Doublet Group distance statistics: 52050

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 1, 3, 5, 2, 0, 2, 0, 0, 1, 1, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.027 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.036, 0.069, 0.102, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.069 std_dev=0.033
O4	A	0, 0.078, 0.152, 0.226, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.152 std_dev=0.074
N2	B	0, 0.310, 0.584, 0.857, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.584 std_dev=0.274
C2'	A	0, -0.084, 0.199, 0.483, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.199 std_dev=0.284
O4'	A	0, -0.137, 0.185, 0.507, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.185 std_dev=0.322
O2'	A	0, -0.043, 0.280, 0.604, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.280 std_dev=0.324
C2	B	0, 0.379, 0.730, 1.081, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.730 std_dev=0.351
N3	B	0, 0.404, 0.797, 1.189, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.797 std_dev=0.393
N1	B	0, 0.415, 0.818, 1.222, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.818 std_dev=0.404
C4'	A	0, -0.160, 0.291, 0.742, 2.339 max_d=2.339 avg_d=0.291 std_dev=0.451
C3'	A	0, -0.167, 0.296, 0.759, 2.402 max_d=2.402 avg_d=0.296 std_dev=0.463
C4	B	0, 0.468, 0.941, 1.414, 1.880 max_d=1.880 avg_d=0.941 std_dev=0.473
C6	B	0, 0.505, 0.988, 1.470, 1.828 max_d=1.828 avg_d=0.988 std_dev=0.482
C2'	B	0, 0.540, 1.024, 1.508, 2.225 max_d=2.225 avg_d=1.024 std_dev=0.484
C5	B	0, 0.515, 1.030, 1.545, 1.987 max_d=1.987 avg_d=1.030 std_dev=0.515
O6	B	0, 0.574, 1.100, 1.627, 2.028 max_d=2.028 avg_d=1.100 std_dev=0.526
C1'	B	0, 0.532, 1.070, 1.607, 2.326 max_d=2.326 avg_d=1.070 std_dev=0.538
N9	B	0, 0.515, 1.054, 1.593, 2.241 max_d=2.241 avg_d=1.054 std_dev=0.539
C3'	B	0, 0.582, 1.163, 1.744, 2.536 max_d=2.536 avg_d=1.163 std_dev=0.581
O3'	B	0, 0.541, 1.123, 1.706, 2.452 max_d=2.452 avg_d=1.123 std_dev=0.582
O3'	A	0, -0.149, 0.438, 1.024, 3.091 max_d=3.091 avg_d=0.438 std_dev=0.586
N7	B	0, 0.568, 1.169, 1.769, 2.378 max_d=2.378 avg_d=1.169 std_dev=0.600
O2'	B	0, 0.409, 1.013, 1.618, 3.086 max_d=3.086 avg_d=1.013 std_dev=0.604
C8	B	0, 0.562, 1.175, 1.789, 2.519 max_d=2.519 avg_d=1.175 std_dev=0.614
O4'	B	0, 0.581, 1.216, 1.852, 2.698 max_d=2.698 avg_d=1.216 std_dev=0.635
C4'	B	0, 0.591, 1.246, 1.900, 2.731 max_d=2.731 avg_d=1.246 std_dev=0.655
C5'	A	0, -0.173, 0.599, 1.372, 4.072 max_d=4.072 avg_d=0.599 std_dev=0.772
C5'	B	0, 0.604, 1.408, 2.211, 3.316 max_d=3.316 avg_d=1.408 std_dev=0.804
O5'	A	0, -0.307, 0.703, 1.714, 5.278 max_d=5.278 avg_d=0.703 std_dev=1.011
O5'	B	0, 0.529, 1.641, 2.754, 5.526 max_d=5.526 avg_d=1.641 std_dev=1.113
P	A	0, -0.305, 0.950, 2.205, 6.683 max_d=6.683 avg_d=0.950 std_dev=1.255
OP1	A	0, -0.299, 1.182, 2.662, 7.992 max_d=7.992 avg_d=1.182 std_dev=1.481
P	B	0, 0.442, 2.030, 3.618, 8.245 max_d=8.245 avg_d=2.030 std_dev=1.588
OP2	A	0, -0.646, 1.001, 2.649, 8.666 max_d=8.666 avg_d=1.001 std_dev=1.648
OP1	B	0, 0.483, 2.198, 3.914, 8.933 max_d=8.933 avg_d=2.198 std_dev=1.716
OP2	B	0, 0.220, 2.142, 4.064, 10.167 max_d=10.167 avg_d=2.142 std_dev=1.922

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.22	0.08	0.32	0.21
C2	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.01	0.07	0.38	0.18	0.62	0.39
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.09	0.19	0.00	0.03	0.05	0.01	0.13	0.05	0.23	0.13
