Doublet Group distance statistics: 52059

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 16, 22, 12, 2, 1, 0, 0, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.006, 0.008, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.017, 0.025, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.024, 0.035, 0.047, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.025, 0.037, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.037 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.024, 0.036, 0.048, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.036 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.025, 0.038, 0.050, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.038 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.054, 0.085, 0.115, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.085 std_dev=0.031
N4	A	0, 0.079, 0.123, 0.167, 0.212 max_d=0.212 avg_d=0.123 std_dev=0.044
C2	B	0, 0.112, 0.236, 0.359, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.236 std_dev=0.124
N1	B	0, 0.111, 0.260, 0.408, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.260 std_dev=0.149
O2	B	0, 0.156, 0.306, 0.455, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.306 std_dev=0.150
C1'	B	0, 0.151, 0.341, 0.530, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.341 std_dev=0.190
O4'	A	0, -0.096, 0.121, 0.338, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.121 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.030, 0.247, 0.464, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.247 std_dev=0.217
C2'	A	0, -0.012, 0.207, 0.427, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.207 std_dev=0.220
C6	B	0, 0.026, 0.280, 0.535, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.280 std_dev=0.255
O2'	A	0, 0.059, 0.317, 0.575, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.317 std_dev=0.258
C4'	A	0, -0.089, 0.203, 0.494, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.203 std_dev=0.292
C4	B	0, -0.032, 0.284, 0.600, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.284 std_dev=0.316
C5	B	0, -0.049, 0.282, 0.613, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.282 std_dev=0.331
C3'	A	0, -0.060, 0.273, 0.607, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.273 std_dev=0.334
O4'	B	0, 0.103, 0.459, 0.816, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.459 std_dev=0.356
O2'	B	0, 0.050, 0.417, 0.785, 2.182 max_d=2.182 avg_d=0.417 std_dev=0.367
C2'	B	0, 0.029, 0.424, 0.820, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.424 std_dev=0.396
O4	B	0, -0.040, 0.378, 0.795, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.378 std_dev=0.418
OP2	A	0, 0.041, 0.460, 0.879, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.460 std_dev=0.419
O3'	A	0, -0.066, 0.392, 0.851, 2.103 max_d=2.103 avg_d=0.392 std_dev=0.459
O5'	A	0, -0.155, 0.308, 0.772, 2.125 max_d=2.125 avg_d=0.308 std_dev=0.463
P	A	0, -0.121, 0.348, 0.817, 2.235 max_d=2.235 avg_d=0.348 std_dev=0.469
OP1	A	0, -0.078, 0.447, 0.972, 2.438 max_d=2.438 avg_d=0.447 std_dev=0.525
C5'	A	0, -0.241, 0.301, 0.844, 2.407 max_d=2.407 avg_d=0.301 std_dev=0.543
C4'	B	0, -0.015, 0.539, 1.093, 2.546 max_d=2.546 avg_d=0.539 std_dev=0.554
O5'	B	0, -0.058, 0.505, 1.068, 2.617 max_d=2.617 avg_d=0.505 std_dev=0.563
