22	0.22	0.14
C2	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.02	0.01	0.10	0.02	0.43	0.32	0.24
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.03	0.04
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.04	0.01	0.02	0.08	0.04	0.00	0.00	0.00	0.10	0.07	0.10	0.09	0.03
C4	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.12	0.00	0.44	0.34	0.26
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.08	0.04	0.00	0.00	0.08	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.02	0.16	0.00	0.56	0.43	0.34
C5'	0.03	0.06	0.02	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.10	0.04	0.05	0.15	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.15	0.00	0.60	0.45	0.35
C8	0.02	0.00	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.04	0.20	0.01	0.52	0.43	0.34
N1	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.13	0.01	0.53	0.39	0.31
N2	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.08	0.03	0.39	0.29	0.21
N3	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.09	0.01	0.37	0.29	0.21
N7	0.02	0.00	0.03	0.08	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.04	0.19	0.01	0.62	0.50	0.39
N9	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.38	0.32	0.24
O2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.07	0.00	0.06	0.08	0.04	0.00	0.01	0.09	0.04	0.00	0.00	0.01	0.16	0.08	0.02	0.22	0.11
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.13	0.03	0.15	0.21	0.13
O5'	0.09	0.10	0.02	0.10	0.12	0.01	0.16	0.00	0.15	0.20	0.13	0.08	0.09	0.19	0.13	0.01	0.16	0.13	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.17	0.00	0.68	0.50	0.40
OP1	0.22	0.43	0.15	0.10	0.44	0.04	0.56	0.01	0.60	0.52	0.53	0.39	0.37	0.62	0.38	0.06	0.02	0.15	0.01	0.68	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.32	0.03	0.09	0.34	0.03	0.43	0.01	0.45	0.43	0.39	0.29	0.29	0.50	0.32	0.04	0.22	0.21	0.00	0.50	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.24	0.04	0.03	0.26	0.02	0.34	0.01	0.35	0.34	0.31	0.21	0.21	0.39	0.24	0.03	0.11	0.13	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00