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.10	0.05	0.11	0.16	0.01	0.01	0.08	0.01	0.05	0.06	0.14	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.03	0.42	0.23	0.81	0.49
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.04	0.06	0.06	0.03	0.08	0.00	0.01	0.08	0.11	0.02
C5	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.01	0.08	0.38	0.22	0.72	0.46
C5'	0.04	0.08	0.02	0.01	0.17	0.01	0.20	0.00	0.18	0.10	0.12	0.07	0.05	0.04	0.18	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.10	0.33	0.17	0.57	0.37
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.01	0.33	0.14	0.52	0.33
N3	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.01	0.05	0.42	0.21	0.75	0.46
O2	0.04	0.00	0.19	0.16	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.19	0.01	0.13	0.36	0.19	0.57	0.36
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.08	0.06	0.10	0.05	0.09	0.04	0.08	0.13	0.00	0.06	0.10	0.07	0.06	0.08	0.10	0.06
O3'	0.04	0.12	0.03	0.01	0.08	0.03	0.09	0.04	0.10	0.05	0.12	0.19	0.06	0.00	0.09	0.04	0.18	0.14	0.18	0.14
O4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.00	0.04	0.44	0.24	0.88	0.52
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.05	0.13	0.07	0.04	0.04	0.00	0.21	0.06	0.27	0.20
O5'	0.22	0.38	0.13	0.05	0.42	0.01	0.38	0.01	0.33	0.33	0.42	0.36	0.06	0.18	0.44	0.21	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.08	0.18	0.05	0.06	0.23	0.08	0.22	0.09	0.17	0.14	0.21	0.19	0.08	0.14	0.24	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.62	0.23	0.14	0.81	0.11	0.72	0.15	0.57	0.52	0.75	0.57	0.10	0.18	0.88	0.27	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.39	0.13	0.05	0.49	0.02	0.46	0.01	0.37	0.33	0.46	0.36	0.06	0.14	0.52	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.09	0.12	0.35	0.16	0.46	0.15	0.49	0.11	0.22	0.08	0.10	0.13	0.19	0.21	0.33	0.51	0.42	0.59	0.10	1.24	0.95	1.03
C2	0.22	0.11	0.18	0.24	0.15	0.38	0.14	0.39	0.11	0.18	0.10	0.11	0.14	0.16	0.19	0.36	0.43	0.39	0.45	0.11	1.04	0.74	0.86
C2'	0.15	0.10	0.26	0.20	0.12	0.24	0.13	0.25	0.11	0.15	0.10	0.11	0.11	0.14	0.14	0.45	0.29	0.22	0.32	0.12	0.90	0.64	0.70
C3'	0.13	0.12	0.14	0.18	0.12	0.16	0.11	0.17	0.10	0.12	0.11	0.13	0.13	0.11	0.12	0.33	0.30	0.16	0.24	0.09	0.83	0.55	0.61
C4	0.22	0.11	0.22	0.20	0.17	0.35	0.16	0.36	0.13	0.20	0.11	0.10	0.15	0.18	0.20	0.37	0.39	0.38	0.38	0.12	0.85	0.55	0.71
C4'	0.33	0.18	0.19	0.52	0.26	0.49	0.26	0.52	0.22	0.32	0.18	0.15	0.21	0.30	0.30	0.16	0.65	0.41	0.62	0.22	1.27	0.96	1.02
C5	0.22	0.08	0.20	0.24	0.15	0.38	0.15	0.39	0.11	0.20	0.08	0.10	0.12	0.17	0.19	0.42	0.44	0.40	0.43	0.11	0.91	0.61	0.76
C5'	0.44	0.31	0.38	0.69	0.39	0.56	0.40	0.59	0.37	0.46	0.32	0.27	0.33	0.44	0.43	0.23	0.83	0.47	0.66	0.37	1.25	0.94	1.00
C6	0.22	0.08	0.15	0.29	0.15	0.41	0.14	0.43	0.10	0.20	0.08	0.10	0.11	0.17	0.19	0.40	0.48	0.40	0.49	0.10	1.05	0.75	0.87
N1	0.23	0.09	0.15	0.28	0.15	0.41	0.14	0.43	0.10	0.19	0.08	0.10	0.12	0.16	0.19	0.37	0.47	0.40	0.50	0.09	1.10	0.81	0.92
N3	0.21	0.12	0.21	0.20	0.16	0.35	0.15	0.36	0.13	0.19	0.12	0.12	0.15	0.16	0.19	0.36	0.40	0.38	0.40	0.12	0.93	0.62	0.77
O2	0.22	0.12	0.19	0.24	0.16	0.38	0.14	0.39	0.12	0.19	0.12	0.12	0.15	0.16	0.19	0.34	0.43	0.38	0.46	0.12	1.07	0.77	0.88
O2'	0.21	0.18	0.29	0.28	0.20	0.32	0.22	0.34	0.22	0.24	0.20	0.17	0.18	0.24	0.22	0.45	0.36	0.29	0.44	0.24	1.04	0.81	0.84
O3'	0.11	0.11	0.14	0.16	0.11	0.11	0.10	0.13	0.10	0.11	0.10	0.12	0.11	0.10	0.11	0.30	0.23	0.11	0.19	0.09	0.74	0.49	0.53
O4	0.22	0.15	0.25	0.20	0.20	0.32	0.19	0.33	0.16	0.21	0.14	0.12	0.19	0.20	0.21	0.35	0.36	0.37	0.33	0.15	0.74	0.44	0.61