OP2	B	0, -0.031, 0.572, 1.175, 2.776 max_d=2.776 avg_d=0.572 std_dev=0.603
P	B	0, -0.034, 0.572, 1.178, 2.897 max_d=2.897 avg_d=0.572 std_dev=0.606
C5'	B	0, -0.052, 0.558, 1.168, 2.867 max_d=2.867 avg_d=0.558 std_dev=0.610
C3'	B	0, -0.112, 0.540, 1.192, 2.832 max_d=2.832 avg_d=0.540 std_dev=0.652
OP1	B	0, -0.079, 0.740, 1.559, 3.934 max_d=3.934 avg_d=0.740 std_dev=0.819
O3'	B	0, -0.145, 0.677, 1.499, 3.531 max_d=3.531 avg_d=0.677 std_dev=0.822

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.12	0.18	0.06
C2	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.02	0.23	0.18	0.19	0.17
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.06	0.03	0.15	0.00	0.01	0.01	0.18	0.22	0.11	0.14
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.10	0.02	0.13	0.02	0.07	0.04	0.17	0.02	0.01	0.01	0.24	0.28	0.10	0.20
C4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.36	0.28	0.27	0.30
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.03	0.04	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.12	0.19	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.39	0.31	0.28	0.32
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.04	0.05	0.07	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.10	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.02	0.35	0.27	0.22	0.26
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.23	0.19	0.18	0.16
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.02	0.29	0.22	0.23	0.24
N4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.38	0.31	0.31	0.33
O2	0.02	0.00	0.15	0.17	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.20	0.03	0.16	0.14	0.17	0.12
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.06	0.03	0.11	0.00	0.03	0.03	0.07	0.19	0.11	0.07
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.04	0.02	0.11	0.03	0.13	0.02	0.09	0.05	0.20	0.03	0.00	0.02	0.20	0.32	0.11	0.21
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.00	0.05	0.06	0.28	0.09
O5'	0.10	0.23	0.18	0.24	0.36	0.01	0.39	0.01	0.35	0.23	0.29	0.38	0.16	0.07	0.20	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.12	0.18	0.22	0.28	0.28	0.12	0.31	0.10	0.27	0.19	0.22	0.31	0.14	0.19	0.32	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.19	0.11	0.10	0.27	0.19	0.28	0.22	0.22	0.18	0.23	0.31	0.17	0.11	0.11	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.17	0.14	0.20	0.30	0.02	0.32	0.01	0.26	0.16	0.24	0.33	0.12	0.07	0.21	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.07	0.38	0.48	0.06	0.33	0.15	0.32	0.20	0.15	0.08	0.07	0.16	0.34	0.17	0.22	0.37	0.42	0.38	0.33
C2	0.15	0.09	0.36	0.33	0.13	0.21	0.19	0.19	0.20	0.15	0.09	0.08	0.19	0.19	0.12	0.14	0.24	0.26	0.25	0.19
C2'	0.30	0.14	0.49	0.60	0.16	0.45	0.36	0.46	0.39	0.28	0.08	0.09	0.23	0.43	0.06	0.35	0.55	0.60	0.62	0.53
C3'	0.33	0.09	0.53	0.71	0.10	0.53	0.29	0.54	0.38	0.26	0.14	0.10	0.28	0.58	0.29	0.40	0.64	0.70	0.71	0.62
C4	0.12	0.08	0.33	0.23	0.10	0.15	0.10	0.13	0.11	0.10	0.09	0.08	0.23	0.17	0.12	0.11	0.14	0.17	0.12	0.10
C4'	0.22	0.12	0.43	0.64	0.28	0.44	0.12	0.43	0.17	0.13	0.25	0.13	0.22	0.56	0.50	0.29	0.49	0.57	0.51	0.45
C5	0.16	0.07	0.37	0.35	0.11	0.25	0.06	0.22	0.10	0.11	0.10	0.08	0.17	0.22	0.18	0.17	0.21	0.26	0.16	0.16
C5'	0.21	0.22	0.42	0.69	0.49	0.47	0.28	0.45	0.14	0.12	0.41	0.21	0.25	0.68	0.74	0.28	0.49	0.59	0.48	0.44
C6	0.19	0.07	0.38	0.44	0.12	0.32	0.08	0.29	0.15	0.14	0.10	0.08	0.16	0.30	0.22	0.22	0.30	0.35	0.27	0.26