O4'	0.41	0.16	0.22	0.61	0.29	0.67	0.29	0.71	0.23	0.39	0.17	0.11	0.22	0.35	0.37	0.14	0.77	0.58	0.83	0.23	1.51	1.19	1.26
O5'	0.59	0.55	0.54	0.77	0.61	0.56	0.64	0.53	0.63	0.64	0.59	0.49	0.56	0.65	0.61	0.34	0.92	0.53	0.59	0.64	1.05	0.81	0.86
OP1	0.70	0.51	0.88	1.12	0.68	0.74	0.74	0.78	0.70	0.83	0.59	0.39	0.54	0.82	0.74	0.69	1.16	0.61	0.79	0.73	1.17	0.91	0.96
OP2	1.01	1.15	1.03	1.02	1.18	0.67	1.23	0.57	1.26	1.14	1.22	1.07	1.13	1.20	1.12	0.97	1.07	0.76	0.61	1.28	0.83	0.70	0.74
P	0.78	0.73	0.84	1.02	0.82	0.68	0.86	0.63	0.85	0.86	0.78	0.64	0.74	0.88	0.83	0.66	1.13	0.64	0.67	0.86	1.01	0.80	0.85

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.00	0.11	0.01	0.16	0.17	0.05
C2	0.03	0.00	0.22	0.17	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.13	0.11	0.08	0.15	0.02	0.15	0.28	0.09
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.09	0.10	0.11	0.17	0.27	0.21	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.08	0.19	0.14	0.05
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.14	0.01	0.17	0.01	0.19	0.13	0.19	0.17	0.14	0.17	0.11	0.02	0.01	0.01	0.17	0.21	0.18	0.15	0.04
C4	0.01	0.01	0.11	0.14	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.04	0.22	0.01	0.07	0.40	0.16
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.06	0.11	0.04	0.04	0.02	0.11	0.05	0.15	0.01	0.01	0.01	0.08	0.25	0.06	0.15
C5	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.07	0.02	0.32	0.01	0.22	0.62	0.34
C5'	0.02	0.04	0.09	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.09	0.13	0.06	0.04	0.03	0.13	0.05	0.06	0.10	0.01	0.01	0.11	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.19	0.00	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.03	0.31	0.00	0.21	0.62	0.32
C8	0.01	0.01	0.11	0.13	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.06	0.08	0.41	0.01	0.31	0.71	0.46
N1	0.02	0.01	0.17	0.19	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.09	0.06	0.23	0.01	0.10	0.45	0.18
N2	0.04	0.00	0.27	0.17	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.13	0.10	0.11	0.02	0.24	0.17	0.13
N3	0.02	0.00	0.21	0.14	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.12	0.09	0.13	0.01	0.17	0.22	0.08
N7	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.08	0.05	0.42	0.01	0.38	0.82	0.51
N9	0.00	0.02	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.11	0.07	0.01	0.24	0.01	0.08	0.41	0.20
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.07	0.15	0.16	0.06	0.13	0.25	0.09	0.21	0.13	0.25	0.11	0.00	0.03	0.10	0.15	0.17	0.15	0.16	0.04
O3'	0.16	0.11	0.02	0.01	0.08	0.01	0.07	0.10	0.08	0.06	0.09	0.13	0.12	0.08	0.07	0.03	0.00	0.09	0.18	0.10	0.20	0.12	0.08
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.06	0.10	0.09	0.05	0.01	0.10	0.09	0.00	0.06	0.02	0.17	0.08	0.08
O5'	0.11	0.15	0.08	0.17	0.22	0.01	0.32	0.01	0.31	0.41	0.23	0.11	0.13	0.42	0.24	0.15	0.18	0.06	0.00	0.36	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.02	0.08	0.21	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.17	0.10	0.02	0.36	0.00	0.32	0.75	0.42
OP1	0.16	0.15	0.19	0.18	0.07	0.25	0.22	0.05	0.21	0.31	0.10	0.24	0.17	0.38	0.08	0.15	0.20	0.17	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.28	0.14	0.15	0.40	0.06	0.62	0.02	0.62	0.71	0.45	0.17	0.22	0.82	0.41	0.16	0.12	0.08	0.02	0.75	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.05	0.04	0.16	0.15	0.34	0.01	0.32	0.46	0.18	0.13	0.08	0.51	0.20	0.04	0.08	0.08	0.00	0.42	0.00	0.01	0.00