N1	0.18	0.07	0.38	0.42	0.06	0.28	0.14	0.27	0.19	0.15	0.06	0.07	0.16	0.27	0.14	0.19	0.30	0.35	0.30	0.26
N3	0.13	0.10	0.34	0.24	0.15	0.14	0.17	0.13	0.17	0.13	0.12	0.09	0.22	0.17	0.15	0.11	0.16	0.18	0.16	0.12
N4	0.09	0.09	0.28	0.12	0.11	0.11	0.09	0.12	0.08	0.08	0.12	0.11	0.29	0.24	0.13	0.14	0.10	0.11	0.09	0.09
O2	0.16	0.11	0.36	0.33	0.18	0.20	0.24	0.19	0.23	0.17	0.12	0.09	0.19	0.19	0.17	0.13	0.25	0.27	0.28	0.21
O2'	0.29	0.15	0.46	0.59	0.19	0.44	0.36	0.46	0.37	0.27	0.10	0.10	0.20	0.41	0.11	0.34	0.56	0.62	0.64	0.55
O3'	0.38	0.11	0.56	0.78	0.10	0.60	0.36	0.63	0.44	0.30	0.12	0.10	0.30	0.64	0.22	0.46	0.76	0.83	0.88	0.75
O4'	0.15	0.13	0.33	0.49	0.29	0.32	0.16	0.29	0.12	0.10	0.24	0.13	0.18	0.41	0.46	0.18	0.32	0.40	0.30	0.28
O5'	0.60	0.30	0.76	1.05	0.11	0.89	0.20	0.85	0.43	0.45	0.13	0.32	0.48	1.02	0.31	0.72	0.85	0.91	0.74	0.77
OP1	0.52	0.19	0.64	1.06	0.24	0.90	0.14	0.91	0.28	0.32	0.16	0.22	0.41	1.11	0.44	0.70	0.92	1.05	0.87	0.89
OP2	0.53	0.21	0.65	1.07	0.39	0.91	0.31	0.89	0.22	0.30	0.25	0.24	0.41	1.07	0.58	0.71	0.86	0.91	0.64	0.75
P	0.54	0.20	0.69	1.08	0.24	0.91	0.14	0.89	0.27	0.34	0.13	0.25	0.43	1.11	0.45	0.71	0.87	0.96	0.72	0.79

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.01	0.00	0.09	0.07	0.13	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.22	0.01	0.12	0.14	0.16	0.17	0.18
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.12	0.06	0.02	0.06	0.10	0.00	0.02	0.04	0.02	0.26	0.21	0.32	0.27
C3'	0.02	0.02	0.00	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.14	0.05	0.05	0.07	0.02	0.00	0.11	0.02	0.03	0.09	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.10	0.00	0.02	0.08	0.10	0.13	0.12
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.11	0.02	0.06	0.16	0.13	0.01	0.03	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.03	0.00	0.09	0.09	0.09	0.12	0.10
C5'	0.04	0.15	0.12	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.07	0.06	0.13	0.22	0.03	0.13	0.08	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.11	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.03	0.01	0.11	0.07	0.07	0.11	0.09
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.01	0.08	0.08	0.13	0.12
N3	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.01	0.08	0.12	0.15	0.16	0.17
O2	0.02	0.00	0.10	0.07	0.01	0.16	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.30	0.01	0.22	0.20	0.22	0.21	0.24
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.14	0.13	0.26	0.03	0.26	0.08	0.05	0.22	0.00	0.06	0.15	0.06	0.22	0.17	0.40	0.26
O3'	0.19	0.22	0.02	0.00	0.10	0.01	0.03	0.13	0.03	0.14	0.18	0.30	0.06	0.00	0.09	0.12	0.13	0.29	0.18	0.19
O4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.09	0.00	0.02	0.08	0.10	0.13	0.12
O4'	0.00	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.08	0.22	0.06	0.12	0.02	0.00	0.07	0.06	0.08	0.06
O5'	0.09	0.14	0.26	0.03	0.08	0.02	0.09	0.01	0.07	0.08	0.12	0.20	0.22	0.13	0.08	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.16	0.21	0.09	0.10	0.06	0.09	0.05	0.07	0.08	0.15	0.22	0.17	0.29	0.10	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.17	0.32	0.05	0.13	0.03	0.12	0.02	0.11	0.13	0.16	0.21	0.40	0.18	0.13	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.18	0.27	0.04	0.12	0.02	0.10	0.01	0.09	0.12	0.17	0.24	0.26	0.19	0.12	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00